Nouvelles idées sur les stratégies de survie de Toxoplasma gondii
Des recherches montrent comment les infections mixtes aident à la croissance de Toxoplasma et à l’évasion immunitaire.
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Table des matières
- Importance de l'Étude de Toxoplasma
- Écrans CRISPR en Mode Pooled dans la Recherche sur Toxoplasma
- Le Rôle des Protéines Sécrétées
- Investigation des Effets de MYR1
- Expérimentation avec des Infections Mixtes
- Comprendre le Mécanisme des Effets Paracrines
- Implications pour Comprendre les Stratégies de Survie de Toxoplasma
- Conclusion
- Source originale
Les écrans CRISPR en mode pooled sont des outils super puissants en génétique pour comprendre le rôle précis de certains gènes. Ils permettent aux scientifiques d'étudier plusieurs gènes dans plein de cellules en même temps, que ce soit pour voir si un gène aide ou freine la survie cellulaire. En utilisant ces écrans, les chercheurs peuvent analyser différentes situations, que ce soit en labo ou chez des organismes vivants, pour voir comment les gènes se comportent.
Un organisme particulier qui a été étudié avec des écrans CRISPR en mode pooled, c’est Toxoplasma Gondii, un parasite unicellulaire. Toxoplasma peut infecter plein d’animaux à sang chaud, y compris les humains. On le trouve partout et il est surtout commun chez le bétail et la faune. Beaucoup de gens portent ce parasite sans montrer de symptômes, mais ça peut être dangereux pour ceux qui ont un système immunitaire faible ou pour les femmes enceintes.
Toxoplasma gondii se développe dans les cellules hôtes et peut changer de forme au cours de son cycle de vie. Le parasite grandit vite au début et puis peut devenir dormant dans des kystes tissulaires, qui peuvent rester dans le corps longtemps. Le système immunitaire de l’hôte joue un rôle crucial pour contrôler la croissance du parasite, mais il échoue souvent à l’éliminer complètement.
Importance de l'Étude de Toxoplasma
Comprendre comment Toxoplasma survit et se propage est super important, surtout parce que ça pose des risques pour la santé humaine. Quand le parasite pénètre dans le corps, il est reconnu par des cellules immunitaires spéciales qui déclenchent une réponse pour combattre l'infection. Un acteur clé de cette réponse est une protéine appelée interféron-gamma (IFN-γ), qui aide à activer les cellules immunitaires pour limiter la croissance du parasite. Cependant, la réponse immunitaire n’est pas toujours assez forte pour éliminer tous les parasites. Certains peuvent rester sous une forme dormante, pouvant se réactiver et provoquer des maladies plus tard.
Les chercheurs ont découvert que lorsque Toxoplasma envahit les cellules hôtes, il relâche aussi plusieurs Protéines qui influencent la façon dont le système immunitaire de l'hôte réagit. Ces protéines secrétées peuvent interférer avec les signaux immunitaires, aidant le parasite à survivre plus longtemps à l'intérieur de l'hôte. Donc, étudier ces protéines peut révéler comment Toxoplasma échappe à la réponse immunitaire et s'installe dans l'hôte.
Écrans CRISPR en Mode Pooled dans la Recherche sur Toxoplasma
Dans des études précédentes, des écrans CRISPR en mode pooled ont été réalisés avec Toxoplasma gondii chez des souris pour identifier quelles protéines sont vitales pour la survie du parasite. Ces écrans ont montré que certaines protéines, secrétées par le parasite, sont cruciales pour sa capacité à prospérer dans son hôte.
Cependant, les chercheurs ont remarqué quelque chose d’intéressant : alors que certaines mutations génétiques dans Toxoplasma rendaient la survie du parasite plus difficile dans des tests isolés, les mêmes mutations semblaient pas freiner le parasite dans des tests en mode pooled. Ça a soulevé des questions sur l’influence de la présence d'autres types de parasites sur les résultats et si les interactions entre différents Mutants affectaient les résultats.
