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Verstehen von Rifampicin-Toleranz bei TB-Bakterien

Eine Studie zeigt, wie TB-Bakterien sich an die Behandlung mit Rifampicin anpassen.

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Die Anpassung vonDie Anpassung vonTB-Bakterien anRifampicinRifampicin zu überleben.Strategien entwickeln, um gegenForschung zeigt, wie TB-Bakterien
Inhaltsverzeichnis

Tuberkulose (TB) ist eine Krankheit, die durch ein Bakterium namens Mycobacterium tuberculosis verursacht wird. Jedes Jahr gibt es etwa 10 Millionen neue TB-Fälle, die zu etwa 1,5 Millionen Todesfällen weltweit führen. TB zu behandeln kann knifflig sein, weil die Bakterien sich ändern und anpassen können, um gegen die Medikamente zu überleben, die wir verwenden. Das bedeutet, dass selbst genetisch ähnliche Bakterien unterschiedlich auf Medikamente reagieren können.

Wenn die Bakterien Antibiotika oder Stress vom Körper des Wirts ausgesetzt sind, können sie zwei Hauptverhaltensweisen entwickeln: 1) Einige Bakterien werden weniger anfällig für die Medikamente, was als Antibiotika-Toleranz bezeichnet wird, das heisst, sie werden nicht so schnell abgetötet wie andere, und 2) einige entwickeln Persistenz, wo sie in kleineren Gruppen länger überleben können im Vergleich zu denen, die leichter abgetötet werden. Diese Verhaltensweisen können sich verschlimmern, wenn die Bakterien unter Druck vom Wirt stehen oder wenn Antibiotika eingesetzt werden.

In klinischen Situationen können einige Bakterien, die empfindlich auf Antibiotika reagieren, sich trotzdem anpassen, um toleranter oder persistenter zu werden, was problematisch ist. In einigen Fällen können Veränderungen wie Mutationen auftreten, wodurch diese Bakterien schwieriger zu behandeln oder sogar resistent gegen Medikamente werden. Ein grosses Anliegen ist die Entwicklung von Resistenzen gegenüber Rifampicin, einem der wichtigsten Medikamente zur Behandlung von TB. Wenn Bakterien Resistenzen gegen sowohl Rifampicin als auch Isoniazid (ein weiteres wichtiges TB-Medikament) entwickeln, sprechen wir von multiresistenter TB (MDR TB).

Es gibt mehrere Gründe, warum Bakterien tolerant oder resistent gegen Rifampicin werden können. Dazu gehören bestimmte Mechanismen, die es den Bakterien ermöglichen, das Medikament herauszupumpen, Fehler bei der Proteinproduktion oder Variationen in der Zellgrösse und den inneren Prozessen. Diese Diversität im Wachstum der Bakterien kann auch beeinflussen, wie wir die Behandlungsrisiken und die Genesung bewerten.

Ein weiteres wichtiges Thema bei der TB-Behandlung ist die Resistenz gegen Isoniazid. Etwa 10% der TB-Fälle weltweit haben Bakterien, die gegen dieses Medikament resistent sind. Diese Resistenz zu identifizieren, ist oft herausfordernd, und resistente Bakterien führen in der Regel zu schlechteren Behandlungsergebnissen. Es besteht auch das Risiko, dass Isoniazid-resistente Bakterien später eine Resistenz gegen Rifampicin entwickeln, was zu schwereren Formen von TB führt.

Trotz der Wichtigkeit, Rifampicin-Toleranz in klinischen Bakterien zu kennen, fehlt es immer noch an Informationen über deren Verbreitung und Einfluss auf die Behandlungsoptionen. Tests auf Toleranz sind selten Teil der Routine-Diagnostik, und wir verstehen nicht vollständig, wie vorherige Isoniazid-Resistenz die Rifampicin-Toleranz beeinflusst.

Um diese Lücke zu schliessen, wurde eine neue Methode entwickelt, um die Rifampicin-Toleranz effizient zu messen. Ziel war es, eine breite Palette von klinischen Isolaten von M. tuberculosis zu analysieren, einschliesslich sowohl Isoniazid-sensibler als auch Isoniazid-resistenter Stämme. Durch die Untersuchung dieser Proben wollten wir mehr über die Rifampicin-Toleranz und deren Zusammenhang mit dem bakteriellen Wachstum und der Medikamentenresistenz erfahren.

