Automatisierung der Erkennung von Hautkrankheitsmustern
Ein neues System hilft Dermatologen dabei, Hautmuster mit maschinellem Lernen zu erkennen.
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Inhaltsverzeichnis
In der Dermatologie ist es super wichtig, Hautkrankheiten genau zu erkennen und zu beschreiben, um die richtige Diagnose zu stellen. Mit der steigenden Anzahl an Bilddaten wird die manuelle Überprüfung von Bildern unpraktisch. Dieser Artikel diskutiert eine Methode, um wichtige Muster in Hautbildern mithilfe einer Kombination aus Computeralgorithmen und maschinellem Lernen automatisch zu entdecken.
Hintergrund
Die Dermatoskopie ist eine Technik, die genutzt wird, um Hautläsionen genauer zu untersuchen. Im Laufe der Jahre wurden viele Muster dokumentiert, die mit verschiedenen Hautzuständen verbunden sind. Früher wurden diese Muster von Ärzten manuell identifiziert. Mit der zunehmenden Anzahl an Bildern wird dieser manuelle Ansatz jedoch zu einer überwältigenden Arbeitslast für die Gesundheitsfachkräfte, was es schwierig macht, die Genauigkeit aufrechtzuerhalten.
Neurale Netzwerke, insbesondere eine Art davon, die Faltungsneuralnetzwerke (CNNs), haben sich als nützliche Werkzeuge zur Klassifizierung medizinischer Bilder herausgestellt. Forschungen zeigen, dass diese Netzwerke die Genauigkeit von Dermatologen in experimentellen Umgebungen erreichen oder sogar übertreffen können. Sie können Bilder analysieren und Merkmale automatisch identifizieren, was bei der Bildklassifizierung und -wiederherstellung hilft.
Diese Studie zielt darauf ab, ein automatisiertes System zu entwickeln, das bedeutende visuelle Muster aus dermatoskopischen Bildern von Hauttumoren extrahiert. Dieses Tool soll Gesundheitsfachkräften helfen, indem es interpretierbare Daten für Diagnosen liefert.
Methodik
Datensammlung
Für die Studie wurde ein vorhandenes öffentliches Datenset namens HAM10000 verwendet. Dieses Datenset enthält Bilder von 10.015 Hautläsionen, mit Anmerkungen zu deren Diagnosen und dem Layout der Läsion. Statt die gesamten Bilder zu analysieren, konzentrierten sich die Forscher auf kleinere Abschnitte, sogenannte Tiles. Durch das Zerlegen der Bilder in 128x128 Pixel grosse Tiles konnten sie spezifische Merkmale in den Läsionen isolieren.
Insgesamt wurden 29.420 Tiles für die Analyse extrahiert. Um eine ausgewogene Vertretung der verschiedenen Diagnosen sicherzustellen, wurde eine zufällige Auswahl getroffen.
Training des Neuronalen Netzwerks
Ein spezieller Typ eines neuronalen Netzwerks, genannt VGG16, wurde zur Klassifizierung der Hautläsion-Tiles in sieben Kategorien von Hautzuständen verwendet. Das Modell wurde mit 70 % der gesamten Tiles trainiert, während 30 % für Tests reserviert blieben. Dieses Training war darauf ausgelegt, Merkmale aus den Tiles zu extrahieren, statt die höchste Vorhersagegenauigkeit zu erreichen.
Es wurden Techniken zur Datenaugmentation während des Trainings angewendet, um Vielfalt in den Eingabedaten zu schaffen. Diese Techniken umfassten das Drehen und Spiegeln der Bilder. Nach dem Training wurden Merkmale aus den Tiles gewonnen, was den Forschern eine effektivere Analyse der Bilder ermöglichte.
Muster-Clustering
Um ähnliche Muster aus den extrahierten Merkmalen zu finden und zu gruppieren, wurde eine Clustering-Technik namens K-Means verwendet. K-Means hilft dabei, natürliche Gruppen in Daten zu identifizieren. Die Forscher entwickelten zwei Methoden, um die Anzahl der Cluster zu bestimmen: die Ellenbogenmethode und eine benutzerdefinierte Kompaktitätsmetrik. Die Ellenbogenmethode identifiziert Cluster basierend auf der Varianz, während die Kompaktitätsmetrik dafür konzipiert wurde, die Gruppierung zu verfeinern, indem sie Cluster relevant und informativ hält.
Das Ziel war, Cluster beizubehalten, die für die menschliche Interpretation sinnvoll wären, während redundante Muster, die keinen Mehrwert bieten, minimiert wurden.
Ergebnisse
Die Ergebnisse zeigten deutliche Unterschiede zwischen den beiden Clustering-Methoden. Mit der Ellenbogenmethode wurde im Durchschnitt 24,7 Cluster für jede Diagnose erstellt, wobei ein erheblicher Teil uninformativ war. Im Gegensatz dazu lieferte die Kompaktitätsmethode weniger Cluster – durchschnittlich etwa 13,4 – und einen deutlich geringeren Prozentsatz uninformativiger Cluster.
