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# Biologie# Biologie du développement

Comment les changements génétiques influencent le développement des mouches à fruits

Une étude montre comment les drosophiles s'adaptent aux changements génétiques dans le développement.

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Les changements dans la manière dont les gènes sont régulés jouent un grand rôle dans le développement et l'évolution des êtres vivants. Pourtant, il y a encore plein de choses qu'on ne comprend pas sur ce processus, surtout quand on regarde différents environnements et comment ces changements se produisent pendant la croissance d’un organisme. En particulier, comprendre comment les réseaux de gènes fonctionnent ensemble durant le développement peut nous en apprendre sur la façon dont les êtres vivants s'adaptent à leur environnement.

Le Rôle des Réseaux de Développement

Les réseaux de développement impliquent plein de processus différents qui opèrent à divers niveaux, des cellules uniques jusqu'aux organismes complets. Ces réseaux ne se concentrent pas seulement sur le travail des gènes de manière individuelle. Ils prennent aussi en compte comment les cellules communiquent entre elles et comment elles réagissent à l'environnement. En général, les scientifiques étudient ces réseaux en se concentrant sur des parties ou des moments spécifiques du développement. Bien que cette approche ait donné des infos précieuses, elle peut aussi limiter notre vision des autres possibilités en matière de régulation génique et d'évolution.

Pour avoir une vue d'ensemble, il faut qu'on regarde comment ces réseaux fonctionnent à une plus grande échelle et chez différents organismes. Cette perspective plus large peut nous aider à comprendre les limites et les chemins potentiels du changement évolutif.

Étude des Réseaux Génétiques chez les Mouches à Fruits

Dans cette étude, on a examiné un réseau de développement bien connu chez les mouches à fruits (Drosophila) qui est responsable des débuts du développement embryonnaire. Plus précisément, on a étudié les effets de copies supplémentaires d'un gène clé nommé bicoid, qui aide à établir le plan corporel de l'embryon. En observant les changements de développement qui se produisaient avec ces copies extracopies de gènes, on a pu voir comment divers Phénotypes, ou traits observables, apparaissaient.

On a constaté que lorsque les mouches à fruits avaient des copies supplémentaires du gène bicoid, elles se développaient différemment. Par exemple, la position de certaines caractéristiques de développement changeait, ce qui permettait à certains embryons de devenir des mouches adultes normales, même si certaines avaient des défauts. Fait intéressant, on a pu voir que les changements dans l'expression des gènes et le développement global de la mouche pouvaient se produire rapidement en laboratoire.

Réponses Rapides aux Changements Génétiques

Notre étude a montré que le gène bicoid a un impact significatif sur le développement des mouches à fruits. Bicoid agit comme un guide, aidant à positionner d'autres gènes qui contrôlent divers traits de développement. Dans les mouches avec des copies supplémentaires du gène bicoid, on a remarqué que la position de certains marqueurs de développement était modifiée. Même si ces mouches avaient des défauts de position, beaucoup pouvaient quand même devenir adultes, bien que avec quelques problèmes.

On a constitué plusieurs groupes de mouches à fruits portant les gènes bicoid supplémentaires et on a suivi comment ces populations réagissaient sur plusieurs générations. Avec deux copies supplémentaires du gène, on a observé que les positions de certains marqueurs de développement commençaient à se rapprocher de celles des mouches normales. Cet ajustement indique que les mouches pouvaient s'adapter aux changements causés par les copies supplémentaires de gènes au fil du temps.

Découvertes de l'Évolution Expérimentale

Pour mieux comprendre comment ces changements se produisaient, on a organisé 15 populations de laboratoire parallèles dérivées de mouches avec les gènes bicoid supplémentaires. Ces populations ont été créées en utilisant des traitements chimiques qui ont introduit des mutations aléatoires. L'objectif était d'observer comment ces changements pouvaient aider les mouches à faire face aux défis de fitness posés par les gènes bicoid supplémentaires.

En observant ces populations de laboratoire, on a constaté que leurs traits de développement commençaient à se stabiliser après plusieurs générations. Les déplacements de position des marqueurs de développement indiquaient un certain niveau d'adaptation aux changements génétiques. On a aussi vu une augmentation surprenante de la taille des ovaires et des embryons, suggérant que les mouches utilisaient des stratégies différentes pour gérer le fardeau génétique d'avoir des bicoids supplémentaires.

La Connexion Entre la Taille de l'Embryon et le Développement

L'un des changements les plus remarquables que nous avons enregistrés était une augmentation de la longueur des embryons dans diverses populations de mouches à fruits au fil des générations. À mesure que la taille de l'embryon augmentait, la capacité à gérer les effets de l'excès de bicoids augmentait également. Les embryons plus grands semblaient donner aux mouches plus de flexibilité de développement, atténuant certains des problèmes associés au développement anormal.

