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O Papel dos Chromossomos Acessórios em Patógenos Fúngicos

Regiões acessórias moldam a adaptabilidade e a virulência de patógenos fúngicos.

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Muitos patógenos fúngicos têm características únicas na sua composição genética. Essas características incluem partes do genoma que são estáveis e compartilhadas entre diferentes linhagens, assim como partes que podem mudar e se adaptar mais rapidamente a novos ambientes ou hospedeiros. As partes mais estáveis são chamadas de regiões centrais, enquanto as partes mais adaptáveis são chamadas de regiões acessórias. Essa adaptabilidade é crucial para a sobrevivência deles, especialmente quando enfrentam diferentes plantas ou condições em mudança.

Regiões Acessórias: Características e Funções

As regiões acessórias geralmente diferem das regiões centrais de várias maneiras. Elas costumam ter mais variação nas suas sequências genéticas e incluem uma quantidade maior de elementos móveis, que podem se mover dentro do genoma. Essas regiões também podem ter formas diferentes de codificar proteínas (uso de códons) e contêm menos genes no geral.

Em muitas espécies de fungos, as regiões acessórias podem ser encontradas em duas formas: ou misturadas com os Cromossomos centrais ou existindo como cromossomos independentes. Essas regiões acessórias desempenham papéis importantes em como os fungos interagem com seus hospedeiros e podem incluir genes que ajudam os fungos a infectar as plantas.

Importância das Regiões Acessórias na Vireulência

O propósito exato dessas regiões acessórias ainda está sendo estudado. No entanto, já foi mostrado que muitas dessas regiões codificam proteínas que ajudam os fungos a infectar seus hospedeiros vegetais. Às vezes, essas regiões também podem ajudar os fungos a passar características vantajosas para outras linhagens. Isso foi observado em populações naturais desses fungos, onde evidências sugerem que características benéficas podem ser transferidas entre diferentes espécies.

Estudos experimentais conseguiram transferir cromossomos acessórias entre diferentes linhagens de fungos, mostrando como esses organismos podem ser adaptáveis e capazes.

Complexo de Espécies Fusarium Oxysporum

Um grupo bem conhecido de patógenos fúngicos é o complexo de espécies Fusarium oxysporum. Esses fungos têm regiões acessórias bastante variadas e são conhecidos pela sua capacidade de infectar muitos tipos diferentes de plantas. Diferentes linhagens dentro desse complexo foram categorizadas em raças com base em quão virulentas são contra várias variedades de banana. A raça atual que está causando a epidemia de Murcha de Fusarium na Banana se chama raça tropical 4 (TR4), que pode infectar uma variedade de bananas, incluindo a amplamente cultivada Cavendish.

Curiosamente, as linhagens TR4 são geneticamente bem semelhantes e foram reclassificadas em uma espécie relacionada conhecida como F. odoratissimum. O genoma da linhagem TR4 de referência contém duas regiões acessórias significativas, uma das quais está ligada a um cromossomo central e a outra existe como um cromossomo separado. Esse cromossomo separado, chamado AC12, inclui vários genes que ajudam o fungo a infectar as plantas.

Mudanças nos Cromossomos Acessórios

Pesquisas anteriores mostraram que certas linhagens de F. oxysporum têm várias cópias de certas regiões acessórias, indicando que essas regiões podem se expandir em tamanho através da duplicação. Estudos recentes levantaram questões sobre essa expansão e se algumas linhagens realmente carecem de cromossomos acessórios independentes.

Estudos experimentais e de cariótipo sugeriram que muitas linhagens TR4, incluindo a linhagem de referência, possuem cromossomos acessórios tradicionais. O tamanho do AC12, em particular, foi encontrado muito maior do que o registrado anteriormente devido a duplicações internas repetidas dentro do próprio cromossomo.

Funcionalidade do AC12

Para entender melhor o papel do AC12, cientistas criaram linhagens do fungo que não possuem esse cromossomo. Esses mutantes mostraram que o AC12 não é necessário para o crescimento básico, significando que o fungo pode prosperar mesmo sem ele. No entanto, a perda do AC12 levou a uma diminuição da capacidade de causar doenças em plantas de banana. Em testes de laboratório, os mutantes que não tinham AC12 causaram danos significativamente menores aos cormos de banana do que a linhagem selvagem, indicando que o AC12 é crucial para a virulência do fungo.

Detalhes sobre a Perda de Cromossomos e Mutação

Ao gerar as linhagens sem AC12, vários mutantes diferentes foram estudados para observar quaisquer mudanças genéticas adicionais. Embora a perda do AC12 não tenha impactado o crescimento em placas de crescimento padrão, alguns mutantes mostraram mudanças em seus cromossomos centrais. Essas mudanças foram notadas, mas não impactaram significativamente a capacidade do fungo de crescer.

