Étudier le comportement des protéines à basse température
Une étude examine comment les protéines interagissent dans des solutions de glycérine-eau sous des conditions froides.
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Table des matières
- Le défi des cristaux de glace
- Méthodes utilisées dans l'étude
- Configuration expérimentale
- Observations pendant le refroidissement
- Le rôle de la glycérol
- Formation de glace lors du chauffage
- Effets sur les interactions protéiques
- Dépendance de la température au comportement des protéines
- Conclusion
- Source originale
Étudier comment les protéines se comportent à basse température est important pour améliorer le stockage de matériaux biologiques comme les tissus, la nourriture et les vaccins. Un gros problème qui peut survenir, c'est la formation de cristaux de glace, même en utilisant des substances spéciales appelées cryoprotecteurs. Ces cristaux de glace peuvent endommager les protéines, les rendant moins efficaces. Cet article examine une solution protéique spécifique à basse température, particulièrement comment elle change quand elle est refroidie.
Le défi des cristaux de glace
En refroidissant les solutions protéiques, des cristaux de glace peuvent se former et endommager les protéines. C'est un souci car ça limite l'utilisation des cryoprotecteurs, censés prévenir les dégâts. L'étude se concentre sur une protéine appelée Lysozyme dans une solution de Glycérol-eau, couramment utilisée pour garder les protéines en sécurité quand elles sont congelées. L'objectif est de comprendre comment ce mélange change de structure lorsqu'il est refroidi.
Méthodes utilisées dans l'étude
Pour enquêter sur les changements dans les solutions protéiques, deux méthodes appelées diffusion des rayons X à petit angle (SAXS) et diffusion des rayons X à large angle (WAXS) ont été utilisées. Ces techniques ont permis aux chercheurs de regarder en détail comment les protéines interagissaient entre elles et avec l'eau environnante pendant le refroidissement et le réchauffement. L'étude a observé la solution de Lysozyme à différentes Températures, en commençant par la température ambiante jusqu'à des conditions beaucoup plus froides.
Configuration expérimentale
La Lysozyme a été mélangée avec une solution de glycérol-eau, et les mélanges ont été préparés pour des études de diffusion des rayons X. Les expériences ont eu lieu dans une installation qui fournit des rayons X à haute énergie. La température des échantillons a été soigneusement contrôlée, permettant des cycles de refroidissement et de chauffage précis. Ce dispositif visait à surveiller comment les interactions entre protéines changeaient avec la variation de température.
Observations pendant le refroidissement
À mesure que la température chutait, les solutions protéiques montraient des changements distincts. Pour la concentration plus faible de la protéine, les différences étaient minimales, tandis que la concentration plus élevée montrait des modèles clairs dans les données de diffusion. Cela indiquait que les protéines interagissaient plus étroitement à mesure que la température diminuait.
Lors du refroidissement depuis la température ambiante, les chercheurs ont observé un changement significatif dans les motifs de diffusion, indiquant un décalage dans la façon dont les protéines s'alignaient et interagissaient. Ce décalage était cohérent avec des résultats précédents dans des études similaires. Les données montraient que les protéines formaient des structures plus compactes à mesure que la température chutait.
Le rôle de la glycérol
La glycérol est utilisé dans ces expériences car il aide à prévenir la formation de glace dans les mélanges. La présence de glycérol change la façon dont l'eau se comporte autour des protéines. Cela modifie les liaisons hydrogène et impacte la manière dont les protéines interagissent avec l'eau. Cette étude a noté que la glycérol crée efficacement un environnement protecteur pour les protéines.
Formation de glace lors du chauffage
Lorsque la température augmentait, la présence de cristaux de glace devenait évidente dans les données WAXS. Ces données révélaient des pics distincts correspondant à la glace. Cela montrait que, bien que le refroidissement empêche la formation de glace, le chauffage faisait croître la glace. Malgré le refroidissement à des températures très basses, la glycérol empêchait d'abord la formation de glace.
