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# Biologie# Zellbiologie

Neue Erkenntnisse zur Chromosomenstruktur während der Teilung

Forscher zeigen, wie Chromosomen ihre Form während der Zellteilung mit fortschrittlichen Bildgebungstechniken verändern.

Jan Ellenberg, K. S. Beckwith, A. Brunner, N. Morero, R. Jungmann

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Wenn eine Zelle sich teilt, verändern sich die Chromosomen. Sie werden kompakt und steif, was ihnen hilft, sich in neue Zellen zu trennen. Dieser normale Prozess hängt von speziellen Proteinen ab, die als Condensins bekannt sind. Wissenschaftler haben sich diese Proteine genau angesehen, um zu erklären, wie Chromosomen während der Teilung aufgebaut sind.

Forscher haben fortschrittliche Bildgebungstechniken verwendet, um Condensins in einzelnen Zellen und Zellgruppen zu studieren. Sie haben vorgeschlagen, dass Chromosomen in Schleifen gefaltet sind, wobei grössere Schleifen in kleinere aufgeteilt werden. Frühere Studien haben auf diese schleifenartige Organisation hingewiesen, aber es war schwierig, sie direkt zu sehen, weil die DNA in Chromosomen dicht gepackt ist. Die innere Struktur der Chromosomen während des Teilungsprozesses ist immer noch nicht ganz verstanden.

Neueste Fortschritte in der fluoreszierenden DNA-Verfolgung haben es möglich gemacht, zu visualisieren, wie DNA in einzelnen Zellen organisiert ist. Diese Methode wurde bisher noch nicht an Chromosomen während der Zellteilung eingesetzt. Ein neuer Ansatz namens LoopTrace hilft den Forschern, wie Chromosomen während der Teilungsphase gefaltet und gepackt werden, zu studieren.

Chromosomen vom Anfang bis zum Ende visualisieren

Um einen klaren Blick darauf zu bekommen, wie Chromosomen von einer Phase zur anderen wechseln, haben Wissenschaftler spezielle Probenbibliotheken entworfen, die gesamte menschliche Chromosomen nachverfolgen. Sie konzentrierten sich darauf, spezifische Segmente von Chromosomen mit unterschiedlichen Auflösungen zu verfolgen.

Nachdem sie ihre Methoden zur DNA-Verfolgung verbessert hatten, konnten die Forscher die Organisation der Chromosomen festhalten, während die Zellen sich von einer Ruhephase in eine Teilungsphase bewegten. Sie stellten fest, dass die Chromosomen in der Interphase als separate, deutliche Regionen innerhalb des Zellkerns erschienen. Strukturen, die als DNA-Schleifen bekannt sind, waren ebenfalls sichtbar und bestätigten frühere Erkenntnisse. Allerdings verschwanden die kleineren Schleifen, als die Zellen in die Teilungsphase eintraten. Stattdessen entwickelten sich längere und komplexere DNA-Schleifen.

Als die Chromosomen die verschiedenen Phasen der Teilung durchliefen, begannen sie, unterschiedliche Formen anzunehmen. In den frühen Phasen waren sie verstreuter und gebogen, wurden aber gleichmässiger und kompakter, während sie fortschritten. In der finalen Phase der Teilung hatten die Chromosomen eine feste, stabähnliche Form.

Veränderungen in der Chromosomenstruktur analysieren

Die detaillierten 3D-Aufzeichnungen von Chromosomen aus vielen sich teilenden Zellen ermöglichten es den Forschern, zu untersuchen, wie sich die Struktur der DNA während der Teilung entwickelte. Sie schauten sich Merkmale wie die Anzahl der Schleifen, deren Grössen und wie sie ineinander verschachtelt waren, an. Ausserdem untersuchten sie die allgemeine Form der Chromosomen.

Während der Zellteilung beobachteten die Forscher, dass die Anzahl und Grösse der Schleifen signifikant zunahmen. Dieser Anstieg begann früh im Prozess und setzte sich fort, als die Zellen in spätere Teilungsstadien übergingen. Interessanterweise begann sich auch die Art und Weise, wie die Schleifen miteinander verschachtelt waren, zu ändern, was half zu erklären, wie die Chromosomen kompakter wurden.

Die Forscher stellten fest, dass diese Verdichtung grösstenteils durch die Aktivität der Condensins getrieben wurde, die sich an die DNA binden und bei der Bildung dieser Schleifen helfen. Die Grösse der Schleifen und wie sie miteinander verschachtelt waren, waren entscheidend für die Kompaktheit der Chromosomen insgesamt.

Schlüsselmerkmale der Chromosomenstruktur

Einer der wichtigen Aspekte beim Studieren von Chromosomen ist zu verstehen, wie ihre Struktur auf höheren Ebenen aussieht. Die Forscher fanden kein einheitliches Muster der Organisation auf verschiedenen Skalen. Stattdessen waren die Schleifen relativ zur Hauptachse der Chromosomen eher zufällig angeordnet.

Die Art und Weise, wie sich der Abstand zwischen den DNA-Abschnitten während der verschiedenen Phasen der Teilung änderte, gab weitere Einblicke. Die Forscher bemerkten, dass die Chromosomen, wie erwartet, kompakter wurden, aber auch, dass bestimmte Regionen weniger dicht erschienen. Diese ungleichmässige Organisation machte deutlich, dass die Chromosomen sich nicht einfach komprimierten, sondern sich auch auf komplexe Weise änderten.

