As Origens dos Eucariontes: Uma Evolução Complexa
Este artigo explora como as células eucarióticas evoluíram e suas conexões com arqueias e bactérias.
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Eucariotes são um tipo de organismo, incluindo plantas, animais e fungos, que têm células complexas. Essas células são bem diferentes das células mais simples que encontramos em bactérias e arqueias. Uma das maiores perguntas na biologia evolutiva é como os eucariotes surgiram pela primeira vez. Esse processo é chamado de eucariogênese.
Os eucariotes têm características especiais que tornam suas células mais complexas do que as de bactérias e arqueias. Por exemplo, eles têm um sistema de endomembrana, que inclui um núcleo. O núcleo é uma parte chave das células eucariotas onde o material genético é armazenado. As células eucariotas também têm uma estrutura chamada citoesqueleto que ajuda a manter sua forma, e Mitocôndrias, que são as partes da célula que produzem energia. Os cientistas acreditam que as mitocôndrias vieram de bactérias que foram absorvidas por células eucariotas primitivas.
No começo, os pesquisadores achavam que os primeiros eucariotes não tinham mitocôndrias. Eles propuseram que um ancestral eucariota simples absorveu uma bactéria, que mais tarde se transformou nas mitocôndrias. No entanto, estudos posteriores mostraram que todos os eucariotes conhecidos têm mitocôndrias ou estruturas relacionadas, indicando que o último ancestral comum dos eucariotes, chamado de Último Ancestral Comum Eucariota (LECA), já tinha mitocôndrias.
Pesquisas adicionais ajudam a entender que os genes principais dos eucariotes podem ser rastreados tanto para arqueias quanto para bactérias. Muitos dos genes que vêm das arqueias são vitais para processos como a replicação do DNA e a produção de proteínas. Por outro lado, a maioria dos genes bacterianos em eucariotes está envolvida no metabolismo.
A descoberta de um grupo de arqueias chamado Asgard mudou a forma como os cientistas pensam sobre as origens dos eucariotes. As arqueias Asgard são consideradas as parentes mais próximas dos eucariotes. Uma análise dos genes dentro desses organismos sugere que muitas características-chave das células eucariotas evoluíram a partir dessas arqueias antes do desenvolvimento das mitocôndrias.
Várias teorias sobre como os eucariotes se originaram foram apresentadas. Algumas sugerem que uma arqueia Asgard primitiva foi engolida por uma bactéria, levando ao desenvolvimento de uma célula mais complexa. Essa ideia sugere que vários eventos endossimbióticos, ou cenários onde um organismo vive dentro de outro, aconteceram, resultando na criação de células eucariotas.
Além de explorar as origens, os pesquisadores têm analisado as relações entre diferentes famílias de proteínas em Procariotos e eucariotos. Para isso, criaram bancos de dados e usaram métodos sofisticados para analisar proteínas de vários organismos. O objetivo era identificar quais proteínas nos eucariotes são semelhantes às dos procariotos, ajudando a esclarecer as conexões evolutivas entre os dois grupos.
A partir de um banco de dados com milhões de proteínas derivadas de vários genomas, os cientistas queriam explorar as relações entre as famílias de proteínas procariotas e eucariotas. Eles construíram vários modelos para analisar essas conexões e determinar as prováveis origens das proteínas nas células eucariotas. Focaram nas classes funcionais dos genes para ver quais grupos de proteínas podem ser rastreados até ancestrais específicos.
Os resultados desse trabalho indicam que um número significativo de genes eucariotas, especialmente aqueles relacionados a funções essenciais dentro da célula, se originou das arqueias Asgard. Muitos desses genes estão envolvidos nos sistemas de processamento de informação das células, incluindo como o DNA é copiado e como as proteínas são feitas.
Além disso, a pesquisa mostrou que diferentes caminhos em eucariotes estão associados a grupos procariotos específicos. Por exemplo, proteínas relacionadas à produção de energia em células eucariotas estão principalmente ligadas a Alphaproteobacteria, que são consideradas os ancestrais das mitocôndrias. Apesar da influência significativa das Alphaproteobacteria, é claro que as arqueias Asgard desempenham um papel mais central na composição genética das células eucariotas.
Além disso, a análise destacou que, embora alguns grupos bacterianos diversos tenham contribuído para a evolução eucariota, eles não mostraram padrões consistentes. A maioria dessas contribuições não levou a tendências claras ou associações com funções celulares específicas. Isso sugere que as conexões evolutivas entre os vários grupos bacterianos e os eucariotes são mais complexas e menos lineares.
Um desafio para entender as origens dos eucariotes é que muitas das proteínas e caminhos envolvidos em sua evolução ainda não estão totalmente caracterizados. Embora alguns caminhos, como os envolvidos na síntese de determinados tipos de lipídios, permaneçam indefinidos, há associações fortes com as arqueias Asgard para muitos outros processos.
Vendo o quadro geral, parece que uma grande parte do conjunto de genes nos eucariotes se deriva das arqueias Asgard, especialmente em relação a funções metabólicas cruciais e sistemas de processamento de informação. Isso indica que o ancestral eucariota primitivo provavelmente já era complexo e tinha muitas características que associamos aos eucariotes hoje.
Uma das grandes perguntas que ainda restam é como os eucariotes adquiriram as membranas do tipo bacteriano que possuem. Embora seja claro que muitos caminhos metabólicos relacionados à síntese de lipídios foram herdados das arqueias Asgard, as origens das enzimas envolvidas na produção de lipídios de membrana permanecem complicadas.
Em resumo, a pesquisa sobre a eucariogênese destaca a complexa interação entre diferentes grupos de organismos. As arqueias Asgard parecem ser um grande contribuidor para a evolução dos eucariotes, fornecendo blocos fundamentais para muitas funções celulares. Enquanto as Alphaproteobacteria desempenham um papel chave no metabolismo energético, as amplas contribuições de outros grupos bacterianos mostram uma influência irregular e menos definitiva na história evolutiva dos eucariotes. A pesquisa contínua sobre genomas procariotos e eucariotos promete trazer mais insights sobre os eventos antigos que moldaram a vida como a conhecemos hoje.
Título: Dominant contribution of Asgard archaea to eukaryogenesis
Resumo: Origin of eukaryotes is one of the key problems in evolutionary biology. The demonstration that the Last Eukaryotic Common Ancestor (LECA) already contained the mitochondrion, an endosymbiotic organelle derived from an alphaproteobacterium, and the discovery of Asgard archaea, the closest archaeal relatives of eukaryotes inform and constrain evolutionary scenarios of eukaryogenesis. We undertook a comprehensive analysis of the origins of the core eukaryotic genes tracing to the LECA within a rigorous statistical framework centered around evolutionary hypotheses testing using constrained phylogenetic trees. The results reveal dominant contributions of Asgard archaea to the origin of most of the conserved eukaryotic functional systems and pathways. A limited contribution from Alphaproteobacteria was identified, primarily relating to the energy transformation systems and Fe-S cluster biogenesis, whereas ancestry from other bacterial phyla was scattered across the eukaryotic functional landscape, without consistent trends. These findings suggest a model of eukaryogenesis in which key features of eukaryotic cell organization evolved in the Asgard ancestor, followed by the capture of the Alphaproteobacterial endosymbiont, and augmented by numerous but sporadic horizontal acquisition of genes from other bacteria both before and after endosymbiosis.
Autores: Eugene V. Koonin, V. Tobiasson, J. Luo, Y. I. Wolf
Última atualização: 2024-10-17 00:00:00
Idioma: English
Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.14.618318
Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.10.14.618318.full.pdf
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