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# Scienze della salute# Epidemiologia

Tecniche di Machine Learning nella diagnosi del COVID-19

Analizzare i sintomi dei pazienti tramite machine learning per migliorare le diagnosi di COVID-19.

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COVID-19, conosciuto anche come Coronavirus Disease 2019, è causato da un virus chiamato SARS-CoV-2. I primi casi sono stati segnalati a Wuhan, in Cina, alla fine del 2019. Nel marzo 2020, l'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS) l'ha riconosciuto come una pandemia globale. Questo virus si diffonde facilmente tra le persone e può cambiare, portando a nuove varianti. Questi cambiamenti e il modo in cui il virus si diffonde hanno portato a ripetute ondate di infezioni in tutto il mondo.

Per ridurre il numero di persone che si ammalano, i test sono diventati fondamentali, soprattutto per chi mostrava Sintomi o aveva contatti con persone infette. Quando i test non erano disponibili, i medici si basavano sui pazienti per descrivere i loro sintomi per comprendere la loro condizione. Analizzare questi segni e sintomi è essenziale per fare Diagnosi rapide e accurate, che possono portare a trattamenti migliori.

Machine Learning in Sanità

Il Machine Learning (ML) è una parte dell'Intelligenza Artificiale (AI) che viene utilizzata in sanità fin dagli anni '50. Il suo ruolo è cresciuto significativamente grazie alla raccolta digitale dei dati dei pazienti. Il ML è riconosciuto per il suo potenziale di portare nuove idee in sanità analizzando grandi quantità di dati diversi in molto meno tempo di quanto possano fare le persone.

Tuttavia, alcuni sistemi di ML sono complessi e difficili da interpretare per i professionisti della salute. Questa complessità può rendere difficile per loro fidarsi dei risultati prodotti da questi sistemi.

Obiettivi dello Studio

L'obiettivo principale di questo studio era esaminare i metodi e i modelli di ML per diagnosticare COVID-19 basandosi solo sui sintomi dei pazienti. Mira ad assistere i fornitori di salute durante i focolai. Gli obiettivi specifici sono:

  1. Valutare quanto siano efficaci le tecniche di ML nella diagnosi di COVID-19, specialmente durante le diverse ondate di contagio.
  2. Migliorare la chiarezza delle diagnosi di COVID-19 per aiutare i fornitori di salute a decidere il miglior trattamento.
  3. Identificare i sintomi più comuni durante le varie ondate di infezioni.
  4. Analizzare come i sintomi variano tra le diverse ondate di COVID-19.

Studi Correlati

Studi precedenti hanno utilizzato vari metodi per costruire strumenti per diagnosticare COVID-19. Ad esempio, uno studio in Giordania ha creato uno strumento diagnostico usando tecniche di ML, raggiungendo oltre il 90% di accuratezza. Un altro studio in Inghilterra ha analizzato i dati di oltre un milione di partecipanti per valutare i tassi di infezione. Concentrandosi su sintomi e risultati dei test, questi studi hanno scoperto che alcuni sintomi erano indicatori più affidabili di COVID-19.

Mentre molti studi hanno utilizzato il ML per aiutare nella diagnosi di COVID-19, questa ricerca si differenzia concentrandosi su come i sintomi cambiano nel tempo e su come i diversi test influenzano i risultati. Lo studio sottolinea anche l'importanza di dati equilibrati, assicurando che i risultati non siano distorti da un lato.

Metodologia

La ricerca ha coinvolto diversi passaggi per analizzare i dati in modo efficace. Il primo passo è stato raccogliere dati sui sintomi e sui risultati dei test dei pazienti dai sistemi sanitari o da moduli online. Successivamente, è iniziata una fase di pre-elaborazione dei dati, in cui le informazioni raccolte sono state organizzate e sono stati affrontati i dati mancanti o gli outliers. I dati sono stati poi raggruppati in base alle diverse ondate di infezione.

Una volta preparati i dati, sono stati testati vari algoritmi di ML per vedere quanto bene potessero prevedere COVID-19 in base ai sintomi identificati. Cinque algoritmi sono stati selezionati per questo scopo: Random Forest, Multi-Layer Perceptron, XGBoost, Logistic Regression e un metodo chiamato Shapley Additive Explanation per comprendere i risultati del modello.

Panoramica dei Risultati

Lo studio si è concentrato su una struttura sanitaria a Rio de Janeiro, dove sono stati analizzati i dati dei pazienti diagnosticati con COVID-19. La ricerca mirava a valutare come vari sintomi riportati dai pazienti siano cambiati durante le diverse ondate della pandemia. I sintomi sono stati raggruppati e analizzati per creare un quadro più chiaro di quali segni potessero indicare un'infezione.

Dopo un'analisi dettagliata, sono emersi diversi sintomi come influenti durante ogni ondata. Ad esempio, sintomi come febbre e tosse erano costantemente importanti, ma altri sintomi come la congestione nasale sono diventati più rilevanti nelle ondate successive.

Analisi dei Dati e Risultati

Lo studio ha diviso i dati in vari gruppi basati su diverse ondate e tipi di test. Questo ha permesso una migliore comprensione di come i sintomi si presentassero durante ogni ondata e di quanto fossero efficaci i diversi metodi di test.

