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# Biologia# Biofísica

Novas Ideias sobre a Origem da Vida

Pesquisadores simulam condições para a replicação inicial de ácidos nucleicos.

Dieter Braun, P. Schwintek, E. Eren, C. B. Mast

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Insights sobre a OrigemInsights sobre a Origemda Vidanucleicos.métodos de replicação de ácidosCondições de laboratório revelam
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A pergunta de como a vida começou na Terra ainda é um mistério pros cientistas. Eles acham que esse evento rolou há cerca de 3,7 a 4,5 bilhões de anos. Os sinais mais antigos de vida que temos são isótopos de carbono fossilizados, que datam de uns 3,7 bilhões de anos atrás. Pra entender como a vida primitiva se formou antes disso, é importante identificar os ambientes geológicos certos que poderiam suportar os processos que levam à vida.

Uma teoria popular sugere que o processo de evolução ajudou a criar moléculas informacionais, que foram chave pra origem da vida. Entre elas, os Ácidos Nucleicos como o RNA são importantes porque conseguem armazenar informação genética e se replicar formando estruturas de dupla fita. Essa habilidade permite que o RNA mutue e se adapte, o que ajudou no desenvolvimento de proteínas que são essenciais pra vida hoje.

Mas tem um grande desafio com a diluição. Pra que os processos de vida primitiva funcionem, eles precisam de altas concentrações de certos materiais. Grandes corpos de água, como os oceanos, são muito uniformes e faltam fontes de energia local pra impulsionar as reações necessárias. Como resultado, eles são lugares improváveis pra vida primitiva ter se formado.

Por outro lado, condições físicas específicas e não uniformes podem concentrar moléculas como os ácidos nucleicos em vários ambientes geológicos. Por exemplo, lugares com diferenças de temperatura nas rochas, ciclos de evaporação e adsorções em minerais podem levar ao acúmulo de moléculas.

Ainda assim, juntar sais e moléculas traz seus próprios problemas. Os ácidos nucleicos de fita simples podem se transformar em formas de dupla fita, mas elas precisam ser separadas novamente pra que o processo de Replicação continue. Essa Separação fica mais difícil à medida que mais moléculas se acumulam porque a temperatura necessária pra derreter as fitas muda conforme a concentração de sais. Mesmo que altas concentrações de magnésio sejam necessárias pra replicação, elas também podem aumentar a temperatura pra níveis que são prejudiciais pros ácidos nucleicos.

Portanto, precisamos de outras maneiras de separar as fitas de ácido nucleico sem aplicar muito calor. Uma possível solução é por meio de mudanças no pH, que podem acontecer devido a alterações de temperatura ou durante ciclos de congelamento e descongelamento. Outro exemplo são as gotas de orvalho nas rochas que podem diminuir temporariamente a concentração de Sal, facilitando a separação.

Neste estudo, os cientistas analisaram um cenário simples onde a água flui por um poro de rocha e é seca pelo fluxo de gás a uma temperatura constante. Essa situação poderia acontecer perto de vulcões subaquáticos ou em rochas porosas expostas ao vento. Essas condições teriam sido comuns em ilhas vulcânicas na Terra primitiva, proporcionando o ambiente certo pra síntese de RNA.

Pra entender melhor esse cenário, os pesquisadores criaram um modelo em laboratório representando esse tipo de poro de evapor ação e estudaram como os Fluxos de Gás e água poderiam levar à replicação inicial de ácidos nucleicos. Eles primeiro analisaram como as moléculas se juntam no ponto de encontro dos fluxos de gás e água. Depois, observaram como os ácidos nucleicos se comportavam durante esse processo e, por fim, mostraram como esses fatores poderiam ajudar na replicação em condições de temperatura estáveis.

Acúmulo de Moléculas Onde Gás Encontra Água

No laboratório, os cientistas construíram um modelo pra se parecer com um poro de rocha, focando em dois fatores principais: a água subindo e evaporando onde encontra um fluxo de gás. Essa evaporação causa o acúmulo de materiais dissolvidos, já que eles não conseguem evaporar junto com a água. Ao mesmo tempo, o fluxo de gás cria movimento circular na água, empurrando algumas moléculas pra baixo.

Eles analisaram um cenário onde a água contendo biomoléculas importantes evapora devido ao fluxo de gás. À medida que o fluxo de gás causa correntes de convecção na água, os ácidos nucleicos dissolvidos e sais se acumulam na interface gás-água por causa dos movimentos em espiral. Esse ambiente pode criar diferentes concentrações de sal, ajudando os ácidos nucleicos a se separarem e replicarem.

Os cientistas monitoraram o comportamento de moléculas fluorescentes pra ver como elas se moviam e interagiam nesse ambiente. Eles perceberam que as moléculas na interface estavam se movendo mais rápido devido ao fluxo de gás, criando padrões de vórtice. Eles descobriram que após um curto período, a concentração de DNA nessa interface aumentou significativamente por causa da evaporação constante e das dinâmicas do fluxo de gás.