Die meisten durch die Kompaktitätsmethode generierten Cluster konnten mit bekannten diagnostischen Mustern aus der bestehenden Literatur verknüpft werden. Das deutete darauf hin, dass das Modell in der Lage war, wichtige visuelle Merkmale in Hautläsionen zu identifizieren.
Auswirkungen auf die klinische Praxis
Die Forschung hat gezeigt, dass eine automatisierte Analyse Ärzten effektiv helfen kann, wichtige Muster in Hautläsionen zu erkennen. Die entstehenden Cluster dienen als Werkzeug für Ärzte und Forscher, um diagnostische Muster zu überprüfen und zu interpretieren.
Die Kompaktitätsmetrik zeigte vielversprechende Ansätze, um die Menge an präsentierten Daten zu optimieren, was in einer klinischen Umgebung wertvoll ist. Während die Genauigkeit des Modells bei der Identifizierung spezifischer Erkrankungen als eigenständiges Tool nicht garantiert ist, bietet es eine effektive Unterstützung.
Herausforderungen und Einschränkungen
Trotz der Vorteile stiess die Studie auch auf Herausforderungen. Die Methode zeigte Einschränkungen bei der Klassifizierung seltener Hauterkrankungen, was darauf hindeutet, dass es möglicherweise Verzerrungen im Datensatz im Zusammenhang mit solchen Krankheiten gibt. Das hebt hervor, dass Forscher die Diversität der Erkrankungen beim Training von Algorithmen berücksichtigen müssen.
Zusätzlich war es oft nicht ausreichend, ein einzelnes Muster zur Beschreibung einer Läsion zu finden, was die Notwendigkeit für mehrere Muster zeigte und die Komplexität der Manifestationen von Hautkrankheiten verdeutlichte. Dies könnte darauf hinweisen, dass zukünftige Studien sich darauf konzentrieren sollten, mehrere Merkmale bei der Analyse von Hautläsionen zu kombinieren.
Zukünftige Richtungen
Angesichts der vielversprechenden Ergebnisse ist es wichtig, dass zukünftige Forschungen die Anwendung dieser Methode erweitern. Das Testen des Modells an nicht-pigmentierten Tumoren und anderen Demografien, einschliesslich dunklerer Hauttypen, würde einen umfassenderen Blick auf die Fähigkeiten bieten.
Darüber hinaus sollten Forscher erkunden, wie diese Techniken über verschiedene Bildgebungsmodalitäten hinweg, einschliesslich Dermatopathologie und klinischen Bildern, eingesetzt werden können. Das könnte die Mustererkennung in breiteren medizinischen Anwendungen erheblich verbessern und die diagnostischen Prozesse optimieren.
Fazit
Zusammenfassend zeigt das automatisierte System, das in dieser Studie entwickelt wurde, erhebliches Potenzial, um Dermatologen bei der Erkennung wichtiger Hautmuster zu unterstützen. Durch den Einsatz von maschinellem Lernen und fortschrittlichen Clustering-Techniken könnten Gesundheitsfachkräfte effizienter bei der Diagnose von Hautkrankheiten werden und so die Patientenversorgung verbessern.
Die Ergebnisse unterstreichen die Bedeutung der Integration von Technologie in medizinische Praktiken, die die Belastung durch Datenüberflutung verringern und die Qualität der diagnostischen Prozesse in der Dermatologie verbessern kann. Mit der Weiterentwicklung des Feldes könnten solche Methoden schliesslich ein integraler Bestandteil der Routinepraxis werden und die Art und Weise, wie Hautkrankheiten diagnostiziert und behandelt werden, grundlegend verändern.
Titel: Automated dermatoscopic pattern discovery by clustering neural network output for human-computer interaction
Zusammenfassung: Background: As available medical image datasets increase in size, it becomes infeasible for clinicians to review content manually for knowledge extraction. The objective of this study was to create an automated clustering resulting in human-interpretable pattern discovery. Methods: Images from the public HAM10000 dataset, including 7 common pigmented skin lesion diagnoses, were tiled into 29420 tiles and clustered via k-means using neural network-extracted image features. The final number of clusters per diagnosis was chosen by either the elbow method or a compactness metric balancing intra-lesion variance and cluster numbers. The amount of resulting non-informative clusters, defined as those containing less than six image tiles, was compared between the two methods. Results: Applying k-means, the optimal elbow cutoff resulted in a mean of 24.7 (95%-CI: 16.4-33) clusters for every included diagnosis, including 14.9% (95% CI: 0.8-29.0) non-informative clusters. The optimal cutoff, as estimated by the compactness metric, resulted in significantly fewer clusters (13.4; 95%-CI 11.8-15.1; p=0.03) and less non-informative ones (7.5%; 95% CI: 0-19.5; p=0.017). The majority of clusters (93.6%) from the compactness metric could be manually mapped to previously described dermatoscopic diagnostic patterns. Conclusions: Automatically constraining unsupervised clustering can produce an automated extraction of diagnostically relevant and human-interpretable clusters of visual patterns from a large image dataset.
Autoren: Lidia Talavera-Martinez, Philipp Tschandl
Letzte Aktualisierung: 2023-09-15 00:00:00
Sprache: English
Quell-URL: https://arxiv.org/abs/2309.08533
Quell-PDF: https://arxiv.org/pdf/2309.08533
Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.
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