A Ascensão dos Preprints na Pesquisa Científica
Os preprints estão mudando a forma como os pesquisadores compartilham e acessam descobertas nas ciências da vida.
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Tradicionalmente, os cientistas compartilham suas descobertas publicando artigos em revistas. Esse processo pode ser demorado e cheio de problemas. Pode levar meses, ou até anos, para uma pesquisa ser publicada. Os autores têm que lidar com altos custos para publicar seu trabalho e para os leitores terem acesso a ele. Se um artigo submetido for rejeitado, o autor tem que gastar mais tempo procurando outra revista. Além disso, as decisões de avaliação podem ser influenciadas por preconceitos pessoais. Erros em Pesquisas publicadas podem ser difíceis de corrigir, o que às vezes causa confusão na comunidade científica.
Preprints oferecem uma solução para algumas dessas questões. Um preprint é um manuscrito completo compartilhado pelos autores em uma plataforma pública antes de passar pela revisão por pares da revista. Eles têm muitos benefícios, incluindo comunicação mais rápida e sem custos para os leitores acessarem. Também dão aos autores uma maneira de receber feedback antecipado e aumentar a visibilidade de seu trabalho antes de ser formalmente publicado em uma revista.
Enquanto os preprints são comuns em áreas como física há muitos anos, ainda são uma opção nova nas ciências da vida. Em 2016, menos de 1% dos artigos de ciências da vida eram preprints. A introdução de plataformas especializadas de preprints para ciências da vida ajudou a aumentar seu uso na comunidade. Mudanças nas políticas de editores e organizações de Financiamento também incentivaram os pesquisadores a compartilhar preprints. Muitas agências de financiamento agora consideram preprints durante as decisões de financiamento e promovem a publicação deles antes da publicação em revistas.
Desde 2016, o número de preprints em ciências da vida cresceu significativamente. Entre 2016 e 2018, os preprints nessa área estavam crescendo muito mais rápido que os artigos de revistas. Em 2023, eles representavam mais de 12% dos resultados totais de pesquisa em ciências da vida.
COVID-19 nos Preprints
Impacto daOs preprints se tornaram ainda mais importantes durante a pandemia de COVID-19. Compartilhar rapidamente os resultados de pesquisa foi crucial para a saúde pública. Várias organizações incentivaram o compartilhamento aberto imediato de estudos relacionados à COVID-19. No início da pandemia, os preprints representavam mais de 30% da pesquisa publicada sobre COVID-19. Esse compartilhamento rápido foi possível devido ao fato de que os preprints demandam menos tempo em comparação com publicações tradicionais.
Durante a pandemia, muitas editoras também ajustaram seus processos para apoiar a rápida publicação de pesquisas sobre COVID-19. Elas aceleraram as revisões por pares e permitiram acesso gratuito a muitos estudos. Várias agências de financiamento promoviam os preprints e exigiam que os pesquisadores compartilhassem suas descobertas nesse formato antes da publicação formal.
Apesar da importância deles, encontrar preprints pode ser desafiador. Eles costumam estar espalhados por várias plataformas, dificultando o acesso e o reuso em comparação com artigos de revistas tradicionais. Mais de 60 servidores de preprint focam em conteúdo biomédico e médico, mas muitos mecanismos de busca não cobrem todos eles bem. Algumas ferramentas de descoberta carecem dos recursos necessários para que os pesquisadores encontrem facilmente os preprints ou permitam downloads em massa para análises posteriores.
Reconhecendo esse problema, o Europe PMC começou a indexar preprints de ciências da vida em 2018. O Europe PMC é uma plataforma de ciência aberta que fornece acesso à literatura científica, incluindo preprints. É apoiada por vários financiadores de ciência e oferece acesso gratuito a uma ampla gama de literatura. Em 2020, o Europe PMC aprimorou sua cobertura de preprints indexando preprints sobre COVID-19, tornando o texto completo facilmente acessível para análises de texto-mining.
Como o Europe PMC Lida com Preprints
O Europe PMC inclui preprints de servidores que atendem a critérios específicos. Esses critérios garantem que os servidores sejam confiáveis e tenham uma quantidade significativa de conteúdo de ciências da vida. Para um servidor ser incluído, ele deve ter pelo menos 30 preprints e um procedimento claro para triagem de submissões. Isso ajuda a manter a qualidade e a integridade dos preprints compartilhados.
