Nouvelles idées sur les combinaisons d'antibiotiques et la résistance bactérienne
Des recherches montrent comment les combinaisons d'antibiotiques influencent la croissance des bactéries et leurs taux de survie.
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Table des matières
La résistance antimicrobienne (RAM) est un gros souci que la société affronte en ce moment. Ce problème arrive quand les bactéries changent et ne répondent plus aux médocs qui les tuaient ou freinaient leur croissance. La situation s'est empirée avec le temps à cause d'une baisse dans la découverte de nouveaux antibiotiques. Du coup, il est super important de bien utiliser les antibiotiques qu'on a pour combattre les infections bactériennes.
Une méthode pour rendre les antibiotiques plus efficaces, c'est d'utiliser des combinaisons de différents antibiotiques. Utiliser plus d'un antibiotique peut aider à ralentir le développement de la résistance et à améliorer les résultats du traitement. Mais, combiner des antibiotiques peut aussi causer des interactions entre eux, ce qui peut soit booster leur efficacité, soit la diminuer. Quand les antibiotiques interagissent, leur effet combiné sur la Croissance bactérienne peut être plus fort que prévu (on appelle ça synergique) ou moins fort que prévu (appelé antagoniste). Pour mieux comprendre ces interactions, les chercheurs comparent ce qui se passe quand les antibiotiques sont utilisés ensemble à ce qui se passe quand ils sont utilisés séparément.
Les interactions entre antibiotiques se mesurent en comparant leurs effets observés aux effets attendus basés sur leurs actions individuelles. Deux modèles, l'indépendance de Bliss et l'additivité de Loewe, sont souvent utilisés pour prédire comment ces antibiotiques devraient se comporter en combinaison. Malgré de nombreuses interactions étudiées, les mécanismes spécifiques derrière beaucoup de ces interactions ne sont toujours pas totalement compris.
Les Effets des Combinaisons d'Antibiotiques sur les Bactéries
Les chercheurs ont étudié les interactions de certains antibiotiques qui ciblent l'ADN, comme les fluoroquinolones, avec des inhibiteurs de traduction, comme le chloramphénicol ou la tétracycline. Ils ont trouvé que quand ces antibiotiques sont combinés, l'effet peut parfois être plus faible que prévu. Parfois, la combinaison peut même entraîner une augmentation des taux de croissance de certaines bactéries, ce qui est un peu bizarre. On pense que les fluoroquinolones tuent les bactéries en perturbant des processus importants dans leurs cellules, ce qui entraîne des dommages à l'ADN. Les bactéries réagissent à ces dommages en activant des mécanismes de réparation pour les aider à survivre.
D'un autre côté, les inhibiteurs de traduction comme la tétracycline fonctionnent en arrêtant les bactéries de produire des protéines, qui sont essentielles pour leur croissance. La combinaison de ces deux types d'antibiotiques peut parfois mener à une meilleure croissance de la population parce que l'inhibiteur de traduction peut aider à équilibrer la surproduction de protéines causée par la fluoroquinolone.
Comprendre comment différents niveaux de nutriments affectent les combinaisons d'antibiotiques est crucial pour traiter efficacement les infections bactériennes. Les taux de croissance bactérienne peuvent varier rapidement selon le site de l'infection dans le corps. Par exemple, les bactéries E. coli peuvent doubler de nombre toutes les 3 heures dans l'intestin, mais peuvent le faire toutes les 22 minutes dans les voies urinaires.
La composition d'une bactérie est sensible aux changements dans les environnements nutritionnels, ce qui affecte sa réponse aux antibiotiques. On a observé que les bactéries à croissance rapide ont tendance à être plus affectées par certains antibiotiques que celles à croissance plus lente. Cela suggère que les conditions de croissance changent non seulement la composition des bactéries, mais peuvent aussi influencer leur réponse aux traitements antibiotiques.
L'Importance des Études au Niveau des Cellules Individuelles
Des études ont montré que même au sein de cultures bactériennes isogéniques (génétiquement identiques), il y a beaucoup de variation entre les cellules individuelles en termes de leur comportement, y compris les taux de croissance, les réponses au stress et la sensibilité aux antibiotiques. Quand on applique des antibiotiques, ça peut encore augmenter cette variabilité dans la population. On a remarqué que les dommages à l'ADN peuvent entraîner des variations dans la vitesse à laquelle les cellules grandissent et se divisent, ce qui peut grandement impacter le comportement de la population dans son ensemble.
Pour mieux comprendre comment les bactéries répondent aux combinaisons d'antibiotiques, il est crucial de les étudier au niveau des cellules individuelles. Les mesures traditionnelles de croissance de population regardent le comportement moyen de nombreuses cellules, ce qui peut faire perdre de vue des détails importants sur la façon dont les cellules individuelles réagissent aux traitements.
Dans cette recherche, les scientifiques ont utilisé un appareil appelé "mother machine" pour mesurer comment différentes cellules individuelles répondaient aux combinaisons de ciprofloxacine (une fluoroquinolone) et de tétracycline. Ils se sont spécifiquement intéressés à des facteurs comme la croissance des cellules, l'élongation et combien de cellules mouraient lorsqu'elles étaient exposées à ces antibiotiques.
