Simple Science

Ciência de ponta explicada de forma simples

# Biologia# Biologia evolutiva

O Mundo Inusitado dos Genes wtf em Leveduras

Descubra como os genes wtf desafiam as regras da herança na levedura de fissão.

― 5 min ler


que porra Genes: Umaque porra Genes: UmaAnomalia Genéticaherança e influenciam a evolução.caramba, os genes desafiam as leis da
Índice

A levedura fissionária, especificamente Schizosaccharomyces pombe, é um organismo pequenininho que os cientistas estudam pra entender genética. Dentro dessa levedura, tem uns genes especiais conhecidos como genes wtf (com Tf LTRs). Esses genes são interessantes porque podem agir de formas estranhas durante a reprodução. Em vez de seguir as regras normais de herança, alguns desses genes conseguem promover sua própria propagação, prejudicando outros genes ou o próprio organismo.

O Que São Genes wtf?

Os genes wtf são um grupo de genes que foram identificados por seus métodos únicos de herança. Eles podem produzir duas proteínas diferentes-uma que os protege (o Antídoto) e outra que pode ser prejudicial (a Toxina). Se os filhos herdarem o gene da toxina sem o antídoto, eles podem ter altas taxas de mortalidade.

O Papel da Seleção Natural

Na natureza, os genes competem entre si. Quando um gene tem uma vantagem sobre os outros, ele sobrevive melhor e é passado para as próximas gerações. Mas isso nem sempre acontece com os genes wtf. Às vezes, eles manipulam o processo de reprodução pra garantir a própria sobrevivência à custa dos outros. Esse comportamento destaca uma relação complexa entre genes e evolução.

A Família dos Genes wtf

Em S. pombe, foram identificados 25 genes wtf. Eles receberam números de wtf1 a wtf25 com base em suas localizações no genoma. Os cientistas categorizam esses genes em diferentes grupos com base em suas funções:

  1. Genes wtf Típicos: Esse é o grupo principal e inclui genes que conseguem produzir tanto o antídoto quanto a toxina.
  2. Genes Só de Antídoto: Esses genes produzem só o antídoto, sem a toxina.
  3. Pseudogenes: Esses são restos não funcionais de genes que não funcionam mais corretamente.

Curiosamente, alguns genes wtf, conhecidos como genes wtf "não típicos", não desempenham as funções esperadas durante a reprodução.

Evolução dos Genes wtf

Os cientistas observaram que os genes wtf passam por mudanças significativas com o tempo. Essas mudanças podem ser devido a conversões de genes, expansões e variações no número de genes. Com muitos isolados naturais de S. pombe disponíveis, os pesquisadores estão tentando entender como esses genes wtf evoluem e como conseguem sobreviver por longos períodos em várias condições ambientais.

Eventos de Conversão de Genes

Uma das descobertas legais é que alguns genes wtf conseguem recuperar a funcionalidade depois de ficarem inativos. Isso acontece por meio de um processo chamado conversão de genes, onde partes genéticas trocam informações. Isso pode ajudar um gene inativo a voltar a ser ativo, mantendo a presença de genes wtf dentro de uma população.

A Importância dos Genes 5S rDNA

Mudanças nas localizações dos genes wtf são pensadas como influenciadas por sequências conhecidas como LTRs (repetições terminais longas). Essas LTRs vêm de um tipo de elemento genético chamado retrotransposons, que podem se mover dentro do genoma. Se os genes wtf conseguirem pular nesses elementos ativos, eles podem se espalhar para novas localizações, ajudando a garantir sua longevidade.

Analisando Genes wtf em Vários Isolados

Pra aprender mais, os cientistas sequenciaram genes wtf de vários isolados de S. pombe, permitindo que comparassem a diversidade entre diferentes linhagens. Através desse processo, eles coletaram informações valiosas sobre como diferentes linhagens genéticas interagem e como vários genes wtf se adaptaram a diferentes condições.

