Apuntando a la salud intestinal con lisinas diseñadas
Los investigadores están modificando las bacterias intestinales usando lisinas ingenierizadas para mejorar la salud.
― 6 minilectura
Tabla de contenidos
- La Importancia del Microbioma Intestinal
- Modificando el Microbioma Intestinal
- Avances en la Ingeniería del Microbioma
- El Rol de los Lysin en la Ingeniería del Microbioma
- Diseño de Lysins Quiméricos
- Evaluación de la Actividad
- Resultados de la Evaluación de Lysins
- Análisis Cuantitativo de la Actividad de Lysins
- Impacto en la Comunidad Microbiana
- Efectos en Comunidades Microbianas Específicas
- Medición de la Producción de Metabolitos
- Desafíos y Direcciones Futuras
- Conclusión
- Fuente original
El microbioma intestinal humano es una comunidad de trillones de microorganismos chiquitos que viven en nuestro sistema digestivo. Estos microorganismos son esenciales para nuestra salud y pueden influir en varias enfermedades. Nos ayudan a descomponer la comida, producen nutrientes esenciales como vitaminas y apoyan nuestro sistema inmunológico. Cambios en el microbioma intestinal pueden llevar a problemas de salud, incluyendo obesidad, inflamación y otros problemas metabólicos.
La Importancia del Microbioma Intestinal
El microbioma intestinal juega un rol importante en nuestra salud en general. Ayuda a digerir la comida, especialmente carbohidratos complejos. Además, produce ácidos grasos de cadena corta que son vitales para la salud intestinal y ayudan a prevenir la inflamación. Un microbioma balanceado protege contra Bacterias dañinas, apoya nuestro sistema inmunológico y se asocia con mejor salud mental.
Modificando el Microbioma Intestinal
Los científicos están interesados en maneras de cambiar o modificar el microbioma intestinal para mejorar la salud. Los métodos tradicionales incluyen tomar probióticos, que son bacterias beneficiosas, y prebióticos, que son alimentos para estas bacterias. Otro enfoque es el trasplante de microbiota fecal, que implica transferir bacterias intestinales de una persona a otra. Sin embargo, estos métodos pueden tener limitaciones, como no ser lo suficientemente específicos o no funcionar bien a largo plazo.
Avances en la Ingeniería del Microbioma
Recientemente, los científicos han estado buscando maneras más avanzadas de alterar el microbioma intestinal. Un método prometedor implica usar péptidos antimicrobianos (AMPs) para dirigirse a bacterias específicas. Estos péptidos pueden ayudar a reducir el crecimiento de bacterias no deseadas mientras preservan a las beneficiosas. Sin embargo, hay desafíos ya que los AMPs a veces pueden afectar a toda la comunidad microbiana, llevando a cambios no deseados.
El Rol de los Lysin en la Ingeniería del Microbioma
Los lysins son enzimas especiales producidas por ciertos virus y bacterias que pueden descomponer específicamente células bacterianas. Actúan dirigiéndose a la capa externa protectora de las bacterias, llevando a su muerte. Algunos lysins pueden ser diseñados para atacar bacterias específicas. Esta característica los convierte en herramientas potenciales para modificar el microbioma intestinal de manera efectiva.
Quiméricos
Diseño de LysinsPara crear lysins más efectivos, los científicos diseñaron lysins quiméricos, que se hacen combinando diferentes partes de lysins de varias fuentes. Al mezclar estos componentes, los investigadores pueden crear lysins que atacan bacterias específicas más efectivamente. Comenzaron con Enterolysin A (EnlA), que es conocido por su capacidad de afectar a una variedad de bacterias intestinales.
Evaluación de la Actividad
Los investigadores evaluaron estos lysins quiméricos para ver cuáles podían inhibir el crecimiento de bacterias intestinales específicas. Se enfocaron en varias bacterias comunes y encontraron que diferentes lysins quiméricos tuvieron efectos variados. Algunos lysins funcionaron mejor contra ciertas bacterias mientras que otros fueron menos efectivos. Esta variabilidad sugiere que la combinación de las partes usadas para crear los lysins juega un papel importante en su efectividad.
Resultados de la Evaluación de Lysins
Después de las pruebas, los investigadores notaron que los lysins quiméricos mostraron diversas habilidades para detener el crecimiento de diferentes bacterias intestinales. Por ejemplo, un lysin quimérico fue más efectivo contra ciertas bacterias, mientras que otros tuvieron efectos limitados. Este resultado destacó cómo combinaciones específicas de dominios enzimáticos y regiones de unión podrían llevar a un mejor direccionamiento de especies bacterianas particulares.
