Examiner les connexions neuronales grâce à des techniques avancées
Des recherches montrent comment des réponses neuronales similaires influencent leurs connexions.
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Table des matières
- Défis dans l'Étude des Connexions Neuronales
- Le Jeu de Données MICrONS
- Apprentissage Automatique pour l'Analyse des Neurones
- Collecte de Données et Analyse des Neurones
- Types de Cohortes de Neurones
- Résultats sur la Connectivité Neuronale
- Réponses des Neurones et Leur Force
- Importance de la Similarité des Poids de Caractéristiques
- Aperçus du Modèle de Jumeau Numérique
- Organisation Fonctionnelle de Haut Niveau
- Comparaison avec les Réseaux Neuronaux Artificiels
- Futures Directions de la Recherche
- Conclusion
- Source originale
À la fin des années 1800, un scientifique nommé Santiago Ramón y Cajal a étudié les Neurones, qui sont les éléments de base du système nerveux. Il a proposé la Doctrine du Neurone, qui suggère que chaque neurone est une unité indépendante jouant un rôle clé dans le fonctionnement de notre cerveau. Cette idée met en avant que le fonctionnement d'un neurone est étroitement lié à la façon dont il se connecte avec d'autres neurones. Au fil des années, de nombreux chercheurs ont proposé différentes idées sur la façon dont ces connexions et fonctions s'entrelacent.
Une idée célèbre vient de Donald Hebb, qui a suggéré que les neurones activés ensemble tendent à former des connexions plus fortes. En gros, on dit souvent que "les neurones qui s'activent ensemble, se connectent ensemble." Dans la partie visuelle du cerveau, les chercheurs Hubel et Wiesel ont proposé que les neurones sont organisés d'une manière qui permet aux caractéristiques simples de se combiner et de former des réponses visuelles plus complexes. Par exemple, certaines cellules réagissent à la direction des lignes, tandis que d'autres réagissent à leur position.
Défis dans l'Étude des Connexions Neuronales
Étudier comment les neurones se connectent et fonctionnent a été difficile à cause des défis techniques liés à la mesure à la fois de l'activité neuronale et des connexions entre eux. Dans le cortex visuel, les scientifiques ont trouvé que les neurones ayant des réponses similaires aux stimuli visuels ont tendance à se connecter plus souvent. Ils ont utilisé diverses techniques d'imagerie avancées pour observer ces connexions et l'activité des neurones impliqués.
Cependant, la plupart de ces études se sont concentrées sur de petites zones du cerveau. Cette limitation rend difficile de répondre à des questions plus larges sur la façon dont les règles de connexion s'appliquent à différentes régions du cerveau et à différentes couches de neurones.
Le Jeu de Données MICrONS
Le jeu de données MICrONS est la plus grande collection de données d'imagerie qui combine à la fois des informations fonctionnelles et structurelles sur les neurones. Les chercheurs ont étudié un volume de tissu cérébral chez une souris, en se concentrant sur différentes zones responsables de la vision. Ils ont spécifiquement analysé à quel point différents neurones se connectent en fonction des fonctions qu'ils remplissent.
Ce jeu de données permet un examen plus détaillé de tous les neurones dans le volume étudié, contrairement aux études précédentes qui se concentraient uniquement sur quelques neurones. Il offre une chance de comparer des neurones connectés avec ceux qui sont proches mais non connectés. C'est important pour comprendre comment des neurones qui sont proches l'un de l'autre peuvent ne pas se connecter.
Apprentissage Automatique pour l'Analyse des Neurones
Pour analyser comment ces neurones fonctionnent, les chercheurs ont utilisé des techniques d'apprentissage automatique. En entraînant un modèle pour prédire comment les neurones réagissent à divers stimuli visuels, ils ont créé ce qu'on appelle un "jumeau numérique." Ce jumeau numérique peut simuler une gamme d'entrées visuelles plus large que ce qui pourrait être testé dans de vraies expériences.
Le modèle permet aux chercheurs d'examiner plus en détail les caractéristiques de chaque neurone, découvrant comment ils réagissent à différentes caractéristiques et où se situent leurs champs réceptifs. Cette séparation des caractéristiques et des informations spatiales aide à clarifier comment ces deux aspects se rapportent aux connexions entre neurones.
Collecte de Données et Analyse des Neurones
Les données ont été recueillies d'une souris entraînée à répondre à des stimuli visuels pendant que son activité cérébrale était enregistrée. Cela impliquait d'utiliser des techniques d'imagerie avancées pour capturer le comportement et l'activité de nombreux neurones à la fois. Les chercheurs ont collecté les réponses de plus de 75 000 neurones excitateurs uniques alors qu'ils traitaient divers types de films.
