Le Rôle Essentiel des Biobanques dans la Recherche Moderne
Les biobanques soutiennent la recherche sur les maladies en stockant des échantillons biologiques pour des études scientifiques.
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Table des matières
- L'Orientation des Biobanques sur Différentes Maladies
- Financement et Recherche dans les Études de Biobank
- Mesurer l'Impact des Biobanques
- Le Facteur d'Impact des Biobanques
- L'Impact National et Institutionnel des Biobanques
- Accès aux Données des Biobanques
- Citations et le Vrai Impact des Biobanques
- Caractéristiques des Biobanques et Leur Impact
- Conclusion
- Source originale
- Liens de référence
Les Biobanques sont des endroits qui collectent et stockent des échantillons biologiques, comme du sang ou des tissus, pour la recherche. Ces échantillons aident les scientifiques à étudier les maladies, comprendre la santé et développer de nouveaux traitements. Cet article se penche sur le rôle des biobanques en science, comment elles se concentrent sur différentes maladies, l'impact de leurs Recherches et comment elles sont financées.
L'Orientation des Biobanques sur Différentes Maladies
Les biobanques ne font pas n'importe quoi ; elles se concentrent souvent sur des maladies spécifiques. Les maladies étudiées par une biobanque reflètent les intérêts actuels des chercheurs. On a regardé un réseau qui montre comment différentes biobanques sont connectées en fonction des Publications qui les mentionnent. De là, on a trouvé des milliers de maladies uniques dans plusieurs catégories.
Une des plus grandes catégories s'appelle "Conditions Pathologiques, Signes et Symptômes," qui regroupe plein de problèmes de santé. Cette catégorie inclut plus de 500 biobanques. Ensuite, on a des biobanques qui se concentrent sur les "Maladies du Système Nerveux," les "Néoplasmes" (liés au cancer) et les "Infections." Ces biobanques spécialisées se connectent généralement entre elles, tandis que les biobanques plus générales font le lien entre différentes communautés.
Un petit nombre de maladies attire beaucoup l'attention des chercheurs. Par exemple, des conditions comme l'obésité, la maladie d'Alzheimer, le cancer du sein et le diabète sont des domaines majeurs de recherche. Ces quatre conditions représentent 20 % des publications liées aux biobanques. Cependant, les biobanques s'adaptent aussi rapidement aux nouveaux besoins de recherche, comme on l'a vu avec l'accent mis sur la COVID-19.
Financement et Recherche dans les Études de Biobank
Comprendre comment les biobanques sont financées donne un aperçu des maladies étudiées. Notre analyse a examiné un énorme nombre de publications de recherche mentionnant les biobanques et l'argent que les Instituts Nationaux de la Santé (NIH) allouent à différentes catégories de maladies.
On a trouvé une connection claire : plus de financement mène généralement à plus de publications sur cette maladie et à plus d'utilisation des biobanques. Par exemple, la recherche clinique reçoit le plus de financement et a aussi le plus grand nombre d'études utilisant des Données de biobanks. D'un autre côté, certains domaines importants, comme la recherche sur le vieillissement, ont beaucoup d'études mais sont moins financés.
On a aussi vérifié si le nombre d'études correspondait aux attentes basées sur le financement. Certains domaines ont montré une production de recherche plus élevée que prévu. La recherche sur la nutrition était particulièrement notable, avec beaucoup plus de publications que prévu. À l'inverse, certaines catégories importantes, comme les maladies rares, ont montré moins de publications que prévu par rapport au financement.
Il est clair qu'une grande partie de l'impact scientifique dans la recherche sur les biobanques est liée à quelques maladies et domaines de recherche. Bien qu'il y ait eu des progrès pour diversifier la recherche au cours de la dernière décennie, certains troubles dominent toujours. Un financement adéquat tend à bien correspondre à la production de recherche pour la plupart des maladies, améliorant la représentation dans divers domaines.
Mesurer l'Impact des Biobanques
L'impact des biobanques ne se limite pas à la fréquence à laquelle elles sont citées dans les publications. Pour mieux comprendre leur influence, on a examiné un large éventail de documents mentionnant les biobanques. Les résultats ont montré que les biobanques ont un effet substantiel sur la recherche, le financement, les brevets, les essais cliniques et les politiques.
