Avancées dans la modification génétique avec CRISPR/Cas
Des scientifiques améliorent les cultures avec CRISPR/Cas pour une meilleure production alimentaire.
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Alors que la population mondiale augmente, la demande de nourriture s'accroît. Pour répondre à ce besoin, les scientifiques travaillent sur la création de meilleures variétés de cultures. Ces cultures améliorées peuvent produire plus de nourriture, offrir une meilleure nutrition et résister aux ravageurs et au stress environnemental. Les méthodes traditionnelles de croisement des plantes ont des limites en termes d’efficacité et de rapidité pour apporter ces améliorations.
Pour surmonter ces défis, les scientifiques utilisent maintenant une technique appelée CRISPR/Cas. Cette méthode permet des modifications précises de la composition génétique d'une plante. Le système CRISPR/Cas a été développé à l'origine comme un mécanisme de défense chez les bactéries, et les chercheurs l'ont adapté pour une utilisation dans les plantes. Le processus implique un petit morceau d'ARN qui guide la protéine Cas vers une partie spécifique de l'ADN. La protéine Cas effectue ensuite une coupure dans l'ADN, ce qui peut entraîner des changements dans le fonctionnement des gènes.
Défis avec les Plantes Ligneuses
Pour certains types de plantes, en particulier des espèces ligneuses comme les arbres et les arbustes, il y a des défis supplémentaires. Ces plantes ne réagissent souvent pas bien aux techniques traditionnelles de Modification génétique. Elles peuvent croître lentement et ne pas se régénérer facilement en laboratoire. Pour gérer ce problème, les scientifiques ont trouvé une méthode pour créer des racines chevelues dans ces plantes. Les racines chevelues sont un type de racine spécial qui peut se former lorsque les plantes sont infectées par certaines bactéries. Cette méthode peut être plus efficace que d'autres techniques traditionnelles.
Les cultures de racines chevelues peuvent également être associées à la technologie CRISPR/Cas pour étudier le fonctionnement des gènes. Cette méthode a été réussie dans divers types de plantes, y compris certaines cultures fruitières. En créant des plantes composites avec à la fois des racines naturelles et génétiquement modifiées, les chercheurs peuvent enquêter sur le rôle de gènes spécifiques dans l'ensemble de la plante.
Le Genre Prunus et Son Importance
Le genre Prunus inclut de nombreux arbres fruitiers et plantes ornementales, comme les cerises, les pêches et les amandes. Certaines espèces de ce genre sont difficiles à transformer avec des méthodes traditionnelles. Par exemple, les efforts pour modifier génétiquement les arbres à amandes ont eu un succès limité. Pour trouver une meilleure méthode, les chercheurs ont développé un protocole pour induire des racines chevelues dans les plantes à amande.
Dans leur étude, les chercheurs ont injecté un type de bactéries génétiquement modifiées dans de jeunes semis d'amandiers. Cette méthode a réussi à faire apparaître des racines chevelues dans un bon nombre de plantes. Après avoir excisé les racines chevelues, ils les ont cultivées en conditions de laboratoire. Ils ont expérimenté différents milieux de croissance pour trouver les meilleures conditions pour la croissance des racines. Malheureusement, les racines n'ont pas bien poussé lors de ces premières tentatives.
Cependant, ils ont trouvé que laisser les racines chevelues pousser aux côtés des plantes à amande entraînait une croissance plus saine. Après un certain temps, les plantes ont été transférées dans le sol pour pousser à l'extérieur. Ce système de plante composite a permis aux chercheurs de réaliser des expériences sur les racines et leurs réactions aux changements génétiques.
Analyse de la Fonction des Gènes avec CRISPR/Cas
Les chercheurs se sont concentrés sur deux gènes spécifiques dans les amandes : un qui aide la plante à réagir au stress et un autre qui contrôle la croissance. En utilisant la méthode CRISPR/Cas, ils ont cherché à introduire des changements dans ces gènes dans les racines chevelues. Ils ont conçu de petits modèles d'ARN pour guider la protéine Cas spécifiquement vers ces gènes.