Fait intéressant, cette augmentation de la taille des embryons n'était pas une solution à long terme. Après quelques générations, la taille moyenne des embryons a commencé à diminuer à nouveau. Cette fluctuation suggère que même si les embryons plus grands pouvaient amortir les problèmes de développement, ils pouvaient aussi entraîner leurs propres défis qui ne pouvaient pas être soutenus indéfiniment.

Observation des Changements dans le Métabolisme et les Contributions Maternelles

En plus des changements de taille et de développement, on a aussi remarqué des altérations significatives au niveau moléculaire dans les populations de mouches à fruits. On a réalisé une analyse détaillée de certaines expressions géniques et processus métaboliques qui avaient changé dans les populations expérimentales par rapport à leurs ancêtres. L'augmentation de la taille des embryons semblait correspondre aux changements dans la manière dont les mères fournissaient des nutriments aux œufs en développement.

Beaucoup des gènes qui étaient plus actifs dans les lignées évoluées étaient liés au métabolisme et à la croissance. Cela implique que les mouches avaient ajusté leur utilisation de l'énergie pour soutenir les besoins des embryons plus grands. Puisque les nutriments fournis par la mère sont cruciaux pour le développement des embryons, ce changement met en lumière une connexion plus profonde entre la santé maternelle et la croissance de la progéniture.

Leçons des Populations Naturelles

Nos observations ne se limitaient pas aux mouches en laboratoire. On a aussi étudié des populations naturelles de mouches à fruits, comparant comment des souches sauvages réagissaient aux gènes bicoid supplémentaires. On a découvert que ces souches naturelles, qui diffèrent par leur taille et leurs traits de développement, présentaient des réponses similaires à celles observées en laboratoire. Les embryons plus grands dans les souches naturelles pouvaient offrir une résilience contre les stresses introduits par les gènes bicoid supplémentaires, soutenant encore plus nos résultats des évolutions en laboratoire.

Cette similitude de réponses suggère que les mécanismes qu'on a observés en conditions de laboratoire pourraient être pertinents dans des contextes naturels, où les facteurs environnementaux peuvent influencer le développement embryonnaire et les chemins évolutifs.

Conclusion

Pour résumer, notre étude illustre l'interaction complexe entre la régulation des gènes, le développement et l'évolution. En analysant les effets des duplications du gène bicoid sur le développement des mouches à fruits, on a observé des changements rapides tant au niveau phénotypique que d'expression moléculaire, permettant aux mouches de s'adapter à leur nouvel environnement génétique.

Ces découvertes soulignent l'importance de considérer les réseaux de développement comme des systèmes dynamiques qui peuvent s'adapter rapidement à des conditions changeantes. Les résultats mettent aussi en évidence le rôle des contributions maternelles dans la résilience du développement, ce qui pourrait être un facteur important dans les processus évolutifs.

Dans l'ensemble, cette recherche améliore notre compréhension de la façon dont les organismes vivants réagissent aux changements génétiques et offre des aperçus sur la flexibilité des systèmes de développement face aux défis environnementaux et génétiques. En avançant, continuer à explorer ces relations pourra approfondir notre compréhension de la biologie évolutive et des mécanismes qui motivent l'adaptation.

Source originale

Titre: Rapid response of fly populations to gene dosage across development and generations

Résumé: Although the effects of genetic and environmental perturbations on multicellular organisms are rarely restricted to single phenotypic layers, our current understanding of how developmental programs react to these challenges at a systems level remains limited. Here, we have examined the phenotypic consequences of disturbing the classic bicoid network in Drosophila, which is essential for anterior-posterior patterning in the early embryo. This network can be synthetically perturbed by increasing the dosage of bicoid, which causes a posterior shift of the networks regulatory outputs and a decrease in fitness. To directly monitor network changes across populations and time with extra copies of bicoid, we performed genome-wide EMS mutagenesis, followed by experimental evolution. After only 8-15 generations, experimental populations have normalized patterns of gene expression and increased survival. Using a phenomics approach, we find that populations were normalized through rapid increases in embryo size driven by maternal changes in metabolism and ovariole development. We extend our results to additional populations of flies, demonstrating predictability. Together, our results necessitate a broader view of regulatory network evolution at the systems level. In the future, such synthetic evolution approaches using animal models could provide a generalizable platform for studying the propagation of genetic perturbations across the many layers of complex multicellular systems.

Auteurs: Xueying C. Li, L. Gandara, M. Ekelof, K. Richter, T. Alexandrov, J. Crocker

Dernière mise à jour: 2024-04-04 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.28.509860

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.09.28.509860.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

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