タンパク質発現技術の進展
ポリトランスジーン発現システムを使って、複数の遺伝子を表現する新しい方法を探ってる。
Brian E Chen, R. Y. Yu, A. Bucio-Mendez
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目次
たんぱく質はすべての生物にとって欠かせない部分なんだ。生物学的プロセスのいろんなところで重要な役割を果たしてる。たんぱく質がどう働いて、お互いにどう関わってるかを理解するのは、医学や遺伝学を含む多くの科学の分野で重要なんだよ。たんぱく質の面白い点は、他のたんぱく質と複合体を形成できることだね。これがどう機能するか、そして時間とともにどう変わったかを理解するのに特に重要なんだ。
細胞の中では、複数の遺伝子の行動や相互作用を同時に調べる必要があることが多いんだ。バクテリアや酵母のような簡単な生物では、科学者は特定のDNA配列(プロモーターと呼ばれる)を使って、多くの遺伝子を簡単に発現させられる。でも、もっと複雑な生物ではこれが難しいんだ。動物の場合、複数の遺伝子を一緒に働かせるのはかなりチャレンジングだね。
遺伝子発現技術
複数の遺伝子を一度に発現させる方法の一つは、特別なタイプのメッセンジャーRNA(mRNA)を使うことなんだ。このタイプのmRNAはいくつかの遺伝子の情報を運ぶことができるんだ。例えば、内部リボソーム侵入部位(IRES)という配列を使うと、1つのmRNA鎖から2つの遺伝子を翻訳できるようになる。でも、IRESを使うと、2番目の遺伝子の生産が1番目に比べて低くなることが多いんだ。
もう一つの進んだ方法は、2Aペプチドと呼ばれる短いペプチドを使うことだ。これらのペプチドは1つのmRNA鎖から複数のたんぱく質を発現させるのを助ける。これらのペプチドが生成されると、リボソームに干渉して、一部のセクションをスキップできるようになり、いくつかのたんぱく質を生成することができる。この方法は、最大4つの遺伝子を同時に発現させるのに有効だが、追加の遺伝子ごとに効率が下がるんだ。
哺乳動物の細胞では、マルチラベルと呼ばれるシステムが最大5つの遺伝子を同時に発現させることができる。このシステムは、特定の蛾の細胞株で使われるバキュロウイルス発現法に基づいているんだ。
代替スプライシング
自然がたんぱく質の多様性を生み出すもう一つの方法は、代替スプライシングと呼ばれるプロセスを通じてなんだ。これによって、1つの遺伝子がmRNAの作成時に特定のセグメントを含めたり除外したりすることで、複数のたんぱく質の形を作り出すことができるんだ。有名な代替スプライシングの例は、ショウジョウバエのダウン症細胞接着分子、Dscamだ。このDscam遺伝子は、その複雑なスプライシングメカニズムのおかげで、さまざまなバージョンのたんぱく質を形成できる。
Dscamは、相互排他的に選択できるエクソンのセットを含んでいる。つまり、転写の過程で、いくつかの選択肢の中から1つのバージョンだけが最終的なmRNAに含まれるんだ。これによって、膨大な数の潜在的なたんぱく質産物が生まれる。
ポリ遺伝子発現システム(PXGS)
ポリ遺伝子発現システム(PXGS)は、Dscamの代替スプライシング特性を利用した新しい方法なんだ。Dscamのスプライシング領域全体をDNAベクターに置くことで、研究者はスプライシングオプションに基づいて任意の遺伝子を発現させるように修正できる。これにより、科学者はDscamのユニークな能力を活用して多くの異なるたんぱく質を生成できるんだ。
このシステムを使うことで、研究者は細胞内で特定のたんぱく質がいつどのように作られるかをより良く制御するために遺伝子発現を簡単に操作できる。PXGSを使えば、同時に1つ以上の遺伝子を研究することが可能になるんだ。
PXGSにおけるDscamスプライシングの検証
PXGSを利用する前に、Dscamのユニークなスプライシングが正しく機能するかどうかを検証することが重要だった。科学者たちは、Dscam遺伝子のパーツを新しいDNA構築物に挿入するテストを行った。特定のプロモーターを使って制御された発現を行う際に、スプライシングプロセスが保持されることを確認したかったんだ。結果は、期待通りにDscamの望ましいバリアントが生成されたことを確認したよ。
蛍光たんぱく質と遺伝子置換
研究者たちは、Dscamのフレームに異なる遺伝子を挿入する能力もテストしたんだ。特定のDscamエクソンを蛍光たんぱく質を生成する遺伝子と置き換えることで、細胞内でこれらのたんぱく質がどこでどのように発現するかを追跡できるようになった。最初のテストでは、エクソンを蛍光遺伝子と置き換えることができただけでなく、システムは正常に機能しており、Dscamの特定の配列がスプライシングに厳密に必要ではないことを示したんだ。
細胞内の多色発現
PXGSシステムは、単一の細胞タイプ内で複数の蛍光たんぱく質を同時に発現させることができるんだ。実験では、この設定が成功裏に4つの異なる色の蛍光たんぱく質を発現させ、特定の細胞を区別することができた。
この方法を神経細胞に適用したところ、研究者たちは蛍光が意図した神経細胞全体に広がっていることを見つけた。これにより、異なるたんぱく質の効果的な発現が示された。ただし、システムがうまく機能した一方で、複数のたんぱく質間に発現が分散するため、個々の色の明るさは予想よりも低かったんだ。
