新しい方法でクライオET分析が強化された
科学者たちは、蛍光を使ってリアルタイムで指導することで、低温電子トモグラフィーを改善した。
Anthony V. Sica, Magda Zaoralová, Cali Antolini, Daan B. Boltje, Judit J. Penzes, Lilyana M. Malmqvist, Grant Jensen, Jason T. Kaelber, Peter Dahlberg
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低温電子トモグラフィー、略してCryo-ETは、細胞の中の小さな構造を凍らせたままで見るためのすごい技術なんだ。この方法は、細胞の内部の動きを見せてくれるけど、ちょっとした問題があって、超薄いサンプルでしか使えないんだ。厚いガラス越しに写真を見るようなもので、あんまり理想的じゃないよね?
この薄いサンプルの問題を解決するために、科学者たちはCryogenic Focused-Ion-Beam(Cryo-FIB)ミリングっていう方法を考えたんだ。これは、フォーカスされたイオンビームで細胞の部分を撃ち抜いて、約200ナノメートルの超薄いスライス、つまりラメラを作るんだ。ちょうど髪の毛の数本分くらいの厚さだよ!でも、まだ問題はある。
ターゲティングのジレンマ
この方法を使うとき、顕微鏡で見ているものとイオンビームをうまく合わせるのが難しいんだ。目隠ししてバスケットボールを打つみたいな感じだよ。科学者たちは、観察したい構造を強調するために、小さな光るビーズのような蛍光マーカーをよく使うんだけど、時々これらのマーカーが見たい構造を隠しちゃうこともあるんだ。
さらに、プロセスがめちゃくちゃになることもある。マーカーが完璧に整列していないと、エラーが出てしまうし、切ろうとしている間にサンプルが動いちゃうと、さらに難しくなる。だから、小さい構造や珍しい構造をターゲットにするのは、まるで干し草の中の針を探すような感じなんだ-干し草が細胞の複雑さってわけ。
スマートなアプローチ
もっといい方法があったらどうだろう?それがトライコインシデントシステムなんだ。この面白いセットアップを使うことで、科学者たちは光学、電子、イオン顕微鏡を合わせて、ミリングしながらリアルタイムで何をしてるか見えるようにできるんだ。映画を見ながらポップコーンをジャグリングするような感じだね。
ターゲットに近づくにつれて蛍光が薄くなるのを見ながら、ちょうどいい瞬間にミリングを止めることができるんだ。でも、ちょっと待って、これにも限界がある!構造がラメラの厚さと同じくらいの大きさだと、どうにもならないんだ。
干渉信号を送る
ここから面白くなってくるよ。もし科学者たちがミリングをガイドするために追加の信号を使えたらどうなる?彼らは、小さな水滴に混ぜた蛍光ビーズを使ったシステムを試すことにしたんだ。これらの水滴を凍らせて特別なグリッドに置いた。イオンビームで凍った水滴をミリングすると、蛍光の明るさに変な変化が見られたんだ。
ミリングが続くにつれて、明るさがジェットコースターのように上下するんだ。これは、サンプルの表面で光が反射するからなんだ。この明るさの変化を注意深く観察することで、科学者たちはターゲットの構造がどれくらい遠くに隠れているかを見つけられたんだ。
リアルタイムでの調整
ミリングをさらにスマートにするために、明るさの変化にモデルを当てはめて、正確な位置を特定する手助けをしたんだ。これで、もう盲目的な攻撃はなくなった;彼らはイオンビームをどこに集中させるか正確に決めることができるようになったんだ。材料によって予想される明るさと反射を知ることで、ミリングのターゲティングもさらに上手になった。
反射の強さはサンプルによって変わることもあるんだ。鏡も角度によって見え方が違うでしょ。だから、科学者たちはまずテストサンプルをミリングして完璧な設定を見つけてから、本物のターゲットに挑んでいったんだ。
テストする
この新しい方法がどれくらもうまくいくか見てみるために、チームはアデノ関連ウイルス(AAV)という超小さいウイルスをターゲットにすることにしたんだ。このウイルスは人間の遺伝子治療に使えるんだけど、遺伝子の小さな配達サービスみたいなもので、AAVが人間の細胞に入ると、たくさんのものをすり抜けなきゃいけないから、追いかけるのが難しいやつなんだ。
彼らのセットアップを使って、科学者たちは蛍光ラベルされたサンプルを通して、ウイルスに近づくにつれて振動がどう変わるかを観察したんだ。それらの変化をメモして、細胞内のウイルスクラスターの周りを切るようにミリングを調整したんだ。最終的には、細胞のゲルの海の中でウイルスが泳いでいるようなクールなトモグラフィー画像をキャッチすることに成功したんだ。
蛍光の波に乗る
彼らの頑張りのおかげで、科学者たちは蛍光マーカーのリアルタイム観察を使ってミリングを導くことができるようになったんだ。もう推測ゲームはおしまい!彼らはターゲットを見失うことなく、どこを切るべきかを正確に特定できるようになった。この方法は、以前は捉えにくかった小さな構造を観察する道を開いてくれる。まるで、微視的な世界をナビゲートするためのハイテクGPSを手に入れたようなものだね。
未来は明るい
この新しい技術で、可能性は無限大だよ。科学者たちは、余計なマーカーを使ったり、最適な切り口を見繕う必要がなくなって、小さい珍しい構造を細胞の中で研究できるようになったんだ。このアプローチは、生物学的システムの観察の新しい扉を開いてくれる。
そして、もしかしたら、いつかはAAVのようなウイルスがどのように働くのかリアルタイムで観察できるようになって、より良い遺伝子治療への洞察を得ることができるかもしれないね。だから、次に科学のことを考えるときは、目に見えないものを見る新しい方法を見つけ続けている賢い人たちがいることを思い出して!分子の世界がこんなに楽しいなんて、誰が思っただろうね?
タイトル: Optical Interference for the Guidance of Cryogenic Focused Ion Beam Milling Beyond the Axial Diffraction Limit
概要: Using a tri-coincident cryogenic FIB-SEM-LM system, we identify an interferometric optical response that can be used for targeting lamella production to fluorescently labelled structures with accuracy beyond the diffraction limit. We demonstrate the approach using synthetic samples of fluorescent beads embedded in micron-scale droplets of water. We then apply the approach to capture virions inside host cells. Successful targeting is confirmed by cryogenic electron tomography revealing clusters of virions in intracellular vesicles.
著者: Anthony V. Sica, Magda Zaoralová, Cali Antolini, Daan B. Boltje, Judit J. Penzes, Lilyana M. Malmqvist, Grant Jensen, Jason T. Kaelber, Peter Dahlberg
最終更新: 2024-11-03 00:00:00
言語: English
ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.01.621231
ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.11.01.621231.full.pdf
ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。
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