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# Biologie# Biologie du cancer

Comprendre l'impact de l'hypoxie dans le cancer du pancréas

Nouvelles découvertes sur comment le faible oxygène influence le comportement des protéines dans les cellules du cancer du pancréas.

Irene Lui, Katie Schaefer, Lisa L. Kirkemo, Jie Zhou, Rushika M. Perera, Kevin K. Leung, James A. Wells

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Le carcinome canalaire pancréatique (PDAC) représente plus de 90% des cancers du pancréas. Malheureusement, plus de la moitié des personnes diagnostiquées avec un PDAC sont déjà à un stade avancé de la maladie. Ça, c'est surtout à cause d'un manque de signes d'alerte clairs qui pourraient mener à un diagnostic précoce. Malgré les progrès dans les traitements du cancer, la chance de survivre cinq ans après un diagnostic de PDAC n'est que d'environ 12,5 %. C'est vraiment un casse-tête, du coup les scientifiques sont hyper motivés à en apprendre plus sur les cellules impliquées dans le PDAC et leur environnement pour améliorer les traitements.

L'environnement tumoral et son rôle

La zone qui entoure une tumeur, appelée Microenvironnement tumoral (TME), influence pas mal la façon dont le cancer se développe et se propage. Ça joue un rôle dans tout, de la vitesse de multiplication des cellules cancéreuses à leur capacité à échapper au système immunitaire. Un truc commun dans cet environnement, c'est l'Hypoxie, c'est-à-dire des niveaux d'oxygène bas. L'hypoxie se produit à cause de changements dans la formation des vaisseaux sanguins et peut influencer comment les cellules grandissent, leur métabolisme et leur résistance aux traitements.

Quand il n'y a pas assez d'oxygène, ça crée une situation compliquée pour les cellules immunitaires, rendant difficile pour le corps de lutter contre le cancer. Fait intéressant, le cancer du pancréas est l'un des cancers les plus hypoxiques, parfois jusqu'à 25 fois plus hypoxique que le tissu sain.

Le rôle de la Protéolyse

Un autre aspect important du TME, c'est le processus de protéolyse. C'est quand les protéines se décomposent en morceaux plus petits. La protéolyse est super importante pour plein de processus cellulaires, comme la signalisation cellulaire, le remodelage des tissus et la mort cellulaire. Par contre, quand la protéolyse n'est pas régulée correctement, ça peut mener à la progression de la maladie. Les chercheurs veulent comprendre comment les Protéases (les enzymes qui réalisent la protéolyse) influencent la surface des cellules et leur environnement. Pour ça, plusieurs techniques avancées ont été mises au point pour voir où ces coupures se produisent et quelles protéines sont touchées.

Résultats des recherches précédentes

Des études passées ont examiné comment les faibles niveaux d'oxygène changent le comportement cellulaire dans le PDAC. Par exemple, l'hypoxie peut augmenter la migration cellulaire et aider les cellules à passer d'un état épithélial (plus attaché entre elles) à un état mésenchymateux (plus mobile). La recherche a aussi regardé comment des protéines spécifiques s'expriment dans les tumeurs pancréatiques. Cependant, c'est encore flou de savoir comment les faibles niveaux d'oxygène changent la façon dont les protéines sont traitées et sécrétées dans le PDAC.

Investiguer l'impact de l'hypoxie sur la protéolyse

Pour découvrir comment les faibles niveaux d'oxygène affectent le traitement des protéines sur les surfaces des cellules PDAC, les chercheurs ont utilisé une technique spéciale appelée stabiligase liée aux glycanes (GT-stabiligase). Ils ont étudié quatre types différents de cellules PDAC et comment elles réagissaient à l'hypoxie. Ils ont identifié plus de 900 morceaux uniques de protéines provenant d'environ 384 protéines membranaires différentes. Ils ont déterminé que l'hypoxie provoquait des changements significatifs dans les protéines présentes à la surface des cellules PDAC, en particulier celles qui influencent la façon dont les cellules s'attachent et se déplacent.

Identifier les changements dans les protéines de surface cellulaire

Les chercheurs ont utilisé une méthode pour marquer des parties spécifiques des protéines (les N-termini) sur les cellules PDAC, à la fois sous de faibles niveaux d'oxygène (hypoxiques) et en conditions normales. Ils ont cultivé les cellules dans des conditions contrôlées pour voir comment l'hypoxie influençait les protéines. Après avoir appliqué la technique GT-stabiligase, ils ont trouvé une large variété de protéines touchées par l'hypoxie. La plupart de ces protéines étaient des types qui traversent la membrane cellulaire, avec la majorité des changements se produisant dans des sections des protéines qui ne sont pas rigides.

Conclusions sur les changements induits par l'hypoxie

Pour les différents types de cellules PDAC, les réponses à l'hypoxie n'étaient pas les mêmes. Chaque type de cellule avait ses propres schémas de changements dans le traitement des protéines. L'analyse génétique a montré que beaucoup des protéines affectées étaient liées à la signalisation cellulaire, au mouvement et à l'adhésion. Ces découvertes s'alignent avec ce que les scientifiques savent déjà sur l'hypoxie qui favorise les changements dans la façon dont les cellules se déplacent et s'attachent les unes aux autres.

