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Aprendizado de Máquina Melhora o Diagnóstico da Doença Celíaca

Novo estudo mostra promessas no uso de aprendizado de máquina para uma melhor avaliação da doença celíaca.

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A Doença Celíaca é uma condição em que o sistema imunológico do corpo reage negativamente ao glúten, uma proteína encontrada no trigo, cevada e centeio. Cerca de 1% das pessoas tem essa doença. Os sintomas podem variar bastante; algumas pessoas não apresentam nada, enquanto outras têm grandes dificuldades em absorver nutrientes dos alimentos.

Um dos aspectos preocupantes da doença celíaca é o risco um pouco maior de desenvolver um tipo de câncer chamado linfoma intestinal em comparação com quem não tem a doença. Isso torna o diagnóstico da doença celíaca super importante. O diagnóstico geralmente envolve a análise de pequenas Amostras de Tecido do intestino, o que pode ser complicado já que os sintomas variam muito.

Importância da Histologia no Diagnóstico

Histologia é o estudo dos tecidos sob um microscópio. Ela desempenha um papel fundamental no diagnóstico e manejo da doença celíaca. Os médicos procuram características específicas nas amostras de tecido, como um número aumentado de certas células imunológicas, alterações na forma do tecido ou uma diminuição na altura das projeções em forma de dedo (vilosidades) no intestino. Esses detalhes ajudam os médicos a confirmar a presença e a gravidade da doença.

No entanto, muitas vezes há falta de consenso entre os patologistas ao examinarem amostras de Biópsia. Isso pode levar a diagnósticos inconsistentes, mesmo que múltiplas amostras sejam analisadas. A qualidade das amostras e as semelhanças que têm com outras condições podem contribuir para esse problema.

Para melhorar a situação, tem crescido o interesse em usar Aprendizado de Máquina na área da patologia. Essa tecnologia pode ajudar a aumentar a precisão e a rapidez no diagnóstico da doença celíaca.

O Papel do Aprendizado de Máquina

Aprendizado de máquina envolve o uso de computadores para analisar dados e fazer previsões. No contexto da doença celíaca, pode ajudar a oferecer uma forma mais consistente de avaliar amostras de tecido. Usando aprendizado de máquina, os pesquisadores esperam reduzir variações no diagnóstico e até permitir que estudos menores mostrem se um tratamento é eficaz.

Avanços recentes resultaram na criação de ferramentas que podem analisar amostras de tecido com mais precisão. Por exemplo, certos tipos de modelos computacionais conseguem identificar tipos celulares específicos e regiões no tecido. Isso inclui observar o número de células imunes presentes e como elas se relacionam com a saúde geral do tecido.

Objetivos do Estudo

Um estudo recente teve como objetivo preencher lacunas na pesquisa atual sobre a doença celíaca aplicando técnicas de aprendizado de máquina. Os pesquisadores se concentraram em usar essa tecnologia para analisar amostras de pacientes com diferentes graus de doença celíaca. O objetivo era criar um sistema que pudesse segmentar os tecidos e classificar diferentes tipos celulares em lâminas de tecido completas.

Com isso, eles esperavam extrair características específicas das amostras relacionadas à doença e comparar essas características com sistemas de pontuação já estabelecidos usados para determinar a gravidade da doença.

Coleta de Dados

Os pesquisadores coletaram amostras de tecido de pacientes com doença celíaca e aquelas de tecido normal do intestino. Eles reuniram um total de 318 amostras de pacientes com diferentes níveis de gravidade da doença e 58 amostras normais. As amostras foram escaneadas para que pudessem ser analisadas sob um microscópio.

Para garantir que a análise fosse precisa, os pesquisadores dividiram as amostras em grupos de treinamento, validação e teste. Assim, puderam desenvolver seus modelos de aprendizado de máquina de forma eficaz.

Desenvolvimento do Modelo de Aprendizado de Máquina

O estudo focou na criação de um modelo de aprendizado de máquina que conseguisse identificar regiões importantes nas amostras de tecido. Usaram modelos previamente desenvolvidos para classificar diferentes células nas amostras. O objetivo final era quantificar características específicas relacionadas à doença celíaca.

Para isso, os pesquisadores anotaram as amostras de tecido. Patologistas experientes marcaram várias regiões das amostras, incluindo áreas onde células específicas foram encontradas. Essas anotações ajudaram a treinar os modelos de aprendizado de máquina para prever essas características com precisão.

Validação e Controle de Qualidade

Para garantir a precisão das previsões, os pesquisadores realizaram uma revisão de controle de qualidade das anotações de tecido. Um patologista especialista revisou as previsões do modelo e fez os ajustes necessários. Esse processo iterativo ajudou a melhorar o desempenho do modelo.

Para verificar como o modelo conseguia reconhecer tipos celulares, os pesquisadores pegaram amostras representativas e pediram que vários patologistas as anotassem. Usaram essas anotações para comparar as previsões do modelo com as feitas por especialistas humanos.

Resultados do Modelo de Aprendizado de Máquina

Os pesquisadores extraíram características específicas das amostras de tecido e procuraram correlações com sistemas de pontuação estabelecidos para a gravidade da doença celíaca. Descobriram que certas características relacionadas à área e densidade de células específicas estavam intimamente ligadas à gravidade da doença.

