Simple Science

La science de pointe expliquée simplement

# Biologie# Microbiologie

Santé interconnectée : Le rôle des microbiomes

Cette étude examine comment les microbiomes influencent la santé des écosystèmes.

― 7 min lire


Microbiomes et impact surMicrobiomes et impact surla santé des écosystèmesinterconnectés.stress nuisent aux microbiomesUne étude révèle que les facteurs de
Table des matières

L'idée de One Health se concentre sur le fait que les humains, les Animaux, les Plantes et notre environnement sont tous connectés et que leur santé dépend les uns des autres. Ça veut dire que si une partie de ce système ne va pas bien, ça peut affecter les autres. Un élément clé de ce système, ce sont les petits organismes vivants, appelés microbes, qui vivent sur et à l'intérieur de tous ces composants. Ces microbes jouent des rôles importants pour maintenir tout le système en bonne santé.

Le Rôle des Microbiomes

Chaque partie de notre système – des humains aux plantes en passant par les animaux – abrite une communauté de microbes qu’on appelle un microbiome. Ces microbiomes aident à diverses fonctions, comme décomposer la nourriture, combattre les maladies et recycler les nutriments. Par contre, quand ces microbiomes sont perturbés ou déséquilibrés, ça peut causer des problèmes de santé pour tout le système.

Par exemple, si le microbiome dans notre intestin est pas en forme, ça peut entraîner des problèmes digestifs, et si le microbiome du sol est affecté, ça peut nuire à la croissance des plantes. C'est pour ça que c'est super important de comprendre comment ces microbiomes réagissent face à différents défis.

Stress qui Impactent les Microbiomes

Divers stress peuvent nuire à la santé de ces microbiomes. Les stress peuvent être des produits chimiques comme les métaux lourds, les pesticides ou certains métabolites de plantes. Ces substances peuvent affecter directement la santé de l'environnement ou des organismes vivants qui s’y trouvent. Elles peuvent changer la vitesse de croissance des organismes, leur façon de traiter la nourriture, et même perturber l'équilibre des microbiomes.

La recherche se concentre généralement sur comment ces stress affectent la santé des humains, des animaux ou des plantes individuellement. Cependant, il y a un manque d'études sur comment un stress impacte les microbiomes connectés entre différents composants du système. Comprendre ça pourrait nous aider à savoir à quel point les microbiomes individuels sont résilients face à des défis communs.

Le Besoin d'Études Complètes

Pour combler cette lacune, on doit faire des études systématiques où les microbiomes de différents composants du système – comme l'eau, le sol, les plantes et les animaux – sont exposés aux mêmes stress dans des conditions contrôlées. Ça nous permettra de répondre à plusieurs questions clés sur les connexions entre microbiomes et leurs réponses au stress.

Les principales questions à explorer seraient :

  1. Les microbiomes de différents composants peuvent-ils être affectés négativement par le même stress ?
  2. Si oui, comment leur sensibilité au stress se compare-t-elle entre et au sein des différents composants ?
  3. Y a-t-il des réponses communes ou des différences dans la façon dont ces microbiomes réagissent au stress ?

Mise en Place de l'Étude

Pour investiguer ces questions, les chercheurs ont conçu un modèle de chaîne alimentaire idéal composé d'eau, de sédiments, de sol, de plantes et d'animaux (comme des souris). Ils ont sélectionné trois stress : l'arsenic (un métal toxique), les benzoxazinoïdes (des produits chimiques naturels provenant des plantes) et le terbuthylazine (un herbicide courant).

Les Composants de l'Étude

  1. Eau et Sédiments : Ces éléments représentent les parties aquatiques de l'écosystème, remplies de microbes divers.
  2. Sol : Contient une riche Diversité de microbes qui jouent un rôle crucial dans le recyclage des nutriments.
  3. Plantes : Représentent des producteurs primaires qui dépendent de leurs microbiomes pour leur croissance et leur santé.
  4. Animaux : Ici, des souris ont été utilisées pour représenter des consommateurs finaux qui comptent sur des intestins sains grâce à leurs microbiomes.

Les chercheurs ont ensuite exposé systématiquement ces microbiomes aux produits chimiques sélectionnés tout en s'assurant de concentrations constantes et en les surveillant dans le temps.

Méthodologie de Recherche

Les chercheurs ont préparé des solutions contenant les stress et les ont appliquées à chaque composant tous les jours pour garantir une exposition continue. Après une semaine, des échantillons ont été prélevés de chaque composant pour analyse. Ils ont extrait l'ADN des échantillons pour étudier les microbiomes, en se concentrant sur les signatures génétiques uniques des microbes présents.

Analyse des Microbiomes

Ils ont utilisé différentes techniques pour évaluer la santé globale et la diversité des microbiomes. Les métriques importantes incluaient :

  • Diversité Alpha : Mesure combien de types différents de microbes sont présents dans un microbiome et leur répartition relative.
  • Diversité Bêta : Regarde à quel point les microbiomes sont différents les uns des autres.

