Come l'acetilazione influisce sul ripiegamento delle proteine nelle cellule
Esplorando il ruolo dell'acetilazione nella funzione di Ydj1 e nel ripiegamento delle proteine.
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Indice
- Ruolo delle Chaperoni Molecolari
- Struttura di Ydj1
- Importanza dell'Acetilazione
- Impatto dell'Acetilazione sulla Funzione
- Acetilazione e Risposta allo Stress
- Collegamenti con la Traduzione delle Proteine
- L'Acetilazione Influisce sulle Interazioni
- Riepilogo dei Risultati
- Implicazioni per la Salute Cellulare
- Direzioni Future
- Conclusione
- Fonte originale
- Link di riferimento
Le cellule sono posti super attivi pieni di proteine che devono essere piegate correttamente per funzionare bene. A volte, le nuove proteine faticano a prendere la forma giusta a causa di tutto il movimento intorno a loro. Le chaperoni molecolari sono proteine helper che aiutano in questo processo fondamentale. Una chaperone ben nota è Ydj1, che gioca un ruolo chiave nell'aiutare le altre proteine a piegarsi correttamente e a mantenere la loro funzionalità.
Ydj1 collabora con altre chaperoni, in particolare Hsp70, per garantire che le proteine siano assemblate correttamente. Tuttavia, la funzione di Ydj1 può essere influenzata da vari cambiamenti chimici, come l'aggiunta di un gruppo acetile a specifiche parti della proteina. Questi cambiamenti possono influenzare quanto bene Ydj1 interagisce con i suoi partner e aiuta nella piegatura delle proteine.
Questo articolo esplora come l'aggiunta di gruppi acetile a Ydj1 influisce sulla sua funzione e come ciò sia collegato alla salute complessiva della cellula.
Ruolo delle Chaperoni Molecolari
Le chaperoni molecolari sono essenziali per mantenere la salute delle cellule. Aiutano a controllare la forma delle proteine, assicurando che svolgano i loro compiti in modo efficace. Ydj1 è una di queste chaperoni e ha una struttura specifica che le permette di interagire con altre proteine. È cruciale per la corretta piegatura delle proteine appena create ed è coinvolta nella gestione di situazioni di Stress come alte temperature o certi tipi di danno.
Ydj1 aiuta nell'assemblaggio dei complessi proteici interagendo con le chaperoni Hsp70, che sono responsabili del riconoscimento e del legame con le nuove proteine mentre vengono prodotte. Un gruppo di proteine helper note come co-chaperoni lavora con Ydj1 e Hsp70 per migliorare l'efficienza di questo processo di piegatura delle proteine.
Struttura di Ydj1
Ydj1 è composto da diverse aree importanti, ognuna con uno scopo specifico. Il dominio J, situato nella parte anteriore di Ydj1, è fondamentale per attivare la funzione della chaperone Hsp70. Questo dominio contiene una sequenza specifica necessaria per permettere a Ydj1 di legarsi efficacemente a Hsp70. Altre aree di Ydj1 sono coinvolte nel legame con le proteine client, il che aiuta queste ultime a raggiungere la loro struttura corretta.
In totale, Ydj1 ha sei importanti regioni funzionali. Le alterazioni a queste regioni, soprattutto attraverso cambiamenti chimici, possono influenzare quanto bene Ydj1 interagisce con altre proteine e svolge il suo ruolo nella cellula.
Acetilazione
Importanza dell'L'acetilazione è un processo in cui un gruppo acetile viene aggiunto a una proteina. Questo cambiamento può influenzare varie proprietà della proteina, inclusa la sua stabilità e le interazioni con altre molecole. Ydj1 ha diversi siti dove può avvenire l'acetilazione, specialmente all'interno del suo dominio J.
Le ricerche mostrano che modificare Ydj1 attraverso l'acetilazione può influenzare come interagisce con Hsp70 e altre proteine. Queste modifiche suggeriscono che l'acetilazione può giocare un ruolo fondamentale nel modo in cui Ydj1 gestisce la piegatura delle proteine in diverse condizioni, come lo stress.
