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Le rôle du créanarchéol dans les sources chaudes

La production de crénaarchéol dans les sources chaudes révèle des infos sur l'adaptation microbienne.

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Les systèmes hydrothermaux sur Terre sont considérés comme des endroits importants pour étudier les débuts de la vie sur notre planète. Ces environnements montrent de fortes variations de température et des conditions chimiques différentes qui auraient pu déclencher les premiers processus de la vie. Dans ces lieux extrêmes, on trouve un groupe de micro-organismes appelés Archées. Les Archées sont bien adaptées pour vivre dans des conditions difficiles, qui peuvent être très chaudes et stressantes pour leur consommation d'énergie.

Archées et leurs Membranes

Une des caractéristiques clés des Archées qui les aide à survivre, c'est la structure spéciale de leurs membranes cellulaires. Les membranes contiennent des Lipides uniques appelés dibiphytanyl glycerol tétraéther isoprénoïde ou iGDGTs. Ces lipides permettent aux Archées de s'adapter aux variations de température et aux environnements chimiques. Le nombre de structures en anneau dans ces lipides peut varier, et ces anneaux jouent un rôle crucial dans la flexibilité de la membrane selon les conditions.

Les Archées peuvent produire différentes formes d'iGDGTs selon leur environnement. Dans la plupart des milieux, elles vont créer des lipides avec zéro à quatre anneaux. Cependant, dans les sources chaudes, elles peuvent produire des lipides avec plus d'anneaux, jusqu'à huit. Ce changement peut aider les scientifiques à comprendre comment les températures ont évolué au fil du temps grâce à une méthode appelée le proxy paléotempérature TEX86. Malheureusement, les chercheurs ont découvert que d'autres facteurs environnementaux peuvent également influencer le nombre d'anneaux, rendant plus difficile l'utilisation de cette méthode uniquement pour des lectures de température.

Le Crenarchaeol Unique

Un type d'iGDGT, appelé crenarchaeol, est intéressant parce qu'il a un anneau de cyclohexane. Cependant, les scientifiques ne comprennent pas encore complètement d'où vient cet anneau ni son utilité dans l'environnement. Bien que les chercheurs aient progressé dans la compréhension de la plupart des iGDGTs, la création de l'anneau de cyclohexane dans le crenarchaeol reste floue. Le crenarchaeol se trouve principalement dans un groupe spécifique d'Archées appelé Nitrososphaerota, qui prospèrent dans les sources chaudes et autres endroits chauds.

Un sous-groupe de Nitrososphaerota, connu sous le nom d'Archées oxydant l'ammoniac, est particulièrement abondant dans certaines sources chaudes. Ces organismes proviendraient probablement des sources chaudes avant de se répandre dans des eaux océaniques plus fraîches sur des millions d'années. Pour s'adapter à ces nouveaux environnements moins extrêmes, ils ont dû modifier la structure de leurs membranes. L'introduction de l'anneau de cyclohexane pourrait aider à rendre leurs membranes moins compactes et plus adaptables.

Recherche sur les Modèles de Crenarchaeol

Pour en savoir plus sur le crenarchaeol et son lien avec l'environnement, les scientifiques ont collecté des échantillons de sédiments de 41 sources chaudes en Amérique du Nord, en Europe et en Asie. Ils ont mesuré divers facteurs, y compris la température, le pH et d'autres caractéristiques chimiques. En analysant ces données, les chercheurs cherchaient à découvrir les conditions qui influencent la production de crenarchaeol.

Dans le parc national de Yellowstone, plus d'échantillons ont été recueillis sur une période de quatre ans. Chaque échantillon fournissait des informations importantes sur les conditions de ces sources géothermiques, telles que la température et l'acidité. Les scientifiques ont soigneusement extrait les lipides de ces échantillons et utilisé des méthodes avancées pour les étudier en détail.

Conclusions sur le Crenarchaeol et les Facteurs Environnementaux

Les résultats ont montré diverses relations entre les conditions environnementales et l'abondance de crenarchaeol. En particulier, le pH et les concentrations de fer se sont révélés être des facteurs significatifs affectant la présence de crenarchaeol dans ces échantillons. Ils ont découvert que des niveaux de pH plus élevés étaient corrélés avec des quantités plus importantes de crenarchaeol, tandis que l'acidité entraînait généralement des niveaux plus bas, voire inexistants.

Ce qui est intéressant, c'est que la température a également joué un rôle, mais ses effets n'étaient pas aussi clairs. Bien que des études précédentes dans des environnements marins aient mis en avant la température comme influence principale sur les structures lipidiques, cette étude a trouvé que le pH pouvait être plus critique dans les zones géothermiques.

Regard sur d'autres Études

Pour appuyer leurs résultats, les chercheurs ont passé en revue des études antérieures examinant des échantillons de lipides similaires. Ils ont découvert que le crenarchaeol était souvent le plus abondant dans des environnements avec un pH supérieur à 7. Dans les sources acides, les niveaux étaient beaucoup plus bas. De plus, bien qu'il y ait une légère corrélation entre la température et la présence de crenarchaeol, celle-ci était plus faible par rapport à la relation avec le pH.

