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Le rôle des lncRNA dans la recherche sur le vieillissement

Des recherches sur les lncRNAs montrent des liens potentiels avec le vieillissement et l'extension de la durée de vie.

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Le vieillissement, c’est le processus qui se déroule au fil du temps, où les fonctions biologiques diminuent progressivement. Cette baisse peut entraîner divers problèmes de santé compliqués comme le cancer, les maladies cérébrales, et des soucis cardiaques ou métaboliques. Fait intéressant, le vieillissement n’est pas un processus figé ; il peut être influencé par plusieurs facteurs comme la génétique, l'alimentation, et certains médicaments. Des recherches sur des organismes modèles (des trucs simples utilisés pour l'étude) ont montré que ces facteurs peuvent prolonger la durée de vie.

Le rôle des organismes simples dans la recherche sur le vieillissement

Pour étudier le vieillissement, les scientifiques utilisent souvent des organismes simples comme la levure. Un type de levure connu sous le nom de levure fission (Schizosaccharomyces pombe) a été utile pour explorer les facteurs qui influencent le vieillissement. Les chercheurs examinent comment les gènes et les facteurs environnementaux déterminent combien de temps ces cellules survivent lorsqu'elles cessent de se diviser, un état connu sous le nom de durée de vie chronologique (CLS).

La Quiescence est une étape où les cellules arrêtent de grandir mais peuvent rapidement redémarrer quand les conditions s’améliorent. Les cellules quiescentes montrent des changements dans leur réponse au stress et à l'utilisation d'énergie. Elles démontrent aussi un reprogrammement de l'activité des gènes. Étudier la quiescence est essentiel parce que ça se rattache à la façon dont les cellules vieillissent dans des organismes plus complexes.

La quiescence et son importance

Dans les organismes, les états quiescents sont courants mais souvent négligés. Ces états sont importants pour le vieillissement et peuvent être observés dans divers organismes. Par exemple, certains processus liés au vieillissement sont partagés entre la levure et les humains, rendant les découvertes sur la levure pertinentes pour des études plus larges.

Un chemin bien connu qui régule la quiescence et le vieillissement se nomme le réseau de signalisation TORC1. Ce réseau contrôle la croissance, l'utilisation de l'énergie, et la production de protéines, ayant des effets similaires à travers de nombreuses formes de vie, de la levure aux mammifères. Les cellules humaines qui passent d'une phase de quiescence à la division jouent des rôles critiques dans le vieillissement, influençant le travail des cellules souches, le renouvellement des tissus, les réponses immunitaires, et la façon dont les tumeurs résistent aux traitements.

Les ARN longs non codants : un acteur clé

Des recherches récentes mettent en avant le rôle des ARN longs non codants (lncRNAs) dans le processus de vieillissement. Les lncRNAs sont des molécules d'ARN de plus de 200 nucléotides, qui ne produisent pas de protéines. Au lieu de cela, elles aident à réguler les gènes de différentes manières. Malgré leur importance, les lncRNAs ne sont pas bien compris à cause des défis liés à leur étude.

Des preuves suggèrent que certains lncRNAs pourraient être impliqués dans le vieillissement et les maladies liées au vieillissement. Par exemple, certains lncRNAs sont exprimés différemment dans les cellules humaines vieillissantes et pourraient agir comme des indicateurs de problèmes de santé liés à l'âge. Trouver et comprendre les lncRNAs pourrait ouvrir de nouvelles voies pour développer des traitements.

La levure fission est un excellent modèle pour étudier la fonction des lncRNAs parce qu'elle partage certaines caractéristiques avec des organismes plus complexes. Récemment, des chercheurs ont examiné les effets de 150 mutants différents de lncRNA dans la levure fission sous diverses conditions pour mieux comprendre leurs rôles.

La caractérisation de SPNCRNA.1530

Un lncRNA que les chercheurs ont caractérisé est SPNCRNA.1530, renommé aal1. Quand ce lncRNA est actif, il aide à prolonger la CLS dans les cellules non divisantes, interagit avec des Protéines ribosomiques, et réduit la croissance cellulaire. Le gène aal1 produit un segment d'ARN spécifique qui montre une activité accrue dans les cellules de levure non divisantes, ce qui suggère qu'il joue un rôle dans le vieillissement.

Dans des conditions expérimentales, les chercheurs ont découvert que l'augmentation des niveaux d'aal1 dans la levure fission mène à de plus longues durées de vie pour les cellules non divisantes et à une croissance plus lente dans les cellules en division. Cela semble être une caractéristique vitale d'aal1, montrant son potentiel en tant que facteur clé dans le vieillissement.

Effets sur la durée de vie chronologique

En utilisant des configurations expérimentales spécifiques, les chercheurs ont testé comment aal1 impacte la CLS de la levure fission. Ils ont créé deux types de souches : une qui surexprime aal1 et une qui ne l’a complètement pas. La souche avec des niveaux accrus de aal1 a montré une durée de vie plus longue, tandis que la souche sans a eu une durée de vie plus courte.

