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# Biología # Biología molecular

Viendo genes en acción: una nueva forma de estudiar la expresión

Los investigadores usan ADN desnudo para observar la expresión genética sin hacer daño a los animales.

Saubhik Som, Gopalapura J Vishalakshi, Lekha E Manjunath, Debraj Manna, Kirtana Vasu, Anumeha Singh, Sandeep M Eswarappa

― 8 minilectura


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La expresión génica es un proceso fundamental en biología que gobierna cómo la información genética se convierte en productos funcionales, como las proteínas. Es como seguir una receta para hornear un pastel: primero, reúnes los ingredientes (ADN), luego los mezclas (Transcripción), los horneas (traducción) y, al final, obtienes un pastel delicioso (proteínas). Pero, al igual que al hornear, las cosas pueden salir mal. Si falta un ingrediente o algo está mal, puedes terminar con algo que sabe raro o, peor, que no se hornea en absoluto. En nuestro caso biológico, cuando la expresión génica sale mal, puede llevar a enfermedades, incluido el cáncer.

Niveles de Regulación de la Expresión Génica

La expresión génica se puede regular en múltiples niveles, desde la transcripción inicial del ADN hasta la degradación final de las proteínas. Vamos a desglosarlo de manera sencilla:

  1. Transcripción: Este es el primer paso donde el ADN se copia en ARN mensajero (ARNm). Piensa en el ARNm como la hoja de pedido que llevas a la cocina. Si el personal de la cocina no entiende el pedido, todo el pastel se echa a perder.

  2. Traducción: Aquí es donde el ARNm se convierte en proteínas. Los ribosomas en las células son como los pastores que siguen tu pedido para hacer el pastel. Si leen mal el pedido, sale el pastel equivocado.

  3. Degradación de proteínas: Después de que se producen las proteínas, no se quedan ahí para siempre. Eventualmente se descomponen y se reciclan. Es como limpiar la cocina después de hornear: si dejas un desorden, las cosas se echan a perder.

Métodos para Estudiar la Regulación de la Expresión Génica

Los científicos han desarrollado varias herramientas y métodos para ver cómo se regula la expresión génica. Cada método es como un gadget de cocina diferente que ayuda con una parte específica del proceso de horneado:

  • Aminoácidos Radiactivos y Fluorescentes: Piensa en esto como un colorante de comida elegante que ayuda a los científicos a ver las proteínas en acción.

  • Secuenciación de ARN: Este método permite a los científicos leer las recetas (genes) y ver cuáles se están siguiendo en un momento dado.

  • Perfilado de Ribosomas: Imagina poder escuchar a los pastores para ver cómo interpretan tu pedido. Este método muestra qué ARNm se están traduciendo en proteínas.

  • Espectrometría de Masas Cuantitativa: Esta es la forma de alta tecnología de pesar y medir los productos horneados finales para ver cuánto de cada proteína está presente.

  • Ensayos de Reporte y Western Blotting: Estos métodos son como darle a los pastores un sello de aprobación o una calificación sobre qué tan bien siguieron la receta. Ayudan a confirmar si se producen ciertas proteínas.

Aunque estos métodos son geniales, a veces pueden ser un poco invasivos. Por ejemplo, a menudo requieren usar animales vivos, lo que significa que los científicos a veces tienen que tomar muestras sacrificando al animal. No es ideal, ¿verdad? Así que los investigadores siempre están en busca de mejores métodos más simples.

Un Nuevo Enfoque para Estudiar la Expresión Génica

Aquí es donde se pone interesante. Los investigadores han encontrado una nueva forma menos intrusiva de estudiar la expresión génica usando algo llamado “ADN desnudo”. No, no es lo que parece. El ADN desnudo se refiere al ADN que no está encerrado en ningún tipo de célula o virus. Al inyectar este ADN desnudo en ratones, los científicos pueden ver qué tan bien se expresan los genes sin dañar a los animales.

La primera demostración exitosa de este método data de 1990 cuando los científicos inyectaron plásmidos desnudos (ADN circular) que codificaban proteínas como la Luciferasa (la sustancia que hace que las luciérnagas brillen) en los músculos de los ratones. Descubrieron que los ratones comenzaron a expresar estas proteínas en sus tejidos musculares. Este fue un descubrimiento importante que llevó al desarrollo de vacunas de ADN.

Ahora, los investigadores han llevado este concepto más allá. Usaron inyecciones de ADN desnudo para producir luciferasa en ratones y medir su actividad utilizando técnicas de imagen avanzadas. De esta manera, pueden ver cómo se comportan los genes sin tener que sacrificar a los ratones. Después de una simple inyección, pueden usar cámaras especiales para detectar el brillo de la luciferasa, como si estuvieran buscando un tesoro escondido.

Resultados del Nuevo Método

Usando esta nueva técnica, los investigadores han podido ver cómo la expresión génica cambia según diferentes factores.

Detección de la Expresión Génica en Acción

Primero probaron si la inyección de ADN desnudo podía producir señales visibles (como brillar) sin dañar al ratón. Inyectaron un plásmido que codificaba la luciferasa de luciérnagas en la cola de los ratones. Unas horas después, les dieron luciferina (el sustrato que la luciferasa necesita para brillar) y utilizaron un sistema de imagen para ver cuánto brillaban los ratones.