A genética por trás dessas mudanças foi analisada usando várias técnicas, confirmando a perda completa do AC12 em todos os mutantes examinados. Essas observações ressaltam a natureza plástica dos genomas fúngicos e sua capacidade de se adaptar através da perda e rearranjo do material genético.

Transferência Horizontal de Genes e Patogenicidade Viral

Cromossomos acessórias como o AC12 podem, às vezes, ser transferidos de uma linhagem de fungo para outra, o que pode aumentar a virulência em linhagens não patogênicas. No entanto, tentativas de transferir o AC12 de uma linhagem para outra não foram bem-sucedidas neste estudo, sugerindo que o processo pode ter requisitos específicos ou que outros fatores desempenham um papel em tais transferências.

Reduzindo a Virulência Através da Manipulação Genética

Para investigar melhor as contribuições de genes específicos localizados no AC12, os cientistas geraram mutantes adicionais visando esses genes. Alguns desses mutantes mostraram redução na virulência, embora nem todas as mudanças fossem estatisticamente significativas. Isso destaca a complexidade dos fatores de virulência e sugere que vários genes podem contribuir para quão efetivamente o fungo pode infectar seu hospedeiro.

Conclusão: Implicações e Direções Futuras

As descobertas enfatizam a natureza dinâmica do genoma fúngico, particularmente no caso das linhagens de Fusarium oxysporum. Cromossomos acessórios como o AC12 desempenham papéis cruciais não apenas na infecção de plantas, mas também na adaptabilidade desses organismos. Compreender como esses cromossomos funcionam pode fornecer insights sobre métodos potenciais de controle para a ampla Murcha de Fusarium na Banana e doenças semelhantes em plantas.

Pesquisas em andamento se concentrarão em entender melhor os mecanismos por trás das mudanças cromossômicas e como isso afeta não apenas a gravidade da doença, mas a aptidão geral do fungo em ambientes variáveis. Esse conhecimento pode ser essencial para desenvolver estratégias eficazes para combater esses patógenos devastadores.

Este trabalho destaca a importância de estudar a composição genética de patógenos fúngicos e explorar como eles evoluem em resposta ao seu ambiente. Os insights obtidos podem levar a métodos aprimorados para gerenciar doenças em plantas e proteger culturas em todo o mundo.

Fonte original

Título: Extensive intrachromosomal duplications in a virulence-associated fungal accessory chromosome

Resumo: Filamentous fungi have evolved compartmentalized genomes consisting of conserved core regions and dynamic accessory regions, which aid the adaptation to changing environments including the interaction with host organisms. In the Fusarium oxysporum species complex, accessory regions play an important role during infection and it has been reported that these regions undergo extensive duplications, however, it is currently unknown how such duplications shape accessory regions. Moreover, the function of accessory regions apart from encoding virulence effectors is not completely understood. Here we determined the karyotype of F. oxysporum Tropical Race 4 (TR4), which causes the ongoing pandemic of Fusarium wilt of banana (FWB). We show that the single accessory chromosome of TR4 isolate II5 has undergone extensive intrachromosomal duplications, resulting in triplication of the chromosome size compared to other closely related TR4 strains. By obtaining mutant strains that have lost the accessory chromosome, we demonstrate that this chromosome is dispensable for vegetative growth but is required for full virulence on banana. Lastly, we found that the loss of chromosome 12 co-occurs with structural rearrangements of core chromosomes, which are generally co-linear between members of the F. oxysporum species complex. Together, our results provide new insights into the chromosome dynamics of the banana infecting TR4 lineage of the F. oxysporum species complex. SignificanceFusarium oxysporum is a major fungal plant pathogen that causes vascular wilt disease on a wide variety of agronomically important crops. A current epidemic of Fusarium wilt of banana (FWB), caused by tropical race 4 (TR4), poses a major threat to global banana production and threatens food security in tropical and subtropical regions where banana is an important staple crop. Controlling TR4 requires a better understanding of the molecular mechanisms underlying pathogenicity, including the evolution of pathogenicity-related accessory regions. Here we demonstrate that intrachromosomal duplications are a key mechanism of accessory chromosome evolution in the F. oxysporum species complex. We identified a single accessory chromosome and show that TR4 mutants that lost this accessory chromosome display significantly reduced virulence on banana plants. Our results provide insight into the evolution of accessory chromosomes in the F. oxysporum species complex, underscore their importance in pathogenicity, and provide new clues for the development of resistant banana plants.

Autores: Gert H.J. Kema, J. Dijkstra, A. C. van Westerhoven, L. Gomez-Gil, C. Aguilera-Galvez, G. Nakasato-Tagami, S. D. Garnier, M. Yamazaki, T. Arie, T. Kamakura, T. Arazoe, A. Di Pietro, M. F. Seidl

Última atualização: 2024-09-16 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.16.611982

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.16.611982.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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