O Europe PMC coleta resumos e metadados de servidores de preprints diariamente. Ele usa um processo automatizado para recuperar conteúdo relevante e atribui um identificador único a cada preprint. Essa abordagem estruturada ajuda na indexação e na exibição eficaz dos preprints.
Quando os preprints dizem respeito à COVID-19 ou são financiados por determinadas organizações, o Europe PMC disponibiliza o texto completo. Esse texto é convertido em um formato padrão para facilitar buscas e análises adicionais. Preprints com licença Creative Commons permitem uso e compartilhamento irrestritos para fins de pesquisa.
O Europe PMC também acompanha versões de preprints. Ele conecta preprints aos seus correspondentes artigos de revistas quando disponíveis. Isso é feito usando identificadores e combinando títulos e autores. Se um preprint for atualizado ou retirado, o Europe PMC refletirá essas mudanças em seus registros, fornecendo aos usuários as informações mais recentes.
Benefícios de Incluir Preprints no Europe PMC
Indexar preprints no Europe PMC traz várias vantagens. Isso torna os preprints mais visíveis e permite que os pesquisadores os encontrem facilmente junto aos artigos de revistas. Isso pode levar a revisões de literatura mais abrangentes e a uma melhor compreensão do panorama da pesquisa.
Os preprints também oferecem uma chance de inovação na publicação e na revisão por pares. Eles permitem experimentação com diferentes maneiras de avaliar pesquisas. As revistas podem adotar modelos de publicação alternativos que incluam preprints, possibilitando uma interação mais dinâmica entre autores, revisores e leitores.
Construir confiança nos preprints é crucial, já que eles não passam pelo mesmo processo de revisão por pares que os artigos de revistas. O Europe PMC visa melhorar a credibilidade dos preprints, garantindo que apenas aqueles que atendem aos padrões sejam incluídos. Também fornece informações sobre quaisquer revisões ou avaliações que os preprints tenham recebido, ajudando os leitores a avaliar a qualidade da pesquisa.
Para apoiar a inclusão de preprints nos fluxos de trabalho de pesquisa, o Europe PMC oferece recursos para citação, informações de financiamento e links para dados de pesquisa relacionados. Os pesquisadores podem citar preprints facilmente e garantir que sejam reconhecidos na comunidade acadêmica. Isso promove um ambiente de pesquisa mais transparente e responsável.
Abordando Desafios com Preprints
Apesar de sua popularidade crescente, ainda existem desafios para gerenciar os preprints de forma eficaz. A diversidade de servidores de preprints pode dificultar a recuperação e padronização de metadados pelo Europe PMC. Por exemplo, nem todas as plataformas de preprint fornecem as informações necessárias para a indexação. Isso pode limitar sua inclusão no Europe PMC.
Outro desafio é a variabilidade nas práticas entre os diferentes servidores de preprints. Cada servidor pode ter métodos diferentes para lidar com versões de preprints, incluindo como atribuem identificadores. Alguns deles podem não fornecer atualizações legíveis por máquina sobre o status dos preprints, complicando o rastreamento de mudanças.
Além disso, questões de licenciamento podem restringir como os preprints podem ser reutilizados. Embora os preprints ofereçam acesso gratuito, alguns autores podem não permitir que seu trabalho seja usado livremente na pesquisa. Isso pode dificultar as oportunidades de text-mining e uma análise mais ampla da literatura de preprints.
Perspectivas Futuras para Preprints no Europe PMC
Olhando para o futuro, o Europe PMC planeja expandir sua cobertura de preprints. Isso inclui encontrar novas maneiras de incluir metadados de várias fontes de preprints, não apenas aquelas registradas no Crossref. Fazendo isso, o Europe PMC pode oferecer uma visão mais abrangente dos resultados de pesquisa em ciências da vida.
Há também um foco em melhorar a qualidade dos metadados associados aos preprints. Ao extrair informações adicionais do texto completo dos preprints, o Europe PMC pode representar melhor as afinidades dos autores e fontes de financiamento. Esse esforço pode aumentar a utilidade dos preprints para os pesquisadores e melhorar sua visibilidade.
