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Le rôle de DNMT3AR882H dans le développement de la leucémie

Des recherches montrent que les mutations DNMT3AR882H sont cruciales au début de la leucémie mais moins importantes par la suite.

Ravindra Majeti, T. Koehnke, D. Karigane, E. Hilgart, A. C. Fan, K. Kayamori, M. Miyauchi, C. T. Collins, F. P. Suchy, A. Rangavajhula, Y. Feng, Y. Nakauchi, E. Martinez-Montes, J. Fowler, K. M. Loh, H. Nakauchi, M. A. Koldobskiy, A. P. Feinberg

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Le cancer, c'est une maladie compliquée, et les chercheurs essaient de comprendre comment les différents changements génétiques dans notre ADN contribuent à son développement. Une question importante est de savoir si certaines Mutations sont nécessaires pour démarrer un cancer ou si elles le sont pour qu'il continue à croître une fois qu'il a commencé. Cette question est particulièrement pertinente pour les cancers du sang comme la Leucémie myéloïde aiguë (LMA).

Dans des études précédentes utilisant des modèles souris, les chercheurs ont découvert que certaines mutations, comme IDH2R140Q et JAK2V617F, sont nécessaires à la fois pour démarrer le cancer et pour le maintenir. Des résultats similaires ont été observés dans des études sur le cancer colorectal, où la correction d'une mutation spécifique dans les cellules cancéreuses a conduit à une réduction de la croissance du cancer, suggérant que ces mutations sont cruciales à ces deux étapes. Cependant, on ne sait toujours pas si cette idée s'applique à tous les changements génétiques observés dans les cancers, surtout ceux qui se produisent tôt.

Étudier comment des mutations spécifiques affectent la progression de la maladie dans des échantillons humains est compliqué à cause des nombreux autres changements génétiques présents chez les patients atteints de cancer. Cela inclut des variations venant des deux parents et des différences entre patients. Pour y remédier, les chercheurs utilisent souvent des modèles comme les souris ou des lignées cellulaires, mais ces systèmes ne peuvent pas reproduire complètement les maladies humaines.

Pour s'attaquer au problème des mutations dans la leucémie myéloïde aiguë en particulier, les chercheurs ont développé une méthode pour étudier ces mutations directement dans des échantillons de patients humains. Ils ont utilisé une technologie appelée CRISPR/Cas9, qui permet aux scientifiques d'apporter des modifications précises dans l'ADN, pour corriger des mutations spécifiques dans les cellules de leucémie et voir comment ces corrections affectent l'initiation et le maintien du cancer.

Focus sur les mutations DNMT3AR882

Une des mutations à l'étude est appelée DNMT3AR882, souvent trouvée dans des conditions pré-leucémiques et dans la leucémie myéloïde aiguë. Cette mutation affecte les cellules souches sanguines et a été liée à de mauvais résultats de traitement dans la leucémie. Il semble que les mutations DNMT3AR882 peuvent augmenter la capacité d'auto-renouvellement de ces cellules souches, ce qui pourrait jouer un rôle dans le début de la maladie.

Les recherches indiquent que ces mutations pourraient être essentielles pour initier la leucémie, mais il est possible qu'après le développement du cancer, d'autres changements génétiques prennent le relais, rendant la mutation DNMT3A moins importante pour le maintien de la maladie. Les méthodes actuelles ne peuvent pas facilement déterminer si cette mutation est également importante aux stades précoces et avancés de la LMA. Par conséquent, les scientifiques ont cherché à comprendre comment les mutations DNMT3AR882 contribuent spécifiquement aux deux étapes dans des échantillons humains.

Correction des DNMT3AR882 dans des cellules pré-leucémiques

L'étude a commencé avec un focus sur la mutation DNMT3AR882H pour voir si la correction de celle-ci dans des cellules souches sanguines pré-leucémiques pouvait normaliser leur croissance. Les chercheurs ont isolé ces cellules de patients qui avaient la mutation DNMT3AR882H mais pas d'autres mutations associées à la leucémie. En utilisant la technologie CRISPR/Cas9, ils ont corrigé la mutation et testé si cela ramènerait les cellules à un état normal.

Ils ont émis l'hypothèse que corriger la mutation DNMT3AR882H stopperait la croissance incontrôlée des cellules. Après avoir introduit la correction, les cellules ont été surveillées pour des changements dans leurs capacités d'auto-renouvellement. Les premiers tests ont montré que, bien qu'il n'y ait pas de différences immédiates dans la croissance, après plusieurs cycles de croissance, les cellules modifiées ont montré des traits d'auto-renouvellement réduits par rapport aux cellules non modifiées.

