Le monde collant de l'adhésion microbienne
Explore comment les microbes collent et les anticorps qui les combattent.
Kelli L. Hvorecny, Gianluca Interlandi, Tim S. Veth, Pavel Aprikian, Anna Manchenko, Veronika L. Tchesnokova, Miles S. Dickinson, Joel D. Quispe, Nicholas M. Riley, Rachel E. Klevit, Pearl Magala, Evgeni V. Sokurenko, Justin M. Kollman
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Table des matières
- FimH : La Superstar des Adhésines Fimbriales
- La Mécanique de la Liaison du Ligand
- FimH et ses Anticorps : Une Bataille d'Esprits
- Types d'Anticorps et leurs Rôles
- Le Pouvoir de l'Analyse Structurale
- Un Regard de Plus Près sur mAb475 : L'Inhibiteur Orthostérique
- mAb926 : Le Puzzle Parastérique
- mAb21 : L'Agent Actif
- mAb824 : Le Piège Conformationnel
- Structure des Anticorps et Dynamiques d'Interaction
- Implications pour les Traitements Futurs
- Conclusion
- Source originale
Les microbes, comme les bactéries et les virus, sont un peu comme des auto-stoppeurs minuscules qui trouvent moyen de se coller à différentes surfaces. Cette action d'accroche est souvent le premier pas vers les Infections et la formation de Biofilms, qui sont des communautés de micro-organismes pouvant se créer sur des tissus vivants et des surfaces non vivantes. Imagine ces microbes comme des invités non désirés qui ne peuvent pas résister à l'envie de se joindre à la fête où qu'ils aillent. En s'accrochant aux surfaces, ils peuvent aussi développer des relations mutuelles, surtout dans l'intestin, où ils aident à la digestion.
Un des aspects fascinants de la façon dont les microbes se fixent aux surfaces est leur utilisation de protéines spéciales appelées Adhésines. Ces protéines les aident à reconnaître et à se lier à des structures spécifiques trouvées sur les surfaces, qui incluent souvent des sucres connus sous le nom d'oligosaccharides. Les adhésines fimbriales, en particulier, sont comme les doigts collants des bactéries, leur permettant de s'accrocher à leurs hôtes.
FimH : La Superstar des Adhésines Fimbriales
Parmi les différents types d'adhésines, FimH de Escherichia coli se démarque comme la plus célèbre. Pense à FimH comme le chanteur principal d'un groupe de rock de protéines. C'est le membre le mieux compris d'une grande famille d'adhésines fimbriales structurellement diverses, surtout chez les bactéries qui ont une méthode d'assemblage spécifique appelée la voie chaperon-usher.
FimH joue un rôle essentiel dans des maladies comme les infections urinaires et les maladies inflammatoires de l'intestin, ce qui en fait une cible principale pour les chercheurs cherchant à lutter contre les infections. Situé à la pointe des fimbriae de type 1 (ou pilus), FimH se compose de deux parties principales : un domaine lectine qui se lie à des sucres spécifiques (comme une clé qui s'insère dans une serrure) et un domaine pilin qui se connecte à d'autres parties de la fimbriae.
La Mécanique de la Liaison du Ligand
Quand FimH rencontre le bon sucre, quelque chose d'intéressant se passe. La protéine change de forme de manière spectaculaire, un peu comme un élastique qui se met en position lorsqu'il est étiré. Quand il n'y a pas de sucre, FimH reste dans un état replié et inactif, avec sa zone de liaison ouverte et détendue. Cependant, une fois qu'un sucre se lie, FimH passe à une forme plus active, prêt à s'accrocher fermement.
Ce changement peut être influencé par une force mécanique. Imagine tirer sur une corde : ça peut créer une tension qui fait bouger les parties séparément ou les rapprocher. Dans le cas de FimH, cette force l'aide à passer d'une boule repliée à une forme allongée et active qui se lie mieux.
