Il ruolo di DNMT3AR882H nello sviluppo della leucemia
La ricerca mostra che le mutazioni DNMT3AR882H sono fondamentali nelle fasi iniziali della leucemia ma meno critiche in seguito.
Ravindra Majeti, T. Koehnke, D. Karigane, E. Hilgart, A. C. Fan, K. Kayamori, M. Miyauchi, C. T. Collins, F. P. Suchy, A. Rangavajhula, Y. Feng, Y. Nakauchi, E. Martinez-Montes, J. Fowler, K. M. Loh, H. Nakauchi, M. A. Koldobskiy, A. P. Feinberg
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Indice
Il cancro è una malattia complessa e i ricercatori stanno cercando di capire come diversi cambiamenti genetici nel nostro DNA contribuiscano al suo sviluppo. Una domanda importante è se certe Mutazioni siano necessarie per avviare un cancro o se servano per farlo crescere una volta iniziato. Questa domanda è particolarmente rilevante per i tumori del sangue come la leucemia mieloide acuta (AML).
Negli studi precedenti utilizzando modelli di topo, i ricercatori hanno scoperto che alcune mutazioni, come IDH2R140Q e JAK2V617F, sono necessarie sia per avviare il cancro che per mantenerlo. Risultati simili sono stati osservati negli studi sul cancro del colon-retto, dove correggere una mutazione specifica nelle cellule tumorali ha portato a una riduzione della crescita del cancro, suggerendo che queste mutazioni siano cruciali in entrambe le fasi. Tuttavia, non è ancora chiaro se questa idea si applichi a tutti i cambiamenti genetici osservati nei tumori, soprattutto quelli che avvengono nelle fasi iniziali.
Studiare come specifiche mutazioni influenzino la progressione della malattia in campioni umani è complicato a causa dei molti altri cambiamenti genetici presenti nei pazienti oncologici. Questi includono variazioni da entrambi i genitori e differenze tra i pazienti. Per affrontare questo, i ricercatori spesso usano modelli come topi o linee cellulari, ma questi sistemi non possono replicare completamente le malattie umane.
Per affrontare specificamente il problema delle mutazioni nella leucemia mieloide acuta, i ricercatori hanno sviluppato un modo per studiare queste mutazioni direttamente nei campioni di pazienti umani. Hanno usato una tecnologia chiamata CRISPR/Cas9, che consente agli scienziati di apportare modifiche precise nel DNA, per correggere mutazioni specifiche nelle cellule leucemiche e vedere come queste correzioni influenzino l’inizio e il mantenimento del cancro.
Focalizzarsi sulle Mutazioni DNMT3AR882
Una delle mutazioni studiate si chiama DNMT3AR882, trovata frequentemente in condizioni pre-leucemiche e nella leucemia mieloide acuta. Questa specifica mutazione colpisce le cellule staminali del sangue ed è stata associata a scarsi risultati nel trattamento della leucemia. Sembra che le mutazioni DNMT3AR882 possano aumentare la capacità di auto-rinnovamento di queste cellule staminali, il che potrebbe giocare un ruolo nell'inizio della malattia.
La ricerca indica che queste mutazioni possono essere cruciali per avviare la leucemia, eppure è possibile che, dopo che il cancro si è sviluppato, altri cambiamenti genetici possano prendere il sopravvento, rendendo la mutazione DNMT3A meno importante per il mantenimento della malattia. I metodi attuali non possono facilmente determinare se questa mutazione sia ugualmente importante nelle fasi iniziali e avanzate della AML. Pertanto, gli scienziati hanno deciso di indagare come le mutazioni DNMT3AR882 contribuiscano specificamente a entrambe le fasi in campioni umani.
Correggere DNMT3AR882 nelle Cellule Pre-Leucemiche
Lo studio è iniziato focalizzandosi sulla mutazione DNMT3AR882H per vedere se correggerla nelle cellule staminali del sangue pre-leucemiche potesse normalizzarne la crescita. I ricercatori hanno isolato queste cellule dai pazienti, che avevano la mutazione DNMT3AR882H ma non altre mutazioni associate alla leucemia. Utilizzando la tecnologia CRISPR/Cas9, hanno corretto la mutazione e testato se questo avrebbe riportato le cellule a uno stato normale.
Hanno ipotizzato che correggere la mutazione DNMT3AR882H avrebbe fermato le cellule dal crescere in modo incontrollato. Dopo aver introdotto la correzione, le cellule sono state monitorate per eventuali cambiamenti nelle loro capacità di auto-rinnovamento. I test iniziali hanno mostrato che, mentre non c'erano differenze immediate nella crescita durante il primo test, dopo diversi cicli di crescita, le cellule modificate hanno rivelato tratti di auto-rinnovamento ridotti rispetto a quelle non modificate.