Impatto dell'Acetilazione sulla Funzione
Gli scienziati hanno studiato come l'acetilazione influisce sulla capacità di Ydj1 di supportare la funzione cellulare durante situazioni stressanti. Creando diverse versioni di Ydj1 con specifici residui di lisina mutati, i ricercatori hanno analizzato quanto bene queste proteine modificate potessero svolgere i loro ruoli.
Gli esperimenti hanno mostrato che prevenire l'acetilazione non ha influenzato significativamente la funzione di Ydj1. Al contrario, imitare l'acetilazione cambiando certe lisine in glutamine ha portato a problemi evidenti con la crescita e la resistenza allo stress nelle cellule di lievito.
In particolare, le mutazioni che imitano l'acetilazione in certe posizioni di Ydj1 hanno ostacolato gravemente la funzione della proteina, in particolare durante lo stress da alta temperatura. Questo risultato suggerisce che l'acetilazione agisce come un regolatore critico del ruolo di Ydj1 nella piegatura delle proteine e nella salute complessiva della cellula.
Acetilazione e Risposta allo Stress
Studi globali hanno identificato numerosi siti di acetilazione su Ydj1, principalmente situati nel dominio J, un'area cruciale per la sua interazione con Hsp70. Esaminando quali siti erano conservati tra diverse specie e come influenzano la capacità di Ydj1 di rispondere allo stress, i ricercatori hanno determinato che certe mutazioni possono sia imitare che prevenire l'acetilazione.
In particolare, le mutazioni che prevengono l'acetilazione hanno permesso a Ydj1 di funzionare in modo simile al tipo selvatico in condizioni stressanti. Tuttavia, le mutazioni che imitavano l'acetilazione hanno fatto perdere a Ydj1 la sua capacità di aiutare le cellule a rispondere allo stress, soprattutto durante alte temperature o in presenza di agenti dannosi.
Collegamenti con la Traduzione delle Proteine
È interessante notare che molte proteine che interagiscono con Ydj1 sono collegate alla traduzione delle proteine, un processo essenziale nelle cellule dove le proteine vengono create. Ydj1 sembra avere un ruolo nell'assistere l'assemblaggio dei ribosomi, che sono le strutture dove le proteine vengono sintetizzate.
Le ricerche hanno mostrato che quando le cellule di lievito mancano di Ydj1 o esprimono mutanti che imitano l'acetilazione, questo interrompe gravemente la traduzione delle proteine. Questa interruzione suggerisce una connessione significativa tra la funzione di Ydj1 e il processo in cui le proteine vengono create nella cellula.
L'Acetilazione Influisce sulle Interazioni
Gli studi hanno ulteriormente esplorato come l'acetilazione influisce sulla capacità di Ydj1 di interagire con altre proteine. Analizzando le interazioni proteiche, i ricercatori hanno scoperto che una parte significativa dei partner di Ydj1 poteva essere influenzata dal fatto che Ydj1 fosse acetilato.
I risultati hanno indicato che alcune interazioni si rafforzavano quando Ydj1 era nella sua forma acetilata, mentre altre si indebolivano. Ad esempio, l'interazione tra Ydj1 e Hsp70 era notevolmente compromessa quando Ydj1 era acetilato, il che ostacolava la capacità di Ydj1 di aiutare nella piegatura delle proteine.
Riepilogo dei Risultati
La ricerca ha evidenziato l'intricato rapporto tra Ydj1, acetilazione e piegatura delle proteine. È diventato chiaro che l'acetilazione in siti specifici su Ydj1 potrebbe alterare la sua funzione e le interazioni con altre proteine.
Prevenire l'acetilazione ha permesso a Ydj1 di svolgere adeguatamente i suoi compiti, mentre imitare l'acetilazione ha causato una serie di problemi, inclusa la sensibilità allo stress e interferenze con processi cellulari vitali come la traduzione delle proteine.
