Le rôle de Med12 dans la différenciation cellulaire
Med12 est super important pour réguler comment les cellules se différencient pendant le développement.
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La Différenciation cellulaire, c'est le processus par lequel une seule cellule se transforme en plusieurs types de cellules avec des fonctions différentes. C'est super important pour le développement des organismes, car ça permet de former différents tissus et organes. Pendant la différenciation cellulaire, les cellules changent l'expression de leurs gènes en réponse à des Signaux venant de leur environnement. Ça veut dire que certains gènes sont activés ou désactivés, ce qui mène à des fonctions et caractéristiques variées des cellules.
Comment les cellules changent pendant le développement
Au début du développement chez les mammifères, deux types principaux de cellules apparaissent : les cellules trophoblastiques et la masse cellulaire interne (ICM). Le trophoblaste fait partie du placenta, tandis que l'ICM deviendra finalement l'embryon. L'ICM se divise ensuite en deux groupes : l'endoderme primitif (PrE), qui contribue au placenta, et l'épiblaste embryonnaire (Epi), qui formera le fœtus.
Au fur et à mesure que le processus avance, les cellules Epi passent par des transitions, passant d'un état naïf de pluripotence à des états plus spécialisés. Ça veut dire qu'elles peuvent devenir n'importe quel type de cellule, mais au fur et à mesure qu'elles évoluent, elles deviennent plus spécifiques sur ce qu'elles peuvent devenir. Par exemple, cette transition fait partie de la préparation pour que les cellules forment différentes couches qui deviendront des organes et tissus variés.
L'importance des signaux
Les cellules doivent réagir correctement aux signaux externes pour assurer une bonne différenciation. Ces signaux proviennent de protéines et d'autres molécules à l'extérieur des cellules. Les cellules doivent être capables d'interpréter ces signaux pour produire les bonnes réponses, tout en restant adaptables aux conditions changeantes.
Comprendre comment les gènes sont régulés pendant ce processus est essentiel, car ça aide à révéler comment les cellules décident de se différencier en types spécifiques. Les voies de signalisation jouent un rôle crucial dans ce processus. Par exemple, les signaux des voies FGF (facteur de croissance des fibroblastes) et ERK (kinase régulée par des signaux extracellulaires) sont importants pour la différenciation de la PrE et les diverses transitions que les cellules Epi subissent.
Le rôle du complexe Médiateur
Un des acteurs clés dans la régulation de l'expression génique est le complexe Médiateur, qui est composé de nombreuses protéines qui aident à transmettre les signaux de l'extérieur de la cellule jusqu'à la machinerie à l'intérieur qui active ou désactive les gènes. Ce complexe fait le lien entre différentes molécules de signalisation et l'ARN polymérase, l'enzyme responsable de la copie de l'ADN en ARN. Le bon fonctionnement du Médiateur est essentiel pour une expression génique normale.
Le Médiateur a différentes parties, connues sous le nom de sous-unités, qui peuvent être liées à des changements spécifiques de l'expression génique. Par exemple, quand certaines sous-unités sont absentes, ça peut perturber la façon dont les gènes réagissent aux signaux, affectant le processus de différenciation.
Le focus sur Med12
Dans des études récentes, une protéine appelée Med12 a été mise en avant comme un aspect important du complexe Médiateur. Les chercheurs ont découvert que Med12 joue un rôle significatif dans la façon dont les cellules réagissent aux signaux et régulent l'expression génique. La perturbation de Med12 peut entraîner des changements majeurs dans la façon dont les cellules se différencient.
Par exemple, quand Med12 est éliminé ou ne fonctionne pas correctement, les cellules montrent une capacité réduite à changer leurs schémas d'expression génique en réponse aux signaux. Ça peut affecter leur capacité à sortir de leur état pluripotent, ce qui signifie qu'elles ont du mal à passer d'un type cellulaire générique à un type plus spécialisé.
Comment les chercheurs étudient la régulation génique
Pour mieux comprendre le rôle de Med12, les chercheurs utilisent diverses techniques. Une méthode courante est le criblage CRISPR à l'échelle du génome, qui permet aux scientifiques de modifier des gènes à travers le génome et d'observer les effets sur le comportement cellulaire. Dans ce criblage, les scientifiques peuvent chercher des gènes qui augmentent ou réduisent l'expression de gènes rapporteurs spécifiques.
Dans ce cas, les chercheurs se sont concentrés sur un rapporteur appelé Spry4, qui est connu pour répondre aux signaux FGF et ERK. En modifiant des gènes et en observant les changements dans l'expression de Spry4, les scientifiques peuvent identifier des régulateurs qui influencent la façon dont les cellules se différencient.
Résultats des expériences
Le criblage CRISPR a révélé que plusieurs gènes, y compris ceux impliqués dans la Signalisation FGF, régulent positivement l'expression de Spry4. En revanche, certains gènes affectent négativement l'expression de Spry4, comme ceux qui sont impliqués dans la voie de signalisation mTOR.
