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# La biologia# Genetica

Il Ruolo della Dominanza nella Genetica

Capire la dominanza aiuta a spiegare come i tratti vengono ereditati e influenzano la forma fisica.

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La Dominanza è un’idea importante nella genetica. Aiuta a spiegare come le diverse versioni di un gene, chiamate allele, influenzino i tratti di un organismo. In genetica, un individuo può avere due allele differenti per un gene. Questi allele possono essere uguali, il che è chiamato Omozigote, o diversi, chiamato Eterozigote. Il modo in cui questi allele interagiscono può influenzare come certi tratti vengono trasmessi dai genitori alla prole.

Quando parliamo di dominanza, ci riferiamo spesso a come un particolare allele può mascherare l'effetto di un altro allele. Ad esempio, se un allele è dominante, determina il tratto che si manifesta, mentre un allele recessivo mostrerà il suo effetto solo se entrambe le copie del gene sono recessive. Questa idea di dominanza è importante per capire come vengono espressi i diversi tratti negli organismi e come le Mutazioni possano influenzare l'idoneità di un organismo.

Impatto della Dominanza sull'Idoneità

L'idoneità è un termine usato in biologia per descrivere quanto bene un organismo può sopravvivere e riprodursi nel suo ambiente. Nella genetica, l’effetto di idoneità di un genotipo eterozigote può essere confrontato con quello dei due genotipi omozigoti. A seconda della dominanza di una mutazione, il suo effetto sull'idoneità può variare notevolmente.

Quando una mutazione è completamente recessiva, non ha impatto sull'idoneità quando un individuo è eterozigote. Al contrario, quando la mutazione è additiva, il suo effetto su un genotipo eterozigote è esattamente a metà tra i due genotipi omozigoti. Questo significa che capire se le mutazioni sono recessive, additive o da qualche parte in mezzo è fondamentale per studiare la genetica evolutiva.

Il Ruolo della Dominanza negli Studi Evolutivi

Il concetto di dominanza è cruciale quando si studia come la dimensione della popolazione influisca sulle variazioni dannose e sulla depressione da consanguineità. Questo è importante perché il comportamento delle mutazioni dannose cambia a seconda che siano altamente recessive o parzialmente recessive. Ad esempio, se una mutazione è altamente recessiva, può comportarsi in modo molto diverso in una piccola popolazione rispetto a una più grande.

Molti studi si sono concentrati su come le popolazioni umane portano mutazioni dannose. I ricercatori hanno esaminato come la migrazione storica degli esseri umani fuori dall'Africa ha influenzato il livello di variazioni dannose trovate in diverse popolazioni. I risultati di questi studi suggeriscono che le popolazioni non africane potrebbero portare un carico maggiore di variazioni genetiche dannose a causa del collo di bottiglia che hanno vissuto durante la migrazione.

Parametri di Dominanza e Loro Misurazione

Nonostante l'importanza di capire la dominanza nella genetica, i ricercatori non hanno quantificato bene i parametri di dominanza negli esseri umani o in altri vertebrati. Ci sono poche stime disponibili, e quelle che esistono coprono solo piccole parti del genoma umano. Questa mancanza di informazioni complica la nostra conoscenza di come funziona la dominanza negli esseri umani.

In ambienti di laboratorio, gli scienziati hanno studiato la dominanza usando organismi modello come la mosca della frutta e i lieviti. Questi studi generalmente supportano l'idea che le mutazioni dannose siano spesso parzialmente recessive, ma evidenziano anche una significativa quantità di incertezze. Inoltre, i risultati degli studi di laboratorio controllati potrebbero non adattarsi bene alle popolazioni naturali, specialmente in organismi più complessi come gli esseri umani.

Stimare la Selezione e i Parametri di Dominanza

Un altro modo per stimare gli effetti della selezione e della dominanza è attraverso l'analisi dei modelli di variazione genetica. Un metodo comune coinvolge l'uso di un modello statistico per dedurre i parametri in base alle frequenze osservate degli allele in una popolazione. Tuttavia, questo può diventare complicato quando la distribuzione degli effetti di idoneità per le nuove mutazioni è sconosciuta.

Molti studi hanno ignorato del tutto i parametri di dominanza o hanno presunto che tutte le mutazioni siano additive. Questo è un errore significativo, poiché ricerche recenti suggeriscono che assumere un singolo valore per la dominanza in tutte le mutazioni potrebbe non essere accurato. Alcuni ricercatori hanno tentato di adattare modelli che tengano conto degli effetti non additivi, ma questi studi hanno affrontato sfide nel identificare chiaramente la relazione tra la dominanza e i coefficienti di selezione.

L'Approccio dell'Arabidopsis

Per cercare di capire meglio la dominanza, i ricercatori hanno esaminato le popolazioni di Arabidopsis, un organismo modello vegetale. Utilizzando sia popolazioni autofecondanti che incrociate, hanno ottenuto intuizioni sui parametri di dominanza. Le popolazioni autofecondanti forniscono informazioni sulla selezione, mentre le popolazioni incrociate fanno luce su come le mutazioni si comportano in uno stato eterozigote.

Questi studi hanno trovato evidenze di una relazione tra dominanza e gravità della mutazione. Le mutazioni più dannose tendono a essere più recessive, con alcune che mostrano addirittura che le mutazioni moderatamente dannose possono essere altamente recessive. Queste intuizioni contrastano con i risultati di altri organismi e sottolineano il potenziale affinché i parametri di dominanza differiscano significativamente tra le specie.