Outro objetivo é estender as redes de citação para incluir preprints. Atualmente, as citações são coletadas principalmente de artigos de revistas. Incluir preprints nessa rede pode proporcionar mais contexto sobre o panorama da pesquisa e ajudar os autores a rastrear o impacto de seu trabalho.
Por fim, o Europe PMC continuará a trabalhar no desenvolvimento de padrões para metadados e práticas de preprints. Colaborar com a comunidade de preprints garantirá que as futuras práticas de indexação atendam às necessidades diversas desse campo em crescimento.
Conclusão
Os preprints estão mudando a forma como a pesquisa científica é compartilhada e comunicada, especialmente nas ciências da vida. Com sua disseminação rápida e aceitação crescente, eles oferecem uma maneira valiosa para os pesquisadores compartilharem suas descobertas e receberem feedback. Plataformas como o Europe PMC desempenham um papel significativo em tornar os preprints mais descobertos e integrados ao fluxo de trabalho acadêmico.
À medida que o uso de preprints continua a crescer, enfrentar os desafios que eles enfrentam será essencial para construir uma comunidade de pesquisa confiável e digna de confiança. O futuro parece promissor para os preprints, à medida que se tornam uma parte padrão do cenário de pesquisa, promovendo colaboração e inovação na comunicação científica.
Título: Enabling preprint discovery, evaluation, and analysis with Europe PMC
Resumo: Preprints provide an indispensable tool for rapid and open communication of early research findings. Preprints can also be revised and improved based on scientific commentary uncoupled from journal-organised peer review. The uptake of preprints in the life sciences has increased significantly in recent years, especially during the COVID-19 pandemic, when immediate access to research findings became crucial to address the global health emergency. With ongoing expansion of new preprint servers, improving discoverability of preprints is a necessary step to facilitate wider sharing of the science reported in preprints. To address the challenges of preprint visibility and reuse, Europe PMC, an open database of life science literature, began indexing preprint abstracts and metadata from several platforms in July 2018. Since then, Europe PMC has continued to increase coverage through addition of new servers, and expanded its preprint initiative to include the full text of preprints related to COVID-19 in July 2020 and then the full text of preprints supported by the Europe PMC funder consortium in April 2022. The preprint collection can be searched via the website and programmatically, with abstracts and the open access full text of COVID-19 and Europe PMC funder preprint subsets available for bulk download in a standard machine-readable JATS XML format. This enables automated information extraction for large-scale analyses of the preprint corpus, accelerating scientific research of the preprint literature itself. This publication describes steps taken to build trust, improve discoverability, and support reuse of life science preprints in Europe PMC. Here we discuss the benefits of indexing preprints alongside peer-reviewed publications, and challenges associated with this process.
Autores: Maria Levchenko, M. Parkin, J. McEntyre, M. Harrison
Última atualização: 2024-05-14 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590240
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.04.19.590240.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.
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Ligações de referência
- https://asapbio.org/journal-policies
- https://www.ncbi.nlm.nih.gov/labs/pmc/about/covid-19/
- https://asapbio.org/funder-policies
- https://asapbio.org/preprint-servers
- https://tinyurl.com/searchenginecomparison
- https://europepmc.org/
- https://europepmc.org/Preprints#preprint-criteria
- https://europepmc.org/Funders/
- https://www.crossref.org/
- https://plus.europepmc.org/user-guide/preprintfaqs#license
- https://europepmc.org/orcid/import
- https://sciety.org/
- https://eeb.embo.org/
- https://sciety.org/docmaps/v1/index?updatedAfter=
- https://eeb.embo.org/api/v2/docmap/
- https://europepmc.org/LabsLink
- https://europepmc.org/ArticleStatusMonitor
- https://europepmc.org/RestfulWebService#!/Europe32PMC32Articles32RESTful32API/statusUpdateSearch
- https://europepmc.org/searchsyntax
- https://europepmc.org/AnnotationsApi
- https://europepmc.org/grantfinder
- https://stemjnl.org/preprint-search
- https://www.crossref.org/documentation/research-nexus/posted-content-includes-preprints/
- https://api.datacite.org