Le Secretome : Proteines libérées dans l'environnement

En plus d'étudier les protéines à la surface des cellules, les chercheurs ont aussi regardé ce qui était relâché dans l'environnement (le secretome) par les cellules PDAC. Ils ont utilisé une méthode qui leur a permis de suivre les protéines sécrétées dans le milieu de culture. Ils ont trouvé plus de 500 protéines potentielles libérées, et tout comme pour les protéines de surface, beaucoup étaient aussi des types qui traversent les membranes. Le secretome était plus riche en protéines libérées que les protéines encore attachées à la surface cellulaire.

Groupes de protéines basés sur leur réponse à l'hypoxie

En examinant les protéines libérées, les chercheurs ont identifié trois principaux groupes. Le premier groupe était constitué de protéines qui étaient moins fréquentes sous des conditions d'oxygène bas. Beaucoup de celles-ci étaient liées à l'inflammation et à la réponse immune. Le deuxième groupe montrait de légères augmentations et était lié au métabolisme cellulaire. Le dernier groupe comprenait des protéines impliquées dans le développement des tissus et le traitement des antigènes, ce qui pourrait aider le cancer à échapper au système immunitaire.

Le rôle des protéases dans l'environnement cancéreux

Parmi les protéines identifiées, l'équipe de recherche a trouvé un nombre significatif de protéases actives sous des conditions hypoxiques. Cela incluait des protéases de type sérine, métalloprotéases et cystéine, connues pour leur rôle dans la dégradation des tissus environnants et l'aide à l'invasion des cellules cancéreuses dans des zones saines. L'étude a souligné que l'hypoxie rend certaines protéases actives tout en changeant leur abondance.

Manque de schémas clairs dans les sites de clivage

Quand les chercheurs ont examiné les sites spécifiques où les protéines étaient clivées (coupées), ils n'ont pas trouvé de schéma clair, ce qui n'est pas surprenant vu la diversité des protéases impliquées. Par contre, ils ont remarqué que certains acides aminés étaient plus fréquents à des positions spécifiques, reflétant les types de protéases présentes.

La relation entre les protéines de surface et les protéines sécrétées

En comparant les résultats pour les protéines de surface et les protéines sécrétées, l'équipe a trouvé quelques chevauchements. Ils ont identifié plusieurs protéases qui étaient communes aux deux environnements. Cependant, ils ont aussi remarqué qu'il n'y avait pas de relation directe entre les niveaux de protéines de surface et celles qui étaient sécrétées, probablement à cause du turnover rapide de ces protéines.

Conclusion : La complexité de l'hypoxie dans le PDAC

En résumé, l'étude a souligné à quel point l'hypoxie est importante pour le comportement des cellules PDAC. Ça change la façon dont les protéines sont traitées et libérées, reflétant un ensemble complexe d'interactions entre différentes protéases et leurs cibles. Même s'il faut encore plus de recherche pour valider ces résultats, ce travail pourrait mener à de nouvelles thérapies ciblées et potentiels biomarqueurs pour le cancer du pancréas.

Directions futures pour la recherche

Alors que les chercheurs continuent d'explorer les effets de l'hypoxie sur le PDAC, ils visent à transformer ces informations en traitements concrets. En ciblant les caractéristiques uniques des protéines produites dans des conditions hypoxiques, les scientifiques espèrent améliorer les résultats pour les patients souffrant de cette maladie difficile. Donc, si tu te sens un peu déprimé par la recherche sur le cancer du pancréas, rappelle-toi : les scientifiques sont en mission pour faire la différence, une protéine à la fois !

Source originale

Titre: Hypoxia induces extensive protein and proteolytic remodeling of the cell surface in pancreatic adenocarcinoma (PDAC) cell lines

Résumé: The tumor microenvironment (TME) plays a crucial role in cancer progression. Hypoxia is a hallmark of the TME and induces a cascade of molecular events that affects cellular processes involved in metabolism, metastasis, and proteolysis. In pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC), tumor tissues are extremely hypoxic. Here, we leveraged mass spectrometry technologies to examine hypoxia-induced alterations in the abundance and proteolytic modifications to cell surface and secreted proteins. Across four PDAC cell lines, we discovered extensive proteolytic remodeling of cell surface proteins involved in cellular adhesion and motility. Looking outward at the surrounding secreted space, we identified hypoxia-regulated secreted and proteolytically-shed proteins that are responsible for regulating the humoral immune and inflammatory response and an upregulation of proteins involved in metabolic processing and tissue development. Combining cell surface N-terminomics and secretomics to evaluate the cellular response to hypoxia enabled us to identify significantly altered candidate proteins which may serve as potential biomarkers and therapeutic targets in PDAC. Furthermore, this approach provides a blue print for studying dysregulated extracellular proteolysis in other cancers and inflammatory diseases.

Auteurs: Irene Lui, Katie Schaefer, Lisa L. Kirkemo, Jie Zhou, Rushika M. Perera, Kevin K. Leung, James A. Wells

Dernière mise à jour: 2024-11-02 00:00:00

Langue: English

Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.30.621099

Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.30.621099.full.pdf

Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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