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Come i batteri usano la chemiotassi per prosperare

Scopri come i batteri percepiscono l'ambiente e si muovono verso i nutrienti.

Félix Velando, Jiawei Xing, Roberta Genova, Jean Paul Cerna-Vargas, Raquel Vázquez- Santiago, Miguel A. Matilla, Igor B. Zhulin, Tino Krell

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Le Abilità Segrete di Le Abilità Segrete di Navigazione dei Batteri sopravvivono. Scopri come i batteri trovano cibo e
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I batteri sono organismi viventi microscopici che si trovano praticamente ovunque. Hanno un modo unico di muoversi verso i posti che gli piacciono e allontanarsi da quelli che non gradiscono. Questo movimento si chiama chemiotassi. Pensala come se i batteri facessero una passeggiata verso un buffet quando sentono l'odore del cibo!

Che cos'è la Chemiotassi?

La chemiotassi è il movimento diretto dei batteri verso o lontano da certe sostanze chimiche nel loro ambiente. È il loro modo di cercare cibo o di allontanarsi da sostanze potenzialmente dannose. Immagina di entrare in cucina e seguire il delizioso profumo dei biscotti. I batteri fanno qualcosa di simile, ma con le sostanze chimiche.

L'importanza della Chemiotassi

I batteri usano la chemiotassi per trovare nutrienti e ambienti dove possono prosperare. Quando un batterio sente una concentrazione di nutrienti, fa una corsa verso di essi. D'altro canto, se percepisce sostanze nocive, si allontana nella direzione opposta. Ma non è tutto! I batteri possono anche percepire segnali di altri organismi, il che li aiuta a decidere dove andare. Questo può includere segnali da piante, animali o anche altri batteri nelle vicinanze.

Come percepiscono i batteri il loro ambiente?

I batteri percepiscono il loro ambiente usando proteine specializzate chiamate chemorecettori. Queste proteine possono rilevare diverse sostanze e informare il batterio se muoversi più vicino o più lontano. Il numero di chemorecettori varia tra i batteri. Alcuni ne hanno solo alcuni, mentre altri ne hanno molti, a seconda di dove vivono e di cosa hanno bisogno.

Ad esempio, i batteri che vivono in ambienti stabili potrebbero avere meno chemorecettori, mentre quelli in ambienti variabili o competitivi ne hanno spesso molti di più. Questi chemorecettori possono riconoscere varie sostanze, come zuccheri, aminoacidi e anche ioni metallici.

Chemiotassi e patogeni delle piante

I batteri che infettano le piante hanno una relazione speciale con il loro ambiente grazie alla chemiotassi. Usano questa abilità per trovare la strada verso le piante. Alcune sostanze chimiche rilasciate dalle piante possono attrarre questi batteri, aiutandoli a individuare i punti di ingresso in modo più efficace.

In modo interessante, i patogeni vegetali tendono ad avere più chemorecettori rispetto ai batteri che non interagiscono con le piante. Questo li rende meglio equipaggiati per navigare nel complesso paesaggio chimico di una pianta. Le ricerche mostrano che i batteri patogeni delle piante, in media, hanno circa il doppio dei chemorecettori rispetto ai loro omologhi non vegetali.

Uno sguardo più da vicino a Pectobacterium atrosepticum

Uno dei batteri che gli scienziati studiano si chiama Pectobacterium atrosepticum. Questo batterio è noto per causare malattie come il marciume nero e il marciume molle nelle piante. Ha una forte risposta chemiotattica grazie ai 36 chemorecettori codificati nel suo genoma. I ricercatori si concentrano su come funzionano questi recettori e quali ruoli svolgono.

Hanno scoperto che un chemorecettore specifico, chiamato ECA_RS12390, si lega specificamente ad alcuni importanti composti chimici. Facendo vari esperimenti, gli scienziati hanno scoperto che questo recettore ama particolarmente attaccarsi a composti C3 fosforilati, che sono importanti in molti processi biologici.

Come vengono studiati i chemorecettori?