Il a également été noté qu'augmenter les niveaux de aal1 a conduit à des taux de croissance plus lents dans les cellules divisantes. Cela suggère que la présence de aal1 pourrait aider à maintenir un équilibre entre l’extension de la durée de vie et la croissance cellulaire.

La connexion entre aal1 et les ribosomes

Pour comprendre comment aal1 fonctionne, les chercheurs ont examiné ses interactions avec des gènes codant des protéines, en particulier ceux impliqués dans la traduction des protéines. Lorsque les niveaux d'ARN aal1 augmentent, de nombreux gènes de protéines ribosomiques sont réduits, ce qui signifie qu’aal1 pourrait aider à réguler la production de ribosomes. Les ribosomes sont cruciaux pour traduire l'information génétique en protéines, et des niveaux élevés de ribosomes peuvent souvent conduire à une croissance cellulaire plus rapide.

De plus, aal1 a été trouvé dans le cytoplasme, où se trouvent les ribosomes. Cette localisation soutient l'idée qu’aal1 agit dans le processus de régulation de la traduction.

Les implications du stress ribosomal

Lorsque les chercheurs ont examiné comment aal1 est impliqué dans l’interaction avec les ribosomes, ils ont utilisé des techniques comme le profilage des polysomes. Cela aide à visualiser combien de ribosomes travaillent à traduire des ARNm dans la cellule. Les résultats ont montré que les cellules exprimant des niveaux élevés d’aal1 avaient un contenu global de ribosomes réduit.

Fait intéressant, cette réduction pourrait venir du fait qu’aal1 interagit avec des ARNm spécifiques, comme celui de rpl1901, qui code pour une protéine ribosomique. En se liant à cet ARNm, aal1 pourrait favoriser sa dégradation, entraînant de plus faibles niveaux de ribosomes et ainsi prolongeant la durée de vie.

aal1 et le vieillissement chez les mouches

Les chercheurs ont aussi testé si aal1 pouvait prolonger la durée de vie d'autres organismes au-delà de la levure, spécifiquement chez les mouches à fruits (Drosophila melanogaster). Ils ont utilisé des outils génétiques pour exprimer aal1 chez les mouches et ont observé que cela augmentait significativement leur durée de vie.

Ces découvertes suggèrent que même si la séquence d’ARN aal1 peut ne pas être conservée à travers les espèces, son rôle fonctionnel pourrait être similaire. Cela indique que les mécanismes régulant le vieillissement pourraient être partagés entre différentes formes de vie.

Conclusion

Cette recherche donne un aperçu de la façon dont un lncRNA spécifique, aal1, joue un rôle crucial dans le vieillissement de la levure fission et potentiellement d'autres organismes. En régulant les niveaux de ribosomes et la croissance cellulaire, aal1 impacte la durée de vie. Ces découvertes éclairent la nature complexe du vieillissement et ouvrent des avenues pour des recherches futures qui pourraient mener à des thérapies potentielles pour des maladies liées à l'âge chez les humains.

À mesure que la compréhension des lncRNAs continue d'évoluer, les chercheurs pourraient découvrir encore plus de mécanismes par lesquels ces molécules contribuent aux processus de vieillissement, enrichissant notre connaissance de la biologie et ses implications pour la santé.

Source originale

Titre: Aging-associated long non-coding RNA boosts longevity and reduces the ribosome content of non-dividing fission yeast cells

Résumé: Genomes produce widespread long non-coding RNAs (lncRNAs) of largely unknown functions. We characterize aal1 (aging-associated lncRNA) which is induced in quiescent cells of fission yeast. Deletion of aal1 shortens the chronological lifespan of non-dividing cells, while ectopic overexpression of aal1 prolongs their lifespan, indicating that this lncRNA acts in trans. The overexpression of aal1 leads to the repression of ribosomal protein genes and inhibition of cell growth, and aal1 genetically interacts with coding genes functioning in protein translation. The aal1 RNA localizes to the cytoplasm and associates with ribosomes. Notably, aal1 deletion or overexpression is sufficient to increase or decrease the cellular ribosome content. The rpl1901 mRNA, encoding a ribosomal protein, is a binding target of aal1. The levels of rpl1901 are reduced [~]2-fold by aal1, which is critical and sufficient to extend the lifespan. Remarkably, the expression of aal1 lncRNA in Drosophila triggers an extension of fly lifespan. We propose that aal1 reduces the ribosome content by decreasing the levels of Rpl1901, thus attenuating protein translation and promoting longevity. Although the aal1 lncRNA itself is not conserved, its effect in flies raises the possibility that animals feature related mechanisms that modulate aging, based on the conserved translational machinery.

Auteurs: Jurg Bahler, S. Anver, A. F. Sumit, X.-M. Sun, A. Hatimy, K. Thalassinos, S. Marguerat, N. Alic

Dernière mise à jour: 2024-03-29 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.25.586524

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.03.25.586524.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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