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# 生物学 # 遺伝学

トウモロコシの秘密:自然の遺伝子ゲートキーパー

トウモロコシがいらない遺伝子の混ざりをどう防ぐかを知ってみよう。

Elli Cryan, Garnet Phinney, Arun S. Seetharam, Matthew M.S. Evans, Elizabeth A. Kellogg, Junpeng Zhan, Blake C. Meyers, Daniel Kliebenstein, Jeffrey Ross-Ibarra

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トウモロコシの遺伝的な秘密 トウモロコシの遺伝的な秘密 が明らかにされた てみて。 トウモロコシが自分の系統を守る方法を探っ
目次

植物の世界では、生殖障壁が異なる種が遺伝子を混ぜるのを防ぐ重要な役割を果たしてるんだ。これらの障壁はナイトクラブのバウンサーみたいなもので、正しいタイプの花粉だけが正しいタイプの花に届くようにしてるよ。この中で、トウモロコシ(コーン)は、野生の親戚であるテオシンテとの混合を防ぐ魅力的なシステムを持ってるんだ。この防止が時間をかけて新しい種の創出につながることもあるんだよ。

生殖障壁の種類

生殖障壁は、大きく分けて2つのタイプに分類できる:受精前障壁と受精後障壁。受精前障壁は受精の前に働き、受精後障壁は花粉が卵巣に到達した後に機能する。一般的に、受精前障壁は種を分けるのにもっと効果的で、花粉が卵を受精させるチャンスすら与えないんだ。

受精前障壁

植物における興味深い受精前障壁は、花粉と雌の生殖器官の間で起きる。トウモロコシの場合、花粉とシルク(花の一部)の相互作用が受精が行われるかどうかを決めるんだ。これにより、異なるトウモロコシの集団間の遺伝子の流れが減少することがある。

受精後障壁

受精後障壁は受精後に働く。混血の不妊症みたいな問題を引き起こすことがあって、2つの異なる種から生まれた子孫が自分自身で繁殖できない可能性がある。ただ、これらの障壁は一般的に受精前障壁ほど遺伝子の流れを防ぐのには効果的ではないんだ。

トウモロコシの重要性

トウモロコシは、ただの夕食のおかずじゃないんだ。これは9000年以上前にメキシコで先住民によって家畜化された主要な作物なんだ。この作物は、テオシンテのような野生の親戚の影響を受けて、時間と共に大きな変化を遂げてきたよ。これらの野生の従兄弟たちは、私たちが今日見る現代的なトウモロコシの品種を作るのに一役買ってるんだ。

テオシンテの役割

トウモロコシの野生の祖先であるテオシンテは、トウモロコシ自体の進化を理解するためには欠かせないんだ。少なくとも2つの野生亜種が、今私たちがトウモロコシと呼んでいるものの起源に寄与しているんだ。中央アメリカの農民は、まだこれらの野生の親戚と一緒にトウモロコシを育てていて、彼らの歴史がどれほど絡み合っているかを示しているよ。

ゲノム要因

トウモロコシには、上で説明した生殖障壁を制御する特定の遺伝子のセットがあるんだ。3つの重要な遺伝子が「ゲノム要因」(GA)と呼ばれ、異なる位置にある:Tcb1、Ga1、Ga2。これらの遺伝子は、一方的な交配不適合性を引き起こすことで知られていて、一つの集団が別の集団の受精ができるけど、その逆はできないんだ。

Ga1遺伝子

Ga1遺伝子は、その類の中で最初に特定された遺伝子の一つで、「発見」は100年以上前に遡るんだ。この遺伝子は、トウモロコシとその親戚の間を隔てる障壁を制御する。シルク遺伝子が活性化すると、互換性のないトウモロコシの花粉がブロックされることがあるんだ。

Ga1の働き

Ga1遺伝子は、興味深いメカニズムを通じて働くんだ。花粉と相互作用するタンパク質を生成して、互換性のある花粉だけが成長して受精できるようにしてる。だから、互換性のない遺伝子を持つ花粉粒が活性シルクに出会うと、成長がうまくいかず、受精が失敗しちゃうんだ。

他のGA遺伝子の同定

Ga1遺伝子が理解された後、研究者たちは他のゲノム要因を特定することに進んだ。Tcb1とGa2は、Ga1と同様に機能することがわかったんだ。これらの遺伝子も、トウモロコシとテオシンテの集団の特異性を維持するのに役立つ生殖障壁に寄与することができるんだ。

