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# 生物学# 合成生物学

合成細胞のデザイン:相分離技術の組み合わせ

研究者たちは、先進的な分子相互作用のために革新的な方法を使って合成細胞を作り出している。

Siddharth Deshpande, C. Chen, C. M. Love, C. F. Carnahan, K. A. Ganar, A. N. Parikh

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合成細胞の開発を進める合成細胞の開発を進めるせる。新しい相分離技術が合成細胞の機能を向上さ
目次

生きた細胞は、いろんなパーツが詰まった小さな工場みたいなもんだよ。細胞が仕事をするのを助ける小さな構造物、オルガネラっていうのがいっぱいあって、その中はタンパク質や糖、他の分子でぎゅうぎゅう詰めになってて、常に動き回ったりお互いに影響しあってる。この賑やかな環境が細胞の生命と機能にはめっちゃ重要なんだ。

合成細胞の構築

研究者たちは、実際の細胞を真似た合成細胞を作ろうとしてるんだ。彼らは、基本的な構成要素から始めて、それらを組み合わせて細胞みたいなシステムを作る「ボトムアップ合成生物学」ってアプローチを使ってるんだ。これをやるには、混雑した環境での分子の相互作用を理解することが必要で、これは自然の細胞がどんなふうに機能してるかってことだよ。

合成細胞を作り始めるために、科学者たちは小さな容器、ベシクルって呼ばれるものを作るんだ。これらのベシクルは特定の分子を含むようにカスタマイズできるから、中にもっと複雑な構造を作ることができる。大きく分けて、膜を持つ構造(本物の細胞みたい)と、膜を持たない構造の2つが作れる。後者は特に面白くて、簡単に形を変えたり動き回ったりすることができるんだ。

膜なしオルガネラ

細胞の中には、膜なしオルガネラっていう特別な構造もあるんだ。これらは細胞で重要な役割を果たしてて、よく細胞の膜と相互作用するんだ。合成細胞がうまく機能するためには、研究者たちはこれらのオルガネラがどう機能するか、またラボでどうモデル化できるかを理解する必要がある。これの目的は、これらのオルガネラの本質的な特徴を複製して、基本的な細胞機能を達成すること、最終的には特定の方法で応用することなんだ。

このオルガネラの形成で重要な概念の一つが「液-液相分離(LLPS)」っていうやつなんだ。これは、混合物の一部が異なる液体状態に分かれるプロセスなんだ。LLPSは主に2つの方法で起こる:共鳴相分離(APS)と分離相分離(SPS)。APSは分子同士が引きつけあって、濃い液体相を形成するときに起こる。一方、SPSは異なるタイプの分子がうまく混ざらず、お互いに距離を保った別々の相を作るときに起こるんだ。

細胞プロセスの模倣

最近の実験では、合成細胞の中でAPSを促進することで細胞がどんなふうに働くかを真似ようとしてるんだ。これをすることで、可逆的な凝縮や分裂、生化学反応みたいな動的プロセスを作り出せるんだ。本物の細胞では、凝縮物っていうタンパク質や他の分子の小さな滴がプラズマ膜や細胞質みたいな特定の場所で機能してる。合成細胞でこれらの挙動を再現するのは大きなチャレンジだけど、ワクワクする目標でもあるんだ。

科学者たちが直面する問題の一つは、これらの凝縮物が正しい場所に留まるようにすることなんだ。現在の方法では、凝縮物が膜を越えて自由に動き回ってしまうことが多くて、それが機能には良くないかもしれない。これらの凝縮物が膜の内側とどう相互作用するかを理解するための研究が進行中で、これが本物の細胞で見られるような挙動に繋がるかもしれないんだ。

SPSとAPSの役割

SPSは、混雑した空間での細胞プロセスを再現するのに役立つ別の方法なんだ。この方法は、温度や他の要因を操作することで細胞の中に区画を作るのに使われてきたよ。その結果、生じた変化は出芽や非対称分裂みたいな様々な細胞構造に繋がることがあるんだ。研究者たちは、リポソームっていう小さな構造を使って、SPSがその中で極性構造を作る方法を研究してきたよ。

APSとSPSがそれぞれ独立したアプローチとして成功しているにも関わらず、科学者たちはまだそれらが細胞のような環境の中でリアルタイムでどう協力できるのかを理解する必要があるんだ。この組み合わせが、より良い合成細胞を作るための新しい洞察を提供してくれるかもしれない。

私たちの研究:SPSとAPSの組み合わせ

この研究では、SPSとAPSが小さな合成環境の中でどう協力し合うかを調べたんだ。2種類のシステムを使ったよ:一つはポリエチレングリコール(PEG)とデキストラン(DEX)を基にしたSPS、もう一つはポリ-L-リジン(PLL)とアデノシン三リン酸(ATP)を基にしたAPS。

まず、これらの成分が異なる条件下でどう相互作用するかを示すために基本的な実験を行ったんだ。マイクロフルイディック技術を使って特別な環境を作り、小さな滴(ダブルエマルションやリポソーム)内にSPSとAPS成分を封入できるようにした。このセットアップで、これらのシステムがどう凝縮物の動きや活動を調整するかを観察することができたんだ。

