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# Biología# Genética

Rompiendo Nuevos Esquemas en la Edición de Genes del Corazón

CASAAV-HDR combina técnicas de CRISPR y virales para la investigación de enfermedades cardíacas.

Yanjiang Zheng, Joshua Mayourian, Justin S. King, Yifei Li, Vassilios J. Bezzerides, William T. Pu, Nathan J. VanDusen

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CRISPR-Cas9 es una herramienta que permite a los científicos hacer cambios precisos en el ADN. Piensa en ello como unas tijeras moleculares que pueden cortar el ADN en lugares específicos para arreglar o cambiar genes. Este sistema proviene del sistema inmunológico de las bacterias, que lo usan para defenderse de virus.

Lo Básico de la Edición Genética

La edición genética con CRISPR-Cas9 ha revolucionado el mundo científico. Se ha vuelto popular porque es relativamente fácil de programar y ofrece mejor eficiencia al apuntar a secciones específicas de ADN en comparación con métodos más antiguos. Estos métodos previos, como ZFNs y TALENs, eran más complicados y menos efectivos.

Al crear cortes específicos en el ADN, los científicos pueden influir en cómo se comportan los genes. La célula intentará reparar los cortes, y durante este proceso de reparación, pueden ocurrir cambios que llevan al resultado deseado. Esto es especialmente útil al tratar enfermedades genéticas.

¿Qué Sucede Después?

Cuando CRISPR-Cas9 corta el ADN, la célula tiene un par de formas de reparar el daño. Generalmente, utiliza un método llamado unión de extremos no homólogos (NHEJ), que es rápido pero puede llevar a inserciones y eliminaciones aleatorias en la secuencia de ADN. Aunque esto puede interrumpir genes, a veces conduce al resultado deseado.

Alternativamente, si los científicos proporcionan una plantilla de reparación llamada plantilla donante, la célula puede usar un método más preciso llamado reparación dirigida por homología (HDR). De esta manera, los investigadores pueden hacer cambios específicos en el ADN, como arreglar una mutación o agregar nuevo material genético.

El Nacimiento de CASAAV-HDR

Aquí entra CASAAV-HDR, un nuevo enfoque que combina CRISPR-Cas9 con un tipo de virus llamado virus adenoasociado (AAV). Esta plataforma facilita la entrega de componentes de CRISPR y plantillas donantes a las células, apuntando específicamente a las que son importantes para la salud del corazón, llamadas cardiomiocitos.

CASAAV-HDR permite a los científicos crear ediciones precisas en células del corazón, con hasta un 45% de éxito en hacer cambios en la etapa neonatal. ¡Imagínate poder activar un interruptor en las células del corazón para ver cómo reaccionan: eso es lo que hace CASAAV-HDR!

Modelando Enfermedades del Corazón

Digamos que los científicos quieren estudiar un problema cardíaco. Pueden usar CASAAV-HDR para crear mutaciones específicas en genes vinculados a enfermedades como la Cardiomiopatía Dilatada. Al insertar una pieza de proteína brillante (llamada mScarlet) en un gen, los investigadores pueden observar cómo se comportan las proteínas mutadas dentro de las células del corazón.

Por ejemplo, podrían crear mutaciones en el gen TTN, que produce una proteína llamada titina. Esta proteína desempeña un papel vital en la contracción del corazón. Los investigadores encontraron que estas mutaciones producen proteínas truncadas que no funcionan correctamente porque son como un motor a medio terminar. Al observar cómo se colocan estas proteínas en las células (gracias al etiquetado mScarlet), los científicos obtienen información sobre cómo las mutaciones causan enfermedades.

La Importancia del Fosfolambán

Otro área importante de estudio implica una proteína llamada fosfolambán (PLN). El PLN regula los niveles de calcio en las células del corazón, lo cual es crucial para las contracciones cardíacas. Una mutación específica llamada R14Del en el gen PLN puede interrumpir esta regulación, llevando a problemas cardíacos.

Usando CASAAV-HDR, los científicos pueden editar el gen PLN para estudiar cómo la mutación afecta el comportamiento de la proteína. Descubrieron que aunque la ubicación de la proteína en las células se mantiene en gran medida sin cambios, la función de PLN se ve afectada, lo que provoca problemas con cómo se mueve el calcio dentro y fuera de las células del corazón.

