Salmonella Typhimurium e Resistência a Fagos
Estudo revela fatores genéticos na resistência da Salmonella aos fagos.
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Índice
- Bacteriófagos e Seu Potencial
- A Corrida Armamentista: Bactérias vs. Phages
- Desafios em Estudar Interações entre Bactérias e Phages
- Tipagem de Phages e Sequenciamento Genético
- A Emergência de Cepas Multirresistentes
- Investigando a Resistência a Phages em Salmonella Typhimurium
- O Papel do Gene wzy
- Métodos de Pesquisa
- Análise Filogenética de Bactérias
- Identificando Mudanças Genéticas
- Mudanças no Locus wzy
- Deleções e Reversões do Gene wzy
- Seleção de Variantes Resistentes
- Mecanismo de Reversão
- Reconstrução do Estado Ancestral
- Implicações para a Terapia com Phages
- Conclusão
- Fonte original
Salmonella enterica é um tipo de bactéria que pode causar doenças sérias tanto em humanos quanto em animais. Uma cepa específica, conhecida como Salmonella Typhimurium, é preocupante porque consegue desenvolver resistência a antibióticos. Essa resistência geralmente está ligada ao uso excessivo de antibióticos, principalmente na agricultura. Pra enfrentar essas bactérias resistentes, os pesquisadores estão buscando alternativas como os bacteriófagos, que são vírus que atacam e matam especificamente as bactérias.
Bacteriófagos e Seu Potencial
Os bacteriófagos, ou só phages, têm mostrado potencial como uma opção de tratamento contra infecções bacterianas. Eles funcionam grudando nas bactérias e injetando seu material genético, levando à morte da célula bacteriana. Usar phages pode ajudar a reduzir a transmissão dessas bactérias prejudiciais e sua persistência no meio ambiente. Mas, tem desafios em usar phages como tratamento. Um grande problema é que as bactérias podem rapidamente desenvolver resistência aos phages por meio de mudanças em suas proteínas de superfície.
A Corrida Armamentista: Bactérias vs. Phages
Quando os phages atacam as bactérias, essas costumam se adaptar e evoluir formas de resistir a esses ataques. Essa batalha contínua faz com que os phages também tenham que evoluir novas estratégias pra superar as bactérias. Muitos phages precisam de receptores específicos na superfície das bactérias pra grudar e entrar nas células. Mudanças nesses receptores podem afetar bastante se as bactérias podem ser atacadas pelos phages.
Experimentos mostraram que bactérias como Escherichia coli podem desenvolver resistência rapidamente aos phages. Mas, em alguns casos, a exposição prolongada a phages pode resultar em uma relação mais complexa entre as bactérias e os phages. Algumas bactérias evoluem várias maneiras de resistir a phages, mas essas mudanças podem ter um custo em termos de aptidão, ou seja, as bactérias podem ficar menos aptas ou menos capazes de sobreviver no ambiente.
Desafios em Estudar Interações entre Bactérias e Phages
Estudar como bactérias e phages interagem em ambientes naturais é complicado. Grande parte da pesquisa se baseou em estudos observacionais por causa da escassez de grandes dados que consigam ligar características bacterianas com sua sensibilidade a phages. Uma oportunidade interessante surgiu quando os pesquisadores conseguiram acessar um conjunto de dados sobre a sensibilidade a phages e Sequenciamento Genético de Salmonella Typhimurium. Isso trouxe insights valiosos sobre a relação entre cepas bacterianas e sua resposta a phages.
Tipagem de Phages e Sequenciamento Genético
No passado, diferentes cepas de Salmonella Typhimurium foram identificadas com base em sua sensibilidade a vários phages. Isso foi feito usando um sistema chamado Anderson phage typing scheme. Mais de 1700 isolados de Salmonella Typhimurium foram analisados, e os resultados mostraram que esses phages podiam ser agrupados com base em suas semelhanças genéticas. A maioria dos phages identificados estava intimamente relacionada a um tipo conhecido como P22, que usa um receptor específico nas bactérias para infecção.
Os pesquisadores analisaram os dados genéticos de Salmonella Typhimurium e descobriram que diferentes linhagens bacterianas tinham padrões únicos de sensibilidade a phages. Essa descoberta foi também notada em outro tipo de bactéria chamada E. coli enterohemorrágica. Além disso, algumas linhagens de Salmonella Typhimurium que desenvolveram resistência a múltiplos medicamentos mostraram menos sensibilidade a ataques de phages.
