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Un Nuovo Approccio per Studiare il Cervello Umano

I ricercatori stanno usando tessuti umani per studiare le malattie del cervello in modo più efficace.

JP McGinnis, Joshua Ortiz-Guzman, Sai Mallannagari, Maria Camila Guevara, Benjamin D. W. Belfort, Suyang Bao, Snigdha Srivastava, Maria Morkas, Emily Ji, Kalman A. Katlowitz, Angela Addison, Evelyne K. Tantry, Melissa M. Blessing, Carrie A. Mohila, Nisha Gadgil, Samuel G. McClugage III, David F. Bauer, William E. Whitehead, Guillermo Aldave, Omar Tanweer, Naser Jaleel, Ali Jalali, Akash J. Patel, Sameer A. Sheth, Howard L. Weiner, Shankar Gopinath, Ganesh Rao, Akdes Serin Harmanci, Daniel Curry, Benjamin R. Arenkiel

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Quando si tratta di studiare il cervello umano, i ricercatori spesso si scontrano con un muro. La maggior parte delle volte devono fare affidamento su modelli animali per imparare sulle malattie cerebrali, ma questi studi non sempre si traducono bene negli esseri umani. È come cercare di imparare a andare in bicicletta guardando un criceto in una ruota: può essere carino, ma non è proprio la stessa esperienza. Ecco perché c'è una crescente spinta ad usare modelli basati sugli esseri umani per capire meglio come funziona il cervello, specialmente quando si tratta di malattie neurologiche difficili.

Un sviluppo entusiasmante in questo campo è l'uso degli Organoidi Cerebrali. Pensali come cervelli miniaturizzati cresciuti in laboratorio. Danno agli scienziati la possibilità di studiare le cellule cerebrali umane in un contesto più rilevante. Sfortunatamente, le versioni attuali di questi organoidi somigliano a un cervello embrionale più che a un cervello umano completamente sviluppato. Questo può rendere difficile applicare ciò che apprendono alle condizioni umane reali.

Entra in gioco il modello di fette organotipiche di cervello umano. Questo modello permette ai ricercatori di mantenere in vita pezzi reali di tessuto cerebrale umano al di fuori del corpo (in un laboratorio, non in un lugubre rifugio da scienziato pazzo). Facendo ciò, possono studiare come questi tessuti reagiscono a diversi trattamenti o interventi nel tempo. Idealmente, queste fette manterrebbero le loro caratteristiche originali, così i ricercatori hanno un quadro più accurato di come si comporterebbero in una persona viva.

Perché Tessuto Umano?

Usare tessuto cerebrale umano è una svolta. Studiandolo direttamente, i ricercatori possono ottenere una comprensione più chiara di come i diversi tipi di cellule nel cervello lavorano insieme. Questo è cruciale per malattie come tumori, epilessia e altri disturbi neurologici. L'obiettivo finale è migliorare i trattamenti e rendere le sperimentazioni cliniche più predittive e pertinenti.

Tuttavia, sebbene l'uso di tessuto umano offra molti vantaggi, porta anche sfide. Non tutti i pazienti che si sottopongono a interventi chirurgici possono fornire campioni di tessuto, e i tipi di malattie studiate sono limitati a quelle che richiedono un intervento chirurgico. Tuttavia, il potenziale per nuove scoperte rende comunque l'impegno utile.

Il Processo di Studio

In uno studio recente, i ricercatori hanno raccolto campioni di tessuto cerebrale da pazienti sottoposti a intervento. Il processo era semplice: ottenere il consenso dal paziente (o dai loro caregiver), poi raccogliere qualsiasi tessuto cerebrale che non fosse necessario per la diagnosi. I campioni sono stati rapidamente raffreddati e portati in laboratorio per ulteriori elaborazioni.

Una volta in laboratorio, il tessuto cerebrale è stato sezionato con cura in fette e posizionato in specifici mezzi di coltura. Queste fette sono state trattate come ospiti VIP, ricevendo assistenza e manutenzione quotidiana per mantenerle vive e sane.