El Poder de los Ensayos de Reportero Masivamente Paralelos

En el mundo de la regulación genética, los científicos están interesados en entender qué hace que algunos genes sean más activos que otros. Para abordar esto, desarrollaron ensayos de reportero masivamente paralelos (MPRAs). Estos ensayos ayudan a examinar muchos genes simultáneamente para entender cómo diferentes regiones de ADN, conocidas como potenciadores, regulan la actividad génica.

Utilizando CASAAV-HDR, los investigadores pueden insertar con precisión estos potenciadores en ubicaciones específicas del genoma. Por ejemplo, apuntaron al gen Tnni1, que es importante para la función del corazón. Al integrar potenciadores en este gen, pudieron estudiar cuánto más activo se volvió en las células del corazón.

Los resultados fueron prometedores: encontraron que ciertos potenciadores aumentaron efectivamente la actividad del gen, allanando el camino para explorar más a fondo la regulación genética.

Limitaciones y Perspectivas Futuras

Si bien CASAAV-HDR muestra un gran potencial, no está exenta de limitaciones. La eficiencia de hacer ediciones puede variar según dónde se esté apuntando en el ADN. A veces, la edición no resulta como los científicos esperan, llevando a resultados mixtos dentro del mismo tejido.

Sin embargo, CASAAV-HDR permite a los investigadores etiquetar las células que han sido editadas con éxito, haciéndolas más fáciles de estudiar. Incluso con sus limitaciones, CASAAV-HDR ofrece fantásticas oportunidades para que los científicos comprendan mejor las enfermedades genéticas y exploren formas de tratarlas.

Conclusión: Un Futuro Brillante por Delante

CASAAV-HDR representa un avance significativo en la tecnología de edición genética. Ha abierto nuevas avenidas en el campo de la cardiología, permitiendo a los investigadores modelar enfermedades y estudiar las funciones génicas de manera más efectiva. Con esta herramienta, la comunidad científica está mejor equipada para abordar enfermedades genéticas y potencialmente desarrollar nuevas terapias.

A medida que los científicos continúan explorando otras aplicaciones posibles de CASAAV-HDR, como la terapia génica y la clonación, podemos esperar avances emocionantes en cómo entendemos y tratamos las enfermedades del corazón. Todo este trabajo sugiere que el futuro de la genética es brillante, ¡y quién sabe? Tal vez un día podamos arreglar corazones rotos más allá del sentido emocional.

Fuente original

Título: Cardiac Applications of CRISPR/AAV-Mediated Precise Genome Editing

Resumen: The ability to efficiently make precise genome edits in somatic tissues will have profound implications for gene therapy and basic science. CRISPR/Cas9 mediated homology-directed repair (HDR) is one approach that is commonly used to achieve precise and efficient editing in cultured cells. Previously, we developed a platform capable of delivering CRISPR/Cas9 gRNAs and donor templates via adeno-associated virus to induce HDR (CASAAV-HDR). We demonstrated that CASAAV-HDR is capable of creating precise genome edits in vivo within mouse cardiomyocytes at the neonatal and adult stages. Here, we report several applications of CASAAV-HDR in cardiomyocytes. First, we show the utility of CASAAV-HDR for disease modeling applications by using CASAAV-HDR to create and precisely tag two pathological variants of the titin gene observed in cardiomyopathy patients. We used this approach to monitor the cellular localization of the variants, resulting in mechanistic insights into their pathological functions. Next, we utilized CASAAV-HDR to create another mutation associated with human cardiomyopathy, arginine 14 deletion (R14Del) within the N-terminus of Phospholamban (PLN). We assessed the localization of PLN-R14Del and quantified cardiomyocyte phenotypes associated with cardiomyopathy, including cell morphology, activation of PLN via phosphorylation, and calcium handling. After demonstrating CASAAV-HDR utility for disease modeling we next tested its utility for functional genomics, by targeted genomic insertion of a library of enhancers for a massively parallel reporter assay (MPRA). We show that MPRAs with genomically integrated enhancers are feasible, and can yield superior assay sensitivity compared to tests of the same enhancers in an AAV/episomal context. Collectively, our study showcases multiple applications for in vivo precise editing of cardiomyocyte genomes via CASAAV-HDR.

Autores: Yanjiang Zheng, Joshua Mayourian, Justin S. King, Yifei Li, Vassilios J. Bezzerides, William T. Pu, Nathan J. VanDusen

Última actualización: Dec 4, 2024

Idioma: English

Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.03.626493

Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.03.626493.full.pdf

Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Cambios: Este resumen se ha elaborado con la ayuda de AI y puede contener imprecisiones. Para obtener información precisa, consulte los documentos originales enlazados aquí.

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