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# Biologie# Zellbiologie

Neue Einblicke in die Funktion und Regulation von Peroxisomen

Forschung zeigt die Rollen von RNF146 und Tankyrase in der Peroxisomenaktivität.

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Inhaltsverzeichnis

Peroxisomen sind kleine Strukturen in den Zellen, die wichtige Aufgaben im Stoffwechsel übernehmen. Sie enthalten spezielle Proteine, die helfen, Fettsäuren abzubauen und schädliche Substanzen wie reaktive Sauerstoffmoleküle zu verwalten. Jede Zellart kann unterschiedliche Arten von Peroxisomen haben, je nachdem, was die Zelle braucht. Zum Beispiel arbeiten Peroxisomen im Darm von Mäusen daran, eine bestimmte Art von Fettmolekül zu erzeugen, während sie in anderen Zellen, wie denen im Innenohr, helfen, Schäden durch laute Geräusche zu verhindern.

Wenn Peroxisomen aufgrund von Genmutationen nicht richtig funktionieren, kann das zu verschiedenen Gesundheitsproblemen bei Menschen führen, die als Peroxisom-Biogenesestörungen bekannt sind. Diese Störungen können eine Reihe von Symptomen verursachen, von schweren Problemen bei Säuglingen bis hin zu Bedingungen, die die Entwicklung und Organfunktion im späteren Leben betreffen. Daher ist es wichtig, sowohl die Gene zu verstehen, die mit Peroxisomen in Verbindung stehen, als auch wie diese Strukturen ihre Aktivität je nach Bedarf der Zelle anpassen.

Wie Peroxisomen hergestellt werden

Über 30 spezifische Proteine, bekannt als PEX-Proteine, sind an der Herstellung und Erhaltung von Peroxisomen beteiligt. Sie helfen, die Membranen der Peroxisomen aufzubauen und die benötigten Proteine, die darin arbeiten, zu importieren. Der Prozess, Proteine in Peroxisomen zu bekommen, hängt von der Anwesenheit der richtigen Strukturen und dieser PEX-Proteine ab, die eine effiziente Lieferung gewährleisten.

Proteine, die in Peroxisomen gelangen müssen, haben oft ein spezifisches Tag an einem Ende, das PTS1 genannt wird. Dieses Tag wird von einem Rezeptorprotein namens PEX5 erkannt. PEX5 bringt die markierten Proteine zu einem Andockbereich, sodass sie durch die Membran des Peroxisoms gelangen können. Nach diesem Import muss PEX5 recycelt werden, was komplexe Schritte umfasst, darunter einen Tagging-Prozess mit Molekülen, die für das Recycling signalisieren.

Zellen müssen sorgfältig abstimmen, wie sie Proteine in Peroxisomen importieren, basierend auf ihren Bedürfnissen. Veränderungen in der Art und Weise, wie Proteine hergestellt oder modifiziert werden, können beeinflussen, wie gut sie in der Zelle funktionieren. Ausserdem können bestimmte Signale, wie Phosphorylierung aus anderen zellulären Funktionen, spezifische Reaktionen auslösen, wie den Abbau von Peroxisomen unter Stress.

Identifizierung neuer Gene, die die Peroxisomenfunktion beeinflussen

Um neue Gene zu entdecken, die beeinflussen, wie Proteine in Peroxisomen importiert werden, führten Wissenschaftler ein gross angelegtes Screening mit einer Methode namens CRISPRi durch. Dieser Ansatz kann spezifische Gene stilllegen, um zu sehen, wie die Veränderungen die Peroxisomenaktivität beeinflussen.

Unter den untersuchten Genen war eine besonders interessante Entdeckung, dass die Verringerung der Werte eines Gens namens RNF146 Auswirkungen darauf hatte, wie gut die für den Import in Peroxisomen markierten Proteine aufgenommen wurden. RNF146 ist ein Enzym, das hilft, andere Proteine zu regulieren, indem es sie für die Zerstörung markiert. Man dachte, dass RNF146 auch einen wichtigen Partnerprotein namens Tankyrase beeinflussen könnte, der daran beteiligt ist, ADP-Ribose-Moleküle an Proteine anzuhängen, ein Prozess, der als PARylation bekannt ist.

In Experimenten bemerkten die Wissenschaftler, dass bei gesenkten RNF146-Werten mehr Tankyrase in den Zellen gefunden wurde, und dieser Anstieg korrelierte mit einem reduzierten Import von Proteinen in Peroxisomen. Sie schlugen ein Modell vor, das nahelegt, dass Tankyrase, wenn sie aktiv ist, an ein PEX-Protein namens PEX14 bindet und ADP-Ribose anhängt, was möglicherweise den Import von Proteinen blockiert, die innerhalb der Peroxisomen benötigt werden.