Dopo due settimane di coltura, i ricercatori erano pronti ad analizzare i campioni utilizzando il sequenziamento RNA a singolo nucleo. Questo metodo ha permesso loro di esaminare i livelli di espressione genica per vari tipi di cellule all'interno del tessuto. L'obiettivo era vedere quanto bene questi tipi di cellule mantenessero le loro caratteristiche uniche nel tempo. Se si comportavano in modo simile a come lo farebbero in un cervello vivo, indicherebbe che il modello era davvero efficace.

Uno Sguardo Sotto il Cozzo

Quindi, cosa hanno scoperto esattamente i ricercatori durante la loro analisi? Hanno esaminato diversi tipi di cellule, come Neuroni, Astrociti (cellule di supporto) e cellule tumorali, per vedere come i loro Profili di Espressione Genica cambiavano dal giorno zero (subito dopo l'intervento) al giorno quattordici (dopo due settimane in coltura).

Risultati e Scoperte

I risultati sono stati promettenti. La maggior parte dei tipi di cellule ha mostrato correlazioni relativamente alte tra le loro espressioni al giorno zero e al giorno quattordici. Questo significa che le cellule hanno mantenuto le loro identità nel periodo di due settimane, rendendo il modello di fette organotipiche una buona candidatura per studiare le malattie cerebrali.

  1. Astrociti: Queste cellule di supporto hanno mostrato risultati variabili. In alcuni campioni, hanno mantenuto bene la loro identità, ma in altri, non così tanto.

  2. Cellule Endoteliali: Queste cellule, che fanno parte dei vasi sanguigni, hanno fatto un ottimo lavoro nel preservare le loro caratteristiche nel tempo.

  3. Neuroni: I risultati erano misti. Mentre alcuni tipi di neuroni hanno mantenuto adeguatamente i loro profili, altri hanno mostrato un notevole declino.

  4. Cellule Tumorali: Sorprendentemente, le cellule tumorali da campioni di glioblastoma e medulloblastoma hanno mantenuto eccezionalmente bene i loro profili di espressione genica. Questo suggerisce che il sistema di modellizzazione ha potenziale per capire come si comportano questi tumori aggressivi.

Confrontando i dati del giorno zero e del giorno quattordici, i ricercatori sono stati in grado di vedere cosa era cambiato e cosa era rimasto lo stesso. È come guardare una foto prima e dopo, tranne che invece di un nuovo taglio di capelli, si tratta di quanto bene le cellule cerebrali hanno mantenuto le loro caratteristiche uniche nel tempo.

Creare una Base

Uno dei risultati chiave di questa ricerca è stato stabilire una base per come le cellule cerebrali si comportano al di fuori del corpo. Questo è cruciale per studi futuri. Se i ricercatori possono capire quanto tempo i diversi tipi di cellule possono mantenere le loro identità, possono iniziare a modificare le condizioni di coltura per migliorare la conservazione. Più i modelli sono fedeli alla biologia umana reale, più saranno utili per testare nuove terapie.

L'Importanza della Collaborazione

L'accesso al tessuto cerebrale umano è ancora una sfida. Molti laboratori potrebbero non avere la possibilità di ottenere tali campioni regolarmente. Ecco perché la collaborazione è cruciale. Lavorando insieme, i ricercatori possono unire le loro risorse e conoscenze per sfruttare questo modello prezioso. I neurochirurghi, in particolare, sono in una posizione unica per guidare questi studi poiché sono spesso quelli che effettuano le chirurgie.

Direzioni Future

Man mano che i ricercatori continuano a indagare su questo modello, ci sono molte strade da esplorare. Ad esempio, potrebbero vedere come diversi tipi di malattie cerebrali influenzano la conservazione delle cellule. Questo modello potrebbe aiutare i ricercatori a capire come si comportano gli gliomi a bassa gradazione o altri tipi specifici di tumori? O come potrebbe applicarsi a malformazioni vascolari o epilessia? Queste domande sono solo l'inizio.

