Clarifier le concept des essaims hybrides
Une étude examine le terme 'essaim hybride' et ses implications dans la recherche sur l'hybridation.
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Table des matières
L'Hybridation se produit quand deux espèces différentes s'accouplent et produisent une progéniture. Ce processus peut mener à différents résultats, comme la création de nouvelles espèces, le mélange de gènes entre les espèces parentes, ou même la production d'Hybrides qui ne peuvent pas se reproduire. L'hybridation a été importante pour former la variété d'espèces qu'on voit aujourd'hui. Par exemple, beaucoup de nouveaux types de poissons cichlidés sont apparus à cause de l'hybridation naturelle entre différentes lignées de cichlidés.
Cependant, l'impact de l'hybridation sur la biodiversité peut être déroutant. C'est difficile de définir des espèces quand elles se mélangent et que l'hybridation se produit en continu. Quand des espèces se mélangent, il peut y avoir des situations où certains individus sont remplacés par des hybrides. Ce mélange génétique peut compliquer la classification des espèces, entraînant différentes interprétations parmi les chercheurs sur ce qu'est vraiment un hybride.
Qu'est-ce qu'un essaim hybride ?
Le terme "essaim hybride" a été utilisé dans des études sur l'hybridation. Il a été défini pour la première fois il y a presque un siècle comme un groupe fluctuant d'hybrides affichant des traits mélangés, souvent en faveur d'une des espèces parentes. Cependant, l'utilisation de ce terme a évolué au fil du temps et peut signifier des choses différentes pour différentes personnes.
Le but d'une étude récente était de clarifier ce que les chercheurs entendent par "essaim hybride", à quel point ce terme est utilisé de manière cohérente entre différentes espèces et s'il devrait continuer à être employé. Cette étude a inclus une analyse détaillée de la façon dont le terme apparaît dans la littérature scientifique, y compris quels types d'espèces ont été étudiés, comment les hybrides ont été identifiés, et combien d'espèces étaient impliquées.
Collecte des données
Les chercheurs ont collecté des articles scientifiques par un processus détaillé en utilisant une méthode de recherche spécifique. Ils ont configuré une recherche axée sur les essaims hybrides et la biologie. Après les premières recherches, les articles non pertinents ont été filtrés. Les chercheurs ont rassemblé un total de 148 articles, dont 111 se sont avérés uniques. Ils ont classé les articles selon qu'ils discutaient de l'hybridation et s'il y avait un essaim hybride actif.
Pour recueillir des informations détaillées, deux personnes ont lu chaque article pertinent et ont extrait des données sur divers aspects de l'hybridation. Cela incluait le type de preuves pour l'hybridation, quelles espèces étaient impliquées, combien d'individus ont été étudiés et combien de générations hybrides ont été notées.
Analyse des données
Les chercheurs ont créé des chronologies pour montrer les événements clés liés au terme "essaim hybride" et ont tracé la fréquence de son utilisation au fil du temps. Ils ont trouvé 67 articles pertinents pour l'hybridation, dont 49 décrivaient des essaims hybrides actifs. La première occurrence du terme dans leur recherche date de 1989.
Les résultats ont montré que la plupart des études se concentraient sur les plantes comme sujet principal quand on parlait d'essaims hybrides. Les systèmes hybrides à deux espèces étaient les plus souvent étudiés, tandis que les systèmes impliquant plus de deux espèces étaient moins fréquents.
Les données ont révélé que la plupart des études n'impliquaient pas beaucoup d'individus, et il y avait une tendance montrant que le même schéma était vrai pour le nombre de sites d'échantillonnage et de loci génétiques utilisés dans une étude.
Modèles dans les preuves
Ces dernières années, les études ont de plus en plus utilisé des polymorphismes à un seul nucléotide (SNPs) pour décrire les essaims hybrides. Cette tendance a été accompagnée d'une baisse de l'utilisation des marqueurs microsatellites. Les preuves provenant d'études génétiques sont restées stables, tandis que l'utilisation de preuves phénotypiques est également restée constante, mais les preuves génétiques étaient citées plus souvent dans l'ensemble.
Les articles de recherche décrivant des essaims hybrides ont été publiés plus fréquemment ces dernières années. Notamment, les populations de poissons représentées comme des essaims hybrides étaient souvent soumises à des perturbations, contrairement aux populations de plantes.
Résultats de l'hybridation
Concernant les types d'hybrides trouvés dans les systèmes d'essaims hybrides actifs, la présence d'hybrides de première génération (F1) était courante. Les résultats trouvés dans ces études variaient grandement, certaines études montrant des exemples des trois types d'hybrides (F1, hybrides de deuxième génération, et retours) tandis que d'autres n'en avaient aucun.
