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L'impact du passage d'hôtes bactérien sur la santé publique

La recherche explore comment les bactéries s'adaptent en changeant d'hôtes et les conséquences que ça a sur la santé.

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Changement d'HôteChangement d'HôteBactérien Expliquéinfecter différents hôtes.Enquête sur la capacité des bactéries à
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Récemment, les scientifiques s'intéressent de plus en plus à la façon dont les pathogènes, comme les virus et les Bactéries, peuvent changer d'hôte. C'est important parce que de nouveaux pathogènes représentent un risque grandissant pour la santé humaine. Par exemple, certains virus qui causent des pandémies, comme les coronavirus, se propagent des animaux aux humains. Quand ces pathogènes changent d'hôte, ils se déplacent généralement entre des espèces étroitement liées, comme différents types de mammifères ou d'oiseaux. Par exemple, les coronavirus et les filovirus viennent souvent des chauves-souris, passant parfois par d'autres animaux comme les civettes ou les chameaux avant d'atteindre les humains. D'autre part, de nouveaux types de virus de la grippe viennent principalement des oiseaux aquatiques.

Fait intéressant, il y a très peu de cas connus de virus sautant des humains aux plantes. Un exemple potentiel est le virus de l'hépatite D, qui a quelques similarités avec les viroïdes végétaux, mais il n'est pas directement lié à eux.

En revanche, les bactéries changent souvent d'hôte à travers différents règnes, ce qui signifie qu'elles peuvent passer d'un type d'organisme vivant à un autre qui est assez différent. La plupart de ces changements se produisent entre les plantes et les humains. Les bactéries responsables de ces sauts causent généralement des Infections, mais elles n'affectent souvent que les personnes avec des systèmes immunitaires plus faibles, comme celles à l'hôpital ou avec des problèmes de santé spécifiques.

Comprendre les sauts d'hôte chez les bactéries

L'étude de la façon dont ces sauts d'hôte se produisent est fascinante. Différents organismes ont diverses façons d'être infectés, et pourquoi certaines bactéries peuvent infecter à la fois des plantes et des animaux n'est toujours pas complètement compris, même si cela a été étudié beaucoup. Certains facteurs connus qui pourraient aider les bactéries à infecter différents Hôtes incluent certaines enzymes et toxines, mais les chercheurs essaient encore de comprendre comment ces facteurs fonctionnent ensemble.

Dans des études récentes, les scientifiques ont proposé que certaines enzymes, appelées lipoxygénases, pourraient jouer un rôle dans la façon dont les bactéries peuvent infecter différents types d'hôtes. Les lipoxygénases aident à produire des molécules de signalisation connues sous le nom d'oxylipines, qui sont importantes pour les réponses au stress et immunitaires dans de nombreux organismes vivants. Grâce à cette recherche, on a découvert que les lipoxygénases chez les bactéries sont souvent liées au fait d'être multicellulaires à un certain stade de leur cycle de vie. Cela suggère que les oxylipines pourraient être utilisées pour la communication entre les cellules depuis longtemps.

Cependant, certaines bactéries analysées n'ont pas montré de signes de multicellularité, et peu d'informations écologiques étaient disponibles à leur sujet. À partir des données collectées, les bactéries pouvaient être divisées en trois groupes en fonction de leurs associations : celles qui infectent les humains ou les vertébrés, celles associées aux plantes et celles liées à la vie marine. Fait intéressant, certaines bactéries, comme Pseudomonas aeruginosa et Burkholderia gladioli, peuvent infecter à la fois des plantes et des humains.

Méthodologie de recherche

Pour poursuivre cette recherche, les scientifiques ont commencé par mettre à jour et affiner leur base de données sur les lipoxygénases bactériennes. Ils ont utilisé diverses bases de données en ligne pour trouver de nouvelles séquences et les ajouter à leur liste existante. Les critères d'inclusion pour les bactéries dans cette liste étaient basés sur les données écologiques disponibles et leurs relations connues avec différents hôtes.

Les chercheurs ont effectué une revue approfondie de la littérature existante et utilisé des termes spécifiques pour caractériser l'écologie des bactéries. Ils ont regardé les dix premiers résultats pour chaque espèce dans une base de données bien connue pour les articles médicaux. Ils ont analysé les résumés, les titres et les mots-clés pour extraire des termes écologiques pertinents et les classer en groupes, comme ceux liés aux humains, aux plantes, aux insectes et à la vie marine.

Profil écologique des bactéries portant des LOX

La recherche a montré que le profil écologique des bactéries portant des lipoxygénases a plusieurs traits remarquables. Des termes associés aux menaces pour la Santé publique, comme la résistance aux antimicrobiens, apparaissaient fréquemment, indiquant que beaucoup de ces bactéries pourraient être dangereuses. Les porteurs de LOX associés aux humains affectaient souvent les poumons et causaient des infections, tandis que ceux associés aux plantes vivaient généralement dans les racines.

Dans les représentations visuelles des données, certains groupes sont apparus. Par exemple, il y avait un groupe de termes liés aux plantes et un autre pour les humains et les menaces pour la santé publique. L'analyse a révélé de fortes connexions entre les traits, suggérant que les deux groupes de bactéries portant des LOX pourraient partager des mécanismes similaires pour causer des infections.