Investigare la Dominanza negli Umani

Per capire meglio la dominanza negli esseri umani, gli scienziati hanno iniziato a esaminare quanto bene diversi modelli di dominanza si adattano ai modelli di variazione genetica nelle popolazioni umane. Poiché è difficile separare gli effetti di selezione e dominanza basandosi solo sui dati genetici, i ricercatori hanno vincolato i loro modelli per riflettere scenari di dominanza realistica.

Le loro analisi hanno mostrato che una gamma di modelli di dominanza può adattarsi ai dati di variazione genetica umana. Alcuni modelli suggeriscono una connessione tra allele dominanti e mutazioni deleterie, il che potrebbe avere importanti implicazioni per comprendere la diversità genetica umana e la storia della nostra specie.

Conseguenze Evolutive della Dominanza

Le implicazioni di questi risultati si estendono oltre gli esseri umani. Nelle specie non umane, in particolare quelle a rischio di estinzione, comprendere la dominanza e il suo ruolo nelle variazioni deleterie può aiutare a prevedere la vitalità delle popolazioni. Molti studi hanno già iniziato a esplorare come gli effetti delle variazioni genetiche recessive possano impattare la sopravvivenza di popolazioni piccole e isolate.

Ad esempio, i ricercatori hanno scoperto che i cambiamenti nelle dimensioni storiche della popolazione possono influenzare significativamente i rischi di estinzione, specialmente quando sono presenti allele dannosi altamente recessivi. Questo campo di ricerca è cruciale poiché può contribuire agli sforzi di conservazione per le specie in pericolo.

Simulare la Variazione Genetica e il Carico

Gli scienziati hanno condotto simulazioni per comprendere meglio come diversi modelli di dominanza influenzino il carico di variazioni deleterie nelle popolazioni umane. Queste simulazioni possono fornire intuizioni su come vari modelli di variazione genetica e dominanza influenzino la salute e l'idoneità complessiva delle popolazioni.

Nelle loro simulazioni, i ricercatori hanno scoperto che il carico delle variazioni genetiche dannose potrebbe variare in base al modello di dominanza utilizzato. Ad esempio, alcuni modelli indicavano che le popolazioni non africane potrebbero avere un carico genetico leggermente più alto, mentre altri suggerivano potenziali benefici in certe condizioni.

Conclusione

In sintesi, la dominanza gioca un ruolo vitale nella genetica e nella biologia evolutiva, influenzando come i tratti vengono espressi e come le popolazioni si adattano ai loro ambienti. Anche se sono stati fatti molti progressi nella comprensione della dominanza e delle sue implicazioni, rimangono sfide, in particolare nella misurazione dei parametri di dominanza negli esseri umani e in altri vertebrati.

La ricerca continua in quest'area può aiutare a chiarire i meccanismi attraverso cui la dominanza influisce sulla variazione genetica, sulla dinamica delle popolazioni e persino sugli sforzi di conservazione delle specie. Man mano che impariamo di più sulle complesse relazioni tra dominanza, mutazione e idoneità, possiamo ottenere una comprensione più profonda dei processi evolutivi che plasmano la diversità della vita sulla Terra.

Fonte originale

Titolo: Constraining models of dominance for nonsynonymous mutations in the human genome

Estratto: Dominance is a fundamental parameter in genetics, determining the dynamics of natural selection on deleterious and beneficial mutations, the patterns of genetic variation in natural populations, and the severity of inbreeding depression in a population. Despite this importance, dominance parameters remain poorly known, particularly in humans or other non-model organisms. A key reason for this lack of information about dominance is that it is extremely challenging to disentangle the selection coefficient (s) of a mutation from its dominance coefficient (h). Here, we explore dominance and selection parameters in humans by fitting models to the site frequency spectrum (SFS) for nonsynonymous mutations. When assuming a single dominance coefficient for all nonsynonymous mutations, we find that numerous h values can fit the data, so long as h is greater than [~]0.15. Moreover, we also observe that theoretically-predicted models with a negative relationship between h and s can also fit the data well, including models with h=0.05 for strongly deleterious mutations. Finally, we use our estimated dominance and selection parameters to inform simulations revisiting the question of whether the out-of-Africa bottleneck has led to differences in genetic load between African and non-African human populations. These simulations suggest that the relative burden of genetic load in non-African populations depends on the dominance model assumed, with slight increases for more weakly recessive models and slight decreases shown for more strongly recessive models. Moreover, these results also demonstrate that models of partially recessive nonsynonymous mutations can explain the observed severity of inbreeding depression in humans, bridging the gap between molecular population genetics and direct measures of fitness in humans. Our work represents a comprehensive assessment of dominance and deleterious variation in humans, with implications for parameterizing models of deleterious variation in humans and other mammalian species. Author SummaryThe dominance coefficient (h) of a mutation determines its impact on organismal fitness when heterozygous. For instance, fully recessive mutations (h=0) have no effects on fitness when heterozygous whereas additive mutations (h=0.5) have an effect that is intermediate to the two heterozygous mutations. The extent to which deleterious mutations may be recessive, additive, or dominant is a key area of study in evolutionary genetics. However, dominance parameters remain poorly known in humans and most other organisms due to a variety of technical challenges. In this study, we aim to constrain the possible set of dominance and selection parameters for amino acid changing mutations in humans. We find that a wide range of models are possible, including models with a theoretically-predicted relationship between h and s. We then use a range of plausible selection and dominance models to explore how deleterious variation may have been shaped by the out-of-Africa bottleneck in humans. Our results highlight the subtle influence of dominance on patterns of genetic load in humans and demonstrate that models of partially recessive mutations at amino-acid-changing sites can explain the observed effects of inbreeding on mortality in humans.

Autori: Kirk E Lohmueller, C. C. Kyriazis

Ultimo aggiornamento: 2024-02-26 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.25.582010

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.25.582010.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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