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Aprovechando los Modelos de Lenguaje para la Detección del Alzheimer

Usando modelos de lenguaje para mejorar la identificación de signos de Alzheimer en registros clínicos.

― 7 minilectura


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Los Modelos de Lenguaje Grandes (LLMs) pueden crear textos que suenan naturales y se usan en muchas áreas, incluyendo la medicina. Una área que no se ha explorado del todo es el uso de estos modelos para ayudar a extraer información importante de los registros clínicos, especialmente en casos donde los datos son limitados, sensibles o están distribuidos de manera desigual. Este artículo investiga cómo los LLMs pueden ayudar a identificar signos y síntomas de la Enfermedad de Alzheimer (EA) a partir de registros de salud electrónicos (EHRs). Esta tarea es bastante difícil, ya que requiere un alto nivel de experiencia.

Resumen de la Enfermedad de Alzheimer

La enfermedad de Alzheimer es una condición grave que afecta a muchos adultos en todo el mundo. Provoca problemas con la memoria, el comportamiento y la realización de actividades cotidianas. Identificar signos y síntomas de la EA en los registros médicos es esencial para un diagnóstico temprano y la planificación de la atención. Sin embargo, esta tarea se complica por la limitada cantidad de datos médicos disponibles y la complejidad de los síntomas.

El Papel de los Modelos de Lenguaje Grandes en la Generación de Datos

Los LLMs han demostrado un fuerte rendimiento en varias tareas de lenguaje natural. Sin embargo, su uso en la minería de texto médico no se ha explorado en profundidad debido a los desafíos únicos en este campo. Este documento investiga cómo los LLMs pueden ayudar a crear Datos sintéticos para asistir en la identificación de signos y síntomas relacionados con la EA.

Creando una Taxonomía para los Síntomas de Alzheimer

Para guiar a los LLMs en la generación de datos útiles, desarrollamos un sistema de clasificación sencillo para los síntomas de la EA basado en el conocimiento de expertos. Este sistema incluye nueve tipos de síntomas que cubren las diferentes áreas afectadas por la EA: aspectos cognitivos, conductuales y funcionales.

Métodos Usados para la Generación de Datos

Aplicamos dos métodos para generar datos con LLMs:

  1. De Datos a Etiquetas: Etiquetamos oraciones de una colección pública de EHRs para identificar signos y síntomas relacionados con la EA.
  2. De Etiquetas a Datos: Generamos nuevas oraciones basadas en las definiciones de los signos y síntomas de la EA.

Estos métodos ayudan a hacer el proceso de recopilación de datos más eficiente y nos permiten usar datos sintéticos para apoyar la tarea de clasificación.

Conjuntos de Datos Usados en la Investigación

Para entrenar nuestro sistema, utilizamos tres conjuntos de datos:

  1. Conjunto de Datos Oro: Este conjunto consiste en anotaciones de expertos en EHRs de pacientes con EA, aprobadas para su uso por las autoridades relevantes.
  2. Conjunto de Datos Plata: Este conjunto incluye oraciones de la base de datos MIMIC-III, anotadas usando el método de datos a etiquetas.
  3. Conjunto de Datos Bronce: Este conjunto contiene oraciones generadas por el LLM utilizando el método de etiquetas a datos.

Descubrimos que usar los conjuntos de datos plata y bronce mejoró el rendimiento del sistema en comparación con el uso exclusivo del conjunto de datos oro.

Impacto de la Verificación de Datos en el Rendimiento

Para probar nuestros métodos, creamos sistemas que pueden identificar signos y síntomas relacionados con la EA a partir de EHRs. Al combinar diferentes conjuntos de datos para el entrenamiento, vimos mejoras significativas. Por ejemplo, cuando fusionamos los conjuntos de datos oro y bronce, la precisión con frecuencia superó los resultados obtenidos solo con los datos oro.

Superando Desafíos en Datos Clínicos

Los principales obstáculos en la minería de texto clínico provienen de la disponibilidad limitada y la sensibilidad de los datos médicos. Nuestro enfoque utilizó LLMs para abordar estos desafíos, permitiéndonos generar conjuntos de datos sintéticos que capturan el lenguaje clínico importante sin incluir información personal sensible.

Evaluación de los Resultados de los LLM

Aunque los LLMs pueden crear datos útiles, hay problemas comunes como inexactitudes fácticas, conocidas como alucinaciones. Estas discrepancias pueden afectar la calidad de la información extraída. Sin embargo, exploramos si estas inexactitudes podrían utilizarse de manera positiva para generar datos sintéticos que retengan las características esenciales de los textos clínicos.

Calidad de la Generación de Datos

Comparamos los resultados de los conjuntos de datos plata y bronce y descubrimos que la calidad de las anotaciones variaba. Los datos bronce mostraron mejor fiabilidad en comparación con los datos plata. La evaluación reveló que los LLMs produjeron resultados más consistentes en el conjunto de datos bronce, lo que resultó en un entrenamiento de modelo más efectivo.