Une hypothèse proposée par les scientifiques est que les protéines d'un type de Toxoplasma pourraient aider d'autres dans une infection mixte. Ça signifie qu'une mutation qui causerait normalement des problèmes à un parasite pourrait être compensée par d'autres parasites dans le même espace, permettant à ces deux types de croître.
Le Rôle des Protéines Sécrétées
Les protéines secrétées de Toxoplasma gondii jouent un rôle crucial dans la façon dont le parasite interagit avec son hôte. En modifiant l'environnement autour d'eux, ces protéines peuvent aider le parasite à survivre aux réponses immunitaires. Par exemple, des protéines comme GRA16 sont liées à des signaux de croissance des cellules hôtes qui facilitent la prospérité de Toxoplasma.
Les recherches ont montré que ces protéines secrétées peuvent aussi influencer les niveaux de divers signaux immunitaires. Si certains facteurs immunitaires sont boostés, cela peut créer un environnement plus favorable pour la survie des parasites, même si un seul isolat ne survivrait pas sans l’aide d’autres.
Investigation des Effets de MYR1
Une protéine particulière, MYR1, a été identifiée comme essentielle pour l’exportation de nombreuses protéines secrétées. Sans MYR1, Toxoplasma a du mal à secréter efficacement ses protéines, ce qui impacte sa capacité à influencer l'environnement immunitaire de l'hôte. Cependant, des expériences ont révélé que des parasites sans MYR1 parvenaient toujours à survivre et à se développer lorsqu'ils étaient mélangés à d'autres parasites.
Dans des études ultérieures, les chercheurs ont infecté des cellules immunitaires avec des parasites Toxoplasma ayant soit MYR1, soit une version sans. Ils ont découvert que ceux avec MYR1 pouvaient manipuler l'environnement de l'hôte pour favoriser leur croissance, tandis que ceux sans MYR1 grandissaient aussi dans le même environnement. Cela a suggéré que le rôle de MYR1 n'est pas aussi critique pour la survie qu'on le pensait, du moins pas en présence d'autres types de parasites.
Expérimentation avec des Infections Mixtes
Pour examiner comment les infections mixtes affectent la croissance de Toxoplasma, les chercheurs ont mené des expériences où des souris étaient infectées à la fois avec des parasites déficients en MYR1 et des parasites normaux. Ils ont remarqué que les parasites déficients en MYR1 se développent mieux en présence de parasites normaux que lorsqu'ils étaient mélangés à d'autres souches déficientes en MYR1.
Cela a fourni des preuves que les parasites normaux envoient des signaux qui favorisent un environnement immunitaire favorable, permettant aux mutants déficients en MYR1 de croître dans des conditions où ils auraient normalement du mal.
En examinant les facteurs immunitaires produits lors de ces infections mixtes, les scientifiques ont trouvé des niveaux accrus de protéines clés comme TNF et CCL2. Ces protéines sont importantes pour recruter des cellules immunitaires sur le site d'infection. Ainsi, l’interaction entre les différentes souches de Toxoplasma semblait contribuer positivement à la survie des mutants.
Comprendre le Mécanisme des Effets Paracrines
Les chercheurs ont ensuite commencé à explorer quels mécanismes biologiques étaient responsables de cet effet de secours. Ils ont découvert que la présence de parasites normaux entraînait des niveaux plus élevés de cellules inflammatoires, comme les monocytes, recrutées dans les zones infectées. Ces changements dans l'environnement immunitaire semblaient soutenir la croissance des parasites déficients en MYR1.
Fait intéressant, même lorsque les niveaux de molécules de signalisation comme IFN-γ étaient élevés, les parasites déficients en MYR1 parvenaient toujours à survivre. Cela a montré que les fonctions d'assistance des parasites normaux fonctionnaient efficacement même face à des réponses immunitaires robustes.