Après avoir collecté des données fonctionnelles, le tissu a été préparé pour une imagerie plus approfondie afin de comprendre sa structure en détail. Cela incluait l'examen des connexions entre neurones et l'identification de leurs rôles dans le traitement de l'information visuelle.
Types de Cohortes de Neurones
Pour mieux comprendre les relations entre les neurones, les chercheurs ont défini trois groupes principaux pour la comparaison. Le premier groupe incluait les neurones directement connectés à un neurone donné. Le deuxième groupe se composait de neurones voisins ayant une proximité proche du neurone donné mais n’étant pas connectés. Le dernier groupe impliquait des neurones de la même zone qui n'étaient pas près de l'axone du premier neurone.
En comparant ces groupes, les chercheurs pouvaient mieux comprendre comment la Connectivité se rapporte à la similarité fonctionnelle.
Résultats sur la Connectivité Neuronale
L'analyse a révélé que les neurones montrant des réponses similaires avaient tendance à se connecter plus fréquemment. Cela était vrai à travers différentes couches et zones du cortex visuel. Les neurones ayant des corrélations de signal plus élevées étaient plus susceptibles d'être connectés. Les résultats ont également indiqué que des neurones similaires avaient plus de chances de co-voyager dans le cerveau. Cela signifie que les chemins de leurs axones se chevauchaient souvent.
De plus, l'étude a montré que plus les réponses de deux neurones étaient similaires, plus leurs connexions étaient probables. Cette relation était cohérente à travers différents types de connexions, qu'elles soient localisées dans une zone du cortex ou étendues à différentes zones.
Réponses des Neurones et Leur Force
Les chercheurs ont également examiné comment la force des connexions entre neurones était liée à leur similarité fonctionnelle. Ils ont trouvé qu'à mesure que la similarité fonctionnelle augmentait, le nombre de Synapses connectant les neurones augmentait aussi. Cela suggère que les neurones fonctionnellement similaires tendent à développer des connexions plus fortes.
L'analyse a révélé que la taille de la synapse et le nombre de connexions synaptiques augmentaient avec une plus grande similarité fonctionnelle. Cela s'aligne avec l'idée que les neurones qui réagissent à des stimuli similaires renforcent leurs connexions lorsqu'ils sont activés ensemble.
Importance de la Similarité des Poids de Caractéristiques
Un autre domaine clé de concentration était sur la similarité des poids de caractéristiques, qui fait référence à la façon dont les neurones étaient similaires quant aux caractéristiques auxquelles ils réagissaient. Les chercheurs ont découvert que les connexions entre les neurones étaient mieux prédites par leur similarité de caractéristiques plutôt que par la distance physique entre leurs champs réceptifs.
Cela signifie que même si deux neurones sont proches l'un de l'autre mais répondent à des caractéristiques différentes, ils peuvent ne pas être connectés. En revanche, les neurones qui réagissent à des caractéristiques similaires – même s'ils sont plus éloignés – sont plus susceptibles de former des connexions.
Aperçus du Modèle de Jumeau Numérique
Le modèle de jumeau numérique a permis aux chercheurs d'analyser et de décomposer les réponses neuronales en caractéristiques et emplacements spécifiques, ce qui a contribué à une compréhension plus approfondie des règles de connectivité. En simulant comment les neurones réagissaient à une large gamme de stimuli, le modèle a fourni une image plus riche des relations entre différents neurones.
Cette vue d'ensemble permet aux chercheurs de prédire la connectivité en se basant sur plus que la simple proximité physique, mais plutôt sur les caractéristiques fonctionnelles des neurones. Les idées tirées de cette analyse pourraient éclairer les investigations futures sur la façon dont le cerveau s'organise autour de fonctions spécifiques.
Organisation Fonctionnelle de Haut Niveau
De plus, l'étude a exploré comment les neurones partageant une entrée commune affichent une plus grande similarité que prévu, suggérant que les connexions entre ces neurones ne reposent pas simplement sur des connexions individuelles. Cela indique qu'il existe des principes d'organisation plus complexes en jeu dans le cerveau.
Les résultats suggèrent qu'il pourrait y avoir des motifs ou des schémas au-delà de règles simples, laissant entrevoir un réseau plus sophistiqué de connexions formées sur la base de propriétés fonctionnelles partagées.