Die Rolle von RNF146 und Tankyrase

RNF146 und Tankyrase sind bekannt dafür, die Stabilität verschiedener Proteine in der Zelle zu regulieren. Sie helfen, Proteine zur Zerstörung zu kennzeichnen, wenn sie nicht mehr benötigt werden. Forscher bemerkten, dass sie Unterschiede in der Stabilität dieser Proteine in Zellen sahen, die bestimmte PEX-Gene fehlten.

Diese Beobachtung führte zu der Erkenntnis, dass Peroxisomen möglicherweise mit wichtigen zellulären Signalwegen verknüpft sind. Insbesondere war einer der betroffenen Wege der Wnt-Signalweg, welcher eine entscheidende Rolle bei der Kontrolle des Zellwachstums und Verhaltens spielt. Die Stabilität von AXIN1, einem Schlüsselprotein in diesem Signalweg, schien sich zu verändern, als die Werte von peroxisomalen Proteinen variierten.

Neue Zellmodelle zur Untersuchung der Peroxisomenfunktion

Um besser zu untersuchen, wie Peroxisomen funktionieren und wie ihre Aktivität getestet werden kann, entwickelten Wissenschaftler einen neuen Zelltyp. Sie konstruierten eine Zelllinie, bei der die Fähigkeit der Peroxisomen, Proteine zu importieren, mit dem Überleben der Zellen verbunden war. Sie haben dies erreicht, indem sie ein grünes fluoreszierendes Protein mit einem Resistenzgen fusionierten, was eine einfache Verfolgung ermöglichte, wie gut diese Proteine in Peroxisomen eingingen.

In ihren Experimenten zeigten Zellen mit gesunden Peroxisomen helle Fluoreszenzstellen, während diejenigen mit gestörtem Proteinimport ein diffuses Signal in der Zelle hatten. Dieses Modell erwies sich als nützlich, um herauszufinden, wie verschiedene Gene die Funktionen von Peroxisomen beeinflussen.

Ergebnisse des genomweiten Screenings

Das genomweite Screening mit der neuen Zelllinie ergab viele interessante Ergebnisse. Bekannte Gene, die mit der peroxisomalen Funktion in Verbindung stehen, waren unter denen, die signifikante Veränderungen zeigten. Ausserdem wurden neue Kandidatengene identifiziert, die zuvor nicht mit Peroxisomen in Verbindung gebracht wurden.

Die Forscher filterten ihre Ergebnisse, um sich auf die Gene zu konzentrieren, die am relevantesten für den Import in Peroxisomen waren. In dieser Filterung fanden sie heraus, dass einige Proteine besonders wichtig für den Prozess des Neuimports in Peroxisomen waren. Es wurden auch einige überraschende Verhaltensweisen entdeckt – es schien, dass nicht alle Gene, die die Peroxisomen beeinflussten, dies auf geradlinige Weise taten.

Erforschung der Mechanismen der Importregulation

Um zu verstehen, wie spezifische Gene die Peroxisomenfunktion beeinflussen, verwendeten Wissenschaftler Fluoreszenzmikroskopie, um die Veränderungen im Proteinimport in ihren Zellmodellen zu beobachten. Sie massen, wie viele fluoreszierende Punkte für Proteine auftauchten, die in Peroxisomen importiert werden sollten, und stellten fest, dass viele Kandidatengene diese Werte beeinflussten.

Sie fanden heraus, dass das Herunterregulieren von RNF146 und anderen ausgewählten Genen die Intensität und Anzahl der fluoreszierenden Marker, die mit Peroxisomen verbunden sind, verringerte. Das deutet darauf hin, dass RNF146 eine bedeutende Rolle bei der Regulierung spielt, wie gut Proteine in Peroxisomen importiert werden.

Das Zusammenspiel zwischen RNF146 und Tankyrase

Da RNF146 und Tankyrase miteinander interagieren, wurde es wichtig zu untersuchen, wie ihre Beziehung die Peroxisomenfunktion beeinflusst. Als RNF146 herunterreguliert wurde, stiegen die Tankyrase-Werte in den Zellen, was auf ein empfindliches Gleichgewicht zwischen diesen Proteinen hinweist. Die Wissenschaftler untersuchten auch, wie diese Beziehung den Proteinimport beeinflusste.

Durch zusätzliche Experimente fanden die Forscher heraus, dass sie, als sie gleichzeitig sowohl RNF146 als auch Tankyrase herunterregulierten, einige der Effizienzen beim Proteinimport zurückgewinnen konnten, die verloren gegangen waren. Diese Übereinstimmung bestätigte weiter, dass die Auswirkungen von RNF146 auf den Importprozess der Peroxisomen von der Aktivität von Tankyrase abhängen.