Par exemple, un grand nombre de publications mentionnent les biobanques, et ces papiers ont collectivement reçu des millions de citations. On a aussi trouvé beaucoup de publications qui étaient financées par des subventions où les biobanques étaient mentionnées. Le financement associé à ces subventions soutient la recherche, la formation, les collaborations et les carrières de nombreux scientifiques.
Les biobanques impactent la recherche indirectement, touchant aux subventions, aux brevets, aux essais cliniques et aux politiques. Par exemple, la UK Biobank a une portée large ; elle a été directement mentionnée dans de nombreuses subventions, mais citée beaucoup plus souvent indirectement dans d'autres recherches. Cela montre que les biobanques jouent un rôle crucial dans de nombreux domaines au-delà de la recherche académique.
Le Facteur d'Impact des Biobanques
Pour comprendre le vrai impact d'une biobanque, on a créé une mesure appelée le Facteur d'Impact des Biobanques (BIF). Cela prend en compte à quelle fréquence les biobanques sont mentionnées dans la recherche scientifique, les innovations et la santé publique ainsi que leur influence dans des domaines spécifiques aux maladies.
Le BIF fournit un score qui reflète l'impact scientifique d'une biobanque dans divers domaines. Cela aide à éviter les biais en faveur des plus grandes biobanques en tenant aussi compte de la profondeur et de la portée de la recherche sur les maladies liée à une biobanque. On a calculé le BIF pour de nombreuses biobanques.
Les meilleures biobanques, classées par BIF, incluent des projets connus axés sur des maladies comme le diabète et le cancer. Cette liste comprend des biobanques du Royaume-Uni et des États-Unis, indiquant que des biobanques impactantes existent à l'échelle mondiale. L'outil en ligne qu'on a créé permet aux utilisateurs d'accéder facilement à ces informations et de comparer différentes biobanques.
L'Impact National et Institutionnel des Biobanques
Beaucoup de chercheurs préfèrent s'appuyer sur des biobanques locales par souci de familiarité. On a examiné l'étendue de l'impact local par rapport à l'impact mondial en regardant d'où vient la recherche. On a trouvé que la plupart des mentions d'une biobanque dans la recherche proviennent d'auteurs du même pays que la biobanque, avec une part significative venant aussi de la même institution.
En comparant l'impact des différentes biobanques, on a pu voir que les biobanques les moins impactantes ont tendance à avoir une plus grande influence locale, tandis que les biobanques les plus impactantes ont souvent des liens internationaux. Cela montre que la collaboration et les connexions peuvent aider à améliorer la visibilité et l'utilisation d'une biobanque.
Accès aux Données des Biobanques
Accéder aux données des biobanques peut être difficile, nécessitant souvent de longs processus de demande. Cependant, la co-rédaction avec l'équipe derrière la biobanque est un moyen courant pour les chercheurs de gagner cet accès. Cette pratique influence fortement l'authorship des articles mentionnant les biobanques.
Les membres de biobanques ayant des scores BIF élevés tendent à avoir des taux de co-auteur plus bas par rapport à ceux issus de biobanques moins impactantes. Cela suggère que si une biobanque a une forte réputation, elle peut avoir plus de demande pour l'accès aux données sans avoir à compter lourdement sur la co-auteur.
Beaucoup de collaborations dans la recherche sur les biobanques se font au sein du même pays, ce qui peut expliquer l'impact local fort de nombreuses biobanques. L'inconvénient de cela est que cela peut créer des barrières géographiques à l'utilisation des données des biobanques.
Citations et le Vrai Impact des Biobanques
Le nombre de citations ne représente pas toujours le véritable impact qu'une biobanque a sur la recherche. De nombreux articles utilisant les données des biobanques ne citent pas les articles de référence associés à ces biobanques. Pour mieux comprendre cela, on a examiné les "citations cachées," qui se réfèrent aux cas où les biobanques sont mentionnées mais pas formellement citées.