À mesure que la température montait, les premiers signes de glace apparaissaient, suggérant que les protéines étaient dans un état où la glace pouvait se former après avoir été bien protégées pendant la phase de refroidissement. Les chercheurs ont noté la taille des cristaux de glace et leur taux de croissance durant la phase de réchauffement.
Effets sur les interactions protéiques
Les interactions entre les protéines changeaient aussi avec la température. L'attraction entre les protéines augmentait à mesure que la température chutait. Cela a été caractérisé par l'examen du facteur de structure, qui montrait à quel point il était probable de trouver des protéines appariées à différentes distances.
De plus, le refroidissement a conduit à une plage limitée de distances entre les protéines, indiquant qu'elles devenaient plus ordonnées. En conséquence, il y avait moins d'espace entre les protéines, leur permettant de se regrouper plus étroitement. Les résultats suggèrent que l'environnement autour des protéines influençait significativement leur interaction.
Dépendance de la température au comportement des protéines
Cette étude a enregistré comment les protéines réagissaient lors des cycles de température, notant un effet d'hystérésis où le comportement différait lors du refroidissement par rapport au réchauffement. Le processus de refroidissement impliquait un changement significatif dans les interactions, tandis que le réchauffement montrait une tendance différente, indiquant que l'environnement joue un rôle clé dans la dynamique des protéines.
L'hystérésis observée souligne que les protéines ne retournent pas simplement à leur état précédent après avoir été chauffées. Au lieu de cela, elles subissent des changements qui dépendent de la rapidité avec laquelle elles se réchauffent ou se refroidissent, entraînant un comportement varié dans leurs interactions entre elles.
Conclusion
En résumé, cette enquête sur le comportement de la Lysozyme dans des solutions de glycérol-eau à basse température fournit des informations précieuses sur les interactions protéiques. L'effet protecteur du glycérol aide à prévenir la formation de glace, maintenant l'intégrité des protéines. Cependant, à mesure que la température change, de nouvelles dynamiques émergent qui affectent la façon dont les protéines interagissent entre elles.
L'étude éclaire l'équilibre entre l'efficacité des cryoprotecteurs et le phénomène de formation de glace, soulignant la nature délicate du comportement des protéines dans des environnements stockés cryogéniquement. Comprendre ces facteurs peut aider à améliorer les applications biotechnologiques, comme le stockage sûr de matériaux biologiques, permettant de meilleures techniques de conservation et renforçant la stabilité des protéines à basse température.
Titre: Nanocrystallites Modulate Intermolecular Interactions in Cryoprotected Protein Solutions
Résumé: Studying protein interactions at low temperatures has important implications for optimizing cryostorage processes of biological tissue, food, and protein-based drugs. One of the major challenges is related to the formation of ice nanocrystals which can occur even in the presence of cryoprotectants and can lead to protein denaturation. Here, using a combination of small- and wide-angle X-ray scattering (SAXS and WAXS), we investigate the structural evolution of concentrated Lysozyme solutions in a cryoprotected glycerol-water mixture upon cooling from room temperature (T=300 K) down to cryogenic temperatures (T=195 K). Upon cooling, we observe a transition near the melting temperature of the solution (T~245 K), which manifests both in the temperature dependence of the scattering intensity peak position reflecting protein-protein length scales (SAXS) and the interatomic distances within the solvent (WAXS). Upon thermal cycling, a hysteresis is observed in the scattering intensity, which is attributed to the formation of nanocrystallites in the order of 10 nm. The experimental data is well described by the two-Yukawa model, which indicates temperature-dependent changes in the short-range attraction of the protein-protein interaction potential. Our results demonstrate that the nanocrystal growth yields effectively stronger protein-protein attraction and influences the protein pair distribution function beyond the first coordination shell.
Auteurs: Mariia Filianina, Maddalena Bin, Sharon Berkowicz, Mario Reiser, Hailong Li, Sonja Timmermann, Malte Blankenburg, Katrin Amann-Winkel, Christian Gutt, Fivos Perakis
Dernière mise à jour: 2023-04-12 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2304.05802
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2304.05802
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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