Insights Genéticos sobre a Doença de Parkinson de Início Precoce
Novos testes genéticos revelam causas escondidas da doença de Parkinson de início precoce.
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Índice
A doença de Parkinson (DP) é um problema cerebral comum que afeta o movimento. É a segunda doença neurodegenerativa mais comum, depois da doença de Alzheimer, impactando cerca de 6 milhões de pessoas no mundo todo. Pessoas com DP sentem tanto sintomas motores, como movimento lento, rigidez e tremores, quanto sintomas não motores, que podem incluir mudanças de humor ou sono. Em alguns casos, cerca de 5 a 10% dos casos de DP são causados por mutações genéticas específicas, enquanto os outros casos geralmente são considerados de origem desconhecida.
Genética da Doença de Parkinson
Um gene chave associado à DP de início precoce é o gene PRKN. Mutações nesse gene geralmente estão ligadas a uma forma de DP que começa mais cedo. O gene PRKN está localizado no cromossomo 6 e contém 12 seções que codificam uma proteína chamada Parkin. Essa proteína ajuda a manter as células saudáveis, regulando as mitocôndrias, que são importantes para a produção de energia nas células.
Mutações patogênicas no PRKN representam uma pequena porcentagem dos casos isolados de DP e uma proporção maior dos casos familiares de DP de início precoce. Os sintomas costumam envolver parkinsonismo em idade jovem, com uma boa resposta ao medicamento levodopa. Nesses casos, os pacientes normalmente apresentam sintomas motores, mas com menos frequência exibem sintomas não motores, como declínio cognitivo.
Avanços em Testes Genéticos
Recentes avanços em testes genéticos, especificamente no Sequenciamento de leitura longa (LRS), permitem que cientistas identifiquem variações genéticas complexas que métodos tradicionais podem perder. Essa técnica melhora a detecção de sequências de DNA curtas repetidas e variações estruturais em genes. O LRS pode ajudar a identificar causas genéticas de doenças quando o sequenciamento padrão não consegue fazer isso.
Em um estudo envolvendo dois irmãos que tinham DP de início precoce, o LRS revelou Variantes Estruturais complexas no gene PRKN que haviam passado despercebidas. Esses irmãos estavam fazendo testes genéticos por anos sem um diagnóstico claro, mas o LRS forneceu as informações necessárias para entender os fatores genéticos que contribuíam para a condição deles.
Participantes do Estudo e Métodos
O estudo focou em dois irmãos caucasianos diagnosticados com DP de início precoce. O histórico médico da família não revelou outros casos de DP, e eles apresentaram sintomas no início dos trinta anos. Esses sintomas, que incluíam boa resposta ao levodopa e uma progressão lenta da doença, indicavam uma possível ligação genética com mutações no PRKN.
Os pesquisadores primeiro diagnosticaram DP nos irmãos com base em critérios clínicos estabelecidos. Após isso, buscaram consentimento e realizaram vários testes genéticos para procurar anormalidades no gene PRKN. Usaram uma combinação de técnicas, incluindo amplificação de sondas de hibridação multiplex (MLPA) e sequenciamento do exoma completo, mas os resultados iniciais foram inconclusivos.
Investigações Genéticas e Resultados
Inicialmente, os testes mostraram que ambos os irmãos tinham uma cópia do exon 4 do gene PRKN, enquanto nenhuma mutação patogênica foi detectada. No entanto, os resultados sugeriram que poderia haver uma deleção no exon 4, sem variantes adicionais presentes. Testes adicionais também mostraram uma baixa cobertura do exon 4, indicando um possível problema de número de cópias.
Para aprimorar a compreensão das variações genéticas, os pesquisadores usaram o sequenciamento de leitura longa, que forneceu dados mais completos. O LRS identificou uma duplicação significativa e uma deleção de seções dentro do gene PRKN. Especificamente, os resultados mostraram uma duplicação que incluía o exon 3 e uma deleção que abrangia os Exons 3 e 4.
