Amélioration de la mesure de la tête fœtale avec l'apprentissage profond
Cette étude améliore la mesure de la tête fœtale par ultrasons grâce à des techniques de deep learning.
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Table des matières
Mesurer la taille de la tête d'un bébé pendant la grossesse est super important. Ça aide les docs à estimer comment le bébé grandit. Pour bien mesurer la tête, les docs doivent d'abord repérer et délimiter la tête du bébé sur les images échographiques. L'Échographie, c'est une méthode courante lors des contrôles de grossesse car c'est simple à utiliser et ça n'implique pas de radiations nocives. Cependant, le processus de mesure de la tête du bébé peut varier d'une personne à l'autre, ce qui peut mener à des erreurs.
Avec l'avènement de la technologie, l'apprentissage profond a été utilisé pour améliorer l'analyse de ces images. Une méthode populaire s'appelle U-Net, une sorte de réseau de neurones qui aide à identifier et à délimiter des objets dans les images, y compris le fœtus. Bien qu'U-Net ait montré de bons résultats, ça demande beaucoup de puissance informatique et de temps pour l'entraînement, surtout quand les données pour l'entraîner ne sont pas abondantes. Ça peut être un gros souci dans les endroits où les ressources sont limitées.
Importance de la mesure de la tête fœtale
La circonférence de la tête fœtale est une mesure clé utilisée pour déterminer sa taille. Des échographistes expérimentés dessinent généralement une ellipse autour de la tête du bébé sur l'image échographique puis calculent la circonférence. Ce processus peut varier pour chaque patiente et peut dépendre des compétences du technicien, de la machine utilisée et d'autres facteurs. À cause de cette variabilité, il est nécessaire d'avoir un moyen précis de mesurer.
Pour relever ces défis, de nouvelles technologies utilisant l'apprentissage profond peuvent segmenter des images, ce qui veut dire qu'elles peuvent identifier et délimiter différentes parties d'une image automatiquement. Ça pourrait rendre le processus de mesure plus cohérent et précis. Cependant, un gros problème est que beaucoup d'endroits n'ont souvent pas assez d'images étiquetées pour l'entraînement.
Techniques d'apprentissage profond
Les avancées récentes en apprentissage profond ont conduit au développement de plusieurs techniques pour améliorer la Segmentation d'images. Une technique, U-Net, a été spécifiquement conçue pour aider à la segmentation d'images biomédicales en utilisant des images qui ont été soigneusement étiquetées. Néanmoins, entraîner un réseau U-Net depuis le début peut être difficile, surtout avec une quantité limitée d'images étiquetées.
Une autre méthode appelée transfert d'apprentissage peut aider. Cette technique consiste à prendre un modèle qui a déjà été entraîné sur un ensemble de données et à l'adapter pour fonctionner avec un autre ensemble de données. Par exemple, utiliser des images de cerveaux fœtaux provenant de vidéos échographiques peut aider à entraîner le modèle, qui peut ensuite être adapté pour mesurer la tête fœtale dans différents scénarios.
Stratégies de réglage fin
Le réglage fin fait référence à l'ajustement d'un modèle pré-entraîné pour améliorer sa performance sur une tâche spécifique. Dans cette étude, plusieurs stratégies de réglage fin ont été testées pour voir lesquelles donneraient les meilleurs résultats pour segmenter les images de tête fœtale à partir des données échographiques. Une stratégie implique d'utiliser un modèle plus léger appelé MobileNet comme partie d'U-Net. C'est utile car MobileNet est conçu pour bien fonctionner même avec des ressources informatiques limitées.
Les méthodes de réglage fin peuvent impliquer d'entraîner différentes parties du modèle tout en verrouillant d'autres en place. Par exemple, les chercheurs ont testé comment entraîner seulement certaines parties du décodeur dans l'U-Net affectait les résultats. L'efficacité de ces stratégies aide à déterminer la meilleure façon d'obtenir des résultats précis et efficaces dans des environnements à faibles ressources.
Sources de données
La recherche a utilisé des images échographiques provenant de divers ensembles de données à travers différents pays. Les ensembles de données comprenaient des images collectées à différents stades de la grossesse auprès de patientes aux Pays-Bas, en Espagne, au Malawi, en Égypte et en Algérie. Chaque ensemble de données avait des caractéristiques uniques, comme la qualité des images et les types de machines échographiques utilisées.