Durante l'analisi, è stato scoperto che l'algoritmo Random Forest ha superato gli altri in molti scenari. Le performance sono state misurate utilizzando vari metriche, inclusa l'accuratezza, la sensibilità e la specificità, che mostrano quanto bene i modelli identificassero i casi positivi e negativi di COVID-19.

In generale, i risultati hanno indicato che alcuni sintomi erano forti predittori di infezione da COVID-19. Sintomi come febbre, tosse e mialgia erano significativi in più ondate, mentre altri variavano in importanza.

Impatto dei Metodi di Testing

Lo studio ha confrontato diversi metodi di test, inclusi test RT-PCR, RT-anticorpi e test RT-antigeni. I test RT-PCR hanno generalmente fornito i risultati più affidabili per diagnosticare infezioni attive da COVID-19. Al contrario, i test RT-anticorpi spesso portavano a risultati meno affidabili, specialmente all'inizio dell'infezione.

È stato notato che i test eseguiti entro un certo periodo dall'inizio dei sintomi producevano risultati migliori. Ad esempio, quando i test venivano eseguiti entro 3-7 giorni dall'inizio dei sintomi, l'accuratezza migliorava significativamente, mostrando il valore dei test tempestivi nella gestione della malattia.

Variazione dei Sintomi tra le Ondate

Una parte importante dell'analisi ha coinvolto la comprensione di come i sintomi siano cambiati nel corso della pandemia. In diverse ondate, l'importanza di alcuni sintomi è variata. Ad esempio, durante la prima ondata, sintomi come l'anosmia (perdita dell'olfatto) erano indicatori critici, ma con il proseguire della pandemia, sintomi come la congestione nasale e il mal di gola sono diventati più prominenti.

I risultati hanno evidenziato che i modelli addestrati su dati di un'ondata non performavano bene se utilizzati con dati di un'altra ondata. Questo suggerisce che le strategie di salute pubblica potrebbero dover adattarsi man mano che il virus evolve e i sintomi associati all'infezione cambiano.

Spiegazione dei Risultati

Per aiutare i fornitori di salute a interpretare i risultati dei modelli di ML, è stato utilizzato un metodo spiegabile. Questo approccio ha aiutato a chiarire quali sintomi influenzavano maggiormente le previsioni diagnostiche. Comprendendo queste relazioni, i professionisti della salute possono prendere decisioni più informate sulle opzioni di trattamento.

Ad esempio, utilizzando tecniche di visualizzazione, lo studio ha illustrato quali sintomi avevano l'effetto più significativo sulla diagnosi di COVID-19 in ogni ondata. Ha anche indicato che alcuni sintomi potevano significare risultati positivi o negativi, guidando i fornitori di salute nelle loro valutazioni.

Conclusioni e Direzioni Future

In conclusione, questo studio mostra che le tecniche di ML possono analizzare efficacemente i sintomi per assistere nella diagnosi di COVID-19. I risultati sottolineano la necessità di test tempestivi e accurati e l'importanza di comprendere la variazione dei sintomi nel tempo.

Tuttavia, i modelli hanno anche rivelato limitazioni, soprattutto quando si cercava di applicare i risultati di un'ondata a un'altra. È chiaro che, man mano che il virus cambia, così fanno anche i segni e i sintomi associati ad esso, indicando la necessità di ricerca continua e adattamento negli approcci diagnostici.

Per studi futuri, i ricercatori puntano a incorporare nuovi dati relativi a varianti virali e stato di vaccinazione. Questo potrebbe fornire approfondimenti più approfonditi su come diversi segni e sintomi si correlano a specifiche varianti. Ci sono anche piani per applicare le stesse metodologie ad altre malattie, espandendo potenzialmente il loro impatto sulla salute pubblica.

Fonte originale

Titolo: Analysis of signs and symptoms of SARS-CoV-2 virus infection considering different waves using Machine Learning

Estratto: In March 2020, the World Health Organization declared a world pandemic of COVID-19, which can manifest in humans as a consequence of virus infection of SARS-CoV-2. On this context, this work uses Data Mining and Machine Learning techniques for the infection diagnosis. A methodology was created to facilitate this task and can be applied in any outbreak or pandemic wave. Besides generating diagnosis models based only on signals and symptoms, the method can evaluate if there are differences in signals and symptoms between waves (or outbreaks) through explainable techniques of the machine learning models. Another aspect is identifying possible quality differences between exams, for example, Rapid Test (RT) and Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). The case study in this work is based on data from patients who sought care at Piquet Carneiro Polyclinic of the State University of Rio de Janeiro. In this work, the results obtained with the tests were used to diagnose symptomatic infection of the SARS-CoV-2 virus, based on related signals and symptoms, and the date of the initial of these signals and symptoms. Using the Random Forrest model, it was possible to achieve the result of up to 76% sensitivity, 86% specificity, and 79% accuracy in the results of tests in one contagion wave of the SARS-CoV-2 virus. Moreover, differences were found in signals and symptoms between contagion waves, in addition to the observation that exams RT-PCR and RT Antigen tests are more reliable than RT antibody test.

Autori: Felipe Cassemiro Ulrichsen, A. da Costa Sena, K. Figueiredo, L. C. Porto

Ultimo aggiornamento: 2024-02-13 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.02.12.24302722

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.02.12.24302722.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia medrxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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