Nouvelles découvertes dans la recherche sur les virus de chauve-souris

Les chauves-souris sont un groupe varié de mammifères, juste derrière les rongeurs en nombre d'espèces. Elles jouent plusieurs rôles importants dans la nature, comme aider à polliniser les plantes, contrôler les nuisibles, disperser des graines et participer à la reforestation. Mais bon, elles portent aussi plein de virus, dont certains peuvent provoquer des maladies chez les humains. Certains de ces virus de chauves-souris sont connus pour être la source de maladies qui peuvent passer des animaux aux gens. Ça complique la gestion des écosystèmes à cause des menaces directes que ces virus font peser sur les populations de chauves-souris.

Des recherches suggèrent que les chauves-souris ont des caractéristiques uniques qui leur permettent de porter des virus. Une des raisons est leur capacité à voler, ce qui a pu entraîner des changements dans leur métabolisme qui pourraient affaiblir leur système immunitaire. De plus, les chauves-souris vivent souvent en grandes colonies, ce qui peut augmenter la propagation des virus entre elles. Les perturbations de leur habitat peuvent les rapprocher des humains ou des animaux domestiques, ce qui augmente le risque de transmission de maladies.

À cause de tout ça, beaucoup de pays ont commencé à surveiller les populations de chauves-souris pour suivre les virus qu'elles portent.

#Recherche sur les Virus de Chauves-souris

Les scientifiques ont fait des avancées significatives dans la découverte des virus animaux grâce à une méthode appelée métagénomique. Cette approche a élargi nos connaissances sur les virus dans le monde et a aidé à identifier de nouveaux virus dans divers échantillons, qu'ils soient cliniques ou environnementaux. À l'heure actuelle, une base de données pour les virus de chauves-souris contient plus de 19 000 séquences de virus, la plupart venant d'Asie et d'Afrique. Un plus petit nombre provient d'Europe.

La majorité des virus de chauves-souris enregistrés dans la base de données sont des Virus à ARN, comme les coronaviruses, alors qu'un petit pourcentage seulement sont des virus à ADN. C'est surtout parce que les virus à ARN sont plus susceptibles de passer des animaux aux humains, ce qui pousse à faire plus de recherches sur eux par rapport aux virus à ADN. La plupart des séquences virales trouvées dans la base de données sont des séquences partielles, ce qui signifie que les génomes viraux complets sont rares.

L'Espagne abrite plus de trente espèces de chauves-souris et a un nombre notable de virus associés à ces animaux. La base de données rapporte près de 300 séquences virales provenant d'Espagne, principalement des virus à ARN. Certains de ces virus peuvent être transmis aux humains, ce qui soulève des inquiétudes pour la santé publique. Pour remédier à ce déséquilibre dans les connaissances, des chercheurs ont utilisé la métagénomique pour étudier les virus à ADN présents dans les excréments de chauves-souris collectés dans différentes régions d'Espagne.

#Collecte et Traitement des Échantillons

Des chauves-souris ont été capturées dans divers habitats à travers sept régions d'Espagne en utilisant des filets en nylon et des pièges à harpe. Chaque chauve-souris capturée a été identifiée par espèce, pesée et des échantillons fécaux ont été prélevés. Ces échantillons ont ensuite été regroupés dans des tubes pour les prochaines étapes d'analyse.

Les échantillons ont été gardés au frais au début puis congelés jusqu'à ce qu'ils puissent être analysés au laboratoire. Un total de 189 chauves-souris de 22 espèces différentes ont été échantillonnées. La plupart des chauves-souris appartenaient à des familles connues pour leur diversité.

Le processus d'analyse des échantillons impliquait l'homogénéisation des matières fécales, leur filtration et l'extraction des acides nucléiques pour une analyse plus approfondie. Les chercheurs ont préparé des bibliothèques à partir de ces acides nucléiques et les ont séquencés pour identifier les séquences virales présentes.

#Détection des Séquences Virales

Après séquençage, les scientifiques ont pu identifier des milliers de séquences virales. L'analyse a abouti à plus de 35 000 séquences virales, dont beaucoup étaient de nouveaux virus identifiés. Différentes familles de virus ont été détectées parmi les échantillons, et les chercheurs se sont concentrés sur un ensemble spécifique de virus susceptibles d'affecter les vertébrés.

Les séquences virales ont été classées, et les chercheurs ont utilisé diverses méthodes pour évaluer leur qualité et leur classification. Grâce à cette analyse rigoureuse, ils ont pu déterminer lesquels des virus identifiés pouvaient potentiellement infecter des chauves-souris ou d'autres vertébrés.

#Nouveaux Virus Découverts chez les Chauves-souris

#Papillomavirus

Les chercheurs ont identifié plusieurs nouveaux papillomavirus chez les chauves-souris. Ces virus ont été trouvés dans différentes espèces de chauves-souris à travers divers endroits en Espagne. La composition génétique de ces virus a été comparée à des papillomavirus connus, révélant certains qui étaient étroitement liés tandis que d'autres semblaient distincts.