Les chercheurs ont découvert que la combinaison de ciprofloxacine et de tétracycline n'améliorait pas tant la croissance des cellules qu'elle réduisait la mort cellulaire. La combinaison a conduit à une augmentation de la survie, particulièrement chez les cellules à croissance rapide. Ils ont ensuite regardé de plus près comment différentes cellules réagissaient au traitement à la ciprofloxacine seule. Certaines cellules continuaient de croître et de se diviser, tandis que d'autres arrêtaient complètement de croître.
Analyser les Effets des Antibiotiques
Pour examiner en profondeur comment la combinaison d'antibiotiques fonctionnait, les scientifiques ont surveillé les taux d'élongation des cellules et d'autres paramètres importants sous diverses conditions de croissance. Ils ont découvert que la combinaison de ciprofloxacine et de tétracycline menait à des taux de survie accrus pour les cellules individuelles.
Les chercheurs ont mesuré la survie des bactéries sous différents traitements à travers trois conditions de croissance uniques. Ils ont constaté que la combinaison de ciprofloxacine et de tétracycline améliorait nettement la survie des bactéries par rapport à l'utilisation de ciprofloxacine seule. Cela était vrai pour toutes les conditions de croissance testées, ce qui signifie que la combinaison d'antibiotiques était efficace pour maintenir des populations bactériennes plus élevées.
Haute Expression SOS et Ses Conséquences
Pour mieux comprendre comment les cellules mouraient, les chercheurs ont aussi regardé la Réponse SOs, qui est un système de réparation cellulaire activé en réponse à des dommages à l'ADN. Ils ont trouvé qu'un sous-ensemble de cellules montrait des niveaux élevés de réponse SOS. Ces cellules étaient plus susceptibles de mourir, surtout dans des conditions de croissance plus lentes.
Fait intéressant, dans le traitement combiné, bien que la survie globale ait augmenté, les chercheurs ont noté que la dynamique de la réponse SOS avait changé. Les cellules qui ont survécu avaient tendance à avoir des niveaux d'expression SOS plus bas que les cellules qui sont mortes. Cela suggère une interaction complexe où la réponse des cellules aux dommages et la présence des antibiotiques peuvent grandement affecter leur destin.
Importance des Conditions de Croissance
La recherche a mis en avant que les conditions de croissance influençaient profondément la façon dont les bactéries réagissent aux combinaisons d'antibiotiques. Les cellules à croissance rapide ont vu des améliorations plus significatives dans leurs taux de survie lorsqu'elles étaient traitées avec la combinaison d'antibiotiques, tandis que les cellules à croissance plus lente en profitaient moins.
Les chercheurs ont observé que les cellules à croissance rapide traitées avec la tétracycline avaient leur croissance ralentie, ce qui pourrait les aider à mieux survivre quand on les combinait avec la ciprofloxacine. On pense que la combinaison empêchait en fait certains des effets plus dommageables causés par la ciprofloxacine seule.
Conclusion
L'étude des interactions entre antibiotiques, surtout à travers des combinaisons spécifiques comme la ciprofloxacine et la tétracycline, éclaire les complexités du comportement bactérien et de la résistance. Elle souligne l'importance d'utiliser les antibiotiques existants de manière plus efficace, en particulier à travers des combinaisons.
Comprendre comment ces antibiotiques affectent les cellules individuelles plutôt que juste les populations offre des perspectives précieuses pour lutter contre la résistance antimicrobienne. À mesure que les bactéries évoluent et s'adaptent, la recherche continue sur les combinaisons d'antibiotiques et leurs mécanismes sera essentielle pour développer des stratégies de traitement efficaces.
Les résultats mettent en avant la nécessité de prendre en compte les réponses des cellules individuelles au sein des populations bactériennes, car cela peut grandement influencer les résultats des traitements dans l'ensemble. L'objectif reste de maximiser l'efficacité des antibiotiques actuels tout en atténuant le développement de la résistance par une application et une recherche précises.
Titre: Suppression of bacterial cell death underlies the antagonistic interaction between ciprofloxacin and tetracycline in Escherichia coli
Résumé: Antibiotic combinations are an attractive strategy to maximise the efficiency of drug treatment and minimise resistance evolution, but we still lack a full understanding of their effect on bacterial cells. The interaction between DNA-targeting antibiotics, such as ciprofloxacin, and translation inhibitors, such as tetracycline, is antagonistic, resulting in a weaker effect on bacterial growth than expected from the effect of each single drug. This antagonism has been analysed in detail at the population level, but we lack a single-cell understanding of its effect and how it depends on nutrient availability. Here, we used a microfluidic device to quantify the antagonism between ciprofloxacin and tetracycline at the single-cell level in three nutrient conditions. We showed that improved growth is due to increased survival of cells under the drug combination compared to ciprofloxacin alone. This effect is growth-dependent, with better suppression in rich nutrient conditions. Quantification of the DNA damage response (SOS response) revealed two sub-populations among the cells that die upon ciprofloxacin treatment, with some cells reaching a very high level of SOS while others had a lower level of SOS, similar to surviving cells. The low-SOS cells were more frequent in fast growth conditions and showed increased survival under the drug combination but the high-SOS cells were hardly rescued by the drug combination. This result explains the stronger antagonistic effect of tetracycline on ciprofloxacin in fast growth compared to slow growth. Our results underscore the importance of single-cell quantification in understanding the bacterial response to antibiotic combinations and devising new treatment strategies.
Auteurs: Meriem El Karoui, J. Broughton, A. Fraisse
Dernière mise à jour: 2024-04-20 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.18.590101
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.18.590101.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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