Successivamente, i ricercatori hanno esaminato come correggere la mutazione abbia influenzato le cellule del sangue mature derivate dalle cellule staminali modificate. Hanno eseguito un'analisi dettagliata utilizzando tecnologie di sequenziamento avanzate per identificare i tipi cellulari distinti generati dalle cellule modificate e non modificate. In generale, hanno scoperto che, nonostante piccoli cambiamenti nei tipi cellulari, correggere la mutazione ha portato a cambiamenti significativi nell'attività genica legata all'infiammazione e allo sviluppo delle cellule del sangue.
Questo ha portato i ricercatori a concludere che la presenza della mutazione DNMT3AR882H è una forza trainante dietro le caratteristiche di crescita anomala delle cellule staminali del sangue pre-leucemiche e che correggere questa mutazione potrebbe invertire questi effetti relativamente in fretta.
Indagare DNMT3AR882 nella Leucemia Stabilita
I ricercatori hanno quindi mirato a vedere se la mutazione DNMT3AR882H fosse necessaria per la sopravvivenza delle cellule leucemiche già stabilite. Hanno isolato cellule leucemiche da pazienti con la mutazione DNMT3AR882H e hanno applicato le stesse tecniche di correzione usate sulle cellule pre-leucemiche.
Gli scienziati hanno notato che queste cellule leucemiche portavano non solo la mutazione DNMT3AR882H, ma anche diverse altre mutazioni comunemente viste nella leucemia. Dopo aver corretto la mutazione DNMT3AR882H in queste cellule, le hanno trapiantate in topi per osservare se la correzione avrebbe influenzato la loro capacità di causare leucemia.
Sorprendentemente, correggere la mutazione DNMT3AR882H non ha fermato lo sviluppo del cancro in questi topi. I livelli di innesto erano gli stessi, indipendentemente dal fatto che le cellule avessero la mutazione o meno, suggerendo che questa specifica mutazione potrebbe non essere essenziale una volta che la leucemia si è stabilita. I ricercatori hanno confermato che tutte le altre mutazioni sono rimaste intatte in quelle cellule, indicando che mentre la mutazione DNMT3AR882H potrebbe aiutare a innescare la malattia, non gioca un ruolo vitale nella sua esistenza continua.
Indurre Correzione in Vivo
Per esplorare ulteriormente il ruolo di DNMT3AR882H nella leucemia stabilita, i ricercatori hanno progettato un esperimento per correggere la mutazione all'interno dell'organismo vivo piuttosto che solo in cellule isolate. Hanno creato un tipo speciale di cellula staminale che poteva formare leucemia e avevano un modo per indurre una correzione della mutazione DNMT3AR882H nei topi vivi dopo che la leucemia si era già radicata.
Una volta che le cellule leucemiche erano stabilite nei topi, hanno trattato metà di essi con una sostanza che induceva la correzione della mutazione DNMT3AR882H. Dopo alcune settimane, i topi sono stati esaminati per valutare se la correzione avesse portato a cambiamenti nelle caratteristiche della leucemia.
È interessante notare che, anche dopo aver corretto la mutazione, la leucemia ha mantenuto la sua crescita aggressiva e le sue caratteristiche, senza differenze osservabili nei tassi di sopravvivenza tra i due gruppi.
Questi risultati suggeriscono che, mentre DNMT3AR882H può essere cruciale nelle fasi iniziali della malattia, diventa meno significativo una volta che la leucemia è stabilita.
Il Ruolo delle Cellule Staminali Leucemiche
Le cellule staminali leucemiche sono cellule speciali all'interno della leucemia che hanno la potenzialità di auto-rinnovarsi e alimentare la crescita del cancro. Anche se gli esperimenti precedenti non hanno mostrato differenze nella capacità delle cellule leucemiche di crescere dopo aver corretto la mutazione DNMT3AR882H, i ricercatori hanno voluto verificare se questa mutazione influenzasse la frequenza di queste cellule staminali aggressive.
Per fare ciò, hanno condotto esperimenti di trapianto secondario. Hanno preso cellule leucemiche da topi precedentemente trattati e le hanno reintrodotte in nuovi topi riceventi. Analizzando i risultati, hanno scoperto che correggere la mutazione DNMT3AR882H ha ridotto significativamente il numero di cellule staminali leucemiche nei campioni corretti.
Questo indica che, mentre DNMT3AR882H non è necessario per sostenere la leucemia nel suo complesso, influisce sulla quantità di cellule staminali aggressive nell'ambiente del cancro. I dati suggeriscono che approcci mirati per affrontare questa mutazione potrebbero essere più efficaci durante le fasi iniziali dello sviluppo della leucemia piuttosto che una volta che la malattia è progredita.