神経細胞以外でのPXGSの利用
Dscamは神経細胞だけでなく、さまざまな組織でも発現されるから、研究者たちは他の細胞タイプでもPXGSをテストしようとしたんだ。彼らは、さまざまな細胞で複数のフルオロフォアの発現を可能にするマルチカラーPXGS構築物を成功裏にデザインしたんだ。PXGSラインを異なるGal4ドライバーと交配することで、全組織にわたって神経細胞と非神経細胞の両方をラベル付けできたんだ。
組織機構における機能的発現
PXGSを使用する際の重要な部分は、大きくて機能的に重要な遺伝子を発現できるかどうかをテストすることだった。研究者たちは、多くの細胞表面受容体を選別し、PXGSフレームに組み込んで、特に感覚神経細胞内で誤表現させることにしたんだ。これにより、神経配線のパターンや、これらの受容体がどう相互作用するかをin vivoで研究できたんだ。
これらのテストの結果は、誤表現が軸索の成長や分岐パターンに明らかな変化をもたらしたことを示した。これらの知見は、特定の受容体が神経接続の発展や構造にどう影響を与えるかについての洞察を提供したんだ。
結論
ポリ遺伝子発現システム(PXGS)は、遺伝子発現とそれが生物システムに与える影響を研究するための有望な新しいアプローチを提供しているんだ。一緒に複数の遺伝子を発現させることで、研究者は細胞機能やたんぱく質相互作用、複雑な生物(例えばショウジョウバエ)の発達過程について深い洞察を得ることができる。この革新的な技術は、合成生物学や異なる種にわたる遺伝子発現研究のさまざまな応用に適応できる可能性を秘めているんだ。
タイトル: PXGS: a Poly-Transgene Expression System based on Mutually Exclusive Splicing of Dscam
概要: Biologists often need to investigate multiple genes simultaneously in an organism. However, it is currently not possible to express more than a few transgenes in an animal under conditional control. Here, we developed a technique based on the mutually exclusive splicing of the Down Syndrome Cell Adhesion Molecule1 (Dscam1) gene in Drosophila melanogaster to achieve simultaneous transgene expression of 12 genes at a time. We show that the hypervariable Dscam1 exon 4 region maintains its alternative splicing when placed in a UAS expression vector. Each of the twelve exon 4 alternates can be replaced with an exogenous gene of at least 10 kilobases and will express properly in vivo all under conditional genetic control. We demonstrate the expression of four different fluorophores placed in different exon 4 alternate positions in neural and non-neural cells in vivo. We validated the technique by rewiring Drosophila sensory neuron axons in vivo by simultaneously expressing several cell surface receptors within the neuron. This technology will also enable Drosophila melanogaster as a model system for synthetic biology research.
著者: Brian E Chen, R. Y. Yu, A. Bucio-Mendez
最終更新: 2024-10-27 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.27.620485
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.27.620485.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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