Par exemple, beaucoup d'articles mentionnent la UK Biobank sans créditer ses articles fondateurs. Un pourcentage significatif d'articles mentionnant les biobanques ne cite pas leurs articles de référence, soulignant un schéma de sous-citation dans l'ensemble.
Quand on a évalué la portée scientifique globale des biobanques, on a réalisé qu'elle est beaucoup plus grande que ce que les métriques de citation indiquent. Cela montre que les métriques traditionnelles ne mesurent pas correctement l'impact total des biobanques dans la recherche scientifique.
Caractéristiques des Biobanques et Leur Impact
Plusieurs facteurs influencent la portée et l'impact d'une biobanque, y compris sa taille, le type de données collectées et la reconnaissance de son leadership. Reconnaître ces facteurs peut aider les créateurs de biobanques à améliorer leur efficacité dans la communauté de recherche.
On a identifié des caractéristiques clés liées au BIF. Avoir un index de données ouvert, des tailles de cohortes importantes, la disponibilité de données génétiques, et un leadership bien reconnu contribuent positivement à l'impact d'une biobanque. Il est important de noter que fournir des données médicales améliore aussi l'attrait d'une biobanque.
Bien que de nombreuses biobanques intègrent des données génétiques, le type de données offertes est crucial pour attirer l'intérêt de la recherche. Les biobanques qui peuvent fournir des données détaillées, notamment liées aux marqueurs génétiques ou aux interactions environnementales, sont plus susceptibles d'avoir un impact plus important.
Conclusion
Le succès d'une biobanque dépend largement de ses connexions avec la communauté de recherche. Une équipe fondatrice bien intégrée qui collabore étroitement avec les scientifiques peut engendrer un impact à long terme. Pour les nouvelles biobanques, l'expérience et la réputation de leurs scientifiques leaders peuvent ouvrir des portes et construire des réseaux essentiels.
Il y a beaucoup de biobanques, mais leur visibilité peut parfois être limitée. Sensibiliser sur ce que ces ressources offrent est clé. Un outil global de localisation des biobanques pourrait aider les chercheurs à identifier la biobanque qui convient le mieux à leurs études.
Des données génétiques de haute qualité couplées à une technologie moderne augmentent le potentiel des biobanques. Nos découvertes montrent que les biobanques ayant une collection complète de données génétiques couvrant diverses maladies sont susceptibles de jouer des rôles importants dans la recherche future.
En résumé, bien que l'impact d'une biobanque soit souvent mesuré par des métriques académiques traditionnelles, il est essentiel d'adopter une perspective plus large qui inclut diverses dimensions d'influence, englobant la recherche, la politique et l'innovation. Le BIF fournit une nouvelle façon de comprendre la profondeur et l'impact de la recherche sur les biobanques dans les communautés de santé et scientifiques.
Titre: Quantifying the Impact of Biobanks and Cohort Studies
Résumé: Biobanks advance biomedical and clinical research by collecting and offering data and biological samples for numerous studies. However, the impact of these repositories varies greatly due to differences in their purpose, scope, governance, and data collected. Here, we computationally identified 2,663 biobanks and their textual mentions in 228,761 scientific articles, 16,210 grants, 15,469 patents, 1,769 clinical trials, and 9,468 public policy documents, helping characterize the academic communities that utilize and support them. We found a strong concentration of biobank-related research on a few diseases, where 20\% of publications focus on obesity, Alzheimer's disease, breast cancer, and diabetes. Moreover, collaboration, rather than citation count, shapes the community's recognition of a biobank. We show that, on average, 41.1\% of articles miss to reference any of the biobank's reference papers and 59.6\% include a biobank member as a co-author. Using a generalized linear model, we identified the key factors that contribute to the impact of a biobank, finding that an impactful biobank tends to be more open to external researchers, and that quality data -- especially linked medical records -- as opposed to large data, correlates with a higher impact in science, innovation, and disease. The collected data and findings are accessible through an open-access web application intended to inform strategies to expand access and maximize the value of these valuable resources.
Auteurs: Rodrigo Dorantes-Gilardi, Kerry Ivey, Lauren Costa, Rachael Matty, Kelly Cho, John Michael Gaziano, Albert-László Barabási
Dernière mise à jour: 2024-07-01 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2407.01248
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2407.01248
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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