Per capire come funzionano questi chemorecettori, gli scienziati usano vari saggi, tra cui saggi di trasferimento termico e calorimetria di titolazione isoterma (ITC). Il saggio di trasferimento termico li aiuta a vedere quanto è stabile una proteina quando si lega a diversi ligandi (piccole molecole). L'ITC misura il cambiamento di calore quando un ligando si lega a una proteina, aiutando gli scienziati a capire quanto forte è il legame.

Attraverso questi studi, hanno scoperto che ECA_RS12390, noto anche come PacP, si lega particolarmente bene al glicerolo 3-fosfato, un composto coinvolto nel metabolismo sia delle piante che dei batteri. Hanno appreso che quando Pectobacterium atrosepticum percepisce il glicerolo 3-fosfato, si muove verso di esso.

Il ruolo del Glicerolo 3-Fosfato

Il glicerolo 3-fosfato è molto importante nel mondo vegetale. Aiuta a gestire le risposte immunitarie delle piante. Quando le piante vengono attaccate, possono aumentare la produzione di questo composto per segnalare le loro difese. Questo significa che batteri come Pectobacterium atrosepticum non sono solo attratti dal glicerolo 3-fosfato per nutrirsi, ma anche per trovare punti deboli nelle piante, specialmente in situazioni di stress.

La scoperta di nuovi chemorecettori

I ricercatori hanno anche scoperto una nuova famiglia di chemorecettori responsabili del riconoscimento di questi composti fosforilati. Chiamano questa famiglia sCache_PC3. I membri di questa famiglia di chemorecettori si trovano principalmente in batteri collegati alle piante, dimostrando che questi batteri si sono evoluti per avere sistemi specializzati per percepire e rispondere ai loro ospiti vegetali.

Come funzionano questi chemorecettori?

I membri della famiglia sCache_PC3 lavorano raccolgono segnali da determinati composti, aiutando i batteri a prendere decisioni su dove nuotare. Sembrano avere una preferenza per composti specifici, specialmente per composti C3 fosforilati. Questo significa che sono schizzinosi!

Quando i ricercatori hanno condotto test, hanno scoperto che questi chemorecettori sono principalmente presenti in batteri della classe γ-proteobatteri, specificamente in gruppi che interagiscono con le piante.

Lo stile di vita dei patogeni vegetali

Lo stile di vita dei patogeni vegetali è piuttosto unico. Vivono delle piante che infettano, trovando modi per infiltrarsi ed estrarre nutrienti. Per farlo con successo, devono essere bravi a rilevare i segnali chimici rilasciati dalle piante. La presenza di molti chemorecettori affina le loro abilità, rendendoli migliori a navigare nel loro ambiente.

Quando incontrano un segnale, reagiscono rapidamente, muovendosi nella direzione giusta. La capacità di percepire questi segnali è spesso la differenza tra un'infezione riuscita e un'opportunità mancata.

Esplorare l'evoluzione dei chemorecettori

È interessante pensare a come si siano evoluti questi chemorecettori. Alcuni di loro probabilmente hanno iniziato a riconoscere diversi acidi carbossilici, composti noti per essere importanti in vari processi biologici. Nel tempo, la loro capacità di rilevare composti fosforilati specifici si è sviluppata, portandoli alle loro forme attuali.

Questa evoluzione punta a quanto i batteri possano essere adattabili, permettendo loro di prosperare in ambienti variati e rispondere alle sfide che affrontano.

Lezioni apprese dalla ricerca sulla Chemiotassi

Capire come i batteri usano la chemiotassi può darci preziose intuizioni su come sopravvivono e prosperano. Sapere come navigano nei loro dintorni aiuta gli scienziati a trovare modi per gestire le malattie delle piante causate da questi batteri. Se riusciamo a interrompere la loro capacità di rilevare certi segnali, potremmo essere in grado di prevenire le infezioni.

Inoltre, la scoperta della famiglia sCache_PC3 apre nuove strade per la ricerca. Gli scienziati possono ora esplorare come funzionano questi recettori e quali altri composti potrebbero influenzare il comportamento batterico. Potrebbe portare a sviluppare migliori strategie per controllare i patogeni vegetali.