Les chercheurs ont compilé leurs données actuelles avec d'autres échantillons de sources chaudes déjà publiés, ce qui a permis une analyse plus large de l'abondance de crenarchaeol. Ce plus grand ensemble de données a confirmé la tendance selon laquelle un pH plus élevé contribuait à des quantités plus élevées de crenarchaeol dans les échantillons.

Le Rôle du pH dans la Production de Crenarchaeol

Le lien entre le pH et la production de crenarchaeol suggère que les Archées pourraient être particulièrement sensibles aux changements d'acidité. Lorsque l'environnement devient plus acide, ces organismes pourraient produire du crenarchaeol pour stabiliser leurs membranes. Cette adaptation est probablement cruciale pour leur survie dans des conditions variables.

En revanche, les conditions alcalines ne semblaient pas exercer le même niveau de stress. Cela pourrait expliquer pourquoi le crenarchaeol était toujours présent même dans des environnements à pH élevé. La flexibilité apportée par l'anneau de cyclohexane dans le crenarchaeol pourrait être essentielle pour que les Archées maintiennent leur intégrité cellulaire dans des milieux moins extrêmes.

Comprendre les Températures et les Optima de pH

Pour examiner plus en détail le crenarchaeol, les chercheurs ont analysé les conditions optimales pour sa production sur la base des données recueillies. Ils ont constaté que la plage de pH avec l'abondance moyenne la plus élevée de crenarchaeol se situait entre 7 et 7,5. De plus, la température idéale pour la production de crenarchaeol se situait autour de 46°C. Bien que cette température ne soit pas la plus élevée enregistrée, cela indique que le crenarchaeol peut encore prospérer dans des environnements relativement chauds.

Lien entre Lipides et Géochimie

Cette étude a souligné l'importance d'intégrer les données lipidiques avec des études géochimiques et métagénomiques. En faisant cela, les chercheurs peuvent mieux comprendre comment divers facteurs influencent la production de crenarchaeol. Leur travail démontre davantage l'importance du pH pour la survie et la croissance des Archées dans les sources chaudes.

Un bon échantillonnage et la documentation des paramètres environnementaux amélioreront considérablement les recherches futures. En particulier, comprendre les gènes spécifiques liés à la production de crenarchaeol et des lipides associés aidera à déchiffrer les mystères de l'adaptabilité de ces micro-organismes.

Conclusion

La présence de crenarchaeol dans les sources chaudes offre des aperçus précieux sur la façon dont les formes de vie primitives ont pu s'adapter à divers défis environnementaux. Les résultats mettent en lumière le rôle du pH dans l'abondance de crenarchaeol, suggérant que ces micro-organismes possèdent des mécanismes uniques pour faire face aux changements d'acidité. À mesure que les chercheurs continuent d'étudier ces environnements anciens, ils pourront mieux reconstituer l'histoire de la vie sur Terre et les stratégies que les organismes ont développées pour prospérer dans des conditions extrêmes.

Source originale

Titre: Environmental controls on crenarchaeol distributions in hydrothermal springs

Résumé: AO_SCPLOWBSTRACTC_SCPLOWThermophilic archaea synthesize cellular membranes composed primarily of isoprenoid glycerol dibiphytanyl glycerol tetraethers (iGDGTs). Cells can adjust the structure of iGDGTs by increasing the number of cyclopentyl rings to enhance lipid packing, thereby decreasing membrane permeability and fluidity to maintain cellular function at high temperature and/or acidic pH. Certain archaea synthesize an iGDGT, crenarchaeol, with four cyclopentyl rings and a unique cyclohexyl ring, the function of which is unknown. Structural modeling suggests the cyclohexyl ring may increase membrane fluidity, potentially representing an adaptation that allowed thermophiles to radiate into cooler environments. To begin to investigate this hypothesis, iGDGT abundance was quantified in forty-one hydrothermal springs in Yellowstone National Park (YNP), USA, and contextualized within a compilation of global hydrothermal spring iGDGTs with pH values of 1.1 to 10.1 and temperatures of 16.3 to 95 {degrees}C. pH most strongly correlated with both crenarchaeol abundance and the number of cyclopentyl rings per iGDGT. Crenarchaeol abundance exhibited a nonlinear relationship with both pH and temperature, with highest abundances at pH 7.4 and 46 {degrees}C, then decreasing in abundance above and below these values. These observations support the hypothesis that crenarchaeols cyclohexyl ring facilitated the adaptation of thermophilic and acidophilic archaea to lower temperature and higher pH niches, enabling their radiation into the marine realm. IO_SCPLOWMPORTANCEC_SCPLOWArchaea change the composition of their membrane lipids to alter the fluidity of their membranes to protect cellular functions from environmental stressors. Some archaea produce a lipid, crenarchaeol, with a unique six-membered ring, the effect of which on archaeal membrane dynamics remains unknown. In this study, we identify pH as the most important geochemical variable for archaeal membrane response in Yellowstone National Park hot springs. In addition, the lipid distributions we find support the hypothesis that crenarchaeol facilitated the archaeal evolutionary transition from hot and acidic to cool and neutral waters. We contextualize these findings in a literature compilation that spans the globe.

Auteurs: Amanda N Calhoun, J. Blewett, D. Colman, M. J. Amenabar, C. M. Harris, E. Boyd, A. Pearson, W. D. Leavitt

Dernière mise à jour: 2024-07-09 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.09.602736

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.09.602736.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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