Anticorps : Une Bataille d'Esprits
FimH et sesLes chercheurs ont découvert que, comme les adhésines comme FimH sont si cruciales pour les infections, elles font d'excellentes cibles pour de nouveaux traitements. En bloquant la capacité de FimH à adhérer, on pourrait éviter que les infections se produisent dès le départ.
Les scientifiques ont élaboré des stratégies intelligentes pour inhiber FimH. Par exemple, ils ont développé des composés qui imitent les sucres auxquels FimH se lie, trompant efficacement la protéine et l'empêchant de créer des connexions. Comme un magicien malin sortant un lapin d'un chapeau, ces stratégies visent à duper FimH pour qu'il perde son emprise.
Types d'Anticorps et leurs Rôles
Dans leur quête de connaissances, les chercheurs ont identifié différents anticorps qui ciblent spécifiquement FimH. Ils ont classé ces anticorps en groupes selon leur mode d'action :
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Anticorps Orthostériques : Ce sont des concurrents directs qui bloquent le site de liaison au sucre en s'y insérant, un peu comme un bouchon dans une bouteille. Un exemple est mAb475, qui imite les sucres et met efficacement un panneau "entrée interdite" sur le site de liaison.
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Anticorps Parastériques : Ces anticorps se glissent à côté du site de liaison plutôt que de le bloquer directement. Par exemple, mAb926 se fixe à la poche ouverte de FimH, l'empêchant de se refermer pour attraper des sucres. Pense à un feu de signalisation qui reste vert, empêchant FimH d'avancer.
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Anticorps Dynastériques : Ces anticorps agissent comme des ralentisseurs pour FimH, empêchant son passage entre les formes active et inactive. Ils peuvent maintenir FimH dans sa conformation actuelle, qu'elle soit active ou inactive.
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Anticorps Activants : Contrairement aux types précédents, ces anticorps, comme mAb21, encouragent FimH à rester sous forme active, lui permettant de maintenir ses capacités de liaison.
Le Pouvoir de l'Analyse Structurale
Les chercheurs ont utilisé des techniques avancées comme la cryo-microscopie électronique (cryoEM) pour visualiser comment ces anticorps interagissent avec FimH. En créant des images haute résolution, ils ont pu voir exactement où chaque anticorps se lie et comment cela affecte la forme de FimH. Ces études ont offert des aperçus cruciaux sur les différentes stratégies que les anticorps utilisent pour perturber la fonction de FimH.
Un Regard de Plus Près sur mAb475 : L'Inhibiteur Orthostérique
Un anticorps particulièrement intéressant, mAb475, a attiré l'attention des chercheurs. Il s'avère que cet anticorps a un glycan (un type de sucre) sur sa boucle hypervariable, ce qui lui permet d'imiter les sucres naturels auxquels FimH se lie habituellement. Cette caractéristique unique permet à mAb475 de bloquer FimH efficacement, l'empêchant de se fixer à l'hôte.
Quand les scientifiques ont exploré le fonctionnement de mAb475, ils ont découvert que retirer le glycan entravait sa capacité à se lier, affirmant que le sucre était crucial pour son action inhibitrice.
mAb926 : Le Puzzle Parastérique
Un autre anticorps, mAb926, adopte une approche différente. Au lieu de rivaliser directement pour la poche de sucre, il se fixe à la version ouverte de FimH. Cette liaison n'empêche pas FimH de s'engager avec les sucres, mais modifie la façon dont il peut le faire. Grâce à une cartographie structurale astucieuse et à une modélisation énergétique, les chercheurs ont révélé comment mAb926 empêche FimH de fonctionner de manière optimale, un peu comme mettre un panneau "Sol Glissant" dans un couloir glissant.
mAb21 : L'Agent Actif
De l'autre côté du spectre, mAb21 fonctionne différemment. Cet anticorps ne peut se lier à FimH que lorsqu'il est dans sa conformation active. En s'insérant confortablement, il empêche la protéine de revenir à un état inactif. C'est comme un coach de gym qui motive quelqu'un à rester sur le tapis roulant.
mAb824 : Le Piège Conformationnel
mAb824 est un autre joueur fascinant. Cet anticorps ne se contente pas de rivaliser ou de modifier les capacités de liaison de FimH ; il piège FimH dans l'état qu'il rencontre en premier. Il permet à FimH de soit s'accrocher fermement aux sucres, soit de rester inactif, rendant FimH un adhésif moins efficace.