Comparaison avec les Réseaux Neuronaux Artificiels
Pour éclairer les fonctions potentielles de la connectivité semblable à celle observée dans le jeu de données, les chercheurs ont examiné des réseaux neuronaux récurrents. Ces systèmes artificiels ont démontré que des principes similaires de connectivité sont présents, bénéficiant des connexions semblables en termes de performance et d'apprentissage.
En comparant la performance d'un réseau neuronal entraîné aux connexions aléatoires, les chercheurs ont constaté que les connexions basées sur la similarité étaient plus efficaces pour le fonctionnement du réseau. Cela soulève des questions intéressantes sur la façon dont des structures organisationnelles similaires pourraient exister à la fois dans des systèmes biologiques et artificiels.
Futures Directions de la Recherche
Comprendre comment les structures cérébrales se rapportent à leurs fonctions est un objectif central en neurosciences. Les découvertes tirées de ce jeu de données, en particulier les relations entre les fonctions neuronales et les connexions, offrent des aperçus précieux. L'utilisation de techniques d'imagerie avancées et d'algorithmes d'apprentissage automatique ouvre de nouvelles voies d'exploration.
Avec la disponibilité de plus de données, les chercheurs peuvent continuer à déchiffrer les complexités de l'organisation cérébrale. Des études futures pourraient se concentrer sur des structures de réseau plus larges ou des connexions au niveau des compartiments subcellulaires, aidant à clarifier comment des propriétés fonctionnelles plus complexes émergent de règles simples.
Conclusion
En résumé, les études effectuées sur le jeu de données MICrONS soulignent l'importance de comprendre les connexions entre les neurones et leur fonction. Les résultats soutiennent l'idée que les neurones qui réagissent de manière similaire sont plus susceptibles de se connecter entre eux, révélant des principes essentiels de connectivité neuronale.
Cette recherche fournit une base pour des études futures qui continueront à explorer les relations complexes au sein du cerveau et à élargir nos connaissances sur la façon dont des réseaux interconnectés de neurones traitent l'information.
Titre: Functional connectomics reveals general wiring rule in mouse visual cortex
Résumé: Understanding the relationship between circuit connectivity and function is crucial for uncovering how the brain implements computation. In the mouse primary visual cortex (V1), excitatory neurons with similar response properties are more likely to be synaptically connected, but previous studies have been limited to within V1, leaving much unknown about broader connectivity rules. In this study, we leverage the millimeter-scale MICrONS dataset to analyze synaptic connectivity and functional properties of individual neurons across cortical layers and areas. Our results reveal that neurons with similar responses are preferentially connected both within and across layers and areas -- including feedback connections -- suggesting the universality of the like-to-like connectivity across the visual hierarchy. Using a validated digital twin model, we separated neuronal tuning into feature (what neurons respond to) and spatial (receptive field location) components. We found that only the feature component predicts fine-scale synaptic connections, beyond what could be explained by the physical proximity of axons and dendrites. We also found a higher-order rule where postsynaptic neuron cohorts downstream of individual presynaptic cells show greater functional similarity than predicted by a pairwise like-to-like rule. Notably, recurrent neural networks (RNNs) trained on a simple classification task develop connectivity patterns mirroring both pairwise and higher-order rules, with magnitude similar to those in the MICrONS data. Lesion studies in these RNNs reveal that disrupting like-to-like connections has a significantly greater impact on performance compared to lesions of random connections. These findings suggest that these connectivity principles may play a functional role in sensory processing and learning, highlighting shared principles between biological and artificial systems.
Auteurs: Andreas S. Tolias, Z. Ding, P. G. Fahey, S. Papadopoulos, E. Y. Wang, B. Celii, C. Papadopoulos, A. Chang, A. Kunin, D. Tran, J. Fu, S. Patel, L. Ntanavara, R. Froebe, K. Ponder, T. Muhammad, J. A. Bae, A. L. Bodor, D. Brittain, J. Buchanan, D. J. Bumbarger, M. A. Castro, E. Cobos, S. Dorkenwald, L. Elabbady, A. Halageri, Z. Jia, C. Jordan, D. Kapner, N. Kemnitz, S. Kinn, K. Lee, K. Li, R. Lu, T. Macrina, G. Mahalingam, E. Mitchell, S. S. Mondal, S. Mu, B. Nehoran, S. Popovych, C. M. Schneider-Mizell, W. Silversmith, M. Takeno, R. Torres, N. L. Turner, Wong
Dernière mise à jour: 2024-10-15 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.13.531369
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.03.13.531369.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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