ハプロタイプの多様性

これらのGA遺伝子を研究する際には、トウモロコシの中に多くの多様性、つまりハプロタイプの多様性があることに注意が必要だ。この遺伝子の存在や構造は、障壁がどれだけ効果的に維持されるかに影響を与えることがある。例えば、いくつかのトウモロコシ系統は、これらの遺伝子の活性型や不活性型のバージョンを持っていて、遺伝子流動のレベルが異なるんだ。

不活性なGa1アレル

面白いことに、一般的なGa1アレルの一形態であるga1-Oは、不活性だけど頻繁に見られるんだ。研究者たちは、このアレルが活性ゲノム要因の働きを抑制するかもしれないと考えていて、これが生殖障壁の機能に対する理解に一ひねりを加えてるんだ。

GA遺伝子の進化

これらのGA遺伝子の進化の歴史は複雑なんだ。これらの遺伝子は長い間存在していて、トウモロコシの家畜化よりも前からあったんだ。異なる植物のゲノムに存在することで、トウモロコシとその親戚との間の複雑な進化的圧力や相互作用を示唆しているんだ。

GA遺伝子とSiRNAの相互作用

ga1-Oアレルは、花粉の発達に関連する小さなRNAとも関連があるようなんだ。これらの小さなRNAは、どの遺伝子が発現するかを調整する役割を果たす可能性がある。場合によっては、ga1-Oアレルを持つ系統が活性Ga1アレルを持つものと比べて、RNAの発現パターンが異なることもあるんだよ。

結論

トウモロコシにおける生殖障壁の研究は、不要な遺伝子の混合を防ぎ、種の多様性を支える複雑な相互作用の網を明らかにしているんだ。これらの障壁がどのように機能し、進化するかを理解することは、植物生物学の科学だけでなく、農業や食料安全保障にも重要なんだ。だって、私たちが今日楽しむコーンコブの一つ一つは、数千年の進化と上手な管理の結果なんだから。次回コーンを食べるときは、そのおいしい一口がどうやってあなたの皿に届いたのか、複雑な歴史を思い出してみてね!

オリジナルソース

タイトル: Molecular evolution of a reproductive barrier in maize and related species

概要: Three cross-incompatibility loci each control a distinct reproductive barrier in both domesticated maize (Zea mays ssp. mays) and its wild teosinte relatives. These three loci, Teosinte crossing barrier1 (Tcb1), Gametophytic factor1 (Ga1), and Ga2, each play a key role in preventing hybridization between incompatible populations and are proposed to maintain the barrier between domesticated and wild subspecies. Each locus encodes both a silk-active and a matching pollen-active pectin methylesterase (PMEs). To investigate the diversity and molecular evolution of these gametophytic factor loci, we identified existing and improved models of the responsible genes in a new genome assembly of maize line P8860 that contains active versions of all three loci. We then examined fifty-two assembled genomes from seventeen species to classify haplotype diversity and identify sites under diversifying selection during the evolution of these genes. We show that Ga2, the oldest of these three loci, was duplicated to form Ga1 at least 12 million years ago. Tcb1, the youngest locus, arose as a duplicate of Ga1 before or around the time of diversification of the Zea genus. We find evidence of positive selection during evolution of the functional genes at an active site in the pollen-expressed PME and predicted surface sites in both the silk- and pollen-expressed PMEs. The most common allele at the Ga1 locus is a conserved ga1 allele (ga1-Off), which is specific haplotype containing three full-length PME gene copies, all of which are non-coding due to conserved stop codons and are between 610 thousand and 1.5 million years old. We show that the ga1-Off allele is associated with and likely generates 24-nt siRNAs in developing pollen-producing tissue, and these siRNAs map to functional Ga1 alleles. In previously-published crosses, the ga1-Off allele was associated with reduced function of the typically dominant functional alleles for the Ga1 and Tcb1 barriers. Taken together, this seems to be an example of a type of epigenetic trans-homolog silencing known as paramutation functioning at a locus controlling a reproductive barrier.

著者: Elli Cryan, Garnet Phinney, Arun S. Seetharam, Matthew M.S. Evans, Elizabeth A. Kellogg, Junpeng Zhan, Blake C. Meyers, Daniel Kliebenstein, Jeffrey Ross-Ibarra

最終更新: 2024-12-17 00:00:00

言語: English

ソースURL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.02.626474

ソースPDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.02.626474.full.pdf

ライセンス: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

変更点: この要約はAIの助けを借りて作成されており、不正確な場合があります。正確な情報については、ここにリンクされている元のソース文書を参照してください。

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