A Emergência de Cepas Multirresistentes
Nos últimos anos, certas cepas de Salmonella Typhimurium que são resistentes a múltiplos medicamentos surgiram e se espalharam amplamente entre os animais de criação. Essas cepas geralmente exibem uma sensibilidade reduzida a phages também. Um exemplo notável é um clone específico de Salmonella Typhimurium que surgiu na Europa por volta de 2005, que também mostrou sensibilidade diminuída a phages. Isso levanta preocupações sobre como essas cepas resistentes vão reagir aos tratamentos com phages.
Investigando a Resistência a Phages em Salmonella Typhimurium
Neste estudo, os pesquisadores queriam entender as razões genéticas por trás das mudanças na sensibilidade a phages entre populações específicas de Salmonella Typhimurium. Eles focaram em cepas que são frequentemente encontradas em patos e ligadas a surtos ocasionais de salmonelose em humanos. Os pesquisadores descobriram que certas cepas de Salmonella Typhimurium eram principalmente suscetíveis a phages específicos.
O Papel do Gene wzy
Um gene chamado wzy é crucial para a capacidade das bactérias de produzir um componente de sua camada externa chamado O-antígeno, que ajuda a protegê-las de phages. Este estudo testou a ideia de que mudanças no gene wzy poderiam contribuir para as bactérias se tornarem resistentes a ataques de phages. Ao examinar cepas de Salmonella Typhimurium, os pesquisadores descobriram que algumas cepas haviam perdido esse gene, o que correspondia à sua resistência aumentada a phages.
Métodos de Pesquisa
Os pesquisadores coletaram várias cepas de Salmonella Typhimurium durante vigilância regular e sequenciaram seus genomas pra entender suas diferenças genéticas. Eles construíram uma árvore filogenética pra visualizar as relações e identificaram marcadores genéticos específicos associados à resistência a phages. Além disso, usaram condições de crescimento específicas pra avaliar como diferentes cepas reagiam aos ataques de phages.
Análise Filogenética de Bactérias
Os pesquisadores construíram árvores filogenéticas usando os dados genéticos dos isolados de Salmonella Typhimurium. Essas árvores ajudaram a entender como diferentes cepas estão relacionadas e como evoluíram ao longo do tempo. A análise mostrou padrões distintos de sensibilidade a phages entre as cepas, sugerindo que variações em sua composição genética desempenham um papel em suas respostas a phages.
Identificando Mudanças Genéticas
O estudo também visava identificar mudanças genéticas específicas associadas à resistência a phages em certas cepas. Ao identificar k-mers, que são sequências curtas de DNA, os pesquisadores puderam ligar variações genéticas particulares com diferentes níveis de sensibilidade a ataques de phages. Eles descobriram que a maioria dos marcadores genéticos significativos estava localizada em ou perto do gene wzy.
Mudanças no Locus wzy
O gene wzy foi encontrado como polimórfico, significando que havia variações em sua sequência entre diferentes cepas. Algumas cepas tinham deleções no gene wzy, que provavelmente contribuíram para sua resistência a phages que dependem do O-antígeno para infecção. Os pesquisadores também observaram que algumas cepas tinham mutações que poderiam prejudicar a função do gene wzy.
Deleções e Reversões do Gene wzy
Através de seus experimentos, os pesquisadores descobriram que a deleção do gene wzy levou a uma perda de sensibilidade a phages de tipagem específicos. Eles engenheiraram diferentes variantes de Salmonella Typhimurium pra investigar ainda mais o papel do gene wzy na resistência. Os resultados indicaram que, quando o gene wzy era deletado, as cepas projetadas pra imitar a deleção do wzy exibiam resistência semelhante a ataques de phages.
Seleção de Variantes Resistentes
Quando cepas sensíveis a phages foram cultivadas na presença de phages, a frequência de cepas com deleções no wzy aumentou. Essa descoberta sugere que as deleções no wzy oferecem uma vantagem seletiva quando enfrentam a predação por phages. Importante, as cepas do tipo selvagem (wzy+) podiam coexistir com essas variantes resistentes, criando um equilíbrio na população bacteriana.