Análisis Cuantitativo de la Actividad de Lysins
Para entender mejor cómo funcionaban estos lysins, los investigadores realizaron pruebas adicionales para medir cuánto lysin se necesitaba para inhibir cada especie bacteriana. Se enfocaron en dos lysins, EnlA y otro quimérico (Ch2-2). Las pruebas revelaron que EnlA era particularmente efectivo contra ciertas bacterias en concentraciones específicas, mientras que Ch2-2 tenía diferentes patrones de efectividad.
Impacto en la Comunidad Microbiana
Los investigadores querían ver cómo estos lysins diseñados podrían cambiar la estructura y función de grupos de bacterias, conocidas como comunidades microbianas. Establecieron entornos controlados con bacterias específicas para estudiar sus interacciones. Cuando se aplicaron lysins, observaron cambios en la composición de estas comunidades.
Efectos en Comunidades Microbianas Específicas
En dos configuraciones diferentes de comunidades, los investigadores aplicaron varias concentraciones de lysins. Encontraron que aumentar los niveles de lysins generalmente reducía el número total de bacterias, pero impactaba a diferentes especies de varias maneras. Por ejemplo, una comunidad vio una disminución de un tipo de bacteria, permitiendo que otro tipo prosperara. Esta capacidad de los lysins para cambiar el balance dentro de las comunidades bacterianas puede tener implicaciones significativas para la salud intestinal.
Metabolitos
Medición de la Producción deAdemás de observar cambios en la composición bacteriana, los investigadores también midieron la producción de sustancias importantes creadas por las bacterias, llamadas productos finales de fermentación. Estos compuestos pueden influir en la salud de forma positiva o negativa. Los experimentos mostraron que los lysins podían reducir ácidos dañinos mientras aumentaban compuestos beneficiosos.
Desafíos y Direcciones Futuras
Aunque el potencial de los lysins para modificar el microbioma intestinal es emocionante, los investigadores enfrentan desafíos para entregar estas enzimas de manera efectiva al intestino humano. El sistema digestivo puede descomponer proteínas, lo que significa que los lysins podrían no sobrevivir el tiempo suficiente para tener un impacto si se toman por vía oral. Una idea es usar bacterias probióticas diseñadas para producir y liberar estos lysins directamente en el intestino.
Conclusión
El microbioma intestinal es una comunidad compleja crucial para la salud humana, y hay un creciente interés en cómo podemos manipularlo para mejores resultados en salud. Los lysins muestran promesa como herramientas para lograr cambios específicos dentro del microbioma intestinal. Pueden ser diseñados para atacar específicamente a bacterias dañinas sin afectar a las beneficiosas.
El trabajo en lysins quiméricos proporciona una base para desarrollar nuevos enfoques para controlar el microbioma intestinal, lo que podría llevar a nuevas terapias para varias enfermedades relacionadas con la salud intestinal. A medida que la investigación continúa avanzando en esta área, podemos encontrar maneras aún más efectivas de mejorar la salud a través de una mejor gestión de nuestra comunidad microbiana intestinal.
Título: Engineered lysins to modulate human gut microbiome communities
Resumen: The ability to precisely control the human gut microbiomes composition, metabolic networks, and host interactions would revolutionize medicine and how we treat human disease. Microbiome remodeling approaches such as probiotics, prebiotics, antibiotics, and fecal microbiota transplantation are global perturbations with consequences that are difficult to predict. Lysins are enzymes produced by bacteriophages and bacteria that have exceptional specificity to lyse bacterial cells and could be applied for targeted microbiome remodeling. In this work we demonstrate the ability of lysins to target diverse human gut commensal bacteria, how domain recombination can give rise to chimeric lysins with altered species preferences, and how engineered lysins can directly remodel the structure and function of synthetic human gut microbiomes. Lysins represent a general platform that can be rapidly tailored through protein engineering to control complex microbial ecosystems.
Autores: Philip A Romero, J. R. D. Rodriguez, W. Lu, J. Papadopoulos, O. S. Venturelli
Última actualización: 2024-05-14 00:00:00
Idioma: English
Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.14.594189
Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.14.594189.full.pdf
Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
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