Metilazione e nell'Attività Genica
Indagare i Cambiamenti nellaInoltre, i ricercatori hanno esaminato come la correzione della mutazione DNMT3AR882H abbia influenzato i modelli complessivi di metilazione del DNA e l'espressione genica nelle cellule leucemiche. Hanno condotto analisi approfondite per valutare le differenze nei livelli di metilazione del DNA e come essi si correlassero all'attività genica.
I dati hanno rivelato che la presenza della mutazione DNMT3AR882H portava a variazioni nei modelli di metilazione, che si riferiscono a come alcune regioni del DNA sono modificate e possono influenzare come i geni vengono espressi. Tuttavia, correggere la mutazione non ha ripristinato in modo significativo questi modelli di metilazione a uno stato sano; piuttosto, i modelli sono rimasti altamente individuali e coerenti con le caratteristiche uniche della leucemia di ciascun paziente.
I ricercatori hanno scoperto che i cambiamenti nell'espressione genica erano anche specifici per il paziente. In generale, correggere la mutazione ha avuto un impatto minimo nel ribaltare le modifiche nel paesaggio del DNA. Tuttavia, alcune analisi hanno mostrato che c'era una riduzione nei set di geni associati a caratteristiche delle cellule staminali dopo aver corretto la mutazione DNMT3AR882H.
Questi dati suggeriscono una relazione complessa tra mutazioni, alterazioni del DNA e attività genica nella leucemia, evidenziando che, mentre correggere una specifica mutazione può avere alcuni effetti, potrebbe non ripristinare completamente l'identità epigenetica del cancro.
Conclusione
Questa ricerca suggerisce che certe mutazioni, specialmente DNMT3AR882H, giocano un ruolo essenziale nelle fasi iniziali dello sviluppo della leucemia, ma potrebbero non essere necessarie una volta che il cancro si è stabilito. I risultati sottolineano la necessità di terapie mirate che si concentrino su queste mutazioni durante la fase pre-leucemica, piuttosto che fare affidamento esclusivamente su trattamenti una volta che la leucemia si è affermata.
I risultati illustrano anche l'importanza di utilizzare campioni umani primari per la ricerca, poiché forniscono intuizioni che gli organismi modello non possono replicare completamente. Comprendendo i contributi specifici delle varie mutazioni nel cancro, i ricercatori possono sviluppare strategie di trattamento più efficaci.
Andando avanti, l'obiettivo sarà trovare modi per mirare a mutazioni come DNMT3AR882H nelle loro fasi iniziali e esplorare l'interazione complessa tra i cambiamenti genetici e l'evoluzione del cancro. Questa comprensione più profonda potrebbe portare a progressi nelle terapie personalizzate che tengono conto del patrimonio genetico unico del cancro di ciascun paziente.
Titolo: DNMT3AR882H Is Not Required for Disease Maintenance in Primary Human AML, but Is Associated With Increased Leukemia Stem Cell Frequency
Estratto: Genetic mutations are being thoroughly mapped in human cancers, yet a fundamental question in cancer biology is whether such mutations are functionally required for cancer initiation, maintenance of established cancer, or both. Here, we study this question in the context of human acute myeloid leukemia (AML), where DNMT3AR882 missense mutations often arise early, in pre-leukemic clonal hematopoiesis, and corrupt the DNA methylation landscape to initiate leukemia. We developed CRISPR-based methods to directly correct DNMT3AR882 mutations in leukemic cells obtained from patients. Surprisingly, DNMT3AR882 mutations were largely dispensable for disease maintenance. Replacing DNMT3AR882 mutants with wild-type DNMT3A did not impair the ability of AML cells to engraft in vivo, and minimally altered DNA methylation. Taken together, DNMT3AR882 mutations are initially necessary for AML initiation, but are largely dispensable for disease maintenance. The notion that initiating oncogenes differ from those that maintain cancer has important implications for cancer evolution and therapy. STATEMENT OF SIGNIFICANCEUnderstanding which driver mutations are required for cancer initiation, maintenance, or both phases remains poorly understood. Here, we uncover that highly prevalent pre-leukemic DNMT3A mutations are only required during disease initiation, but become dispensable after leukemic transformation, uncovering the context-specific role of this driver mutation with important therapeutic implications.
Autori: Ravindra Majeti, T. Koehnke, D. Karigane, E. Hilgart, A. C. Fan, K. Kayamori, M. Miyauchi, C. T. Collins, F. P. Suchy, A. Rangavajhula, Y. Feng, Y. Nakauchi, E. Martinez-Montes, J. Fowler, K. M. Loh, H. Nakauchi, M. A. Koldobskiy, A. P. Feinberg
Ultimo aggiornamento: 2024-10-29 00:00:00
Lingua: English
URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.26.620318
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.26.620318.full.pdf
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