Ces évaluations aident à identifier à quel point ces microbiomes sont résilients sous stress.

Comprendre les Résultats

Une fois les données collectées, les chercheurs ont découvert que les microbiomes réagissaient différemment aux stress appliqués.

Sensibilité aux Stress Chimiques

Le microbiome animal a montré les plus grands changements dans sa structure de communauté et sa diversité, indiquant qu'il était le plus sensible aux stress chimiques. Le microbiome du sol a montré une réduction de la diversité, tandis que les autres composants, comme l'eau et les plantes, montraient des changements moins dramatiques.

De plus, les microbes spécifiques qui ont augmenté ou diminué en abondance ont été documentés, fournissant des idées sur quels microbes étaient plus résilients ou sensibles aux différents stress.

Impacts sur la Santé

Les modifications des microbiomes peuvent avoir des implications sérieuses sur la santé. Par exemple, un déclin de certaines bactéries bénéfiques pourrait entraîner une susceptibilité accrue aux maladies chez les animaux, tandis que les changements dans les microbiomes du sol peuvent affecter la santé des plantes. Ça crée une réaction en chaîne, pouvant mettre en péril la santé globale de l'écosystème.

Réseaux de Co-occurrence

Les chercheurs ont également étudié comment les microbes interagissaient au sein des communautés. Ils ont créé des réseaux de co-occurrence pour visualiser ces relations. Des réseaux avec plus de connexions (ou nœuds) sont généralement plus sains et plus stables. Après exposition aux stress, certains réseaux sont devenus moins denses, indiquant une perte potentielle d'interactions bénéfiques entre les microbes. Notamment, le réseau animal a beaucoup changé, suggérant qu'il pourrait être moins stable après exposition au stress.

Conclusions et Directions Futures

Cette étude met en lumière la complexité de la santé à travers des systèmes interconnectés et montre comment les différents composants réagissent de manière unique aux mêmes stress. Les résultats soulignent le besoin de plus de recherche sur comment maintenir des microbiomes sains dans tous les composants de l'écosystème.

À mesure que la science avancer, comprendre ces connexions sera crucial pour développer des stratégies efficaces pour promouvoir la santé des écosystèmes et des organismes qui les habitent. Combler cette lacune de connaissance pourrait mener à de meilleures pratiques pour l'agriculture, la gestion de l'environnement et la santé publique.

En conclusion, les résultats soulignent l'importance de prendre une vue holistique de la santé, où les interdépendances des microbiomes à travers différents composants sont prises en compte, contribuant finalement à un planet plus sain pour tous.

Source originale

Titre: Component specific responses of the microbiomes to common chemical stressors in the human food chain

Résumé: Along a food chain, microbiomes occur in each component and often contribute to the functioning or the health of their host or environment. One Health emphasizes the connectivity of each components health. Chemical stress typically causes dysbiotic microbiomes, but it remains unclear whether chemical stressors consistently affect the microbiomes along food chain components. Here, we systematically challenged a model food chain, including water, sediments, soil, plants, and animals, with three chemical stresses consisting of arsenic (a toxic trace element), benzoxazinoids (an abundant bioactive plant metabolites), and terbuthylazine (an herbicide typically found along a human food chain). The analysis of 1,064 microbiome profiles for commonalities and differences in their stress responses indicated that chemical stressors decreased microbiome diversity in soil and animal, but not in the other microbiomes. In response to stress, all food chain communities strongly shifted in their composition, generally becoming compositionally more similar to each other. In addition, we observed stochastic effects in host-associated communities (plant, animal). Dysbiotic microbiomes were characterized by different sets of bacteria, which responded specifically to the three chemical stressors. Microbial co-occurrence patterns significantly shifted with either decreased (water, sediment, plant, animal) or increased (soil) network sparsity and numbers of keystone taxa following stress treatments. This suggested major re-distribution of the roles that specific taxa may have, with the community stability of plant and animal microbiomes being the most affected by chemical stresses. Overall, we observed stress- and component-specific responses to chemical stressors in microbiomes along the model food chain, which could have implications on food chain health.

Auteurs: Alban Ramette, W. Wasimuddin, A. Chiaia-Hernandez, C. Terrettaz, L. Thoenen, V. Caggia, P. Matteo, M. Coll-Crespi, M. Notter, M. Mukherjee, T. Chavez-Capilla, F. Ronchi, S. C. Ganal-Vonarburg, M. Grosjean, M. Bigalke, S. Spielvogel, A. Macpherson, A. Mestrot, S. Hapfelmeier, M. Erb, K. Schlaeppi

Dernière mise à jour: 2024-04-21 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.20.590402

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.20.590402.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

Merci à biorxiv pour l'utilisation de son interopérabilité en libre accès.

Plus d'auteurs

Articles similaires