L'évolution et la fonction des gènes MutS chez les plantes
Explore les rôles variés des gènes MutS dans le maintien de l'ADN des plantes.
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Table des matières
- L'Arbre Généalogique des MutS
- Les Protéines MutS chez les Plantes
- La Découverte des Gènes MutS des Plantes
- Le Rôle Unique des Gènes MSH des Plantes
- Comment Fonctionne le MSH1 des Plantes
- Découverte de MutS1 chez les Plantes
- MutS2 chez les Plantes
- Comprendre l'Expansion des Gènes chez les Plantes
- Conclusion
- Source originale
Les gènes Muts forment une famille de gènes qui jouent des rôles importants chez divers organismes, y compris les bactéries, les archées, les plantes, et même certains virus. Ces gènes aident à maintenir la structure et l'intégrité de l'ADN, ce qui est crucial pour le bon fonctionnement des cellules et leur reproduction.
L'Arbre Généalogique des MutS
Les scientifiques utilisent une méthode appelée phylogénétique pour étudier l'évolution de ces gènes. En analysant les relations génétiques entre différentes espèces, les chercheurs ont identifié comment les gènes MutS se sont duplicés, transférés entre espèces et diversifiés au fil du temps. Le terme "phylogénomique" a même été créé pour décrire cette étude de l'évolution des gènes MutS.
Les Protéines MutS chez les Plantes
Chez les plantes, la famille des protéines MutS se compose de plusieurs sous-familles. Chaque sous-famille a ses propres rôles et caractéristiques. Par exemple, certaines protéines MutS des plantes se sont fusionnées avec d'autres domaines qui prédisent des fonctions différentes, notamment dans la réparation et l'entretien de l'ADN.
Structure des Protéines MutS
Il existe huit sous-familles connues de protéines MutS chez les plantes. Ces protéines se composent de différents domaines, y compris le domaine ATPase qui est vital pour l'utilisation de l'énergie dans la cellule. Certaines protéines ont des domaines supplémentaires qui peuvent ne pas être présents chez d'autres, ce qui mène à des fonctions différentes parmi les divers membres des MutS.
Protéines MutS et Réparation de l'ADN
La fonction principale de nombreuses protéines MutS est d'aider à réparer l'ADN endommagé. Elles scannent les erreurs ou déformations dans la structure de l'ADN, comme les incompatibilités ou les bases non appariées, et recrutent d'autres protéines pour initier les processus de réparation. Certaines protéines MutS ont montré qu'elles participaient à des processus sans lien avec l'ADN, comme aider à résoudre des problèmes durant la traduction des protéines.
La Découverte des Gènes MutS des Plantes
Des études précoces sur la levure ont identifié six types d'homologues MutS. Parmi ceux-ci, cinq sont courants chez les animaux et les plantes, suggérant une ascendance partagée. Cependant, un type, MSH1, est unique à certains champignons et animaux non bilatériens, ce qui rend ses origines intéressantes à étudier. Le gène MSH1 des plantes est ciblé vers les mitochondries, ce qui indique son rôle dans l'entretien des organelles.
Le Rôle Unique des Gènes MSH des Plantes
Chez les plantes, la famille de gènes MSH a évolué de manière unique. Par exemple, deux gènes similaires à MSH6 ont été trouvés chez les plantes, indiquant des événements de duplication anciens. Ces protéines MSH des plantes ont montré qu'elles aident à maintenir le génome nucléaire et ont des fonctions variées dans la réparation de l'ADN et la recombinaison.
Fonction de MSH6 et MSH7
Les deux gènes similaires à MSH6 chez les plantes sont censés travailler ensemble, car ils peuvent former des hétérodimères. Chacun de ces hétérodimères peut cibler différents types de lésions d'ADN. La recherche a montré que l'une de ces protéines, MSH7, aide à reconnaître les dommages à l'ADN induits par les UV et peut réguler la recombinaison pendant la méiose.
Comment Fonctionne le MSH1 des Plantes
Le gène MSH1 des plantes joue un rôle important dans le maintien de l'ADN des mitochondries et des plastes intact. Il a été découvert grâce à des études sur Arabidopsis, où des mutations dans ce gène ont entraîné des changements visibles de couleur des feuilles en raison de l'instabilité de l'ADN dans les organelles. Ce gène a été lié à la protection contre les mutations et au maintien de la structure de l'ADN des organelles.
Les Origines du MSH1 des Plantes
On pense que le gène MSH1 trouvé chez les plantes a une origine résultant d'un transfert provenant de bactéries. Cette histoire de transfert de gènes soulève des questions sur les relations entre les gènes des plantes et ceux trouvés chez d'autres organismes. Il semble que MSH1 ait été acquis par transfert horizontal, une méthode différente de l'héritage traditionnel.