Sorprendentemente, la inyección en la cola resultó en un brillo fuerte, mientras que otros métodos de inyección no dieron tan buenos resultados. Esto podría significar que las células en la cola son más receptivas al ADN o que la señal se puede detectar mejor desde esa área. Es un poco un misterio, pero uno que los científicos están ansiosos por resolver.

Investigando Diferentes Niveles de Regulación Génica

Una vez que los investigadores confirmaron que podían ver el brillo, querían entender cómo se podía regular la expresión génica en diferentes etapas:

  1. Regulación Transcripcional: Probaron si podían ver diferencias en cómo se expresaban los genes según las piezas de ADN (promotores) que usaron. Al conectar un promotor conocido de un virus llamado citomegalovirus a su gen de luciferasa, crearon una receta súper cargada que permitió una mayor expresión. De hecho, cuando inyectaron este plásmido modificado, los ratones brillaron mucho más, demostrando que se estaba siguiendo la receta de cerca.

  2. Regulación Post-Transcripcional: Luego, observaron cómo pequeñas moléculas llamadas MicroARN podían reducir la expresión génica. Los microARN pueden apagar genes uniéndose a sus mensajeros. Los investigadores etiquetaron la luciferasa con sitios de unión específicos de microARN y vieron que el brillo disminuyó en los ratones, confirmando que esos microARN estaban apagando con éxito la expresión génica.

  3. Regulación Translacional: Luego exploraron cómo se podía regular el proceso de producción de proteínas. Se centraron en un fenómeno conocido como lectura continua del codón de parada, donde la maquinaria celular sigue produciendo una proteína más allá de su punto de parada habitual. Vincularon el gen de luciferasa con una secuencia que fomenta la lectura continua del codón de parada, ¡y voilà! Pudieron ver el brillo de los ratones, demostrando que estaban produciendo estas proteínas extendidas.

  4. Uso de Codones: Finalmente, examinaron cómo la elección de codones (los bloques de construcción del ADN que indican a las células cómo hacer proteínas) afectaba la producción de proteínas. Al insertar codones raros en su gen de luciferasa, encontraron que el brillo era mucho más tenue. Esto sugiere que las células tenían problemas para traducir el gen debido a los codones raros, así como los pastores podrían tener dificultades para seguir una receta si estuviera escrita en un idioma extranjero.

¿Por qué es Importante?

La nueva técnica de imagen in vivo abre muchas posibilidades para los científicos. Les permite estudiar fácilmente la regulación de la expresión génica en animales vivos sin necesidad de sacrificarlos. ¡Eso es una gran victoria para el bienestar animal! Además, es un método rápido: los investigadores pueden ver resultados en solo 24 horas, lo cual es impresionante en comparación con los métodos tradicionales de laboratorio que pueden tardar mucho más.

Esta técnica también tiene implicaciones potenciales para el desarrollo de medicamentos. Al usar este método, los científicos pueden probar cómo los nuevos medicamentos afectan la expresión génica en animales vivos, allanando el camino para tratamientos novedosos que podrían ajustar la actividad génica en varias enfermedades.

Conclusión

La regulación de la expresión génica es una parte crucial para entender cómo funcionan las células. Al usar técnicas innovadoras como inyecciones de ADN desnudo e imágenes avanzadas, los investigadores pueden obtener una comprensión más profunda de este complejo campo.

Así que, la próxima vez que veas una luciérnaga brillante o comas un pastel delicioso, recuerda la ciencia detrás de cómo se expresan los genes. Desde la transcripción inicial de la receta hasta el producto final sabroso, todo se trata de seguir los pasos correctos en el orden correcto. ¡Y quién sabe? Tal vez un día puedas hornear tu propio pastel brillante.

Fuente original

Título: IVISc-L: A quick and simple in vivo assay to study the regulation of gene expression

Resumen: Several methods are available to study the regulation of gene expression at cellular and molecular levels. Adaptation of these methods in vivo is cumbersome and often requires animal sacrifice. Here, we report an assay (IVISc-L, In Vivo Imaging of Subcutaneous Luminescence) to study gene regulation in vivo. This assay involves subcutaneous injection of a plasmid DNA encoding firefly luciferase, whose expression is under the regulatory mechanism to be investigated. We could infer its regulated expression by detecting the subcutaneous luminescence using an in vivo imaging system. Using this assay, we have demonstrated the regulation of gene expression mediated by a promoter, micro-RNAs, stop codon readthrough, and rare codons. This minimally invasive assay does not require animal sacrifice or any tissue extraction. The entire assay can be completed within 24 hours. Therefore, this assay will be useful in investigating the mechanisms of gene expression regulation, and screening molecules that can alter gene expression in vivo.

Autores: Saubhik Som, Gopalapura J Vishalakshi, Lekha E Manjunath, Debraj Manna, Kirtana Vasu, Anumeha Singh, Sandeep M Eswarappa

Última actualización: 2024-12-20 00:00:00

Idioma: English

Fuente URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.16.628807

Fuente PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.12.16.628807.full.pdf

Licencia: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Cambios: Este resumen se ha elaborado con la ayuda de AI y puede contener imprecisiones. Para obtener información precisa, consulte los documentos originales enlazados aquí.

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