Exploiter les parents sauvages pour améliorer le blé
Utiliser la diversité génétique des parents sauvages peut améliorer la résilience du blé face au climat.
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Table des matières
- Défis de la reproduction avec des parents sauvages
- Utilisation d'Aegilops Tauschii pour améliorer le blé
- L'importance du génotypage et phénotypage
- S'adapter au changement climatique : le rôle d'Aegilops
- Analyse génétique et environnementale
- Évaluation des lignées d'introgression
- Comprendre les associations de traits
- Défis de l'introgression
- Directions futures
- Conclusion
- Source originale
Les parents sauvages des cultures modernes sont super importants pour développer de meilleures variétés de plantes. Ils ont plein de Diversité génétique qui peut aider à améliorer des caractéristiques comme la résistance à la sécheresse et le rendement. Pourtant, seulement une petite partie de cette diversité dans les échantillons stockés est utilisée en reproduction. Il y a plein d'échantillons dans ces collections, ce qui rend le choix des meilleurs pour améliorer les cultures compliqué.
Le blé est l'une des cultures les plus importantes au monde. Il a été créé en mélangeant trois types de graminées sauvages il y a des milliers d'années. Au fil du temps, le blé s'est répandu dans différentes parties du monde, chacune avec des climats uniques. Des archives historiques suggèrent que le blé est arrivé dans des endroits comme la Grande-Bretagne et la Chine il y a des milliers d'années. Cette dispersion a permis au blé de s'adapter à différentes conditions environnementales. Cependant, le changement climatique devrait créer des défis qui pourraient réduire les rendements dans de nombreuses zones de culture du blé. On estime qu'environ 40 % de ces zones pourraient nécessiter de nouvelles variétés pour maintenir la production.
Utiliser la diversité génétique trouvée chez les parents sauvages du blé peut offrir des solutions pour élargir la capacité du blé moderne à s'adapter aux climats changeants. Deux des principaux ancêtres sauvages du blé sont Aegilops tauschii et Triticum turgidum ssp. dicoccoides (blé sauvage). Ces espèces sont bien représentées dans les banques de gènes, qui stockent du matériel génétique pour la recherche et la reproduction. Comme elles partagent des génomes similaires, il est possible d'introduire leurs Traits génétiques dans des variétés modernes de blé pour améliorer leur adaptabilité.
Défis de la reproduction avec des parents sauvages
Malgré leur potentiel, l'utilisation de parents sauvages pour la reproduction reste une tâche complexe. Une façon d'aborder cela est de filtrer les parents sauvages pour des traits spécifiques, mais cette méthode fonctionne mieux pour des traits simples. Beaucoup de traits adaptatifs sont plus compliqués, ce qui rend leur évaluation difficile sans tenir compte du contexte des variétés de blé adaptées.
Une autre approche consiste à créer des "collections centrales", qui sont des ensembles plus petits de génotypes divers sélectionnés pour maximiser la variation génétique. Bien que cela puisse simplifier le processus, cela ignore souvent des gènes adaptatifs moins courants qui sont importants pour la survie dans des environnements spécifiques.
Une troisième méthode consiste à sélectionner des parents sauvages en fonction des données environnementales des lieux où ils ont été collectés. Cela peut aider à capturer des gènes contribuant à l'Adaptation, mais cela peut ne pas couvrir efficacement la diversité génétique de toutes les espèces.
Combiner l'analyse génétique avec des études sur les variations environnementales peut aider à détecter des traits adaptatifs utiles. Les avancées technologiques permettent aux chercheurs de collecter et d'analyser rapidement beaucoup de données génétiques. Cette stratégie peut identifier les gènes associés à des traits adaptatifs spécifiques en examinant comment les fréquences d'allèles varient avec les facteurs environnementaux.
Utilisation d'Aegilops Tauschii pour améliorer le blé
Aegilops tauschii est l'un des ancêtres directs du blé et a une large distribution. Comme il partage des similarités génétiques avec le blé, les sélectionneurs peuvent introduire des traits bénéfiques de ce parent sauvage dans des variétés modernes de blé par hybridation. Ce processus a déjà commencé dans divers programmes de reproduction à travers le monde.
Des recherches ont montré qu'Aegilops tauschii peut améliorer l'adaptabilité du blé à des conditions de manque d'eau et de fortes températures, ainsi qu'augmenter la biomasse et le rendement. Le défi reste de capturer efficacement la diversité de ce parent sauvage pour maximiser ses bénéfices.
Actuellement, plusieurs stratégies visent à prioriser l'utilisation de parents sauvages comme Aegilops tauschii dans la reproduction de cultures résilientes au climat. Une méthode est le pré-scrutin phénotypique pour des traits spécifiques désirables, mais encore une fois, cela a ses limites, surtout pour des traits complexes. Les chercheurs continuent de chercher de nouvelles façons d'intégrer le matériel génétique précieux trouvé chez les parents sauvages dans la reproduction moderne du blé pour améliorer sa performance face aux conditions climatiques changeantes.
