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# Biologie# Génomique

Augmentation des cas de vibriosis liés à V. mimicus

Les souches V. mimicus montrent une augmentation des cas de gastro-entérite, mettant en évidence de nouveaux facteurs de virulence.

Sergio Morgado, E. Fonseca, A. C. P. Vicente

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Menace de la vibriosis etMenace de la vibriosis etde V. mimicusV. mimicus est un souci de santé.De nouvelles découvertes révèlent que
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Des rapports montrent que les cas de vibriosis augmentent dans le monde entier, surtout en Europe, en Asie et aux États-Unis. V. mimicus est l'une des bactéries liées à ces cas, provoquant des symptômes comme la gastro-entérite et la diarrhée qui ressemblent à celle du choléra lorsque les gens mangent des aliments contaminés. Les scientifiques essaient encore de comprendre comment V. mimicus cause des maladies, car certaines souches n'ont pas les marqueurs habituels associés à Vibrio cholerae, la bactérie qui cause le choléra. Récemment, une épidémie dangereuse de gastro-entérite en Floride a été attribuée à des souches de V. mimicus qui manquaient de ces marqueurs typiques, soulevant des questions sur d'autres facteurs qui pourraient être responsables de leur capacité à provoquer des maladies.

Étude des Génomes de V. mimicus

Des chercheurs ont étudié la composition génétique de diverses souches de V. mimicus, y compris celles de l'épidémie récente en Floride. Ils ont trouvé un ensemble spécifique de gènes appelé le Système de Sécrétion de Type III (T3SS) et deux toxines, tdh et TRH, dans un petit nombre des génomes. Ce T3SS et les toxines étaient généralement situés dans des régions du génome qui sont considérées comme liées à la capacité de la bactérie à causer des maladies. Étrangement, beaucoup des séquences génétiques T3SS étaient similaires à celles trouvées dans une autre bactérie apparentée appelée V. parahaemolyticus.

Méthodes Utilisées dans l'Étude

Pour analyser les informations génétiques de V. mimicus, les chercheurs ont recueilli des données à partir d'une base de données publique. Ils ont cherché des gènes liés à la virulence et identifié des régions dans le génome qui pourraient indiquer des îles génétiques et des éléments conjugatifs intégratifs. Ils ont utilisé un logiciel spécifique pour la prédiction des gènes et des vérifications manuelles pour assurer la précision.

Résultats sur T3SS et Toxines

Parmi les 44 génomes de V. mimicus qu'ils ont examinés, cinq contenaient des gènes liés au T3SS. Dans quatre de ces génomes, le gène tdh était également présent, tandis que dans un génome, le gène trh apparaissait. La présence de ces toxines suggère qu'elles pourraient jouer un rôle significatif dans la cause de Gastro-entérites, en particulier dans les souches qui ne portent pas les gènes liés au choléra habituels.

Analyse Phylogénétique

Les chercheurs ont créé un arbre pour visualiser les relations entre différents génomes de V. mimicus. Ils ont trouvé que les génomes portant le T3SS se divisaient en deux grands groupes et une souche distincte. Cette analyse a montré que le gène tdh était présent dans les deux génomes de deux des groupes, tandis que le gène trh se trouvait dans un groupe autonome.

Catégories de T3SS

Le T3SS a deux types, T3SS1 et T3SS2. Le deuxième type se trouve souvent avec les gènes tdh et trh, connus pour endommager les membranes cellulaires dans le corps humain. Ces toxines sont courantes dans V. parahaemolyticus, une autre bactérie connue pour causer des gastro-entérites. Les chercheurs ont découvert que le T3SS dans V. mimicus avait différents sous-groupes, montrant une relation complexe entre la bactérie et les toxines qu'elle porte.

Analyse Génétique Détaillée de V. mimicus F9458

Un examen plus approfondi du génome de V. mimicus F9458 a révélé que le T3SS et le gène tdh étaient situés dans une section du génome qui semblait fonctionner comme un élément conjugal intégratif (ICE). Cette découverte a marqué la première identification d'un tel élément dans V. mimicus. L'ICEVmF9458 couvrait une partie importante du génome et montrait des motifs indiquant qu'il pourrait transférer du matériel génétique.

Lien avec les Épidémies Récentes

Lors d'une épidémie de V. mimicus en 2019 aux États-Unis, les chercheurs ont proposé que certains facteurs de virulence pourraient avoir contribué à la diarrhée sévère signalée dans ces cas. En examinant les génomes de cette épidémie, ils ont identifié la toxine tdh associée à T3SS2. Des études précédentes sur V. parahaemolyticus ont suggéré que T3SS2 et la toxine tdh étaient des composants clés dans la causation d'épidémies diarrhéiques similaires.

Importance des Résultats

Les résultats soulignent la nécessité d'examiner non seulement la présence de gènes de toxine cholérique lors des infections à V. mimicus, mais aussi d'autres toxines comme TDH et TRH qui pourraient contribuer à la maladie. L'identification du premier ICE dans V. mimicus soulève des inquiétudes quant à la possibilité que ces traits nuisibles se propagent parmi différentes espèces de Vibrio.

Conclusion

En résumé, la hausse des cas de vibriosis est corrélée à la présence de V. mimicus, qui pourrait utiliser divers mécanismes toxiques pour provoquer des maladies. Le T3SS et les toxines tdh et trh semblent jouer des rôles cruciaux dans la virulence de ces bactéries. Les facteurs génétiques liés à la virulence sont complexes, et des recherches continues sont nécessaires pour mieux comprendre comment ces bactéries fonctionnent et comment elles peuvent impacter la santé publique. Étant donné les résultats, il est essentiel d'élargir le champ des tests pour les toxines dans les cas de V. mimicus au-delà des gènes de toxines cholériques traditionnels pour inclure ceux associés à d'autres espèces de Vibrio.

Source originale

Titre: Vibrio mimicus carrying the Type III Secretion System 2 (T3SS2) and TDH toxin of Vibrio parahaemolyticus in an integrative conjugative element context

Résumé: ObjectivesIdentify possible virulence factors in the genomes of Vibrio mimicus that may be determinants of diarrheal cases/outbreaks. MethodsAll V. mimicus genomes from Genbank were retrieved and the virulome was searched with Abricate using the VFDB database. Genomic islands (GIs) and integrative conjugative elements (ICEs) were identified using IslandViewer and ICEberg, respectively. ResultsFive ctx-negative V. mimicus genomes carrying the Type III Secretion System 2 (T3SS2) and the TDH/TRH toxin from Vibrio parahaemolyticus were identified. The T3SS-positive genomes presented the phylotypes T3SS2 and T3SS2{beta} and formed two clusters and one singleton throughout the V. mimicus phylogeny. Genomes carrying T3SS2 and T3SS2{beta} were associated with the tdh and trh genes, respectively. Furthermore, genomic analyses characterized an integrative conjugative element (ICE) with a size of [~]150 kb carrying both V. parahaemolyticus virulence determinants. ConclusionsIn addition to looking for cholera toxin genes in V. mimicus cases/outbreaks, it is important to consider V. parahaemolyticus toxins such as TDH and TRH. Furthermore, an ICE was identified and characterized in V. mimicus, being associated with T3SS2 and the TDH toxin, which is worrying, as it can disseminate these virulence factors among Vibrio spp.

Auteurs: Sergio Morgado, E. Fonseca, A. C. P. Vicente

Dernière mise à jour: 2024-10-26 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.23.619894

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.23.619894.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.

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