特定の条件下では、合成細胞の膜に特定の成分を移動させることができることがわかったよ。pHに変化を与えることで、膜にくっついて挙動を変えるコアセルベートや分子の集団を含む構造を作ることができた。

これらの環境に凝縮物を置いたとき、互いに孤立していて、動きが制限されていることがわかったんだ。この合成細胞内での凝縮物の場所と挙動を制御する能力は、本物の細胞機能を再現するための重要なステップなんだ。

ダブルエマルションの使用

最初は、水でできた小さな滴が油に囲まれたダブルエマルションを使ってみたんだ。いろんな条件を試した結果、そこに複雑な構造を作り出すことができた。これらの構造は、本物の細胞に見られるような混雑した環境での分子の挙動を再現していたよ。時間が経つにつれて、ダブルエマルションはサイズや形が変わることに気づき、新しい区画が形成されることもあったんだ。

次に、細胞の研究でも使われるリポソームに目を向けたよ。APSとSPS成分で満たされたリポソームを作ったんだ。そこに特定の外部溶液を加えると、リポソームが縮んで表面に新しい構造を作り出すことに気づいたんだ。これは、脂質膜の界面で分子の挙動を制御できることを示してるから、すごく重要なんだ。

膜へのターゲティング

リポソームを使ったアプローチは、分子を膜の表面に向かわせる動きの制御方法を理解するのに役立ったよ。SPSを使ってAPS成分を膜に導くことで、表面でコアセルベートが形成されるのを成功させたんだ。

これらの相互作用は、「花びら構造」っていう膜の表面にできたパターンを生み出し、コアセルベートはその花びらの周辺に見られたんだ。これによって、細胞内の分子だけでなく、それらが膜とどう相互作用するかも操作できるってことがわかったんだ。

合成細胞における複雑な構造

SPSとAPSのアプローチを組み合わせることで、リポソームの中に複雑で花のような構造を作り出すことができたんだ。これらの構造は時間が経っても安定していて、凝縮物の局所的な形成を可能にした。いろんな条件の組み合わせによって、本物の細胞プロセスを模倣するバランスを達成できたんだ。

慎重に監視することで、これらの新しく形成された区画が互いに明確に分かれていることを確認したよ。各区画は独立して機能できて、これは膜なしオルガネラを持つ本物の細胞で見られる挙動を反映しているから、興味深い結果なんだ。

結論:細胞機能に関する新しい洞察

私たちの発見は、混雑した細胞環境での分子相互作用がどう起こるかをより理解するのに貢献してるんだ。SPSとAPSの組み合わせを使うことで、生物分子の凝縮物の挙動や局在を制御できるようになって、新しい合成生物学の戦略に道を開くことができる。

これらの進展は、複雑なタスクを実行する効率的な合成細胞を作り出すことに繋がるだろうし、自然の細胞に似た機能を持つ合成細胞が実現する可能性があるよ。この研究は、分子の相互作用を利用して、より洗練された人工システムを作る方法を垣間見ることができて、医学やバイオテクノロジーなどのさまざまな分野に応用できるかもしれない。

将来的には、これらの原則をさまざまな種類の生体分子や環境に適用して、合成細胞システムをさらに多用途で機能的にすることを探求していくつもりだよ。これらの生命の基本的な構成要素を操作する可能性は、細胞の理解を深める新しい扉を開くことになるし、彼らのプロセスを再現することに繋がるかもしれない。

オリジナルソース

タイトル: Regulating biocondensates within synthetic cells via segregative phase separation

概要: Living cells orchestrate a myriad of biological reactions within a highly complex and crowded environment. A major factor responsible for such seamless assembly are the preferential interactions between the constituent macromolecules, either associative or segregative, that can drive de-mixing to produce co-existing phases, and thus provide a dynamic intracellular compartmentalization. But how these two types of interactions, occurring simultaneously within the cytoplasmic space, influence each other is still largely unknown. This makes understanding and applying the molecular interactions that interfere with each other in such crowded environments crucial when engineering increasingly complex synthetic cells. Here, we show that the interplay between segregative and associative phase separation within cell-mimicking vesicles can lead to rich dynamics between them. Using on-chip microfluidic systems, we encapsulate the associative and segregative components in cell-sized containers and trigger their phase separations to create hierarchical structures that act as molecular recruiters, membrane targeting agents, and initiators of condensation. The obtained multiphase architecture provides an isolated microenvironment for condensates, restricting their molecular communication as well as diffusive motion, and leading to budding-like behaviour at the lipid membrane. In conclusion, we propose segregative phase separation as a universal condensate regulation strategy in managing molecular distribution, condensate location, as well as membrane interaction. We believe our approach will facilitate controlling the behaviour of membraneless organelles within synthetic cells.

著者: Siddharth Deshpande, C. Chen, C. M. Love, C. F. Carnahan, K. A. Ganar, A. N. Parikh

最終更新: 2024-10-19 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.18.619037

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.18.619037.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

オープンアクセスの相互運用性を利用させていただいた biorxiv に感謝します。

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