Die Rolle der Condensins in der Chromosomenstruktur

Das Vorhandensein spezifischer Schleifen während der Zellteilung ist eng mit den Aktivitäten der Condensins verbunden. Um das weiter zu untersuchen, schauten die Forscher, was passiert, wenn sie die Anzahl der in den Zellen vorhandenen Condensins reduzierten. Sie fanden heraus, dass sich die Struktur der Chromosomen signifikant änderte, wenn weniger Condensins vorhanden waren.

Ohne genügend Condensins waren die Schleifen weniger deutlich, und die Gesamtform der Chromosomen wurde unregelmässig. Auch die Fähigkeit der Chromosomen, sich richtig zu komprimieren, war betroffen. Die beobachteten strukturellen Merkmale hingen stark vom Vorhandensein dieser Proteine ab. Das deutete auf die wichtige Rolle hin, die Condensins dabei spielen, dass Chromosomen während der Teilung ihre richtige Struktur beibehalten.

Wie Chromosomen ihre Formen bilden

Die Forscher untersuchten, wie die Kombination aus DNA-Schleifenbildung und dem Vorhandensein verschiedener Proteine zu den einzigartigen Formen der Chromosomen führen könnte. Sie richteten Simulationen ein, basierend auf ihren Beobachtungen, um zu sehen, wie diese Strukturen entstehen könnten. Ihre Daten zeigten, dass die Art und Weise, wie Condensins arbeiten, zu den stabähnlichen Formen führt, die in sich teilenden Chromosomen zu sehen sind.

Die Simulationen zeigten, dass die Bildung von überlappenden Schleifen entscheidend für die Form der Chromosomen ist. Dieser Prozess geschieht, weil diese Schleifen miteinander interagieren. Das Vorhandensein vieler überlappender Schleifen hilft auch, die Gesamtstruktur der Chromosomen aufrechtzuerhalten, selbst wenn sich die Bedingungen ändern.

Auswirkungen von Chromatinmodifikationen

Neben der Rolle der Condensins können Veränderungen in Chromatinmodifikationen beeinflussen, wie Chromosomen sich organisieren. Zum Beispiel können einige Modifikationen den Widerstand zwischen DNA-Abschnitten erhöhen und beeinflussen, wie fest sie zusammengedrückt werden können. Die Forscher modellierten, wie diese Änderungen die Gesamtform der Chromosomen beeinflussten.

Als sie diese Modifikationen einführten, beobachteten sie, dass die Chromosomen weniger kompakt wurden, was mit ihren Vorhersagen übereinstimmte. Diese Erkenntnis bestätigte die Idee, dass der Zustand des Chromatins eine wichtige Rolle bei der richtigen Organisation der Chromosomen während der Zellteilung spielt.

Fazit

Diese Forschung liefert neue Einblicke, wie sich Chromosomen während der Zellteilung verwandeln. Durch die direkte Visualisierung ihrer Struktur und die Verwendung von Computermodellen zur Simulation ihres Verhaltens haben die Forscher zusammengetragen, wie Chromosomen ihre markanten Formen und Kompaktheit erreichen.

Die Ergebnisse heben die Bedeutung von Condensins in diesem Prozess hervor und zeigen, wie sie helfen, die notwendigen Schleifen und das Packen zu erzeugen. Ausserdem zeigt die Studie, wie Chromatinmodifikationen die strukturelle Integrität der Chromosomen verändern können. Diese Mechanismen zu verstehen, ist entscheidend, um zu begreifen, wie Zellen sicherstellen, dass das genetische Material während der Teilung genau verteilt wird, ein fundamentales Konzept der Biologie.

Originalquelle

Titel: Nanoscale 3D DNA tracing reveals the mechanism of self-organization of mitotic chromosomes

Zusammenfassung: How genomic DNA is folded during cell division to form the characteristic rod-shaped mitotic chromosomes essential for faithful genome inheritance is a long-standing open question in biology. Here, we use nanoscale DNA-tracing in single dividing cells to directly visualize how the 3D fold of genomic DNA changes during mitosis, at scales from single loops to entire chromosomes. Our structural analysis reveals a characteristic genome scaling minimum at 6-8 Mbp in mitosis. Combined with data-driven modeling and molecular perturbations, we can show that very large and strongly overlapping loops formed by Condensins are the fundamental structuring principle of mitotic chromosomes. These loops compact chromosomes locally and globally to the limit set by chromatin self-repulsion. The characteristic length, density and increasingly overlapping structure of mitotic loops we observe in 3D, fully explain how the rod-shaped mitotic chromosome structure emerges by self-organization during cell division.

Autoren: Jan Ellenberg, K. S. Beckwith, A. Brunner, N. Morero, R. Jungmann

Letzte Aktualisierung: 2024-10-29 00:00:00

Sprache: English

Quell-URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.28.620625

Quell-PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.28.620625.full.pdf

Lizenz: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Änderungen: Diese Zusammenfassung wurde mit Unterstützung von AI erstellt und kann Ungenauigkeiten enthalten. Genaue Informationen entnehmen Sie bitte den hier verlinkten Originaldokumenten.

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