A Composição dos Genes wtf por Linhagem

Os pesquisadores descobriram que a composição genética varia bastante dependendo da linhagem. Por exemplo, algumas linhagens tinham menos genes wtf funcionais e mais inativos. Isso sugere que eventos históricos, como gargalos populacionais, influenciaram a quantidade e o tipo de genes wtf presentes em cada linhagem.

Identificando Mudanças Recentes nos Genes wtf

Usando métodos avançados, os cientistas documentaram vários eventos evolutivos recentes que afetam os genes wtf. Ao procurar mudanças no número e nas funções dos genes, identificaram 11 eventos distintos onde genes dentro de uma linhagem evoluíram em novas formas ou números devido a vários fatores, como recombinação.

Ressurgimento de Pseudogenes

Um aspecto fascinante dessa pesquisa é o ressurgimento de alguns pseudogenes em genes funcionais através da conversão de genes. Isso significa que mesmo genes que foram considerados perdidos podem às vezes voltar, sugerindo uma paisagem genética dinâmica e flexível.

A Estrutura dos Genes wtf

Através de análises cuidadosas, os pesquisadores descreveram a estrutura dos genes wtf em detalhe. Eles identificaram regiões conservadas específicas que são críticas para a função do gene. Notavelmente, destacaram a importância de repetições diretas que podem ter influenciado como esses genes se espalharam e evoluíram.

Descobertas sobre Sequências Antes e Depois dos Genes wtf

Ao analisar as sequências ao redor dos genes wtf, os cientistas descobriram padrões que fornecem insights sobre como esses genes se comportam. Eles propõem que certas sequências a montante dos genes wtf ajudam a padronizar o conteúdo genético, facilitando a manutenção da função dos genes mesmo enquanto evoluem.

Considerações Finais

O estudo dos genes wtf na levedura fissionária revela um quadro rico e intrincado de competição genética e evolução. Compreender esses processos não só ilumina o fascinante mundo da genética, mas também ajuda os cientistas a aprender mais sobre como os organismos se adaptam e sobrevivem em ambientes em mudança. A pesquisa em andamento sobre esses genes promete descobrir ainda mais sobre seus papéis na natureza e na genética.

Fonte original

Título: Evolutionary modes of wtf meiotic driver genes in Schizosaccharomyces pombe

Resumo: Killer meiotic drivers (KMDs) are a class of selfish genetic elements that defy Mendels law and bias transmission in their favor by destroying meiotic progeny that do not carry them. How KMDs evolve is not well understood. In the fission yeast Schizosaccharomyces pombe, the largest gene family, known as the wtf genes, is a KMD family that causes intraspecific hybrid sterility. Here, we investigate how wtf genes evolve using long-read-based genome assemblies of 31 distinct S. pombe natural isolates, which encompass the known genetic diversity of S. pombe. Our analysis, involving nearly 1,000 wtf genes in these isolates, yields a comprehensive portrayal of the intraspecific diversity of wtf genes. Leveraging single-nucleotide polymorphisms in adjacent unique sequences, we pinpoint wtf-gene-containing loci that have recently undergone gene conversion events and infer their pre-gene-conversion state. These events include the revival of wtf pseudogenes, lending support to the notion that gene conversion plays a role in preserving this gene family from extinction. Moreover, our investigation reveals that solo long terminal repeats (LTRs) of retrotransposons, frequently found near wtf genes, can act as recombination arms, influencing the upstream regulatory sequences of wtf genes. Additionally, our exploration of the outer boundaries of wtf genes uncovers a previously unrecognized type of directly oriented repeats flanking wtf genes. These repeats may have facilitated the early expansion of the wtf gene family in S. pombe. Our findings enhance the understanding of the mechanisms influencing the evolution of this KMD gene family.

Autores: Li-Lin Du, Y.-H. Xu, F. Suo, X.-R. Zhang, Y. Hua, G.-S. Jia, J.-X. Zheng

Última atualização: 2024-06-02 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.30.596636

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.05.30.596636.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

Obrigado ao biorxiv pela utilização da sua interoperabilidade de acesso aberto.

Mais de autores

Artigos semelhantes