L'importance du génotypage et phénotypage
Pour bien comprendre comment incorporer les traits d'Aegilops tauschii dans le blé, une analyse génétique détaillée est nécessaire. Les scientifiques extraient l'ADN de différents accès d'Aegilops tauschii, qui sont des échantillons collectés dans diverses régions. Ces échantillons sont ensuite analysés pour identifier les variations génétiques qui peuvent être liées aux traits d'adaptation.
Le processus implique de séquencer les génomes de ces accès pour découvrir les polymorphismes de nucléotides simples (SNP), qui sont de petites variations génétiques qui peuvent influencer les traits. Une fois ces SNP identifiés, ils peuvent être utilisés pour évaluer comment différents lignages d'introgression (hybrides entre parents sauvages et blé) se comportent sous diverses conditions environnementales.
Cette performance est évaluée sur plusieurs saisons de culture dans différents lieux. Les chercheurs mesurent des traits comme le rendement, la croissance et les réponses physiologiques pour comprendre comment les lignées d'introgression s'adaptent par rapport aux variétés de blé traditionnelles.
De plus, des technologies d'imagerie avancées permettent de surveiller en profondeur la santé des plantes et les dynamiques de croissance au fil du temps. Ces données peuvent révéler des relations entre des traits génétiques spécifiques et la performance globale des plantes. En analysant à la fois les données génétiques et phénotypiques, les scientifiques cherchent à mieux comprendre quels traits contribuent à une adaptation réussie dans des climats changeants.
S'adapter au changement climatique : le rôle d'Aegilops
Alors que les conditions climatiques continuent de changer, les variétés de blé traditionnelles peuvent avoir du mal à s'épanouir. Cela rend crucial d'incorporer les traits génétiques divers des parents sauvages comme Aegilops tauschii, qui s'est adapté à divers défis environnementaux au fil du temps.
Sélectionner des accès d'Aegilops tauschii en fonction de leurs données génétiques et des conditions environnementales où ils ont été trouvés peut aider à améliorer l'adaptabilité du blé moderne. Les chercheurs examinent comment des facteurs climatiques comme la température et les précipitations affectent la variation génétique trouvée dans les populations d'Aegilops tauschii.
En identifiant les gènes d'adaptation climatique au sein d'Aegilops tauschii, les sélectionneurs peuvent choisir les accès les plus prometteurs pour l'introgression dans les variétés de blé. Cette approche vise à renforcer la résilience du blé face aux impacts anticipés du changement climatique, assurant ainsi la production alimentaire continue face à des défis environnementaux.
Analyse génétique et environnementale
Pour mieux comprendre comment Aegilops tauschii s'associe à différents climats, des analyses génétiques ont été réalisées sur une collection diversifiée d'accès. La localisation géographique de chaque accès et les conditions climatiques ont influencé la diversité génétique observée dans la population.
Une partie importante de cette analyse a consisté à mesurer combien de variations dans les traits génétiques pouvaient être expliquées par des distances géographiques et des facteurs climatiques. Les résultats ont montré que le climat à lui seul représentait une partie significative de la variation génétique chez Aegilops tauschii, ce qui signifie que les facteurs climatiques sont un fort moteur de différenciation génétique entre les accès.
Grâce à l'analyse de redondance et aux études d'association à l'échelle du génome (GWAS), les chercheurs ont pu identifier des SNP spécifiques qui sont significativement associés à ces facteurs climatiques. Cela aide à identifier quels gènes pourraient contribuer à une meilleure adaptation, fournissant des informations précieuses pour les programmes de reproduction.
Évaluation des lignées d'introgression
Une fois que les lignées d'introgression ont été développées en croisant Aegilops tauschii avec des variétés de blé adaptées, elles ont été évaluées phénotypiquement dans divers environnements. Cette évaluation a porté sur des traits comme le rendement et les réponses physiologiques à la chaleur et à la sécheresse.
La performance de ces lignées a été comparée à celle des variétés de blé traditionnelles pour voir comment elles s'adaptaient à divers stress. Des technologies de télédétection ont également été utilisées pour recueillir des données sur la santé des plantes, permettant aux chercheurs de suivre les changements au cours de la saison de croissance.
À travers ce processus d'évaluation, les scientifiques ont examiné comment les traits génétiques introgressés corrélaient avec un meilleur rendement et des réponses au stress. Cette relation aide à identifier quels traits spécifiques d'Aegilops tauschii sont bénéfiques lorsqu'ils sont incorporés dans des variétés modernes de blé.