Die Bedeutung der Peroxisomen-Homöostase

Eine ordnungsgemässe Balance der Peroxisomen in den Zellen ist entscheidend für die allgemeine Gesundheit. Wenn Peroxisomen zu wenige oder nicht richtig funktionierend sind, kann das zu erheblichen Problemen führen, einschliesslich Stoffwechselstörungen und Entwicklungsproblemen. Das Verständnis der Regulierung von Peroxisomen, insbesondere im Zusammenhang mit RNF146 und Tankyrase, ist von grosser Bedeutung.

Als die Forscher die genauen Rollen dieser Proteine in der peroxisomalen Funktion entwirrten, wurde klar, dass sie zu einem besseren Verständnis der zellulären Gesundheit beitragen. Störungen in den Proteinen, die die Aktivität der Peroxisomen steuern, könnten zu verschiedenen Gesundheitsproblemen führen, was diese Forschung wertvoll macht.

Verknüpfung von Peroxisomen mit zellulären Signalwegen

Die Ergebnisse deuteten auch darauf hin, dass Peroxisomen möglicherweise eine Rolle bei der Beeinflussung zellulärer Signalwege spielen. Als die Forscher den Einfluss der Manipulation von PEX-Proteinen auf den Wnt-Signalweg untersuchten, fanden sie bemerkenswerte Veränderungen. Die Stabilität von AXIN1, die im Wnt-Signalweg entscheidend ist, variiert je nach Anwesenheit peroxisomaler Proteine.

Die Fähigkeit der Peroxisomen, zelluläre Signalwege zu beeinflussen, wirft spannende Fragen über ihre Rolle in Entscheidungen des zellulären Schicksals auf. Diese Erkenntnis könnte neue Wege eröffnen, um Krankheiten zu verstehen, bei denen Signalwege aus dem Gleichgewicht geraten, wie beispielsweise Krebs.

Zukünftige Richtungen

Zu verstehen, wie Peroxisomen innerhalb der Zelle funktionieren, bietet potenzielle Wege für therapeutische Interventionen bei verwandten Erkrankungen. Zukünftige Studien werden sich wahrscheinlich darauf konzentrieren, wie die Manipulation der Funktionen von RNF146 und Tankyrase die peroxisomale Aktivität verbessern oder die Funktion in Zellen wiederherstellen kann, in denen diese Wege beeinträchtigt sind.

Darüber hinaus unterstreicht die breitere Relevanz der Peroxisomenbiologie für Gesundheit und Krankheit die Bedeutung fortgesetzter Forschung. Die Untersuchung der spezifischen molekularen Mechanismen und Wechselwirkungen wird weiter aufzeigen, wie Peroxisomen die Zellfunktion und die Gesundheit des gesamten Organismus beeinflussen.

Fazit

Die Untersuchung der Peroxisomen hat tiefgreifende Einblicke in den zellulären Stoffwechsel und die Signalgebung ergeben. Durch die Identifizierung wichtiger regulatorischer Proteine wie RNF146 und deren Zusammenspiel mit Tankyrase machen die Forscher Fortschritte auf dem Weg zu einem besseren Verständnis der peroxisomalen Funktion.

Mit wachsendem Wissen nähern wir uns Lösungen für die verschiedenen Gesundheitsprobleme, die durch Peroxisom-Dysfunktionen verursacht werden. Mit dem Potenzial für neue Therapien und einem verbesserten Verständnis der zellulären Gesundheit sieht die Zukunft vielversprechend aus in der Erkundung der Peroxisomen und ihrer kritischen Rollen in unseren Zellen.

Originalquelle

Titel: A genome-wide screen links peroxisome regulation with Wnt signaling through RNF146 and tankyrase

Zusammenfassung: Peroxisomes are membrane-bound organelles harboring metabolic enzymes. In humans, peroxisomes are required for normal development, yet the genes regulating peroxisome function remain unclear. We performed a genome-wide CRISPRi screen to identify novel factors involved in peroxisomal homeostasis. We found that inhibition of RNF146, an E3 ligase activated by poly(ADP-ribose), reduced the import of proteins into peroxisomes. RNF146-mediated loss of peroxisome import depended on the stabilization and activity of the poly(ADP-ribose) polymerase tankyrase, which binds the peroxisomal membrane protein PEX14. We propose that RNF146 and tankyrase regulate peroxisome import efficiency by PARsylation of proteins at the peroxisome membrane. Interestingly, we found that the loss of peroxisomes increased tankyrase and RNF146-dependent degradation of non-peroxisomal substrates, including the beta-catenin destruction complex component AXIN1, which was sufficient to alter the amplitude of beta-catenin transcription. Together, these observations not only suggest previously undescribed roles for RNF146 in peroxisomal regulation, but also a novel role in bridging peroxisome function with Wnt/beta-catenin signaling during development.

Autoren: Brooke Meghan Gardner, J. T. Vu, K. U. Tavasoli, L. Mandjikian, C. J. Sheedy, J. Bacal, M. A. Morrissey, C. D. Richardson

Letzte Aktualisierung: 2024-02-04 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.02.578667

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.02.578667.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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