Cette analyse de réseau a soutenu une hypothèse précédente selon laquelle la capacité de sauter entre les hôtes végétaux et animaux est une caractéristique commune des bactéries avec des lipoxygénases. Cependant, les bactéries associées à la vie marine semblaient plus isolées de ces modèles, indiquant une fonction écologique différente.

Analyse phylogénétique

L'analyse phylogénétique des bactéries portant des LOX a montré que les modèles correspondaient à leurs profils écologiques plutôt qu'à leur histoire évolutive. Les lipoxygénases étudiées pouvaient être regroupées en clusters reflétant leurs associations avec des pathogènes humains ou végétaux. Elles montraient des preuves de transferts horizontaux de gènes, où des gènes sont échangés entre différents types de bactéries, entraînant des interactions écologiques complexes.

Fait intéressant, les bactéries associées à la vie marine formaient un cluster séparé et n'incluaient pas de pathogènes polyvalents capables d'infecter à la fois des plantes et des animaux. Cette découverte suggère que les bactéries porteuses de LOX dans les environnements marins fonctionnent selon des règles écologiques différentes.

Structure et fonction du site de liaison

L'étude a également examiné les structures des sites de liaison dans les lipoxygénases. Les chercheurs ont calculé les volumes de régions spécifiques qui interagissent avec les substrats. Cette analyse a indiqué que les sites de liaison des lipoxygénases provenant de bactéries associées aux humains et aux plantes étaient similaires, tandis que ceux provenant de bactéries associées à la vie marine étaient significativement plus petits. Cela suggère que les structures des lipoxygénases sont adaptées à leurs hôtes spécifiques.

L'analyse a conduit à l'idée que ces enzymes pourraient facilement changer leurs fonctions entre les interactions végétales et humaines sans changements majeurs dans leurs séquences. Cependant, passer aux hôtes marins pourrait être moins courant en raison des conditions environnementales distinctes et des exigences des organismes marins.

Implications pour la santé publique

Les résultats ont soulevé des inquiétudes quant au potentiel des lipoxygénases bactériennes d'impacter la santé publique, en particulier parmi les populations vulnérables, comme celles avec des systèmes immunitaires affaiblis. L'étude a indiqué que ces bactéries présentent souvent un risque significatif, surtout dans les hôpitaux.

Bien qu'il y ait un risque de "superpropagation" des lipoxygénases parmi certaines bactéries, cette idée a été quelque peu rétractée car des investigations ultérieures ont montré que les conclusions précédentes étaient probablement exagérées. Malgré cela, la présence de résistance aux antimicrobiens et de résistance à plusieurs médicaments restait préoccupante, soulignant la nécessité d'une surveillance continue de ces pathogènes.

Directions futures

La recherche a souligné l'importance de comprendre ces interactions bactériennes pour mieux informer les options de traitement et prévenir d'éventuelles épidémies parmi les patients vulnérables. Il y a aussi un appel à explorer les rôles écologiques des bactéries porteuses de LOX dans les écosystèmes marins, qui restent mal compris.

Comprendre comment ces bactéries exploitent différents systèmes d'hôtes est crucial à la fois pour la science fondamentale et pour des domaines appliqués, comme la microbiologie médicale et la santé publique. Continuer à étudier les lipoxygénases pourrait éclairer comment les organismes microbiens s'adaptent et prospèrent dans divers environnements, aidant finalement à lutter contre les maladies infectieuses.

Conclusion

En conclusion, cette recherche met en lumière les interactions complexes entre les bactéries et leurs hôtes. La capacité des bactéries à changer entre différents hôtes et le rôle des lipoxygénases dans ces processus sont essentiels pour comprendre le comportement des pathogènes et développer des stratégies pour combattre les infections. Alors que le paysage des maladies infectieuses continue à évoluer, reconnaître le lien entre l'écologie microbienne et la santé humaine est plus important que jamais.

Source originale

Titre: Bacterial lipoxygenases are associated with host-microbe interactions and may provide cross-kingdom host jumps

Résumé: In this bioinformatic research, we studied the association of bacterial lipoxygenases (LOXs) with pathogenic and symbiotic traits by text networks analysis, phylogenetic analysis, and statistical analysis of molecular structure. We found that bacterial lipoxygenases are associated with a broad host range -- from coral to plants and humans. In humans, bacterial LOXs are associated with opportunistic and nosocomial infections as well as with affecting specific patient populations like cystic fibrosis patients. Moreover, bacterial LOXs are associated with plant-human (or human-plant) host jumps in emerging pathogens. We also inferred a possible mechanism of such host jumps working via a hosts oxylipin signalling "spoofing". Graphical abstract O_FIG O_LINKSMALLFIG WIDTH=200 HEIGHT=81 SRC="FIGDIR/small/497025v5_ufig1.gif" ALT="Figure 1"> View larger version (21K): [email protected]@17c5242org.highwire.dtl.DTLVardef@fca335org.highwire.dtl.DTLVardef@3f2cae_HPS_FORMAT_FIGEXP M_FIG C_FIG

Auteurs: Georgy Kurakin

Dernière mise à jour: 2024-04-07 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.21.497025

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.06.21.497025.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

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