Por exemplo, descobriram que uma área menor de epitélio viloso (a camada externa do intestino) estava associada a escores de gravidade mais altos. Por outro lado, uma área maior de epitélio cripto (a camada mais profunda do intestino) estava relacionada a uma doença mais grave. Eles também notaram o número de células imunes presentes nas amostras de tecido, que aumentava com a gravidade da doença.

Vantagens da Abordagem de Aprendizado de Máquina

O uso de aprendizado de máquina neste estudo traz várias vantagens. Primeiro, oferece uma forma mais objetiva e quantitativa de avaliar as amostras de tecido, ajudando a reduzir a subjetividade que muitas vezes vem com avaliações manuais. Com uma abordagem de medição consistente, os pesquisadores esperam detectar mudanças sutis na estrutura do tecido que métodos tradicionais podem perder.

Segundo, o modelo pode analisar características que normalmente não são incluídas em sistemas de pontuação padrão. Isso inclui medições detalhadas das células imunes, que são essenciais para entender como a doença afeta os pacientes.

Além disso, esse método automatizado consegue diferenciar mais efetivamente entre tecido normal e doente. A capacidade de medir e acompanhar a gravidade da doença ao longo do tempo pode levar a um melhor monitoramento das respostas aos tratamentos e melhorias nos cuidados com os pacientes.

Direções Futuras

Apesar do estudo ter mostrado resultados promissores, os pesquisadores reconheceram que o tamanho da amostra era relativamente pequeno. Estudos maiores serão necessários para refinar o modelo e garantir sua confiabilidade. O trabalho futuro também pode envolver o treinamento do modelo especificamente em tecido do intestino e a exploração de tipos celulares adicionais.

Além disso, a abordagem utilizada neste estudo pode ser adaptada para relatar resultados com base em regiões específicas do tecido. Isso significa que patologistas poderiam avaliar as áreas mais afetadas, levando a diagnósticos mais precisos.

Os pesquisadores acreditam que o aprendizado de máquina será uma ferramenta crucial para avançar na medicina personalizada para pacientes com doença celíaca. À medida que continuam a desenvolver e validar seus modelos, esperam que essa tecnologia ajude os clínicos a entender melhor a doença e a melhorar as opções de tratamento.

Conclusão

A doença celíaca é uma condição complexa que requer um diagnóstico e manejo cuidadosos. A aplicação de aprendizado de máquina na análise de amostras de tecido pode potencialmente aumentar a precisão do diagnóstico e monitoramento da doença celíaca. Ao fornecer um meio de avaliação mais objetiva, essa tecnologia pode abrir caminho para melhores resultados para os pacientes e planos de tratamento personalizados. Com o avanço da pesquisa nessa área, a esperança é criar ferramentas mais eficazes para gerenciar a doença celíaca, levando a um cuidado melhor para aqueles afetados.

Fonte original

Título: Fully automated histological classification of cell types and tissue regions of celiac disease is feasible and correlates with the Marsh score

Resumo: AimsHistological assessment is essential for the diagnosis and management of celiac disease. Current scoring systems, including modified Marsh (Marsh-Oberhuber) score, lack inter-pathologist agreement. To address this unmet need, we aimed to develop a fully automated, quantitative approach for histology characterisation of celiac disease. MethodsConvolutional neural network models were trained using pathologist annotations of haematoxylin and eosin-stained biopsies of celiac disease mucosa and normal duodenum to identify cells, tissue and artifact regions. Human interpretable features were extracted and the strength of their correlation with Marsh scores were calculated using Spearman rank correlations. ResultsOur model accurately identified cells, tissue regions and artifacts, including distinguishing intraepithelial lymphocytes and differentiating villous epithelium from crypt epithelium. Proportional area measurements representing villous atrophy negatively correlated with Marsh scores (r=-0.79), while measurements indicative of crypt hyperplasia and intraepithelial lymphocytosis positively correlated (r=0.71 and r=0.44, respectively). Furthermore, features distinguishing celiac disease from normal colon were identified. ConclusionsOur novel model provides an explainable and fully automated approach for histology characterisation of celiac disease that correlates with modified Marsh scores, facilitating diagnosis, prognosis, clinical trials and treatment response monitoring. KEY MESSAGESO_ST_ABSWhat is already known on this topicC_ST_ABS[tpltrtarr] Prior research has utilised machine learning (ML) techniques to detect celiac disease and evaluate disease severity based on Marsh scores. [tpltrtarr]However, existing approaches lack the capability to provide fully explainable tissue segmentation and cell classifications across whole slide images in celiac disease histology. [tpltrtarr]The need for a more comprehensive and interpretable ML-based method for celiac disease diagnosis and characterisation is evident from the limitations of currently available scoring systems as well as inter-pathologist variability. What this study adds[tpltrtarr] This study is the first to introduce an explainable ML-based approach that provides comprehensive, objective celiac disease histology characterisation, overcoming inter-observer variability and offering a scalable tool for assessing disease severity and monitoring treatment response. How this study might affect research, practice or policy[tpltrtarr] This studys fully automated and ML-based histological analysis, including the correlation of Marsh scores, has the potential to enable more precise disease severity measurement, risk assessment and clinical trial endpoint evaluation, ultimately improving patient care.

Autores: Fedaa Najdawi, M. Griffin, A. Gruver, C. Shah, Q. Wani, D. Fahy, A. Khosla, C. Kirkup, D. Borders, J. A. Brosnancashman, A. D. Fulford, K. M. Credille, C. Jayson, K. Gottlieb

Última atualização: 2023-12-11 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.11.23299520

Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.11.23299520.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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