Análisis de los Resultados

Al evaluar varios modelos a través de diferentes combinaciones de conjuntos de datos, observamos que los modelos se beneficiaron enormemente de la incorporación de los conjuntos de datos plata y bronce. Los resultados confirmaron que usar datos generados por LLM puede conducir a mejoras sustanciales en la identificación de condiciones relacionadas con la EA.

Conclusión

Este estudio destaca el potencial de usar modelos de lenguaje grandes para mejorar la generación de datos clínicos para identificar signos y síntomas de la enfermedad de Alzheimer. Al introducir un nuevo proceso de clasificación y generar conjuntos de datos sintéticos a través de LLMs, encontramos mejoras en los sistemas de detección. Nuestros hallazgos muestran la utilidad de incorporar el conocimiento de expertos en los resultados de los LLM y sugieren nuevas oportunidades para futuras aplicaciones de datos médicos.

Direcciones Futuras

Mirando hacia adelante, planeamos explorar métodos adicionales para mejorar la calidad de las anotaciones producidas por los LLMs. Esto incluye abordar preocupaciones éticas y asegurarnos de que nuestro enfoque siga siendo responsable y seguro. También buscamos aplicar nuestros métodos a otras áreas dentro del procesamiento de texto clínico para seguir mejorando la accesibilidad y calidad de los datos.

Resumen del Trabajo Relacionado

A medida que los LLMs han avanzado mucho, se han reconocido sus capacidades para generar textos útiles en diferentes campos. Sin embargo, los desafíos como el riesgo de alucinaciones siguen siendo una preocupación en las aplicaciones clínicas. Otras investigaciones han explorado la viabilidad de usar LLMs para extraer y analizar información de los registros clínicos.

Desafíos de la Minería de Texto Clínico

La minería de texto clínico tiene muchas aplicaciones, pero también enfrenta desafíos como la disponibilidad limitada de datos médicos diversos y la necesidad de privacidad de datos. Se han hecho esfuerzos para crear conjuntos de datos públicos y datos sintéticos para ayudar en el entrenamiento de modelos para analizar textos clínicos. A pesar de este progreso, continúan surgiendo problemas con la calidad y la consistencia de los datos.

Estrategias para la Mejora

Hay varias maneras de abordar los problemas asociados con los resultados de los LLMs. Las estrategias incluyen limpiar los datos de entrenamiento para reducir errores, incorporar conocimiento externo para mejorar la comprensión del modelo y utilizar retroalimentación humana para verificar los datos generados.

Proceso de Anotación de Datos

Las pautas de anotación que desarrollamos se basaron en las ideas de expertos y se refinaron a través de los resultados de los LLMs. Estas pautas jugaron un papel crucial para asegurar que los datos generados fueran precisos y relevantes.

Próximos Pasos

La investigación futura buscará refinar aún más los procesos involucrados en la generación y validación de resultados de LLM. Además, examinaremos las implicaciones de usar LLMs en contextos médicos y cómo abordar efectivamente las consideraciones éticas.

Resumen

En resumen, aprovechar los LLMs para la augmentación de datos clínicos representa una avenida prometedora para mejorar la detección de signos y síntomas de la enfermedad de Alzheimer. Con los resultados positivos observados de nuestras diversas combinaciones de conjuntos de datos, esperamos allanar el camino para nuevos enfoques en el análisis de datos médicos en el futuro.

Fuente original

Título: Two Directions for Clinical Data Generation with Large Language Models: Data-to-Label and Label-to-Data

Resumen: Large language models (LLMs) can generate natural language texts for various domains and tasks, but their potential for clinical text mining, a domain with scarce, sensitive, and imbalanced medical data, is underexplored. We investigate whether LLMs can augment clinical data for detecting Alzheimer's Disease (AD)-related signs and symptoms from electronic health records (EHRs), a challenging task that requires high expertise. We create a novel pragmatic taxonomy for AD sign and symptom progression based on expert knowledge, which guides LLMs to generate synthetic data following two different directions: "data-to-label", which labels sentences from a public EHR collection with AD-related signs and symptoms; and "label-to-data", which generates sentences with AD-related signs and symptoms based on the label definition. We train a system to detect AD-related signs and symptoms from EHRs, using three datasets: (1) a gold dataset annotated by human experts on longitudinal EHRs of AD patients; (2) a silver dataset created by the data-to-label method; and (3) a bronze dataset created by the label-to-data method. We find that using the silver and bronze datasets improves the system performance, outperforming the system using only the gold dataset. This shows that LLMs can generate synthetic clinical data for a complex task by incorporating expert knowledge, and our label-to-data method can produce datasets that are free of sensitive information, while maintaining acceptable quality.

Autores: Rumeng Li, Xun Wang, Hong Yu

Última actualización: 2023-12-09 00:00:00

Idioma: English

Fuente URL: https://arxiv.org/abs/2401.06774

Fuente PDF: https://arxiv.org/pdf/2401.06774

Licencia: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/

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