Ensuite, les chercheurs ont regardé comment la correction de la mutation affectait les cellules sanguines matures issues des cellules souches modifiées. Ils ont effectué une analyse détaillée en utilisant une technologie de séquençage avancée pour identifier les types de cellules distincts générés à partir des cellules modifiées et non modifiées. Globalement, ils ont trouvé que malgré des changements mineurs dans les types de cellules, corriger la mutation entraînait des changements significatifs dans l'activité génique liée à l'inflammation et au développement des cellules sanguines.

Cela a conduit les chercheurs à conclure que la présence de la mutation DNMT3AR882H est un moteur des caractéristiques de croissance anormales des cellules souches sanguines pré-leucémiques et que corriger cette mutation pourrait inverser ces effets assez rapidement.

Investigation des DNMT3AR882 dans la leucémie établie

Ensuite, les chercheurs ont voulu voir si la mutation DNMT3AR882H était nécessaire à la survie des cellules de leucémie déjà établies. Ils ont isolé des cellules de leucémie de patients ayant la mutation DNMT3AR882H et ont appliqué les même techniques de correction qu'ils avaient utilisées sur les cellules pré-leucémiques.

Les scientifiques ont remarqué que ces cellules de leucémie portaient non seulement la mutation DNMT3AR882H mais aussi plusieurs autres mutations couramment vues dans la leucémie. Après avoir corrigé la mutation DNMT3AR882H dans ces cellules, ils les ont transplantées dans des souris pour observer si la correction affecterait leur capacité à provoquer de la leucémie.

Étonnamment, corriger la mutation DNMT3AR882H n’a pas empêché le cancer de se développer chez ces souris. Les niveaux d'engraftement étaient les mêmes, que les cellules aient la mutation ou non, ce qui suggère que cette mutation spécifique peut ne pas être essentielle une fois la leucémie établie. Les chercheurs ont confirmé que toutes les autres mutations restaient intactes dans ces cellules, indiquant que bien que la mutation DNMT3AR882H puisse aider à initier la maladie, elle ne joue pas un rôle vital dans sa continuation.

Induction de la correction in vivo

Pour explorer davantage le rôle de DNMT3AR882H dans la leucémie établie, les chercheurs ont conçu une expérience pour corriger la mutation à l'intérieur de l'organisme vivant plutôt que juste dans des cellules isolées. Ils ont créé un type spécial de cellule souche qui pouvait former de la leucémie et avaient une manière d'induire une correction de la mutation DNMT3AR882H dans des souris vivantes une fois que la leucémie avait déjà pris racine.

Une fois les cellules de leucémie établies dans les souris, ils ont traité la moitié avec une substance qui induisait la correction de la mutation DNMT3AR882H. Après quelques semaines, les souris ont été examinées pour évaluer si la correction avait entraîné des changements dans les caractéristiques de la leucémie.

Il est intéressant de noter qu'après avoir corrigé la mutation, la leucémie maintenait sa croissance agressive et ses caractéristiques, sans différence observable dans les taux de survie entre les deux groupes.

Ces résultats suggèrent que, bien que DNMT3AR882H puisse être crucial aux stades initiaux de la maladie, il devient moins significatif une fois la leucémie établie.

Le rôle des cellules souches leucémiques

Les cellules souches leucémiques sont des cellules spéciales au sein de la leucémie qui ont le potentiel de s'auto-renouveler et de nourrir la croissance du cancer. Alors que les expériences précédentes n'ont montré aucune différence dans la capacité des cellules de leucémie à croître après la correction de la mutation DNMT3AR882H, les chercheurs ont voulu vérifier si cette mutation influençait la fréquence de ces cellules souches agressives.

Pour cela, ils ont réalisé des expériences de transplantation secondaire. Ils ont pris des cellules de leucémie de souris précédemment traitées et les ont réintroduites dans de nouvelles souris receveuses. En analysant les résultats, ils ont trouvé que corriger la mutation DNMT3AR882H réduisait considérablement le nombre de cellules souches leucémiques dans les échantillons corrigés.

Cela indique que, bien que DNMT3AR882H ne soit pas nécessaire pour maintenir la leucémie globale, il influence la quantité de cellules souches agressives dans l'environnement cancéreux. Les données suggèrent que des approches ciblées pour traiter cette mutation peuvent être plus efficaces durant les phases précoces de développement de la leucémie que lorsque la maladie a déjà progressé.