Separação de Fitas de DNA

A separação das fitas de DNA é crucial pra que o processo de replicação seja eficaz. Enquanto o aquecimento é geralmente usado pra esse propósito, ele pode levar a condições prejudiciais pros ácidos nucleicos. Em vez disso, os cientistas analisaram como mudanças na concentração de sal poderiam induzir a separação. O fluxo circular dos fluidos proporcionado pelo gás poderia levar a áreas com níveis variados de sal, o que pode ajudar as fitas a se separarem com base em suas concentrações.

Usando técnicas de fotografia especiais, eles mediram as interações entre as fitas de DNA. Quando as fitas estão ligadas, um sinal forte é observado, enquanto um sinal fraco indica separação. Isso fornece uma visão sobre os níveis de concentração de sal, já que pouco sal pode promover a separação das fitas.

A partir de seus experimentos, eles descobriram que o fluxo de gás induziu padrões que permitiram ciclos de replicação e separação dos ácidos nucleicos. Eles também simularam como os íons de magnésio se comportavam no sistema, confirmando que a concentração desses íons mudava conforme os ácidos nucleicos se moviam por condições variadas.

Processo de Replicação Isotérmica

Dado que os ácidos nucleicos e sais se juntavam perto da interface gás-água, as concentrações eram baixas nas áreas ao redor. O movimento do gás criou padrões que aprisionavam as moléculas e levavam a mudanças nas concentrações de sal e DNA. Essas mudanças permitiram a separação periódica dos ácidos nucleicos em condições suaves.

Os pesquisadores estavam motivados a ver se conseguiam replicar ácidos nucleicos de forma eficaz nesse ambiente. Eles usaram enzimas específicas que poderiam ajudar nesse processo sem exigir temperaturas extremas pra separar as fitas. Em vez disso, mantiveram uma temperatura constante e permitiram um fluxo contínuo de água pura em direção à interface gás-água.

À medida que a reação avançava, eles observaram um aumento na fluorescência, indicando a formação de estruturas de DNA replicadas. Quando compararam isso a experimentos semelhantes sem fluxo de gás e água, não houve reação notável, demonstrando que as condições eram essenciais pra uma replicação bem-sucedida.

Os cientistas confirmaram seus resultados testando várias amostras e configurações, garantindo que o processo de replicação não ocorreria sem que as condições certas fossem atendidas.

Implicações e Direções Futuras

Essa pesquisa destacou um ambiente potencial onde os processos de vida primitiva poderiam ter ocorrido. Em vez de depender de diferenças extremas de temperatura, que podem ser duras para sistemas moleculares, esse ambiente isotérmico oferece uma maneira suave pra que os ácidos nucleicos se replicassem. Ao entender essas condições, os cientistas podem explorar uma gama mais ampla de lugares onde a vida poderia potencialmente ter se desenvolvido na Terra primitiva ou em outros planetas.

Os achados apoiam a ideia de que ambientes geológicos simples podem ser suficientes pra os processos da vida primitiva, sugerindo caminhos potenciais pra entender como a vida se originou no contexto planetário. Pesquisas futuras podem investigar ainda mais esses ambientes e examinar outros fatores que poderiam influenciar o surgimento da vida.

Através de estudos contínuos nessa área, podemos aprender mais sobre a origem da vida e as condições que permitiram seu desenvolvimento no nosso planeta e possivelmente além.

Fonte original

Título: Prebiotic gas flow environment enables isothermal nucleic acid replication

Resumo: Nucleic acid replication is a central process at the origin of life. On early Earth, replication is challenged by the dilution of molecular building blocks and the difficulty of separating daughter from parent strands, a necessity for exponential replication. While thermal gradient systems have been shown to address these problems, elevated temperatures lead to degradation. Also, compared to constant temperature environments, such systems are rare. The isothermal system studied here models an abundant geological environment of the prebiotic Earth, in which water is continuously evaporated at the point of contact with the gas flows, inducing up-concentration and circular flow patterns at the gas-water interface through momentum transfer. We show experimentally that this setting drives a 30-fold accumulation of nucleic acids and their periodic separation by a 3-fold reduction in salt and product concentration. Fluid dynamic simulations agree with observations from tracking fluorescent beads. In this isothermal system, we were able to drive exponential DNA replication with Taq polymerase. The results provide a model for a ubiquitous non-equilibrium system to host early Darwinian molecular evolution at constant temperature.

Autores: Dieter Braun, P. Schwintek, E. Eren, C. B. Mast

Última atualização: 2024-10-21 00:00:00

Idioma: English

Fonte URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.598889

Fonte PDF: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.06.13.598889.full.pdf

Licença: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Alterações: Este resumo foi elaborado com a assistência da AI e pode conter imprecisões. Para obter informações exactas, consulte os documentos originais ligados aqui.

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