Le premier ensemble de données, appelé HC18, comprend des images de haute qualité collectées dans un centre médical aux Pays-Bas. L'ensemble de données espagnol contenait des images provenant de divers hôpitaux en Espagne, tandis que les ensembles de données africains contenaient des images de milieux à ressources limitées. En comparant ces ensembles de données, les chercheurs visaient à découvrir comment différentes conditions affectent la segmentation des images de tête fœtale.
Processus de formation
Pour entraîner le modèle U-Net, les chercheurs ont d'abord préparé leurs données. Cela incluait des images de la tête fœtale réduites à une taille spécifique et légèrement modifiées pour créer des variations. Des techniques d'augmentation de données, comme des rotations et des retournements, ont été utilisées pour augmenter la quantité de données d'entraînement disponibles.
Le processus d'entraînement consistait à alimenter ces images manipulées dans le modèle U-Net et à ajuster les poids du modèle pour minimiser les différences entre les contours prévus et réels de la tête fœtale. Les chercheurs ont observé comment le modèle performait et ont apporté des modifications si nécessaire pour améliorer la précision.
Résultats et découvertes
Les résultats ont indiqué que le réglage fin du modèle U-Net menait à une meilleure précision par rapport à un entraînement débuté de zéro. Parmi les stratégies testées, le réglage fin des couches de décodeurs a abouti aux meilleures performances. Ça veut dire qu'en se concentrant sur l'ajustement du décodeur, les chercheurs pouvaient obtenir des résultats comparables même avec moins de ressources informatiques.
En général, l'approche de réglage fin a permis au modèle de bien performé, indiquant son efficacité lorsque les ressources sont limitées. Elle a démontré une solide capacité de généralisation, ce qui signifie qu'elle pouvait encore bien performer sur des données qu'elle n'avait pas vues auparavant, ce qui était crucial pour des applications dans différentes régions.
L'étude a également révélé que lorsqu'on utilisait des images échographiques de milieux à haute ressource pour entraîner le modèle, celui-ci pouvait efficacement transférer ses connaissances pour travailler sur des images de milieux à faibles ressources. Cela suggère que les méthodes développées pourraient être bénéfiques pour améliorer les soins prénatals dans des endroits avec moins de ressources.
Conclusion
Mesurer avec précision la taille de la tête fœtale par échographie est essentiel pour suivre la croissance fœtale pendant la grossesse. Utiliser des techniques d'apprentissage profond, notamment le réglage fin des modèles U-Net avec MobileNet, peut conduire à des améliorations significatives dans les tâches de segmentation, même en travaillant avec des données limitées.
Les résultats de cette recherche indiquent qu'il est possible d'obtenir une précision compétitive en se concentrant sur les couches de décodeurs tout en entraînant le modèle avec moins de paramètres. L'approche minimise non seulement la puissance informatique nécessaire, mais renforce aussi la fiabilité des mesures de tête fœtale à travers différents milieux de ressources.
Avec le potentiel montré par ces stratégies de réglage fin, il y a une possibilité d'adoption plus large dans le domaine médical, permettant de meilleurs évaluations prénatales et contribuant finalement à améliorer la santé maternelle et fœtale dans divers environnements.
Titre: Segmenting Fetal Head with Efficient Fine-tuning Strategies in Low-resource Settings: an empirical study with U-Net
Résumé: Accurate measurement of fetal head circumference is crucial for estimating fetal growth during routine prenatal screening. Prior to measurement, it is necessary to accurately identify and segment the region of interest, specifically the fetal head, in ultrasound images. Recent advancements in deep learning techniques have shown significant progress in segmenting the fetal head using encoder-decoder models. Among these models, U-Net has become a standard approach for accurate segmentation. However, training an encoder-decoder model can be a time-consuming process that demands substantial computational resources. Moreover, fine-tuning these models is particularly challenging when there is a limited amount of data available. There are still no "best-practice" guidelines for optimal fine-tuning of U-net for fetal ultrasound image segmentation. This work summarizes existing fine-tuning strategies with various backbone architectures, model components, and fine-tuning strategies across ultrasound data from Netherlands, Spain, Malawi, Egypt and Algeria. Our study shows that (1) fine-tuning U-Net leads to better performance than training from scratch, (2) fine-tuning strategies in decoder are superior to other strategies, (3) network architecture with less number of parameters can achieve similar or better performance. We also demonstrate the effectiveness of fine-tuning strategies in low-resource settings and further expand our experiments into few-shot learning. Lastly, we publicly released our code and specific fine-tuned weights.
Auteurs: Fangyijie Wang, Guénolé Silvestre, Kathleen M. Curran
Dernière mise à jour: 2024-07-29 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://arxiv.org/abs/2407.20086
Source PDF: https://arxiv.org/pdf/2407.20086
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
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