Studienübersicht

Die Studie hatte das Ziel, die Rifampicin-Toleranz in einer grossen Anzahl klinischer M. tuberculosis-Isolate zu analysieren. Die Isolate wurden in die Gruppen Isoniazid-sensibel (IS) und Isoniazid-resistent (IR) eingeteilt. Wir setzten die Bakterien für zwei unterschiedliche Zeiträume Rifampicin aus und massen, wie viele nach mehreren Tagen überlebt haben. So konnten wir die Überlebensraten festlegen und evaluieren, wie die Bakterien auf die Behandlung reagierten.

Während des Experiments wurde Rifampicin in einer höheren Konzentration angewendet, als sie normalerweise in der Behandlung eingesetzt wird, ähnlich den Werten, die bei Patienten vorkommen. Wir bewerteten, wie gut die Bakterien über verschiedene Zeitspannen überlebten und beobachteten Variationen, wie unterschiedliche Isolate reagierten. Einige Bakterien wuchsen sogar schlecht ohne Rifampicin, was die Einschätzung ihrer Überlebensraten erschwerte.

Von 242 analysierten M. tuberculosis-Isolaten waren die meisten entweder empfindlich oder resistent gegen Isoniazid, während einige gegen sowohl Rifampicin als auch Isoniazid resistent waren. Durch die Messung der Überlebensraten nach der Exposition gegenüber Rifampicin konnten wir nachvollziehen, wie sich diese Bakterien unter Druck der Behandlung verhielten.

Rifampicin-Toleranz und Wachstumsanalyse

Wir schauten uns an, wie unterschiedliche Isolate auf die Rifampicin-Behandlung reagierten, indem wir ihre Überlebensraten über zwei verschiedene Erholungszeiten massen. Die Überlebensfraktionen wurden nach einer festgelegten Anzahl von Tagen nach der Behandlung berechnet, um zu sehen, wie viele Bakterien lebendig blieben.

Frühe Ergebnisse zeigten, dass Bakterien, die mit Rifampicin behandelt wurden, eine Reduktion ihrer Population um bis zu 90-99% erlebten. Es war wichtig, die Zeit zu berechnen, die für diese Überlebensreduktion erforderlich war, da sie angab, wie schnell die Bakterien getötet werden konnten.

Für isoniazid-sensible Isolate war die durchschnittliche Zeit, um eine Reduktion von 90% im Überleben zu erreichen, kürzer im Vergleich zu isoniazid-resistenten Isolaten während der frühen Erholungszeit. Allerdings verschob sich dieser Trend nach längerer Inkubation, was darauf hindeutet, dass innerhalb der toleranten Bakterien Subpopulationen unterschiedlich schnell wuchsen.

Als wir die Verteilung der Rifampicin-Toleranz zwischen IS- und IR-Isolaten betrachteten, fanden wir eine bemerkenswerte Variabilität, wie gut sie die Behandlung überlebten. Zum Zeitpunkt der frühen Erholung zeigten IR-Isolate signifikant höhere Überlebensraten im Vergleich zu IS-Isolaten, was auf das Vorhandensein schnell wachsender toleranter Bakterien bei IR-Fällen hindeutet.

Allerdings verblasste dieser Unterschied mit der Zeit, was darauf hinwies, dass der anfängliche Vorteil möglicherweise nicht bestand, nachdem mehr Zeit in Gegenwart von Antibiotika vergangen war. Diese Unsicherheit lenkte die Aufmerksamkeit auf die Notwendigkeit einer weiteren Analyse des Verhaltens dieser Bakterien über die Zeit.

Zusammenhang zwischen Isoniazid-Resistenz und Rifampicin-Toleranz

Eine weitere Analyse zielte darauf ab, die Beziehung zwischen Rifampicin-Toleranz und Wachstumsraten der Bakterien zu verstehen, insbesondere wie Isoniazid-Resistenz diese Faktoren beeinflussen könnte. Während wir feststellten, dass IR-Isolate generell höhere Werte für Rifampicin-Toleranz zeigten, schien dieses Verhalten sich auf schnell wachsende Bakterienpopulationen zu konzentrieren.