Implicazioni per la Salute Cellulare
Questi risultati hanno implicazioni per comprendere come le cellule mantengano la loro salute e rispondano agli stress. La capacità di Ydj1 di assistere nella piegatura delle proteine, specialmente in condizioni difficili, è critica per la sopravvivenza cellulare.
L'acetilazione funge da meccanismo regolatorio che influenza le interazioni e le funzioni di Ydj1. Comprendere questa modulazione fornisce approfondimenti su processi più ampi di gestione delle proteine all'interno delle cellule, specialmente in situazioni in cui lo stress può avere effetti dannosi.
Direzioni Future
In futuro, saranno necessari ulteriori studi per comprendere completamente le complessità dell'acetilazione di Ydj1 e il suo ruolo nel contesto più ampio della cellula. Identificare ulteriori siti di modifica, esplorare gli enzimi responsabili della regolazione di questi cambiamenti e esaminare gli effetti di queste modifiche in tempo reale contribuirà a un quadro più completo della gestione delle proteine nelle cellule.
Inoltre, esaminare come processi simili potrebbero funzionare in altri organismi potrebbe offrire ulteriori approfondimenti sul significato evolutivo della regolazione delle chaperoni e della piegatura delle proteine. La ricerca in corso sul "Codice delle Chaperoni" aiuterà a chiarire come diverse modifiche influenzano la funzione delle chaperoni e la salute cellulare.
Conclusione
In conclusione, questa ricerca sottolinea il ruolo cruciale dell'acetilazione nella regolazione della funzione di Ydj1 come chaperone molecolare. Moderando le interazioni e assistendo nella piegatura delle proteine, Ydj1 gioca un ruolo vitale nel mantenere la funzione cellulare durante varie condizioni di stress. Comprendere come l'acetilazione influisce su Ydj1 apre nuove strade per esplorare i processi intricati della regolazione cellulare e delle risposte allo stress.
Titolo: Acetylation of the yeast Hsp40 chaperone protein Ydj1 fine-tunes proteostasis and translational fidelity
Estratto: Proteostasis, the maintenance of cellular protein balance, is essential for cell viability and is highly conserved across all organisms. Newly synthesized proteins, or "clients," undergo sequential processing by Hsp40, Hsp70, and Hsp90 chaperones to achieve proper folding and functionality. Despite extensive characterization of post-translational modifications (PTMs) on Hsp70 and Hsp90, the modifications on Hsp40 remain less understood. This study aims to elucidate the role of lysine acetylation on the yeast Hsp40, Ydj1. By mutating acetylation sites on Ydj1s J-domain to either abolish or mimic constitutive acetylation, we observed that preventing acetylation had no noticeable phenotypic impact, whereas acetyl-mimic mutants exhibited various defects indicative of impaired Ydj1 function. Proteomic analysis revealed several Ydj1 interactions affected by J-domain acetylation, notably with proteins involved in translation. Further investigation uncovered a novel role for Ydj1 acetylation in stabilizing ribosomal subunits and ensuring translational fidelity. Our data suggest that acetylation may facilitate the transfer of Ydj1 between Ssa1 and Hsp82. Collectively, this work highlights the critical role of Ydj1 acetylation in proteostasis and translational fidelity. Author SummaryCells require a suite of chaperone and co-chaperone proteins to maintain a healthy balance of functional proteins. A large number of modifications on chaperone and co-chaperone proteins have been identified, but their functional importance has not been fully explored. In this study, we identify acetylation sites on the yeast co-chaperone Ydj1 that impact its interactions with major chaperones and client proteins including those involved in protein synthesis. This work sheds light on how modifications on co-chaperones can also play an important role in the health of the proteome.
Autori: Andrew William Truman, S. Omkar, C. Shrader, J. R. Hoskins, J. T. Kline, M. M. Mitchem, Nitika, L. Fornelli, S. Wickner
Ultimo aggiornamento: 2024-06-14 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.598777
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.598777.full.pdf
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