Comprendre les associations de traits
En examinant de près la relation entre les variations génétiques dans Aegilops tauschii et les traits observés dans les lignées d'introgression, les scientifiques peuvent tirer d'importantes conclusions sur les traits qui améliorent la performance. Cette analyse implique de comparer les fréquences d'allèles dans différents traits, en se concentrant sur la façon dont ces fréquences évoluent dans les lignées avec une performance exceptionnelle.
Certains traits, comme le rendement et le nombre de spikelets par épi, ont été trouvés positivement liés, tandis que d'autres ont mis en évidence comment des facteurs génétiques sous-jacents pouvaient contribuer à la santé globale des plantes et à la productivité.
Ces découvertes soutiennent l'idée que l'incorporation d'Aegilops tauschii dans la reproduction du blé peut produire des variétés qui non seulement survivent mais s'épanouissent dans des conditions environnementales difficiles, garantissant ainsi la production alimentaire future.
Défis de l'introgression
Malgré les avantages potentiels d'utiliser des parents sauvages comme Aegilops tauschii, il existe des défis associés à l'introgression. La présence d'allèles délétères liés à des allèles bénéfiques peut compliquer le processus de sélection et affecter la performance globale des plantes.
À mesure que les lignées d'introgression se développent, suivre quels traits génétiques contribuent positivement ou négativement aux résultats des traits devient essentiel. Cette évaluation continue aide les sélectionneurs à comprendre comment sélectionner au mieux les traits désirés tout en minimisant l'impact des associations négatives.
Directions futures
Alors que les technologies de séquençage génétique continuent de progresser et de devenir plus accessibles, il y a des voies prometteuses pour incorporer la diversité génétique des parents sauvages plus efficacement. En intégrant ces technologies avec des scans environnementaux, les chercheurs peuvent identifier et sélectionner plus rapidement les meilleurs accès adaptés à des traits d'adaptation spécifiques.
Aegilops tauschii offre une précieuse ressource génétique pour renforcer la résilience du blé face au changement climatique. La combinaison de l'analyse génétique, de l'évaluation phénotypique et de la sélection continue de traits adaptés sera essentielle pour créer de nouvelles variétés de blé qui peuvent garantir la sécurité alimentaire face à de futurs changements environnementaux.
En comprenant l'adaptation historique des parents sauvages, les sélectionneurs peuvent tirer parti de ces connaissances pour améliorer les variétés de cultures. Cet effort a non seulement le potentiel d'améliorer la productivité agricole, mais contribue également à des pratiques agricoles durables dans le monde entier.
Conclusion
Les parents sauvages comme Aegilops tauschii sont cruciaux pour la reproduction de cultures capables de s'adapter aux climats changeants. Leur diversité génétique offre des traits précieux qui peuvent améliorer la performance du blé dans des conditions difficiles. En tirant parti d'outils génétiques avancés et de méthodologies, les chercheurs visent à sélectionner les meilleurs accès pour l'introgression dans le blé moderne.
En comprenant le lien entre les traits génétiques et les facteurs environnementaux, les scientifiques peuvent développer des variétés de cultures plus résilientes, garantissant un approvisionnement alimentaire stable pour l'avenir. L'intégration des parents sauvages dans les programmes de reproduction représente une direction prometteuse pour atteindre une agriculture résiliente au climat.
Titre: Ecogeographic signals of local adaptation in a wild relative help to identify variants associated with improved wheat performance under drought stress
Résumé: Prioritizing wild relative diversity for improving crop adaptation to emerging drought-prone environments is challenging. Here, we combined the genome-wide environmental scans (GWES) in wheat diploid ancestor Aegilops tauschii with allele testing in the genetic backgrounds of adapted cultivars to identify new diversity for improving wheat adaptation to water-limiting conditions. Evaluation of adaptive allele effects was carried out in Ae. tauschii-wheat introgression lines (ILs) phenotyped for multiple agronomic traits under irrigated and water-limiting conditions using both UAS-based imaging and conventional approaches. The GWES showed that climatic gradients alone explain most (57.8%) of genomic variation in Ae. tauschii, with many alleles associated with climatic factors in Ae. tauschii being linked with improved performance of ILs under water-limiting conditions. The most significant GWES SNP located on chromosome 4D and associated with temperature annual range was linked with reduced canopy temperature in ILs. Our results suggest that (i) introgression of climate-adaptive alleles from Ae. tauschii have potential to improve wheat performance under water-limiting conditions, (ii) variants controlling physiological processes responsible for maintaining leaf temperature are likely among the targets of adaptive selection in a wild relative, and (iii) adaptive variation uncovered by GWES in wild relatives has potential to improve climate resilience of crop varieties.
Auteurs: Eduard Akhunov, M. Nyine, D. Davidson, E. Adhikari, M. Clinesmith, H. Wang, A. Akhunova, A. Fritz
Dernière mise à jour: 2024-03-23 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.20.585976
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.20.585976.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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