Investigation des changements de Méthylation et d'activité génique

En outre, les chercheurs ont examiné comment corriger la mutation DNMT3AR882H a affecté les modèles globaux de méthylation de l'ADN et l'expression génique au sein des cellules leucémiques. Ils ont réalisé des analyses approfondies pour évaluer les différences dans les niveaux de méthylation de l'ADN et comment ils étaient corrélés à l'activité génique.

Les données ont révélé que la présence de la mutation DNMT3AR882H entraînait des variations dans les modèles de méthylation, ce qui fait référence à la manière dont certaines régions de l'ADN sont modifiées et peuvent influencer l'expression des gènes. Cependant, corriger la mutation n'a pas significativement restauré ces modèles de méthylation à un état sain ; plutôt, les modèles restaient très individuels et cohérents avec les caractéristiques uniques de la leucémie de chaque patient.

Les chercheurs ont trouvé que les changements dans l'expression génique étaient aussi spécifiques aux patients. Globalement, corriger la mutation a eu un impact minimal sur la restauration des modifications dans le paysage de l'ADN. Néanmoins, certaines analyses ont montré qu'il y avait une réduction des ensembles de gènes associés aux caractéristiques des cellules souches lors de la correction de la mutation DNMT3AR882H.

Ces données suggèrent une relation complexe entre les mutations, les altérations de l'ADN et l'activité génique dans la leucémie, soulignant que bien que corriger une mutation spécifique puisse avoir certains effets, cela ne réinitialise peut-être pas complètement l'identité épigénétique du cancer.

Conclusion

Cette recherche suggère que certaines mutations, en particulier DNMT3AR882H, jouent un rôle essentiel tôt dans le développement de la leucémie mais peuvent ne pas être nécessaires une fois que le cancer s'est établi. Les résultats soulignent la nécessité de thérapies ciblées qui se concentrent sur ces mutations pendant la phase pré-leucémique, plutôt que de compter uniquement sur des traitements une fois la leucémie bien implantée.

Les résultats illustrent également l'importance d'utiliser des échantillons humains primaires pour la recherche, car ils fournissent des informations que les organismes modèles ne peuvent pas reproduire complètement. En comprenant les contributions spécifiques de diverses mutations dans le cancer, les chercheurs peuvent développer des stratégies de traitement plus efficaces.

À l'avenir, l'objectif sera de découvrir des moyens de cibler des mutations comme DNMT3AR882H à leurs premiers stades et d'explorer l'interaction complexe entre les changements génétiques et l'évolution du cancer. Cette compréhension approfondie pourrait mener à des avancées dans les thérapies personnalisées qui tiennent compte de la composition génétique unique du cancer de chaque patient.

Source originale

Titre: DNMT3AR882H Is Not Required for Disease Maintenance in Primary Human AML, but Is Associated With Increased Leukemia Stem Cell Frequency

Résumé: Genetic mutations are being thoroughly mapped in human cancers, yet a fundamental question in cancer biology is whether such mutations are functionally required for cancer initiation, maintenance of established cancer, or both. Here, we study this question in the context of human acute myeloid leukemia (AML), where DNMT3AR882 missense mutations often arise early, in pre-leukemic clonal hematopoiesis, and corrupt the DNA methylation landscape to initiate leukemia. We developed CRISPR-based methods to directly correct DNMT3AR882 mutations in leukemic cells obtained from patients. Surprisingly, DNMT3AR882 mutations were largely dispensable for disease maintenance. Replacing DNMT3AR882 mutants with wild-type DNMT3A did not impair the ability of AML cells to engraft in vivo, and minimally altered DNA methylation. Taken together, DNMT3AR882 mutations are initially necessary for AML initiation, but are largely dispensable for disease maintenance. The notion that initiating oncogenes differ from those that maintain cancer has important implications for cancer evolution and therapy. STATEMENT OF SIGNIFICANCEUnderstanding which driver mutations are required for cancer initiation, maintenance, or both phases remains poorly understood. Here, we uncover that highly prevalent pre-leukemic DNMT3A mutations are only required during disease initiation, but become dispensable after leukemic transformation, uncovering the context-specific role of this driver mutation with important therapeutic implications.

Auteurs: Ravindra Majeti, T. Koehnke, D. Karigane, E. Hilgart, A. C. Fan, K. Kayamori, M. Miyauchi, C. T. Collins, F. P. Suchy, A. Rangavajhula, Y. Feng, Y. Nakauchi, E. Martinez-Montes, J. Fowler, K. M. Loh, H. Nakauchi, M. A. Koldobskiy, A. P. Feinberg

Dernière mise à jour: 2024-10-29 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.26.620318

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.26.620318.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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