Mecanismo de Reversão
Outro aspecto interessante do estudo foi o potencial das cepas resistentes de reverter para um fenótipo sensível. Os pesquisadores exploraram se o gene wzy original poderia ser transferido de cepas sensíveis para aquelas com deleções. Os experimentos mostraram que tais transferências genéticas poderiam ocorrer durante a co-cultura, sugerindo um mecanismo para a restauração da sensibilidade.
Reconstrução do Estado Ancestral
Pra ganhar insights sobre a evolução dessas cepas de Salmonella, os pesquisadores usaram modelos estatísticos pra reconstruir a provável história das mudanças na sensibilidade a phages. As análises indicaram que as mudanças entre estados sensíveis e resistentes a phages eram comuns e que essa variabilidade poderia ser uma característica chave da dinâmica populacional bacteriana.
Implicações para a Terapia com Phages
As descobertas dessa pesquisa têm implicações importantes para o uso de phages como tratamento para infecções bacterianas. A capacidade das bactérias de alternar entre estados sensíveis e resistentes destaca a complexidade de usar phages contra infecções. Estratégias como combinar diferentes phages ou usar múltiplos tratamentos podem ser necessárias pra combater com sucesso cepas resistentes.
Conclusão
O estudo ilumina a relação intricada entre Salmonella Typhimurium e phages. A capacidade das bactérias de se adaptar através de mudanças genéticas como a perda ou mutação do gene wzy demonstra a batalha evolutiva contínua entre esses microrganismos. Entender essas dinâmicas é crucial pra desenvolver terapias de phages eficazes e gerenciar a resistência a antibióticos em infecções bacterianas.
Título: Reversible excision of the wzy locus in Salmonella Typhimurium may aid recovery following phage predation
Resumo: Bacteriophage (phage) are promising novel antimicrobials but a key challenge to their effective implementation is the rapid emergence of phage resistance. An improved understanding of phage-host interactions is therefore needed. The Anderson phage typing scheme differentiates closely related strains of Salmonella enterica serovar Typhimurium (S. Typhimurium) based on sensitivity to a panel of phage preparations. Switches in phage type are indicative of changes in phage sensitivity and inform on the dynamics of phage interaction with their host bacteria. We investigated the molecular basis of switches between the relatively phage sensitive S. Typhimurium DT8 and phage resistant DT30 strains that are present in the same phylogenetic clade. DT30 strains emerged from DT8 strains predominantly by deletion of a genomic region affecting the wzy locus encoding an O-antigen polymerase. The deletion site was flanked by two perfect direct repeats designated attL and attR. During broth culture in the presence of a typing phage that used O-antigen as primary receptor the {Delta}wzy genotype increased in frequency compared with culture in the absence of phage and removal of attL prevented deletion of the wzy locus. Co-culture of S. Typhimurium DT8 with a strain lacking wzy resulted in reversion of the latter to wild type. We propose a model in which reversible deletion of the wzy locus enables recovery of S. Typhimurium DT8 following predation by phage that use O-antigen as their primary receptor. This was consistent with ancestral state reconstruction of DT8 and DT30 phylogeny that supported a model of reversible transition from DT8 to DT30 in natural populations. ImportanceS. Typhimurium is a major pathogen of livestock that adversely affects productivity and animal welfare and poses a risk of foodborne disease in the human population. Antibiotics are used to control Salmonella infections in livestock that contributes to the antimicrobial resistance global emergency. Viruses of bacteria (phage) are one alternative to antibiotics to control Salmonella in the food chain but their successful implementation as antimicrobials is restricted by the rapid emergence of resistance to phage. A better understanding of the outcome of phage-bacteria interactions is needed to optimise the design and implementation of phage-based antimicrobials. This study identifies a genetic mechanism that confers resistance to phage that use O-antigen as a receptor on the surface of Salmonella. The mechanism is likely to impart a fitness cost on the bacterium but importantly the mechanism has the potential to be revert to a fully fit state once phage predation ceases. A model for how the mechanism may contribute to survival and recovery following phage predation is proposed.
Autores: Robert A Kingsley, O. J. Charity, G. Thilliez, H. Al-Khanaq, L. Acton, R. Kolenda, M. Bawn, L. Petrovska
Última atualização: 2024-09-17 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.17.613263
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.09.17.613263.full.pdf
Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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