Implications pour Comprendre les Stratégies de Survie de Toxoplasma
Ces découvertes sont importantes pour une compréhension plus large de la façon dont Toxoplasma gondii échappe au système immunitaire. Ça met en évidence un aspect précédemment négligé de la manière dont les parasites peuvent manipuler leur environnement à leur avantage, surtout dans des populations mixtes.
Plus précisément, cette recherche indique que la capacité de Toxoplasma à survivre peut être influencée par la présence d'autres parasites plutôt que de se fier uniquement à son propre patrimoine génétique. Les interactions entre parasites et l'environnement qu'ils créent les uns pour les autres peuvent masquer des vulnérabilités potentielles.
Conclusion
L'étude de Toxoplasma gondii et de ses interactions dans des infections mixtes offre des aperçus précieux sur la complexité des relations hôte-parasite. Les chercheurs ont appris que les changements génétiques dans Toxoplasma peuvent affecter sa survie, mais ces effets peuvent différer selon la présence d'autres souches.
Le travail souligne la nécessité d'une meilleure compréhension de la manière dont les réponses immunitaires peuvent être influencées par la dynamique de plusieurs souches de parasites. Cette connaissance pourrait ouvrir la voie à de nouvelles stratégies pour combattre les infections et met en lumière l'importance de considérer les interactions au sein des systèmes biologiques.
En examinant ces relations, les chercheurs peuvent découvrir de nouvelles approches pour s'attaquer aux maladies causées par Toxoplasma et potentiellement d'autres pathogènes, renforçant notre capacité à comprendre et à répondre aux maladies infectieuses en général.
Titre: Paracrine rescue of MYR1-deficient Toxoplasma gondii mutants reveals limitations of pooled in vivo CRISPR screens
Résumé: Toxoplasma gondii is an intracellular parasite that subverts host cell functions via secreted virulence factors. Up to 70% of parasite-controlled changes in the host transcriptome rely on the MYR1 protein, which is required for the translocation of secreted proteins into the host cell. Mice infected with MYR1 knock-out (KO) strains survive infection, supporting a paramount function of MYR1-dependent secreted proteins in Toxoplasma virulence and proliferation. However, we have previously shown that MYR1 mutants have no growth defect in pooled in vivo CRISPR-Cas9 screens in mice, suggesting that the presence of parasites that are wild-type at the myr1 locus in pooled screens can rescue the phenotype. Here, we demonstrate that MYR1 is not required for the survival in IFN-{gamma}-activated murine macrophages, and that parasites lacking MYR1 are able to expand during the onset of infection. While {Delta}MYR1 parasites have restricted growth in single-strain murine infections, we show that the phenotype is rescued by co-infection with wild-type (WT) parasites in vivo, independent of host functional adaptive immunity or key pro-inflammatory cytokines. These data show that the major function of MYR1-dependent secreted proteins is not to protect the parasite from clearance within infected cells. Instead, MYR-dependent proteins generate a permissive niche in a paracrine manner, which rescues {Delta}MYR1 parasites within a pool of CRISPR mutants in mice. Our results highlight an important limitation of otherwise powerful in vivo CRISPR screens and point towards key functions for MYR1-dependent Toxoplasma-host interactions beyond the infected cell. SIGNIFICANCE STATEMENTPooled CRISPR screens are powerful tools to interrogate gene function in a high-throughput manner. Genes conferring fitness advantages or disadvantages upon disruption can be identified by sequencing. However, in Toxoplasma gondii pooled CRISPR screens in mice, fitness defects for some selected mutants drastically diverge from those observed in single-strain infections. Here, we show that a growth defect of a single Toxoplasma gene deletion mutant is rescued if co-infected with wildtype parasites. These results shine light on Toxoplasmas ability to subvert the host response beyond the infected cell, and highlight an important limitation of pooled CRISPR screens in mice. This limitation is probably encountered in CRISPR screens in general where paracrine effects occur.
Auteurs: Moritz Treeck, F. Torelli, D. Matos da Fonseca, S. Butterworth, J. C. Young
Dernière mise à jour: 2024-10-16 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.23.609334
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.08.23.609334.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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