Parmi les résultats du criblage, Med12 s'est démarqué comme un régulateur clé de l'expression génique. Son absence a conduit à une expression réduite du rapporteur Spry4, indiquant que Med12 est essentiel pour une signalisation et une régulation génétique appropriées pendant la différenciation.
Le rôle de Med12 dans les cellules pluripotentes
D'autres expériences ont montré que quand Med12 est manquant, les cellules montrent moins de flexibilité dans leur expression génique. Cette perte de plasticité peut freiner la capacité des cellules à se différencier correctement. Par exemple, les cellules ont du mal à maintenir le bon équilibre de l'expression des gènes de pluripotence et leur réactivité aux signaux de différenciation.
Dans des tests pratiques, lorsque Med12 a été éliminé, les cellules avaient une capacité réduite à former des colonies pluripotentes. Ça veut dire qu'elles étaient moins capables de revenir à un état pluripotent après avoir été dirigées à se différencier. La réactivité réduite aux signaux a affecté la capacité des cellules à passer aux états nécessaires pour une différenciation correcte.
La connexion avec la signalisation FGF
Une des voies avec lesquelles Med12 interagit est la voie de signalisation FGF. Cette voie est cruciale pour de nombreux processus cellulaires, y compris la croissance et la différenciation des cellules. Dans le contexte de la différenciation, le rôle de Med12 est d'aider à atténuer les effets des signaux venant de FGF, s'assurant que les cellules peuvent répondre correctement.
Quand les chercheurs ont examiné l'expression génique en aval de la signalisation FGF dans les cellules dépourvues de Med12, ils ont constaté que l'expression de plusieurs gènes cibles de FGF n'était pas significativement modifiée par rapport aux cellules de type sauvage. Ça suggère que même si Med12 joue un rôle dans la régulation, il ne dicte pas complètement comment les gènes réactifs au FGF sont exprimés.
Les effets de la perte de Med12
Quand les scientifiques ont analysé les effets de l'élimination de Med12, ils ont trouvé plusieurs changements clés dans le comportement des cellules. Les cellules montraient une différenciation plus lente et avaient du mal à sortir de leur état pluripotent. Elles présentaient aussi une expression réduite de nombreux gènes liés à la pluripotence.
En plus, les cellules mutantes de Med12 produisaient moins de molécules d'ARNm pendant la différenciation, indiquant une diminution générale de la production transcriptionnelle. Cette réduction de l'expression génique globale peut contribuer à un manque de flexibilité quand les cellules essaient de s'adapter à différents signaux de différenciation.
Les implications pour le développement
Les découvertes entourant Med12 ont des implications significatives pour notre compréhension du développement précoce et de la différenciation. La capacité à manipuler et comprendre comment les cellules se différencient peut avoir des conséquences de grande portée, surtout dans des domaines comme la médecine régénérative et la biologie du développement.
En comprenant comment des protéines comme Med12 médiatisent la signalisation et la transcription dans les cellules souches, les scientifiques pourraient développer de nouvelles stratégies pour contrôler le comportement cellulaire, ce qui pourrait mener à de meilleures thérapies pour diverses maladies et conditions.
Conclusion
En résumé, la différenciation cellulaire est un processus complexe régulé par divers signaux et gènes. Med12 joue un rôle crucial dans ce processus en influençant la façon dont les cellules réagissent aux signaux externes, affectant ainsi leur capacité à se différencier correctement. Grâce à des études qui explorent la régulation des gènes et les voies de signalisation, on peut obtenir des aperçus importants sur les mécanismes du développement, ouvrant la voie à des avancées dans les interventions thérapeutiques.
Titre: Med12 cooperates with multiple differentiation signals to enhance embryonic stem cell plasticity
Résumé: Cell differentiation results from coordinated changes in gene transcription in response to combinations of signals. FGF, Wnt, and mTOR signals regulate the differentiation of pluripotent mammalian cells towards embryonic and extraembryonic lineages, but how these signals cooperate with general transcriptional regulators is not fully resolved. Here, we report a genome-wide CRISPR screen that reveals both signaling components and general transcriptional regulators for differentiation-associated gene expression in mESCs. Focusing on the Mediator subunit Med12 as one of the strongest hits in the screen, we show that it regulates gene expression in parallel to FGF and mTOR signals. Loss of Med12 is compatible with differentiation along both the embryonic epiblast and the extraembryonic primitive endoderm lineage, but pluripotency transitions are slowed down, and the transcriptional separation between epiblast and primitive endoderm identities is enhanced in Med12-mutant cells. These cellular phenotypes correlate with reduced biological noise upon loss of Med12. These findings suggest that Med12 regulates cellular plasticity through the priming of transcriptional changes during differentiation, thereby modulating the effects of a broad range of signals.
Auteurs: Christian Schröter, M. Fernkorn, C. Schröter
Dernière mise à jour: 2024-01-24 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.22.576603
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.01.22.576603.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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