Resultados do Sequenciamento de Leitura Longa
Os dados do LRS mostraram uma duplicação de 106.727 pares de bases, incluindo o exon 3, e uma deleção de 178.991 pares de bases que afetou os exons 3 e 4. Os pontos de quebra onde essas mudanças ocorreram estavam localizados em regiões do genoma que não codificam proteínas, tornando-os difíceis de detectar usando métodos de sequenciamento padrão.
Verificando esses achados, os pesquisadores usaram técnicas de PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) para confirmar a presença das variantes estruturais em ambos os irmãos. Os resultados indicaram claramente que ambos tinham duas mudanças genéticas distintas, mas relacionadas, que contribuíram significativamente para a DP de início precoce deles.
Desafios dos Testes Genéticos Tradicionais
Enquanto técnicas de sequenciamento tradicionais podem identificar mutações simples, elas podem não ser eficazes para mudanças estruturais complexas em genes. Muitas pessoas com DP relacionada ao PRKN podem ter fatores genéticos ocultos que não são identificados por métodos de teste padrão. Isso destaca uma lacuna nas práticas atuais de diagnóstico genético.
Os desafios em detectar variantes estruturais complexas muitas vezes vêm de sua natureza e das limitações do sequenciamento de leitura curta, que pode não cobrir adequadamente mudanças genéticas maiores. Neste estudo, o uso de LRS permitiu uma investigação mais completa do genoma e trouxe uma compreensão mais clara das condições genéticas dos irmãos.
Implicações para Pesquisas Futuras
Os achados deste estudo enfatizam a importância de usar métodos avançados de teste genético para entender e diagnosticar a DP de início precoce. O sequenciamento de leitura longa provou ser valioso na identificação de mudanças genéticas complexas que muitas vezes são perdidas por técnicas tradicionais. À medida que os pesquisadores continuam a investigar a genética da DP, incorporar o LRS pode levar a melhores insights e ajudar a identificar genes candidatos adicionais ligados à doença.
A identificação de variantes estruturais no gene PRKN nesses irmãos fornece conhecimento valioso para a comunidade médica em geral. Isso reforça a necessidade de pesquisadores e clínicos considerarem métodos de teste avançados quando enfrentam diagnósticos difíceis.
Conclusão
A doença de Parkinson é um distúrbio complexo com uma variedade de fatores genéticos. Para algumas pessoas, detectar a causa genética pode ser desafiador, especialmente quando os testes tradicionais não oferecem respostas. O uso de sequenciamento de leitura longa está surgindo como uma ferramenta poderosa para desvendar as complexidades das mutações genéticas em doenças como a DP. O estudo desses dois irmãos destaca a importância da exploração contínua em pesquisas genéticas para aprimorar nossa compreensão e abordagem ao diagnóstico e tratamento de distúrbios neurológicos.
Título: Long-read sequencing unravels the complexity of structural variants in PRKN in two individuals with early-onset Parkinson's disease
Resumo: BackgroundPRKN biallelic pathogenic variants are the most common cause of autosomal recessive early-onset Parkinsons disease (PD). However, the variants responsible for suspected PRKN-PD individuals are not always identified with standard genetic testing. ObjectivesIdentify the genetic cause in two siblings with a PRKN-PD phenotype using long-read sequencing (LRS). MethodsThe genetic investigation involved standard testing using successively multiple ligation probe amplification (MLPA), Sanger sequencing, targeted sequencing, whole-exome sequencing and LRS. ResultsMLPA and targeted sequencing identified one copy of exon four in PRKN but no other variants were identified. Subsequently, LRS unveiled a large deletion encompassing exon 3 to 4 on one allele and a duplication of exon 3 on the second allele; explaining the siblings phenotype. MLPA could not identify the balanced rearrangement of exon 3. ConclusionsThis study highlights the potential utility of long-read sequencing in the context of unsolved typical PRKN-PD individuals.
Autores: Alexis Brice, G. Cogan, K. Daida, K. Billingsley, C. Tesson, S. Forlani, L. Jornea, L. Arnaud, L. Tissier, E. Leguern, A. Singleton, H. Gervais-Bernard, M. Ferrien, S. Lesage
Última atualização: 2024-05-03 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.02.24306523
Fonte PDF: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.05.02.24306523.full.pdf
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