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# Biologie# Zellbiologie

Fortschritte in der eHAP Zellforschung

Neue Methoden verbessern Genstudien mit eHAP-Zellen und diploiden Zellen.

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HAP-Zellen sind eine Art menschlicher Zellen, die nur einen Satz Chromosomen haben, also haploid sind. Das bedeutet, dass Forscher nur ein Exemplar eines spezifischen Gens ändern müssen, anstatt mit zwei umzugehen, wie es bei typischen diploiden Zellen der Fall ist. eHAP-Zellen sind eine komplett haploide Version der HAP1-Zellen und super hilfreich, um zu verstehen, wie Gene funktionieren. Sie unterstützen Wissenschaftler dabei, die Funktionen von Genen besser zu erforschen.

Allerdings erfordert das Studium von Genfunktionen oft, dass neue Gene in diese Zellen eingefügt werden, die als Transgene bekannt sind. Das kann bedeuten, ein Gen wieder einzuführen, um ein spezielles Problem zu beheben, oder spezielle Marker zu verwenden, um bestimmte Aktivitäten innerhalb der Zellen zu beobachten. Bei Experimenten mit eHAP-Zellen stellten die Forscher fest, dass gängige Methoden zur Einführung dieser Transgene nicht effektiv waren. Viele der Transgene wurden nicht wie erwartet exprimiert, was die durchgeführten Studien einschränkte.

Herausforderungen mit neuen Vektoren überwinden

Um diese Probleme anzugehen, haben Forscher neue Methoden entwickelt, um Transgene besser in eHAP-Zellen einzufügen. Die neuen Vektoren (die Werkzeuge, die verwendet werden, um Gene zu transportieren und einzufügen) konzentrieren sich auf drei Hauptaspekte:

  1. Stabile Integration: Sie verwenden Systeme wie piggyBac und Flp-In, die helfen, sicherzustellen, dass die neuen Gene stabil in das Genom der Zelle integriert werden.
  2. Barriereschutz: Die Vektoren sind mit speziellen Elementen namens cHS4-Kernisolatoren ausgestattet. Diese Elemente helfen, die Stummschaltung von Transgenen zu verhindern, die oft auftritt, wenn Gene in das Genom integriert werden.
  3. Visuelle Marker: Die Vektoren enthalten auch ein blau fluoreszierendes Protein, das hilft, die Zellen zu identifizieren und zu sortieren, die das Transgen erfolgreich aufgenommen haben.

Die piggyBac- und Flp-In-Systeme sind nicht-virale Methoden, was bedeutet, dass sie keine Viren zur Geneinführung verwenden. Stattdessen verlassen sie sich auf spezifische Proteine, um die neuen Gene direkt in das Genom der Zellen zu integrieren.

So funktionieren die PiggyBac- und Flp-In-Systeme

Das Flp-In-System verwendet ein spezielles Protein namens Flp-Rekombinase. Dieses Protein fügt das neue Gen an eine vorher festgelegte Stelle im Genom der Wirtszelle ein. Vor diesem Prozess muss ein spezifischer Ort, bekannt als FRT-Stelle, ins Genom eingefügt werden, um sicherzustellen, dass das neue Gen dort platziert werden kann.

Das piggyBac-System funktioniert dagegen anders. Es nutzt ein Protein namens piggyBac-Transposase, um neue Gene an verschiedenen Stellen im Genom einzufügen, wobei es bevorzugt aktive Bereiche nutzt.

Beide Systeme können Gene integrieren, tun dies jedoch auf unterschiedliche Weise. Während das Flp-In-System konsistente Zelllinien mit demselben genetischen Makeup schafft, kann das piggyBac-System Variationen einführen, was beeinflussen kann, wie gut die neuen Gene funktionieren.

Das Problem der Gensilenzierung

Trotz dieser fortschrittlichen Methoden sahen sich die Forscher einem weiteren Problem gegenüber: der Gensilenzierung. Gensilenzierung tritt auf, wenn die Zelle die Aktivität integrierter Gene aufgrund verschiedener Faktoren wie der umgebenden Chromatinumgebung herunterfährt. Das macht es schwierig, die Expressionsniveaus der eingefügten Transgene zu messen.

Eine Möglichkeit, der Gensilenzierung entgegenzuwirken, ist die Verwendung von Isolatoren, wie dem cHS4-Kernisolator. Diese Isolatoren helfen, die Genexpression aufrechtzuerhalten, indem sie Modifikationen blockieren, die zur Stummschaltung führen. Sie sorgen dafür, dass die integrierten Gene aktiv bleiben und auf höheren Niveaus exprimiert werden können.

Verschmelzen von eHAP-Zellen zur Erzeugung von Diploiden

Neben der Modifizierung haploider eHAP-Zellen haben Forscher auch die Möglichkeit untersucht, diploide Zellen durch das Verschmelzen haploider eHAP-Zellen zu erzeugen. Durch das Verschmelzen zweier verschiedener haploider Zelllinien, jede mit einzigartigen Eigenschaften (wie unterschiedliche Medikamente-Resistenzmarker), können sie diploide Zellen erzeugen, die die Merkmale beider Elternzellen tragen.

Der Fusionsprozess beinhaltet das Mischen der Zellen mit einem chemischen Stoff namens Polyethylenglykol (PEG), der das Zusammenführen der Zellen erleichtert. Nach der Fusion können die kombinierten Zellen basierend auf ihrer Resistenz gegen bestimmte Antibiotika und ihre fluoreszierenden Marker ausgewählt werden. Diese Methode ermöglicht es Forschern, diploide Zellen mit genau definierten Eigenschaften zu erstellen.