Bei näherer Betrachtung wurde deutlich, dass es keinen signifikanten Unterschied in der Rifampicin-Toleranz zwischen IS- und IR-Isolaten unmittelbar nach einer kurzen Behandlung gab, aber das änderte sich mit längeren Erholungszeiten. Durch die Organisation der Ergebnisse in verschiedene Kategorien bewerteten wir die Leistung von niedrigen, mittleren und hohen Rifampicin-Toleranzniveaus unter den Isolaten.

Was hervorstach, war die Beobachtung, dass die meisten Stämme mit niedriger Toleranz Isoniazid-sensibel waren, während IR-Stämme häufiger in höheren Toleranzgruppen vorkamen. Im Laufe der Zeit wurden diese Assoziationen weniger bedeutend, was auf eine unterschiedliche Reaktion zwischen den beiden Gruppen hinwies.

Wir wollten die Isolate basierend auf der Überlebensfraktion kategorisieren, um die Leistung im Vergleich zu bekannten MDR-Isolaten zu vergleichen. Die Ergebnisse zeigten, dass innerhalb der IS- und IR-Gruppen Stämme mit unerwartet hoher Toleranz gegenüber Rifampicin vorhanden waren, was Bedenken aufwarf, dass diese Stämme sich ähnlich wie echte MDR-Stämme verhalten könnten.

Wachstumsrate und genetische Faktoren

Um den Zusammenhang zwischen Wachstumsraten in Abwesenheit von Antibiotika und Rifampicin-Toleranz zu erkunden, analysierten wir, wie verschiedene klinische Isolate ohne Behandlung über die Zeit wuchsen. Überraschenderweise korrelierten langsamere Wachstumsraten nicht immer mit höherer Rifampicin-Toleranz bei IS-Isolaten.

Im Gegensatz dazu führten langsameres Wachstum in beiden Gruppen zu niedrigeren Überlebensraten während längerer Erholungszeiten, was darauf hindeutet, dass sich langsam wachsende Populationen möglicherweise als widerstandsfähigere Form der Toleranz darstellen. Besonders auffällig war, dass IR-Isolate tendenziell langsamer wuchsen als IS-Isolate, was wahrscheinlich die Kosten von Resistenzmutationen widerspiegelte.

Die Studie berücksichtigte auch, wie die MICs (Minimale Hemmkonzentrationen) von Rifampicin in Beziehung zu den Toleranzniveaus standen. Für IS-Isolate waren höhere MICs mit niedrigeren Toleranzniveaus während der längeren Erholungszeit verbunden. Bei IR-Isolaten zeigte sich jedoch keine solche Assoziation, was darauf hindeutet, dass sie sich unter Antibiotika-Druck besser anpassen könnten.

Wir untersuchten die Rolle von Isoniazid-resistenzbedingten Mutationen bei der Beeinflussung der Rifampicin-Toleranz und erkannten, dass verschiedene Mutationen zur Diversität der Antworten in klinischen Isolaten beitragen könnten. Allerdings war es schwierig, eine direkte Korrelation zwischen bestimmten Mutationen und Toleranz herzustellen, da nur wenige Isolate mit bestimmten Mutationen vorhanden waren.

Einfluss der Behandlung auf die Rifampicin-Toleranz

Die Isolate wurden über die Zeit von Patienten während ihrer TB-Behandlung gesammelt. Da das Behandlungsregime in den frühen Phasen Rifampicin beinhaltete, schauten wir uns an, wie diese Exposition möglicherweise tolerantere Bakterienstämme bei Patienten auswählen könnte.

Die Analyse von longitudinalen Proben zeigte, dass während der intensiven Behandlungsphase IR-Isolate eine höhere Rifampicin-Toleranz und Wachstumsfitness aufwiesen. Das deutete darauf hin, dass die Behandlung selbst das genetische Profil der Bakterien beeinflussen und das Auftreten toleranter Stämme fördern könnte.

Um diese Beobachtungen weiter zu validieren, kategorisierten wir Proben basierend auf dem individuellen Fortschritt der Patienten über die Zeit. Durch die Beobachtung von Veränderungen in den Rifampicin-Toleranzlevels unter Isolaten, die von denselben Patienten entnommen wurden, stellten wir fest, dass es Fälle von entweder erhöhter, verringerter oder unveränderter Toleranz gab. Diese Analyse offenbarte potenzielle genetische Verschiebungen innerhalb der bakteriellen Population aufgrund von Behandlungsdruck.