Batteri: Gli organismi sottovalutati

I batteri spesso non ricevono abbastanza riconoscimento. Sebbene possano causare malattie, svolgono anche ruoli vitali negli ecosistemi, inclusa la decomposizione dei materiali organici e il riciclaggio dei nutrienti. La loro capacità di percepire e rispondere al loro ambiente è cruciale per la loro sopravvivenza.

E diciamolo, senza batteri, avremmo molti più problemi in questo mondo. Sono i riciclatori originali! Ogni volta che gusti un piatto di cibo, ricorda solo che i batteri potrebbero aver giocato un ruolo nel renderlo possibile.

Conclusione: La continua ricerca di conoscenza

Lo studio della chemiotassi nei batteri è un campo in continua evoluzione. I ricercatori sono ansiosi di scoprire di più sui segreti dietro come i batteri interagiscono con le piante e i loro ambienti. Man mano che impariamo di più su questi minuscoli organismi, possiamo capire meglio come gestirli in modi che avvantaggiano i nostri ecosistemi.

Quindi, la prossima volta che pensi ai batteri, ricorda che non stanno solo in agguato aspettando di farci ammalare. Sono occupati a fare le loro cose, fiutando nutrienti e, a volte, tracciando la loro prossima mossa nel grande gioco dell'infezione delle piante!

Fonte originale

Titolo: Chemoreceptor family in plant-associated bacteria responds preferentially to the plant signal molecule glycerol 3-phosphate

Estratto: Plant pathogens and plant-associated bacteria contain about twice as many chemoreceptors as the bacterial average, indicating that chemotaxis is particularly important for bacteria-plant interactions. However, information on the corresponding chemoreceptors is limited. In this study, we identified the chemoreceptor PacP from the phytopathogen Pectobacterium atrosepticum, which exclusively recognized C3 phosphorylated compounds at its sCache ligand binding domain, mediating chemoattraction. Using a motif of PacP amino acid residues involved in ligand binding, we identified a chemoreceptor family, termed sCache_PC3, that was specific for C3 phosphorylated compounds. Isothermal titration calorimetry studies revealed that family members preferentially bound glycerol 3-phosphate, a key plant signaling molecule. Additionally, family members recognized glycerol 2-phosphate and glycolysis intermediates glyceraldehyde 3-phosphate, dihydroxyacetone phosphate and 3-phosphoglycerate. This study presents the first evidence of chemoreceptors that bind phosphorylated compounds. We show that the sCache_PC3 family has evolved from an ancestral sCache domain that respond primarily to Krebs cycle intermediates. Members of the sCache_PC3 family were mainly found in bacteria that interact with plants, including many important plant pathogens such as Brenneria, Dickeya, Musicola, Pectobacterium, and Herbaspirillum. Glycerol 3-phosphate is a signal molecule that is excreted by plants in response to stress and infection. Chemotaxis towards this molecule may thus be a means for bacteria to localize stressed plants and move to infection sites. This study lays the groundwork for investigating the functional importance of chemotaxis to phosphorylated C3 compounds in plant-bacteria interactions and virulence. Significance statementThe bacterial lifestyle has shaped the evolution of signal transduction systems, and the number and type of chemoreceptors varies greatly between bacteria occupying various ecological niches. Our understanding of the relationship between lifestyle and chemoreceptor function is limited and the discovery of a chemoreceptor family in plant-associated bacteria that primarily responds to an important plant signal molecule is a significant advancement, allowing for further studies to determine its physiological relevance. The lack of knowledge about signals recognized by bacterial receptors is currently a major challenge in microbiology. This study illustrates the potential of combining experimental ligand screening with computational ligand prediction to identify signals recognized by uncharacterized receptors.

Autori: Félix Velando, Jiawei Xing, Roberta Genova, Jean Paul Cerna-Vargas, Raquel Vázquez- Santiago, Miguel A. Matilla, Igor B. Zhulin, Tino Krell

Ultimo aggiornamento: 2024-12-11 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.10.627748

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.10.627748.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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