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# Biologia# Bioquímica

Novo Método Revela Interações de Proteínas com a Curvatura da Membrana

Pesquisadores desenvolvem uma técnica pra estudar como as proteínas se ligam a diferentes formas de membranas.

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Células eucarióticas, que incluem células humanas e de outros organismos complexos, têm membranas únicas. Essas membranas podem ter várias formas e tamanhos, desde tubos longos até sacos pequenos e curvados. O jeito que essas membranas se curvam e mudam ajuda na recrutação e ativação de Proteínas, que são essenciais para realizar diferentes tarefas dentro da célula.

Quando falamos sobre curvatura de membrana, é importante notar que as proteínas na célula precisam conseguir detectar essas curvas. Existem várias proteínas que ajudam a formar essas estruturas curvadas e elas desempenham papéis vitais em separar ou juntar esses sacos. Portanto, métodos que conseguem medir como as proteínas interagem com diferentes formas de membranas podem nos ajudar a entender mais sobre suas funções.

O Desafio de Medir a Curvatura da Membrana

Para descobrir como as proteínas reagem a diferentes formas de membranas, os pesquisadores precisam criar estruturas esféricas pequenas chamadas Lipossomos. Porém, fazer lipossomos do mesmo tamanho pode ser complicado. O método comum usado para produzir lipossomos, espremendo os maiores através de filtros, só permite tamanhos limitados, o que pode complicar os resultados.

Para resolver esse problema, os pesquisadores estão buscando novas maneiras de criar lipossomos de formas e tamanhos específicos ou testar como as proteínas interagem com uma variedade de tamanhos. Isso levou ao desenvolvimento de várias técnicas para avaliar como as proteínas respondem a diferentes curvaturas de membranas.

Um Novo Método para Medir Propriedades de Membranas

Uma nova técnica foi introduzida que permite aos cientistas rastrear lipossomos individuais e calcular seus tamanhos com base em seu movimento em um líquido. Esse método usa um instrumento especial que utiliza luz para visualizar os lipossomos enquanto se movem. Com isso, os pesquisadores conseguem determinar a quais lipossomos as proteínas se ligam e estudar como essas proteínas alteram as formas das membranas.

Usando essa abordagem, os cientistas podem replicar como certas proteínas reagem a várias curvaturas de membranas e como elas mudam as formas das membranas. Isso ajudou a identificar novos domínios de proteínas que são sensíveis à curvatura das membranas e aqueles que podem mudar suas formas.

Como Esse Método Funciona

Esse método inovador mede como os lipossomos interagem com as proteínas. Um grupo de lipossomos de tamanhos variados é misturado com proteínas rotuladas fluorescentemente. Os cientistas analisam as diferenças de tamanho entre a população total de lipossomos e aqueles que estão ligados às proteínas. Essa comparação revela se há preferência por lipossomos menores ou maiores.

Os resultados dessas comparações podem ser mostrados em formatos visuais simples chamados gráficos de caixa, que mostram o ponto central dos dados de tamanho e como eles se espalham. Essa visualização permite uma avaliação fácil das preferências de curvatura para cada proteína testada.

Testando Respostas de Proteínas à Curvatura

Várias proteínas específicas conhecidas por responder à curvatura da membrana foram examinadas usando esse método. Essas proteínas, conhecidas como domínios BAR, foram testadas quanto às suas preferências em se ligar a diferentes tamanhos de lipossomos. Os resultados mostraram padrões distintos de ligação, com algumas proteínas preferindo lipossomos menores, enquanto outras não mostraram preferência nenhuma.

Usando essa técnica, os pesquisadores puderam determinar com precisão como diferentes proteínas interagiam com lipossomos e como sua estrutura influenciava suas preferências de ligação.

A Importância da Composição Lipídica

Para entender completamente como as proteínas se ligam aos lipossomos, o tipo de lipídios usados para criar as membranas é crucial. Diferentes tipos de lipídios podem impactar a ligação das proteínas, e os pesquisadores descobriram que ajustar os tipos de lipídios pode influenciar significativamente os resultados.

Através da seleção cuidadosa de combinações de lipídios, as proteínas puderam ser testadas de forma mais eficaz, revelando suas preferências de ligação a lipossomos de diferentes tamanhos.

Examinando Vesiculação e Mudanças na Membrana

Uma vantagem adicional dessa técnica é sua capacidade de monitorar mudanças na estrutura da membrana, conhecidas como vesiculação. Os pesquisadores investigaram uma proteína específica, o domínio ENTH da Epsin1, que é conhecida por induzir mudanças na membrana. Ao examinar como essa proteína afetou o tamanho e a concentração dos lipossomos, eles puderam detectar o processo de vesiculação.

O estudo demonstrou como a concentração da proteína ENTH afetou o tamanho dos lipossomos, mostrando uma relação clara entre a quantidade de proteína e a extensão das mudanças na membrana.

Sensing vs. Geração de Curvatura

As proteínas eucarióticas que sentem e criam curvatura nas membranas geralmente fazem os dois ao mesmo tempo. A capacidade de diferenciar entre essas duas funções pode ser desafiadora com métodos tradicionais.

No entanto, essa nova técnica permite que os cientistas meçam como as proteínas respondem às membranas sem o risco de alterar as membranas propriamente ditas. Isso oferece insights mais claros sobre os papéis únicos que diferentes proteínas desempenham.

Por exemplo, uma proteína chamada Endofilina foi estudada em detalhes. Descobriu-se que ela tinha uma forte preferência por certas formas de membrana, e alterar sua estrutura revelou mais sobre como ela se liga a lipossomos de vários tamanhos.

Conclusão

Esse método inovador oferece oportunidades empolgantes para estudar como as proteínas interagem com membranas celulares. Usando uma abordagem simples e eficiente, os pesquisadores podem obter insights valiosos sobre as preferências de várias proteínas diferentes e como elas contribuem para o funcionamento das células.

Com mais exploração e desenvolvimento dessa técnica, há potencial para aprofundar nossa compreensão do complexo mundo da biologia de membranas, levando a avanços na pesquisa e possíveis aplicações terapêuticas.

Fonte original

Título: A single particle analysis method for detecting membrane remodelling and curvature sensing.

Resumo: In biology, shape and function are related. Therefore, it is important to understand how membrane shape is generated, stabilised and sensed by proteins and how this relates to organelle function. Here we present an assay that can detect curvature preference and membrane remodelling using free-floating liposomes using protein concentrations in a physiologically relevant ranges. The assay reproduced known curvature preferences of BAR domains and allowed the discovery of high curvature preference for the PH domain of AKT and the FYVE domain of HRS. In addition, our method reproduced the membrane vesiculation activity of the ENTH domain of Epsin1 and showed similar activity for the ANTH domains of PiCALM and Hip1R. Finally, we found that the curvature sensitivity of the N-BAR domain of Endophilin inversely correlates to membrane charge and that deletion of its N-terminal amphipathic helix increased its curvature specificity. Thus, our method is a generally applicable qualitative method for assessing membrane curvature sensing and remodelling by proteins.

Autores: Leonardo Almeida-Souza, A. Colussi, H. McMahon

Última atualização: 2024-04-09 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.09.588706

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.09.588706.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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