Les chercheurs ont effectué des tests supplémentaires pour déterminer les emplacements géographiques de ces virus. Les résultats ont montré que certains des virus étaient largement répandus dans les populations de chauves-souris testées, suggérant qu'ils sont communs.

#Polyomavirus

De nouveaux génomes de polyomavirus ont également été trouvés dans les excréments de chauves-souris. La structure génétique de ces virus correspondait aux caractéristiques connues des polyomavirus, indiquant qu'ils étaient effectivement liés. Les tests géographiques ont confirmé que ces virus étaient présents chez des chauves-souris de lieux proches.

Ces polyomavirus nouvellement découverts appartiennent à un groupe spécifique de virus, et leur identification pourrait aider à comprendre l'histoire et l'évolution des polyomavirus, notamment dans le contexte des hôtes animaux.

#Parvovirus

Les chercheurs ont trouvé deux nouveaux parvovirus dans des échantillons de chauves-souris. Les génomes de ces virus affichaient la structure attendue pour les parvovirus. Les tests ont confirmé qu'un de ces virus a été trouvé dans un endroit spécifique, tandis que l'autre a été détecté dans un plus petit groupe de chauves-souris.

Le nouveau parvovirus identifié chez les chauves-souris a des liens intéressants avec d'autres virus connus et soulève des questions sur d'éventuels liens avec des mammifères, y compris les humains.

#Adénovirus

Deux nouveaux génomes d'adénovirus ont été détectés dans les échantillons de chauves-souris. L'analyse génétique a montré que ces virus partageaient des similarités avec des adénovirus non primates. Les tests ont suggéré que ces virus étaient communs dans les chauves-souris et pouvaient potentiellement être liés à d'autres virus présents chez les animaux.

On pense que les adénovirus sont répandus chez les chauves-souris, mais d'autres études sont nécessaires pour avoir une vue plus complète de leur diversité et des risques possibles pour les humains.

#Circovirus

Plusieurs nouveaux génomes de circovirus ont été découverts dans différents pools de chauves-souris. La structure de ces génomes correspondait à des circovirus connus. L'analyse génétique a aidé à les classer en deux genres distincts, menant à l'identification de nouvelles espèces basées sur des critères de similarité génétique.

Bien que peu de choses soient connues sur le potentiel zoonotique des circovirus, leur présence dans les excréments de chauves-souris ajoute à la compréhension de la diversité virale.

#Smacovirus

Un groupe de nouveaux smacovirus a été trouvé dans des échantillons provenant de plusieurs espèces de chauves-souris. La structure génétique de ces virus était en accord avec les caractéristiques connues des smacovirus. Les chercheurs ont confirmé que ces virus appartenaient à différentes espèces, indiquant une riche diversité parmi les populations de chauves-souris.

La biologie des smacovirus est encore peu comprise, mais leur détection soulève des questions sur leur rôle dans la nature et les interactions potentielles avec d'autres espèces.

#Genomovirus

Les chercheurs ont identifié une gamme de genomovirus dans les échantillons de chauves-souris. La composition génétique de ces virus les a confirmés comme membres de différents genres. Beaucoup de ces nouveaux virus trouvés sont classés comme nouvelles espèces basées sur des critères de similarité génétique.

La détection de genomovirus chez les chauves-souris ajoute à nos connaissances sur la diversité virale chez la faune, soulignant le besoin de plus de recherches sur les infections virales dans diverses espèces.

#Importance de la Surveillance des Virus de Chauves-souris

Les résultats de cette étude soulignent l'importance de comprendre la diversité des virus chez les chauves-souris, surtout en ce qui concerne leur potentiel à causer des maladies chez les humains. La diversité de la faune joue un rôle significatif dans l'émergence des maladies, et malgré une biodiversité plus faible dans des régions comme l'Europe, les risques existent toujours.

Les chauves-souris sont critiques dans ce contexte à cause de leur tendance à héberger des virus zoonotiques. Étant donné leur proximité avec les humains, surveiller ces virus peut aider à atténuer les risques sanitaires potentiels.

Comprendre les dynamiques de transmission des virus, surtout pour les virus à ADN, peut informer les stratégies de surveillance. C'est crucial pour répondre à d'éventuelles épidémies virales et pour éclairer comment les virus évoluent dans la faune.

#Conclusion

Les chauves-souris servent de réservoir significatif pour divers virus, y compris des virus à ARN et à ADN. La recherche révèle non seulement l'existence de nouveaux virus chez les chauves-souris mais aussi leur potentiel à influencer la santé publique.

L'étude continue des populations de chauves-souris et de leurs virus améliorera notre compréhension de la façon dont ces virus fonctionnent dans la nature et de leur potentiel impact sur la santé humaine. Poursuivre la recherche sera vital pour développer des stratégies de surveillance et de gestion efficaces pour prévenir l'émergence de maladies zoonotiques.