Die Produktion von heterozygoten Diploiden kann besonders nützlich sein, um genetische Interaktionen zu studieren. Diese diploiden Zellen können Einblicke geben, wie unterschiedliche genetische Hintergründe Merkmale oder Reaktionen auf Behandlungen beeinflussen, was wertvoll für das Verständnis komplexer Krankheiten sein kann.

Praktische Anwendungen von eHAP- und Diploid-Zellen

Die beschriebenen Methoden eröffnen neue Möglichkeiten für Experimente. Forscher können effektiv eHAP-Zellen erzeugen, die spezifische Gene tragen, und deren Funktion erkunden. Dies hat nicht nur Auswirkungen auf die Grundlagenforschung, sondern auch auf die Entwicklung von Therapien für verschiedene genetische Krankheiten.

Mit der Fähigkeit, heterozygote diploide Zellen zu schaffen, können Wissenschaftler untersuchen, wie verschiedene Gene zusammenarbeiten, insbesondere bei Krankheiten, die multiple genetische Faktoren beinhalten. Das ist entscheidend, um Bedingungen zu verstehen, bei denen Geninteraktionen eine Rolle spielen, wie bei bestimmten Krebsarten oder genetischen Störungen.

Kultivierung von eHAP-Zellen

Die Kultivierung von eHAP-Zellen umfasst mehrere Schritte. Sie werden in einem speziellen nährstoffreichen Medium gezüchtet, das ihr Wachstum unterstützt. Forscher überwachen die Zellen sorgfältig und übertragen sie alle paar Tage in neue Behälter, um sie gesund zu halten. Um die haploide Natur der Zellen aufrechtzuerhalten, nutzen sie gelegentlich einen Prozess namens Flowsortierung, der hilft, haploide Zellen von diploiden oder aneuploiden Zellen zu trennen, die entstehen können.

In Experimenten verwenden Wissenschaftler auch Antibiotika, um Zellen auszuwählen, die das Transgen erfolgreich integriert haben, sodass nur diese Zellen weiter wachsen.

Strategien zur Verbesserung der Transgenexpression

Forscher haben mehrere Strategien eingesetzt, um die Expression von Transgenen in eHAP-Zellen zu verbessern. Sie haben die Methoden zur Einführung neuer Gene verfeinert, einschliesslich der Optimierung von Transfektionsprotokollen. Mit Systemen wie der reversen Transfektion und Elektroporation erzielen sie bessere Ergebnisse. Bei der reversen Transfektion wird die DNA- und Lipofectamin-Mischung im Voraus vorbereitet, was sich als effizienter erwiesen hat als die Standardmethoden.

Die Elektroporation ist eine weitere Technik, die ein elektrisches Feld nutzt, um die Durchlässigkeit der Zellmembran zu erhöhen, sodass die eingeführte DNA effizienter eindringen kann. Durch das Experimentieren mit verschiedenen Protokollen können Forscher herausfinden, welches am besten für spezifische Anwendungen geeignet ist.

Überwachung der Genexpression

Um den Erfolg der Integration neuer Gene zu überwachen, verwenden Wissenschaftler die fluorescence-aktivierte Zelltrennung (FACS). Diese Technologie ermöglicht es ihnen, Zellen basierend auf ihrer Fluoreszenzintensität zu analysieren und zu sortieren. Wenn eine Zelle das eingefügte Gen erfolgreich exprimiert, emittiert sie ein spezifisches fluoreszierendes Signal, was es einfacher macht, diese Zellen auszuwählen und weiter zu untersuchen.

Durch die Analyse der Fluoreszenzwerte über die Zeit hinweg können die Forscher bestimmen, wie effektiv das Transgen exprimiert wird und ob ihre Strategien zur Verbesserung der Expression erfolgreich sind.

Fazit

Die Entwicklung von eHAP-Zellen und deren anschliessende Manipulation durch fortschrittliche Techniken haben die Werkzeuge, die Forschern zur Verfügung stehen, erheblich erweitert. Mit der Fähigkeit, Gene effektiv einzuführen, ihre Expression zu überwachen und heterozygote diploide Zellen zu erstellen, können Wissenschaftler Gene und deren Interaktionen leichter erforschen.

Diese Fortschritte bieten grosses Potenzial für Bereiche wie Genetik, Molekularbiologie und therapeutische Entwicklung. Indem sie die Komplexität der Genexpression und -interaktionen entschlüsseln, ebnen Forscher den Weg für neue Behandlungen und ein besseres Verständnis genetischer Krankheiten. Die Arbeit mit eHAP-Zellen trägt nicht nur zum wissenschaftlichen Wissen bei, sondern hat auch das Potenzial, Durchbrüche in der Medizin und Gesundheitsversorgung zu ermöglichen.

Originalquelle

Titel: Insulated piggyBac and FRT vectors for engineering transgenic homozygous and heterozygous eHAP cells

Zusammenfassung: Transgene expression in eHAP cells, a haploid cell line popularly used to generate gene knockouts, is difficult owing to its low transfection efficiency and propensity for silencing integrated transgenes. To simplify transgene expression, we engineered insulated integrating plasmids that sustain high levels of transgene expression in eHAP cells, and that can be used in other cell lines. These vectors are compatible with FLP-FRT and piggyBac integration, they flank a gene-of interest bilaterally with tandem cHS4 core insulators, and co-express nuclear-localized blue fluorescent protein for identification of high expressing cells. We further demonstrate that transgenic haploid eHAP cells can be fused to form transgenic heterozygous diploid cells. This method creates diploid cells carrying the transgenic material of the haploid progenitors and could also be used to create heterozygous cells of defined genotypes. These tools expand the repertoire of experiments that can be performed in eHAP cells and other cultured cells.

Autoren: Annabel Y Minard, S. Winistorfer, R. C. Piper

Letzte Aktualisierung: 2024-04-23 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590353

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590353.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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