Migliorare la salute della comunità tramite il monitoraggio delle acque reflue
Test innovativi sulle acque reflue rivelano informazioni sui rischi per la salute della comunità.
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Indice
- Espandere il monitoraggio delle acque reflue
- Sviluppo di uno strumento per la rilevazione multipla dei patogeni
- Processo di raccolta dei campioni
- Metodologia per l'elaborazione dei campioni
- Analisi molecolare dei campioni estratti
- Analisi dei dati e risultati
- Importanza della sensibilità e accuratezza
- Direzioni future nel monitoraggio delle acque reflue
- Conclusione
- Fonte originale
- Link di riferimento
L'Epidemiologia basata sulle acque reflue (WBE) è un metodo usato per tenere d'occhio la salute delle comunità analizzando le acque reflue che producono. Questa tecnica aiuta i funzionari della Salute Pubblica a ottenere informazioni tempestive sulla presenza di virus, batteri e altri Patogeni in una popolazione. Aggiunge intuizioni preziose che i metodi tradizionali di Sorveglianza sanitaria possono perdere. Storicamente, questo metodo è stato utilizzato per vari patogeni, tra cui quelli che causano polio, epatite A, colera e febbre tifoide. Negli ultimi anni, la WBE ha guadagnato importanza nel monitorare la diffusione di SARS-CoV-2, il virus responsabile del COVID-19. Analizzando le acque reflue, i ricercatori possono capire quanto è diffuso il COVID-19 nelle comunità e osservare tendenze nel tempo, aiutando a informare le risposte di sanità pubblica.
Espandere il monitoraggio delle acque reflue
C'è un bisogno crescente di ampliare il monitoraggio delle acque reflue per includere molti patogeni e varianti. Questo permetterebbe di avere un quadro più completo dei rischi per la salute in una popolazione. Nuovi metodi per rilevare più patogeni contemporaneamente potrebbero portare a risultati rapidi e precisi. Con le malattie infettive che continuano a rappresentare rischi, migliorare la sorveglianza attraverso le acque reflue può colmare importanti lacune nei dati e supportare iniziative di salute pubblica.
Sviluppo di uno strumento per la rilevazione multipla dei patogeni
Per migliorare la sorveglianza delle acque reflue, è stato sviluppato uno strumento personalizzato per rilevare e quantificare 33 patogeni comuni, che includono batteri, virus, protozoi e elminti. Questo nuovo approccio mira a espandere le capacità attuali della WBE e può aiutare a identificare sia patogeni rari che emergenti nella comunità. È stato condotto uno studio di caso ad Atlanta, in Georgia, utilizzando campioni provenienti da quattro impianti di trattamento delle acque reflue.
Processo di raccolta dei campioni
Campioni di acque reflue sono stati raccolti da quattro impianti di trattamento di Atlanta per diversi mesi. Questi campioni sono stati mantenuti freddi durante il trasporto e conservati in un congelatore fino a quando non erano pronti per l'analisi. Quando è iniziato il processo di elaborazione, ogni campione è stato scongelato e sono state registrate informazioni importanti come temperatura e pH. Una piccola quantità di ciascun campione è stata messa da parte per misurare i solidi nell'acqua. Inoltre, è stata aggiunta ai campioni una speciale vaccinazione e materiali di controllo per garantire che il processo di test funzionasse correttamente.
Sono stati utilizzati metodi diversi per elaborare i campioni al fine di trovare il modo più efficace per rilevare i patogeni. Questi metodi includevano estrazione diretta, utilizzo di una pipetta concentratrice speciale e una tecnica chiamata flocculazione con latte scremato, in cui il latte scremato veniva aggiunto alle acque reflue per aiutare a catturare i patogeni.
Metodologia per l'elaborazione dei campioni
Estrazione diretta
Nel metodo di estrazione diretta, una piccola porzione delle acque reflue è stata lavorata utilizzando un kit speciale progettato per estrarre il materiale genetico dai patogeni presenti.
Metodo della pipetta concentratrice
Nel metodo della pipetta concentratrice, è stata prelevata una porzione più grande del campione di acque reflue e centrifugata. Questo processo ha aiutato a separare i patogeni dall'acqua. Poi, il campione è stato filtrato usando una pipetta speciale per concentrare i patogeni per una rilevazione più facile.
Metodo della flocculazione con latte scremato
Durante il metodo della flocculazione con latte scremato, il latte scremato è stato mescolato con le acque reflue e il pH è stato regolato. La miscela è stata agitata per aiutare i patogeni ad attaccarsi insieme. Dopo l'agitazione, il campione è stato centrifugato. Il liquido è stato rimosso e il materiale solido rimanente, che conteneva i patogeni, è stato congelato per test successivi.
Analisi molecolare dei campioni estratti
Una volta elaborati i campioni, sono stati effettuati test molecolari per analizzare i materiali estratti. Sono state utilizzate due piattaforme principali di test: una per PCR quantitativa (qPCR) e l'altra per PCR digitale (dPCR). Questi test hanno permesso ai ricercatori di identificare la presenza di patogeni specifici e misurare le loro concentrazioni all'interno dei campioni di acque reflue.