Migliorare le Condizioni di Coltura

Gli scienziati sono ottimisti sul fatto che migliorare la qualità delle condizioni di coltura porterà a risultati ancora migliori. Alcuni ricercatori si stanno concentrando sull'uso del liquido cerebrospinale umano (CSF) come mezzo per mantenere i tessuti in vita più a lungo. Incorporando un ambiente più naturale, sperano di migliorare i tassi di sopravvivenza delle cellule e mantenere un'ancora maggiore fedeltà.

Conclusione

Il modello di coltura a fette organotipiche di cervello umano rappresenta un passo significativo avanti nella ricerca cerebrale. Usando realmente tessuto umano, i ricercatori possono studiare le complessità del cervello umano in modi che i tradizionali modelli animali non possono assolutamente eguagliare.

I dati sono chiari: il tessuto cerebrale può mantenere i suoi profili di espressione genica ex vivo, il che potrebbe significare risultati più affidabili per le sperimentazioni cliniche e migliori terapie per i pazienti. Il futuro sembra luminoso per quest'area di ricerca, e chissà? Forse un giorno saremo in grado di sviluppare non solo trattamenti, ma vere soluzioni per le maggiori sfide del cervello.

Quindi, mentre i modelli animali hanno il loro posto, è ora di abbracciare questo approccio incentrato sull'uomo. Dopotutto, chi meglio di noi per studiare il cervello umano se non… beh, gli esseri umani?

Fonte originale

Titolo: Cell type transcriptional identities are maintained in cultured ex vivo human brain tissue

Estratto: It is becoming more broadly accepted that human-based models are needed to better understand the complexities of the human nervous system and its diseases. The recently developed human brain organotypic culture model is one highly promising model that requires the involvement of neurosurgeons and neurosurgical patients. Studies have investigated the electrophysiological properties of neurons in such ex vivo human tissues, but the maintenance of other cell types within explanted brain remains largely unknown. Here, using single-nucleus RNA sequencing, we systematically evaluate the transcriptional identities of the various cell types found in six patient samples after fourteen days in culture (83,501 nuclei from day 0 samples and 45,738 nuclei from day 14 samples). We used two pediatric temporal lobectomy samples, an adult frontal cortex sample, two IDH wild-type glioblastoma samples, and one medulloblastoma sample. We found remarkably high correlations of day 14 transcriptional identities to day 0 tissue, especially in tumor cells (r = 0.90 to 0.93), though microglia (r = 0.86), oligodendrocytes (r = 0.80), pericytes (r = 0.77), endothelial cells (r = 0.78), and fibroblasts (r = 0.76) showed strong preservation of their transcriptional profiles as well. Astrocytes and excitatory neurons showed more moderate preservation (r = 0.66 and 0.47, respectively). Because the main difficulty with organotypic brain cultures is the acquisition of human tissue, which is readily available to neurosurgeons, this model is easily accessible to neurosurgeon-scientists and neurosurgeons affiliated with research laboratories. Broad uptake of this more representative model should prompt advances in our understanding of many uniquely human diseases, lead to more reliable clinical trial performance, and ultimately yield better therapies for our patients.

Autori: JP McGinnis, Joshua Ortiz-Guzman, Sai Mallannagari, Maria Camila Guevara, Benjamin D. W. Belfort, Suyang Bao, Snigdha Srivastava, Maria Morkas, Emily Ji, Kalman A. Katlowitz, Angela Addison, Evelyne K. Tantry, Melissa M. Blessing, Carrie A. Mohila, Nisha Gadgil, Samuel G. McClugage III, David F. Bauer, William E. Whitehead, Guillermo Aldave, Omar Tanweer, Naser Jaleel, Ali Jalali, Akash J. Patel, Sameer A. Sheth, Howard L. Weiner, Shankar Gopinath, Ganesh Rao, Akdes Serin Harmanci, Daniel Curry, Benjamin R. Arenkiel

Ultimo aggiornamento: 2024-12-20 00:00:00

Lingua: English

URL di origine: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.19.629223

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.19.629223.full.pdf

Licenza: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Modifiche: Questa sintesi è stata creata con l'assistenza di AI e potrebbe presentare delle imprecisioni. Per informazioni accurate, consultare i documenti originali collegati qui.

Si ringrazia biorxiv per l'utilizzo della sua interoperabilità ad accesso aperto.

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