Die Identifizierung nicht-synonymer Mutationen innerhalb der Bakterien über die Zeit erlaubte uns, einen Blick darauf zu werfen, wie bestimmte genetische Veränderungen mit Variationen in der Rifampicin-Toleranz korrelieren könnten. Die Ergebnisse deuteten darauf hin, dass mehrere Gene die Toleranzniveaus beeinflussen könnten, aber diese Veränderungen waren nicht konsistent über alle Proben hinweg.

Fazit

Diese Studie zeigt bedeutende Assoziationen zwischen Isoniazid-Resistenz und Rifampicin-Toleranz in klinischen M. tuberculosis-Isolaten auf. Wir entdeckten ein breites Spektrum an Rifampicin-Toleranzlevels, wobei einige Stämme Verhaltensweisen zeigten, die denen resistenter Bakterien ähneln.

Die Forschung betont die Wichtigkeit, die unterschiedlichen Reaktionen von bakteriellen Populationen auf Antibiotikabehandlungen zu berücksichtigen, wenn man effektive TB-Regime plant. Es wird angedeutet, dass das Verständnis der Dynamik von Toleranz und Resistenz helfen kann, die Behandlungsstrategien für Patienten mit TB zu verbessern.

Angesichts der Komplexität des bakteriellen Verhaltens als Reaktion auf Medikamente wird zukünftige Forschung entscheidend sein, insbesondere in Bezug darauf, wie Behandlungsregime die bakterielle Evolution und das Auftreten resistenter Stämme beeinflussen. Das Verständnis dieser Faktoren wird wichtig sein, um bessere Ansätze zur TB-Bewältigung zu entwickeln und letztendlich die Ergebnisse für die Patienten zu verbessern.

Originalquelle

Titel: Rifampicin tolerance and growth fitness among isoniazid-resistant clinical Mycobacterium tuberculosis isolates: an in-vitro longitudinal study

Zusammenfassung: Antibiotic tolerance in Mycobacterium tuberculosis leads to less effective bacterial killing, poor treatment responses and resistant emergence. Therefore, we investigated the rifampicin tolerance of M. tuberculosis isolates, with or without pre-existing isoniazid-resistance. We determined the in-vitro rifampicin survival fraction by minimum duration of killing assay in isoniazid susceptible (IS, n=119) and resistant (IR, n=84) M. tuberculosis isolates. Then we correlated the rifampicin tolerance with bacterial growth, rifampicin minimum inhibitory concentrations (MICs) and isoniazid-resistant mutations. The longitudinal IR isolates collected from patients were analyzed for changes in rifampicin tolerance and associated emergence of genetic variants. The median duration of rifampicin exposure reducing the M. tuberculosis surviving fraction by 90% (minimum duration of killing-MDK90) increased from 1.23 (95%CI 1.11; 1.37) and 1.31 (95%CI 1.14; 1.48) to 2.55 (95%CI 2.04; 2.97) and 1.98 (95%CI 1.69; 2.56) days, for IS and IR respectively, during 15 to 60 days of incubation. This indicated the presence of fast and slow growing tolerant sub-populations. A range of 6 log10-fold survival fraction enabled classification of tolerance as low, medium or high and revealed IR association with increased tolerance with faster growth (OR=2.68 for low vs. medium, OR=4.42 for low vs. high, P-trend=0.0003). The high tolerance in IR isolates was specific to those collected during rifampicin treatment in patients and associated with bacterial genetic microvariants. Furthermore, the high rifampicin tolerant IR isolates have survival potential similar to multi-drug resistant isolates. These findings suggest that IR tuberculosis needs to be evaluated for high rifampicin tolerance to improve treatment regimen and prevent the risk of MDR-TB emergence.

Autoren: Nguyen TT Thuong, V. Srinivasan, N. L. H. Bao, D. N. Vinh, N. Thanh Hoang Le, D. D. Thu, N. L. Quang, L. P. T. Trieu, H. N. Nhung, V. T. N. Ha, P. V. K. Thai, D. T. M. Ha, N. H. Lan, M. Caws, G. E. Thwaites, B. Javid

Letzte Aktualisierung: 2024-05-04 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.11.22.568240

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2023.11.22.568240.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

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