È stata utilizzata una scheda speciale con test predeterminati per 33 patogeni nel processo di qPCR. Ogni patogeno che ha dato esito positivo è stato confermato con segnali chiari sulla lettura del test. La dPCR è stata utilizzata per la rilevazione di ulteriori patogeni, focalizzandosi su virus e marcatori particolari.
Analisi dei dati e risultati
Tutti i dati raccolti durante lo studio sono stati analizzati per determinare la presenza e la concentrazione di vari patogeni. L'Escherichia coli enterotossigenico (ETEC) e l'Escherichia coli enteropatogenico (EPEC) sono stati tra i batteri più frequentemente rilevati, mentre diversi protozoi, tra cui Acanthamoeba e Giardia, sono stati trovati comunemente. Tra le rilevazioni virali c'erano norovirus e astrovirus. Alcuni risultati interessanti includevano rilevazioni rare di altri patogeni, come Strongyloides stercoralis, così come RNA di SARS-CoV-2 in circa metà dei campioni testati.
La normalizzazione dei dati è stata effettuata utilizzando marcatori genetici specifici per garantire confronti accurati tra diversi campioni. L'analisi ha rivelato concentrazioni significative di patogeni nelle acque reflue, fornendo importanti intuizioni sulle tendenze della salute pubblica nella comunità.
Importanza della sensibilità e accuratezza
La capacità di rilevare un'ampia gamma di patogeni utilizzando un singolo metodo è essenziale per un'efficace sorveglianza della salute pubblica. Il test delle acque reflue utilizzando la rilevazione multipla dei patogeni offre una visione completa del panorama microbico nella comunità. Questo può aiutare a identificare potenziali focolai e tendenze, guidando le risposte sanitarie.
È fondamentale riconoscere i limiti dei metodi attuali, come le sfide nel trattare campioni di acque reflue archiviate o nel determinare i tassi di escrezione fecale per vari patogeni. Tuttavia, i progressi nella WBE possono portare a risposte più rapide alle minacce per la salute pubblica e migliorare la comprensione delle dinamiche dei patogeni.
Direzioni future nel monitoraggio delle acque reflue
La crescente consapevolezza dei benefici del monitoraggio delle acque reflue ha portato a un maggior interesse nell'espandere questi metodi a livello nazionale e internazionale. La possibilità di testare più patogeni, tra cui virus respiratori, offre una via per sforzi di sorveglianza più completi.
Una corretta implementazione di questi metodi può aiutare a catturare i dati prima, potenzialmente indicando l'inizio di un focolaio prima che i sintomi compaiano nella popolazione. Questo approccio proattivo può supportare decisioni e interventi di salute pubblica migliori.
Conclusione
L'epidemiologia basata sulle acque reflue è uno strumento promettente per capire le preoccupazioni di salute pubblica nelle comunità. La capacità di testare più patogeni contemporaneamente nelle acque reflue può migliorare notevolmente le strategie di monitoraggio e risposta. Lo sviluppo continuo e il perfezionamento di questi metodi saranno cruciali mentre ci sforziamo di mantenere le comunità al sicuro dalle malattie infettive. Con la ricerca e il coinvolgimento continui, il monitoraggio delle acque reflue può svolgere un ruolo vitale nella sorveglianza e risposta della salute pubblica.
Titolo: Simultaneous detection and quantification of multiple pathogen targets in wastewater
Estratto: Wastewater-based epidemiology has emerged as a critical tool for public health surveillance, building on decades of environmental surveillance work for pathogens such as poliovirus. Work to date has been limited to monitoring a single pathogen or small numbers of pathogens in targeted studies; however, few studies consider simultaneous quantitative analysis of a wide variety of pathogens, which could greatly increase the utility of wastewater surveillance. We developed a novel quantitative multi-pathogen surveillance approach (35 pathogen targets including bacteria, viruses, protozoa, and helminths) using TaqMan Array Cards (TAC) and applied the method on concentrated wastewater samples collected at four wastewater treatment plants in Atlanta, GA from February to October of 2020. From sewersheds serving approximately 2 million people, we detected a wide range of targets including many we expected to find in wastewater (e.g., enterotoxigenic E. coli and Giardia in 97% of 29 samples at stable concentrations) as well as unexpected targets including Strongyloides stercoralis (a human threadworm rarely observed in the USA). Other notable detections included SARS-CoV-2, but also several pathogen targets that are not commonly included in wastewater surveillance like Acanthamoeba spp., Balantidium coli, Entamoeba histolytica, astrovirus, norovirus, and sapovirus. Our data suggest broad utility in expanding the scope of enteric pathogen surveillance in wastewaters, with potential for application in a variety of settings where pathogen quantification in fecal waste streams can inform public health surveillance and selection of control measures to limit infections.
Autori: Joe Brown, G. Rao, D. Capone, K. Zhu, A. Knoble, Y. Linden, R. Clark, A. Lai, J. Kim, C.-H. Huang, A. Bivins
Ultimo aggiornamento: 2023-12-05 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.23.23291792
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.23.23291792.full.pdf
Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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