Structure des Anticorps et Dynamiques d'Interaction
Les analyses de la manière dont ces anticorps se lient à FimH ont fourni des aperçus importants sur la mécanique de leurs interactions. Les chercheurs ont pu voir comment les anticorps changent la forme et la structure de FimH lors de la liaison. Cette compréhension révèle des stratégies futures potentielles pour des thérapies ciblées contre les infections causées par des bactéries exprimant FimH.
Implications pour les Traitements Futurs
La diversité dans la manière dont différents anticorps interagissent avec FimH ouvre des possibilités excitantes pour développer de nouveaux traitements antimicrobiens. En ciblant FimH avec diverses stratégies, les scientifiques pourraient être capables de réduire la capacité de certains pathogènes à causer des infections.
Étant donné que de nombreux pathogènes s'appuient sur des mécanismes similaires pour adhérer à leurs hôtes, concevoir des traitements basés sur ces découvertes pourrait avoir un large impact sur la gestion des infections.
Conclusion
L'interaction entre les adhésines microbiennes comme FimH et les anticorps qui les ciblent met en lumière un domaine fascinant de la dynamique moléculaire. En étudiant ces interactions, les scientifiques peuvent développer des stratégies innovantes pour lutter contre les infections et améliorer les résultats en matière de santé. Comme dans un jeu d'échecs, chaque coup – que ce soit la liaison d'un anticorps ou l'attachement d'un sucre – peut faire toute la différence.
Que l'on parle de microbes collants ou d'anticorps malins, la science derrière l'infection et l'immunité reste un domaine passionnant prêt pour la découverte et l'innovation. Avec un peu d'humour et beaucoup de curiosité, on pourrait bien berner les plus petits adversaires dans la bataille pour notre santé.
Source originale
Titre: Antibodies disrupt bacterial adhesion by ligand mimicry and allosteric interference
Résumé: A critical step in infections is the attachment of many microorganisms to host cells using lectins that bind surface glycans, making lectins promising antimicrobial targets. Upon binding mannosylated glycans, FimH, the most studied lectin adhesin of type 1 fimbriae in E. coli, undergoes an allosteric transition from an inactive to an active conformation that can act as a catch-bond. Monoclonal antibodies that alter FimH glycan binding in various ways are available, but the mechanisms of these antibodies remain unclear. Here, we use cryoEM, mass spectrometry, binding assays, and molecular dynamics simulations to determine the structure-function relationships underlying antibody-FimH binding. Our study reveals four distinct antibody mechanisms of action: ligand mimicry by an N-linked, high-mannose glycan; stabilization of the ligand pocket in the inactive state; conformational trapping of the active and inactive states; and locking of the ligand pocket through long-range allosteric effects. These structures reveal multiple mechanisms of antibody responses to an allosteric protein and provide blueprints for new antimicrobial that target adhesins.
Auteurs: Kelli L. Hvorecny, Gianluca Interlandi, Tim S. Veth, Pavel Aprikian, Anna Manchenko, Veronika L. Tchesnokova, Miles S. Dickinson, Joel D. Quispe, Nicholas M. Riley, Rachel E. Klevit, Pearl Magala, Evgeni V. Sokurenko, Justin M. Kollman
Dernière mise à jour: 2024-12-14 00:00:00
Langue: English
Source URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.06.627246
Source PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.06.627246.full.pdf
Licence: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Changements: Ce résumé a été créé avec l'aide de l'IA et peut contenir des inexactitudes. Pour obtenir des informations précises, veuillez vous référer aux documents sources originaux dont les liens figurent ici.
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