Découverte de MutS1 chez les Plantes
Fait intéressant, on pensait que les plantes manquaient de gènes MutS1 similaires à ceux des bactéries trouvés chez d'autres organismes. Cependant, après des investigations plus approfondies, les chercheurs ont découvert que certaines plantes, en particulier les plantes non semencées, possèdent ce gène. Cela suggère que le gène MutS1 chez les plantes provient probablement d'événements endosymbiotiques anciens.
MutS1 et Ses Domaines
Les protéines MutS1 des plantes conservent des domaines MutS1 classiques essentiels pour reconnaître les incompatibilités dans l'ADN. Certaines de ces protéines ont également des régions supplémentaires qui peuvent indiquer d'autres fonctions. Ces domaines sont essentiels pour les processus de réparation au sein de l'ADN de la plante.
MutS2 chez les Plantes
En plus de MutS1, un autre groupe appelé MutS2 se trouve également chez les plantes. Tout comme MutS1, les protéines MutS2 ont une longue histoire évolutive et sont censées avoir une origine des plastes. Grâce à un processus de duplication, les espèces de plantes ont développé deux types de MutS2, indiquant une complexité fonctionnelle au sein de cette famille de gènes.
Fonctions Possibles de MutS2
Bien que les fonctions spécifiques des protéines MutS2 des plantes n'aient pas été profondément étudiées, on soupçonne qu'elles jouent des rôles dans la réparation de l'ADN et les processus de traduction. La présence de certains domaines suggère que ces protéines aident à résoudre des structures de l'ADN formées pendant la recombinaison.
Comprendre l'Expansion des Gènes chez les Plantes
La famille de gènes MutS chez les plantes s'est considérablement étendue en raison de différents processus évolutifs, y compris la duplication des gènes et le transfert horizontal de gènes. Cette expansion a conduit à une riche diversité de fonctions associées à ces protéines.
L'Importance des Domaines Accessoires
Une des caractéristiques remarquables des protéines MutS des plantes est leur capacité à acquérir de nouveaux domaines. Ces domaines accessoires peuvent modifier ou élargir les fonctions des protéines, permettant ainsi des rôles plus spécialisés au sein de la plante. Cette adaptabilité est un facteur clé dans l'évolution des génomes des plantes.
Conclusion
En résumé, l'étude des gènes MutS révèle une histoire d'évolution diverse et complexe à travers différents organismes, en particulier chez les plantes. Ces gènes, avec leurs diverses sous-familles, jouent des rôles cruciaux dans le maintien de l'intégrité et de la fonction de l'ADN. Avec les recherches en cours, il est probable que nous découvrirons encore plus sur leurs fonctions et leur importance dans les processus cellulaires.
Titre: Expansion of the MutS gene family in plants
Résumé: The MutS gene family is distributed across the tree of life and is involved in recombination, DNA repair, and protein translation. Multiple evolutionary processes have expanded the set of MutS genes in plants relative to other eukaryotes. Here, we investigate the origins and functions of these plant-specific genes. Land plants, green algae, red algae, and glaucophytes share cyanobacterial-like MutS1 and MutS2 genes that presumably were gained via plastid endosymbiotic gene transfer. MutS1 was subsequently lost in some taxa, including seed plants, whereas MutS2 was duplicated in Viridiplantae (i.e., land plants and green algae) with widespread retention of both resulting paralogs. Viridiplantae also have two anciently duplicated copies of the eukaryotic MSH6 gene (i.e., MSH6 and MSH7) and acquired MSH1 via horizontal gene transfer - potentially from a nucleocytovirus. Despite sharing the same name, "plant MSH1" is not directly related to the gene known as MSH1 in some fungi and animals, which may be an ancestral eukaryotic gene acquired via mitochondrial endosymbiosis and subsequently lost in most eukaryotic lineages. There has been substantial progress in understanding the functions of MSH1 and MSH6/MSH7 in plants, but the roles of the cyanobacterial-like MutS1 and MutS2 genes remain uncharacterized. Known functions of bacterial homologs and predicted protein structures, including fusions to diverse nuclease domains, provide hypotheses about potential molecular mechanisms. Because most plant-specific MutS proteins are targeted to the mitochondria and/or plastids, the expansion of this family appears to have played a large role in shaping plant organelle genetics. One-Sentence SummaryPlants are distinguished from other eukaryotes by a functionally diverse complement of MutS proteins gained via a combination of gene duplication, endosymbiotic gene transfer, and horizontal gene transfer.
Auteurs: Daniel B Sloan, A. K. Broz, S. A. Kuster, V. Muthye, A. Penafiel-Ayala, J. R. Marron, D. V. Lavrov, L. G. Brieba
Dernière mise à jour: 2024-07-20 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.17.603841
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.17.603841.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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