Dans leurs tests, ils ont créé des plantes composites avec les racines chevelues modifiées grâce à la technologie CRISPR/Cas. En examinant les racines, ils ont pu confirmer si les changements souhaités avaient été apportés aux gènes cibles. Ils ont également mesuré les niveaux d'activité des gènes modifiés pour voir à quel point ils fonctionnaient efficacement.
Résultats de l'Étude
Les résultats ont montré que l'approche CRISPR/Cas a réussi à modifier les gènes cibles dans les racines chevelues. Certaines racines ont montré des changements notables dans l'expression des gènes, indiquant que l'édition était efficace. Les chercheurs ont également vérifié les changements génétiques non intentionnels, connus sous le nom d'effets hors cible, et n'en ont trouvé aucun chez les plantes qu'ils ont analysées.
Bien que les plantes composites créées dans cette étude ne puissent pas transmettre les changements génétiques à leur descendance, elles fournissent des informations utiles sur le fonctionnement de gènes spécifiques. En examinant les racines et leur croissance, les chercheurs peuvent obtenir des informations importantes sur le développement des plantes et les réponses au stress.
Implications pour l'Agriculture
Ce travail a des implications significatives pour l'agriculture. En améliorant l'efficacité des techniques de modification génétique dans des cultures importantes comme les amandes, les scientifiques peuvent aider à augmenter la production alimentaire. Alors que le monde fait face au défi de nourrir une population croissante, ces avancées en science des plantes pourraient jouer un rôle clé.
Le développement de protocoles de transformation robustes pour les plantes ligneuses peut conduire à des programmes de sélection plus réussis. Ces programmes peuvent produire des cultures qui sont non seulement plus productives, mais aussi mieux adaptées à résister aux stress environnementaux tels que la sécheresse ou les ravageurs.
Directions Futures
Les chercheurs prévoient de peaufiner davantage leurs techniques d'utilisation de CRISPR/Cas dans diverses espèces de Prunus. Ils croient que leurs méthodes pourraient également être applicables à d'autres cultures de fruits et de noix. En améliorant la capacité de modifier les gènes dans ces plantes, les scientifiques pourraient découvrir de nouvelles façons d'améliorer la qualité et le rendement des cultures.
Les études futures pourraient se concentrer sur la combinaison de la technologie CRISPR avec d'autres approches pour mieux comprendre la biologie des plantes. Cette méthode intégrée pourrait inclure l'examen de la façon dont plusieurs gènes fonctionnent ensemble et leur impact global sur la santé et la productivité des plantes.
Conclusion
En regardant vers l'avenir, l'utilisation de techniques génétiques innovantes comme CRISPR/Cas offre de l'espoir pour améliorer notre approvisionnement alimentaire. En permettant des changements ciblés dans les gènes des plantes, les scientifiques peuvent développer des cultures qui prospèrent dans des conditions difficiles. Ce progrès est essentiel pour garantir que nous puissions nourrir une population de plus en plus nombreuse tout en protégeant notre environnement. Des recherches comme celle-ci posent les bases de la prochaine génération de pratiques agricoles durables et efficaces.
Titre: Genome editing in almond: A CRISPR-based approach through hairy root transformation
Résumé: Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein (CRISPR/Cas) technology has revolutionized genome manipulation for crop enhancement, providing a powerful toolkit. However, the tissue culture and plant regeneration steps that are critical to the CRISPR/Cas editing framework are often challenging, especially in some woody plant species that exhibit substantial resistance to these procedures. To address this, we have developed an injection-based protocol for inducing hairy roots in almond (Prunus dulcis, syn. Prunus amygdalus), a species known for its recalcitrance to conventional transformation methods. Notably, the hairy root induction method also proved effective in almond x peach hybrids. To evaluate its utility for gene functional analysis, we combined the hairy root transformation system with CRISPR/Cas9 gene editing technology, targeting two transcription factor genes (ERF74 and GAI). Our efforts resulted in transformants with target knock-out, suggesting the potential of this genetic transformation technology as a valuable tool for future routine gene function studies in almond.
Auteurs: Helene S Robert, V. Jedlickova, M. Stefkova, J. F. Sanchez Lopez, J. Grimplet, M. J. Rubio Cabetas
Dernière mise à jour: 2024-04-11 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.11.588989
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.11.588989.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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