D'autres études ont mis en lumière la complexité des dynamiques d'hybridation. Certains articles décrivaient des essaims hybrides comme ayant de nombreux individus rétrocroisés, tandis que d'autres ne trouvaient pas de différences claires dans les types d'hybrides.
L'ambiguïté de l'essaim hybride
Même après des recherches approfondies, la vraie définition d'un essaim hybride reste floue. Beaucoup d'articles définissaient les essaims hybrides avec des critères variés liés au rétrocroisement ou à des caractéristiques spécifiques des hybrides. Le terme a été utilisé de manière diverse pour décrire différentes situations concernant l'hybridation, ce qui a entraîné encore plus de confusion.
Malgré des suppositions initiales selon lesquelles les essaims hybrides seraient facilement définis, la réalité est différente. Les études indiquaient un manque d'accord sur ce qui constitue un essaim hybride, et beaucoup d'articles peinaient à clarifier les types d'hybrides impliqués.
Tendances d'utilisation au fil du temps
L'utilisation du terme essaim hybride a montré une montée progressive depuis les années 1990 jusqu'à un pic autour de 2016-2019, après quoi le terme est devenu moins courant. Cette montée est probablement liée à une augmentation des études sur l'hybridation, poussée par les avancées dans les technologies de séquençage qui ont rendu moins cher d'étudier beaucoup d'individus.
La majorité des articles examinés se concentraient sur des systèmes à deux espèces, ce qui indique que les études impliquant plusieurs espèces restent relativement rares. Cela met en évidence comment le terme essaim hybride peut simplifier à l'excès les complexités de l'hybridation dans des milieux naturels.
Manque de définition claire
La relation entre les concepts de stabilité, de durée et d'essaims hybrides est également floue. Certaines études ont suggéré que les zones hybrides sont des zones stables d'hybridation, tandis que les essaims hybrides sont plus dynamiques et peuvent menacer la survie des espèces parentes.
Les chercheurs ont constaté que le terme essaim hybride a été utilisé sans prendre en compte combien de temps une zone hybride avait été présente ou sa stabilité au fil du temps. Il n'y avait pas de preuves que le terme soit lié à des résultats spécifiques de l'hybridation ou qu'il indique une catégorie unique nécessitant sa propre définition.
Aptitude et hybridation
L'aptitude hybride, ou la façon dont les individus hybrides se portent par rapport à leurs espèces parentes, n'est souvent pas un facteur clé pour définir les essaims hybrides. Dans les études où l'aptitude a été examinée, beaucoup n'avaient pas de mesures directes disponibles pour comparer la vigueur hybride par rapport aux populations parentes.
Les mêmes descriptions générales de variabilité parmi les hybrides peuvent s'appliquer à n'importe quelle population où des hybrides existent. Cela signifie que simplement étiqueter un groupe comme un essaim hybride ne capture pas les complexités impliquées.
Conclusion
La façon dont les chercheurs utilisent le terme essaim hybride varie largement et mène souvent à la confusion. Beaucoup ont noté que des termes comme "zone hybride" et "hybridation" pourraient servir de remplacements adéquats dans la plupart des cas. Ces termes sont utilisés de manière interchangeable dans certaines études et pourraient fournir des descriptions plus précises des dynamiques entourant la progéniture hybride.
Le principal enseignement est que le terme essaim hybride ne représente pas un concept unique qui ne peut pas être décrit avec un langage plus clair. À mesure que le domaine de l'hybridation continue de croître, il est essentiel de réfléchir à la terminologie utilisée pour garantir une communication efficace et une compréhension des résultats dans ce domaine de recherche.
Titre: The ambiguity of "hybrid swarm": inconsistent definitions and applications in existing research
Résumé: 1Hybridization is common in wild taxa and often increases in frequency following anthropogenic disturbance to an environment. Next-generation sequencing techniques make genomic analysis of a large number of individuals feasible, vastly improving the analysis for and promoting a greater frequency of studies on hybridization. However, terminology surrounding hybridization can be inconsistent; in particular, the term "hybrid swarm" has been used extensively in the literature but lacks a consistent definition. In this paper, we conducted a comprehensive review of the literature that uses the term "hybrid swarm" in reference to hybridization between taxa and challenged putative definitions of the term. We found that the term "hybrid swarm" is used in a variety of contexts, including some contradictory to other literature, and that there is little consensus on what constitutes a hybrid swarm in terms of hybrid outcomes, frequency relative to disturbances, or duration of existence. We dissuade researchers from use of the term "hybrid swarm" and instead suggest more specific and clear terminology to describe aspects of hybridization. Consequently, we hope that this paper promotes consensus surrounding hybridization terminology and improves the quality of future research on hybridization.
Auteurs: Amanda Vivian Meuser, J. N. Campbell, E. G. Mandeville, N. C. Lewis
Dernière mise à jour: 2024-10-12 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.11.617831
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.11.617831.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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